More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AFE_2967 on replicon NC_011761
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011206  Lferr_2582  glycosyl transferase group 1  99.55 
 
 
1332 aa  2688    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.35538  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2579  glycosyl transferase group 1  100 
 
 
609 aa  1249    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0228  glycosyl transferase, group 1  46.36 
 
 
1089 aa  876    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4283  glycosyl transferase, group 1  39.79 
 
 
1229 aa  862    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2967  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 
1915 aa  3966    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0758  glycosyl transferase, group 1  49 
 
 
1241 aa  1166    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2941  glycosyl transferase, group 1  43.38 
 
 
1243 aa  943    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0758  glycosyl transferase group 1  46.34 
 
 
1028 aa  844    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1073  glycosyl transferase, group 1  46.94 
 
 
1261 aa  1114    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.328377  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0769  glycosyl transferase group 1  48.07 
 
 
1241 aa  1133    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.507904  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1159  glycosyl transferase group 1  45.49 
 
 
1398 aa  1125    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0412511  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0920  glycosyl transferase, group 1  45.98 
 
 
831 aa  357  1e-96  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1729  glycosyl transferase, group 1  44.72 
 
 
838 aa  357  1e-96  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1631  glycosyl transferase group 1  44.03 
 
 
846 aa  327  1e-87  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.343672  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1702  mannosyltransferase  43.78 
 
 
846 aa  325  4e-87  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.529704  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3278  glycosyl transferase group 1  38.48 
 
 
850 aa  305  6.000000000000001e-81  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1962  mannosyltransferase  40.05 
 
 
859 aa  289  4e-76  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.000841107  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1896  glycosyl transferase group 1  38.48 
 
 
860 aa  289  4e-76  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.00121907  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0492  mannosyltransferase A  27.01 
 
 
743 aa  282  5e-74  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.700737  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2168  glycosyl transferase, group 1 family protein  38.03 
 
 
815 aa  279  3e-73  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1780  mannosyltransferase, putative  28.12 
 
 
1635 aa  258  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.731336  decreased coverage  0.0078788 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1229  putative glycosyltransferase  35.84 
 
 
1219 aa  250  2e-64  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.197488  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21071  hypothetical protein  35.07 
 
 
1232 aa  249  3e-64  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2772  glycosyl transferase, group 1  33.75 
 
 
967 aa  183  4e-44  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.602029  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1334  glycosyltransferase, putative  32.99 
 
 
431 aa  181  2e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.218572  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1492  glycosyl transferase, group 1  32.97 
 
 
395 aa  161  1e-37  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0394  glycosyl transferase group 1  34.06 
 
 
374 aa  150  2.0000000000000003e-34  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.538009  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4271  glycosyl transferase group 1  28.81 
 
 
400 aa  150  3e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.614702 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0239  mannosyltransferase  35.44 
 
 
351 aa  146  4e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.205695  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3800  glycosyl transferase, group 1  35.02 
 
 
386 aa  146  4e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3332  glycosyl transferase, group 1  34.44 
 
 
370 aa  145  7e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.231973 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3583  glycosyl transferase, group 1  32.66 
 
 
408 aa  142  4.999999999999999e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2129  glycosyl transferase, group 1  35.47 
 
 
366 aa  139  5e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.819184  normal  0.0127909 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1265  glycosyl transferase, group 1  32.52 
 
 
376 aa  139  5e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2197  glycosyltransferase  28.57 
 
 
381 aa  139  5e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.122722  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2167  mannosyltransferase B  30.98 
 
 
381 aa  138  8e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0464  glycosyl transferase group 1  36.05 
 
 
394 aa  138  8e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.57819 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1975  glycosyl transferase group 1  27.46 
 
 
763 aa  137  9.999999999999999e-31  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.422047  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2487  putative mannosyltransferase  28.57 
 
 
381 aa  138  9.999999999999999e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0329082  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0683  glycosyl transferase, group 1  32.7 
 
 
482 aa  137  1.9999999999999998e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0144645  normal  0.0442463 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71930  glycosyltransferase WbpX  35.04 
 
 
460 aa  136  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3778  glycosyl transferase, group 1  32.98 
 
 
382 aa  135  6e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.729941  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4314  glycosyl transferase group 1  34.6 
 
 
370 aa  132  5.0000000000000004e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.712653  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4385  glycosyl transferase group 1  30.74 
 
 
378 aa  132  8.000000000000001e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.610092  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1652  glycosyl transferase group 1  31.6 
 
 
382 aa  131  1.0000000000000001e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3369  glycosyl transferase, group 1  35.74 
 
 
417 aa  131  1.0000000000000001e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00689338 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5686  glycosyl transferase, group 1  31.73 
 
 
455 aa  130  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.101413  normal  0.632336 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0218  glycosyl transferase group 1  33.05 
 
 
480 aa  130  2.0000000000000002e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.031233  normal  0.255038 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3776  glycosyl transferase, group 1  33.45 
 
 
371 aa  130  3e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6239  glycosyltransferase WbpX  34.25 
 
 
460 aa  130  3e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4232  glycosyl transferase, group 1  32.69 
 
 
390 aa  129  4.0000000000000003e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000972759 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0191  glycosyl transferase group 1  26.17 
 
 
779 aa  129  5e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.843879 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1702  glycosyl transferase, group 1  30.36 
 
 
360 aa  129  6e-28  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.127413  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2150  glycosyl transferase, group 1  36.44 
 
 
397 aa  129  7e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2483  mannosyltransferase B  30.8 
 
 
375 aa  127  2e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0534516  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2193  glycosyltransferase  30.8 
 
 
375 aa  127  2e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00106475  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3275  glycosyl transferase group 1  33.73 
 
 
380 aa  127  3e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3522  glycosyl transferase group 1  36.29 
 
 
385 aa  127  3e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.828408  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0106  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 
469 aa  127  3e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.341014  normal  0.913948 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1579  glycosyl transferase group 1  31.79 
 
 
394 aa  125  7e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000114352  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3121  glycosyl transferase, group 1  33.46 
 
 
383 aa  125  9e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000483528  unclonable  0.0000199281 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3359  glycosyl transferase group 1  26.69 
 
 
434 aa  124  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0286  glycosyl transferase group 1  30.17 
 
 
384 aa  124  1.9999999999999998e-26  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2130  glycosyl transferase, group 1  29.08 
 
 
370 aa  124  1.9999999999999998e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.799297  normal  0.0127909 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5863  glycosyl transferase group 1  27.6 
 
 
444 aa  124  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1558  glycosyl transferase group 1  26.23 
 
 
374 aa  123  3e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.899676  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1212  glycosyl transferase group 1  29.57 
 
 
451 aa  123  3e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.360145  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0347  glycosyl transferase group 1  32.22 
 
 
369 aa  124  3e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0936  glycosyl transferase, group 1  32.36 
 
 
382 aa  123  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.22828 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2957  glycosyl transferase group 1  31.97 
 
 
395 aa  122  4.9999999999999996e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000652955 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2011  glycosyl transferase group 1  32 
 
 
373 aa  121  9.999999999999999e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4137  glycosyl transferase group 1  34.27 
 
 
431 aa  120  1.9999999999999998e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000953773 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0081  mannosyltransferase  30.42 
 
 
346 aa  121  1.9999999999999998e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.54497  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0690  glycosyl transferase, group 1  32.78 
 
 
394 aa  120  1.9999999999999998e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0084  glycosyl transferase group 1  30.42 
 
 
346 aa  121  1.9999999999999998e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.248022  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0358  glycosyl transferase, group 1  27.95 
 
 
382 aa  120  3e-25  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.348726  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2369  glycosyl transferase, group 1  22.02 
 
 
770 aa  119  5e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.87241  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5868  glycosyl transferase group 1  27.6 
 
 
420 aa  119  6e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1035  glycosyl transferase, group 1  31.15 
 
 
366 aa  119  6.9999999999999995e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.788925  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1273  glycosyl transferase, group 1  31.29 
 
 
380 aa  119  6.9999999999999995e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00681714 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0558  glycosyl transferase group 1  26.56 
 
 
381 aa  119  6.9999999999999995e-25  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0239  glycosyl transferase group 1  27.65 
 
 
381 aa  119  7.999999999999999e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.836427 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1956  glycosyl transferase group 1  26.74 
 
 
382 aa  119  7.999999999999999e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0491  glycosyl transferase, group 1  29.01 
 
 
381 aa  118  8.999999999999998e-25  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0016  glycosyl transferase group 1  31.19 
 
 
361 aa  118  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0017  glycosyl transferase group 1  29.01 
 
 
377 aa  118  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0476  glycosyl transferase group 1  31.02 
 
 
361 aa  118  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1156  glycosyl transferase group 1  32.77 
 
 
371 aa  118  1.0000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.242648  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0235  glycosyl transferase group 1  34.02 
 
 
373 aa  117  2.0000000000000002e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.118803 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5496  glycosyl transferase group 1  32.22 
 
 
381 aa  117  2.0000000000000002e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0528  glycosyl transferase group 1  34.26 
 
 
368 aa  117  3e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1410  glycosyl transferase group 1  35.02 
 
 
381 aa  116  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.27124 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0461  glycosyl transferase group 1  30.31 
 
 
390 aa  116  5e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.208871  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1171  glycosyl transferase group 1  32.64 
 
 
366 aa  116  5e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.059053 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3357  glycosyl transferase group 1  26.63 
 
 
437 aa  115  6e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2582  glycosyl transferase group 1  31.45 
 
 
369 aa  115  7.000000000000001e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.411312 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4438  glycosyl transferase group 1  29.62 
 
 
381 aa  115  7.000000000000001e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1801  glycosyl transferase WbpY  33.2 
 
 
380 aa  115  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0707089 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0139  glycosyl transferase group 1  27.12 
 
 
384 aa  114  1.0000000000000001e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00161479 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3799  glycosyl transferase, group 1  35.79 
 
 
386 aa  114  1.0000000000000001e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>