More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AFE_2845 on replicon NC_011761
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011761  AFE_2845  single-strand binding protein  100 
 
 		 156 aa  318  1.9999999999999998e-86  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.101348  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2466  single-strand binding protein  100 
 
 		 156 aa  318  1.9999999999999998e-86  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.34674  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1260  single-strand binding protein  74.36 
 
 		 161 aa  231  3e-60  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0616311  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0140  single-strand binding protein  65.38 
 
 		 164 aa  207  6e-53  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1569  single-strand binding protein  65.38 
 
 		 164 aa  206  7e-53  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.285989  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1280  single-strand binding protein  66.03 
 
 		 164 aa  200  7e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00522699 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0438  single-strand binding protein  58.64 
 
 		 157 aa  183  8e-46  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.367584 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0312  single-strand binding protein  55.95 
 
 		 168 aa  173  8e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000035276 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2227  single-strand binding protein  54.43 
 
 		 152 aa  173  9e-43  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.261214  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2184  single-strand binding protein  60.51 
 
 		 160 aa  172  9.999999999999999e-43  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4573  single-stranded DNA-binding protein  53.76 
 
 		 171 aa  170  7.999999999999999e-42  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3023  single-strand binding protein  56.44 
 
 		 163 aa  169  1e-41  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.208974  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0640  single-strand binding protein  65.22 
 
 		 236 aa  169  2e-41  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.021198  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4028  single-strand binding protein  64.41 
 
 		 238 aa  169  2e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4105  single-strand binding protein  55.56 
 
 		 181 aa  169  2e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.512282  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1729  single-stranded DNA binding protein  54.14 
 
 		 149 aa  169  2e-41  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3753  single-strand binding protein  65.22 
 
 		 234 aa  168  3e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000011541  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0587  single-strand binding protein  65.22 
 
 		 236 aa  167  3e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0173283  normal  0.785333 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0581  single-strand binding protein  65.22 
 
 		 234 aa  168  3e-41  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00543875  normal  0.0620215 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0556  single-strand binding protein  65.22 
 
 		 234 aa  168  3e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00736875  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03931  single-strand DNA-binding protein  51.67 
 
 		 178 aa  167  4e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0479609  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3933  single-strand binding protein  51.67 
 
 		 178 aa  167  4e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3968  single-stranded DNA-binding protein  51.67 
 
 		 178 aa  167  4e-41  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0530108 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5562  single-stranded DNA-binding protein  51.67 
 
 		 178 aa  167  4e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.214992  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4301  single-stranded DNA-binding protein  51.67 
 
 		 178 aa  167  4e-41  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4611  single-stranded DNA-binding protein  51.67 
 
 		 178 aa  167  4e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0571  single-strand binding protein  62.18 
 
 		 222 aa  167  4e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00000000499632  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4521  single-stranded DNA-binding protein  51.67 
 
 		 178 aa  167  4e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03891  hypothetical protein  51.67 
 
 		 178 aa  167  4e-41  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0417311  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1608  single-strand binding protein  52.2 
 
 		 151 aa  167  5e-41  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.409638  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2424  single-strand binding protein  52.1 
 
 		 167 aa  167  7e-41  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00208547  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06540  single-stranded DNA-binding protein  54.44 
 
 		 167 aa  166  8e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0610132  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2815  single-stranded DNA-binding protein  49.15 
 
 		 177 aa  165  2e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3313  single-strand binding protein  62.07 
 
 		 231 aa  165  2e-40  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0358843  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0723  single-strand binding protein  51.09 
 
 		 180 aa  165  2e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0421  single-strand binding protein (SSB) (helix-destabilizing protein)  50.31 
 
 		 159 aa  164  2.9999999999999998e-40  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0516  single-strand binding protein  70.3 
 
 		 234 aa  164  5e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.490928  normal  0.543357 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0397  single-strand binding protein (SSB) (helix-destabilizing protein)  50 
 
 		 159 aa  164  5e-40  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3975  single-strand binding protein  51.92 
 
 		 146 aa  164  5e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00000000156614  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4062  single-strand binding protein  53.85 
 
 		 148 aa  164  5.9999999999999996e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0107  single-strand binding protein  50.3 
 
 		 165 aa  164  5.9999999999999996e-40  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.0655467  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1903  single-strand binding protein  53.46 
 
 		 151 aa  163  1.0000000000000001e-39  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0620  single-stranded DNA-binding protein  51.83 
 
 		 182 aa  162  2.0000000000000002e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.210142  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0533  single-strand binding protein  68.32 
 
 		 236 aa  162  2.0000000000000002e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0176705  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0111  single-strand binding protein  49.45 
 
 		 173 aa  160  5.0000000000000005e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00797744  hitchhiker  0.00729769 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3590  single-strand binding protein  68.32 
 
 		 235 aa  160  5.0000000000000005e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0152827  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4599  single-stranded DNA-binding protein  54.07 
 
 		 176 aa  160  6e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4598  single-stranded DNA-binding protein  54.07 
 
 		 176 aa  160  6e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.454444  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4650  single-stranded DNA-binding protein  54.07 
 
 		 176 aa  160  6e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4504  single-stranded DNA-binding protein  54.07 
 
 		 176 aa  160  6e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.580839  normal  0.345309 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3411  single-strand binding protein  64.81 
 
 		 146 aa  160  6e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3419  single-strand binding protein  68.32 
 
 		 236 aa  160  6e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0354621  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4512  single-stranded DNA-binding protein  54.07 
 
 		 176 aa  160  6e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4397  single-strand binding protein  54.49 
 
 		 149 aa  160  8.000000000000001e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000143406  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0325  single-strand binding protein  51.88 
 
 		 160 aa  160  9e-39  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00235  single-strand binding protein  64.76 
 
 		 196 aa  159  1e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.508026  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3728  single-strand binding protein  50 
 
 		 167 aa  158  2e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0825596  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2293  single-strand binding protein  55.41 
 
 		 155 aa  159  2e-38  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2746  single-strand binding protein  54.84 
 
 		 154 aa  158  2e-38  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1129  single-stranded DNA-binding protein  51.27 
 
 		 154 aa  158  3e-38  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0688352  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0996  single-stranded DNA-binding protein  49.43 
 
 		 175 aa  157  5e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000000000000269191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4439  single-strand binding protein  51.69 
 
 		 181 aa  157  5e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.580245  normal  0.977465 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3662  single-stranded DNA-binding protein  52.27 
 
 		 180 aa  156  8e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.311594  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3512  single-stranded DNA-binding protein  52.33 
 
 		 176 aa  156  8e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.534706  n/a   
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6278  single-stranded DNA-binding protein  47.8 
 
 		 190 aa  156  9e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6544  single-strand binding protein  46.59 
 
 		 188 aa  156  1e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0555  single-strand binding protein  66.67 
 
 		 183 aa  155  2e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3117  single-strand binding protein  54.49 
 
 		 146 aa  155  3e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3819  single-strand binding protein  61.79 
 
 		 175 aa  155  3e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.131469  normal  0.852259 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03705  single-stranded DNA-binding protein  62.39 
 
 		 178 aa  155  3e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1823  single-strand DNA binding protein  51.88 
 
 		 158 aa  155  3e-37  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.0000000500943  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0262  single-stranded DNA-binding protein  49.42 
 
 		 176 aa  154  3e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0370  single-stranded DNA-binding protein  52.17 
 
 		 158 aa  154  3e-37  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  4.28253e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3850  single-stranded DNA-binding protein  69.7 
 
 		 182 aa  154  5.0000000000000005e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0223  single-strand binding protein  48.41 
 
 		 172 aa  154  5.0000000000000005e-37  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0749  single-stranded DNA-binding protein  69.7 
 
 		 182 aa  154  5.0000000000000005e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0561709 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3760  single-stranded DNA-binding protein  69.7 
 
 		 182 aa  154  5.0000000000000005e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.637198  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3772  single-strand binding protein  46.59 
 
 		 167 aa  154  6e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0930  single-strand binding protein  65.35 
 
 		 233 aa  153  7e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0362  single-strand binding protein  62.62 
 
 		 147 aa  153  8e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000141012  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4565  single-strand binding protein  64.86 
 
 		 162 aa  153  8e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.111222 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3710  single-strand binding protein  60.71 
 
 		 242 aa  153  8e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000000568362  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0148  single-strand binding protein  45.92 
 
 		 200 aa  153  9e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000650066  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0025  single-strand binding protein  63.21 
 
 		 185 aa  153  1e-36  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.326087  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1964  single-strand binding protein  48.8 
 
 		 166 aa  153  1e-36  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0586806  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3307  single-strand binding protein  50.3 
 
 		 167 aa  152  1e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.358097  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03522  Single-strand binding protein (SSB) (Helix-destabilizing protein)  60.71 
 
 		 161 aa  152  2e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.721181  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03473  hypothetical protein  60.71 
 
 		 161 aa  152  2e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.953641  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0108  single-strand DNA-binding protein  47.93 
 
 		 175 aa  152  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.127981 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0868  single-stranded DNA-binding protein  65.22 
 
 		 165 aa  152  2e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.949427  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09200  single-stranded DNA-binding protein  65.22 
 
 		 165 aa  152  2e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0140345  normal  0.797582 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0691  single-strand binding protein  47.75 
 
 		 182 aa  152  2e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0461  single-stranded DNA-binding protein  62.83 
 
 		 183 aa  151  2.9999999999999998e-36  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4136  single-strand binding protein  51.9 
 
 		 165 aa  151  4e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.00257705  normal  0.135122 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0449  single-strand binding protein  51.92 
 
 		 143 aa  151  4e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000857397  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0351  single-stranded DNA-binding protein  63.89 
 
 		 169 aa  150  5e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0967385  normal  0.582722 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3876  single-strand binding protein  53.05 
 
 		 162 aa  150  5e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.611448  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2200  single-strand binding protein  47.74 
 
 		 157 aa  150  5e-36  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.886044 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2690  single-strand binding protein  52.05 
 
 		 172 aa  150  5.9999999999999996e-36  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0960941  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0535  single-strand binding protein  60.55 
 
 		 220 aa  150  5.9999999999999996e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000686084  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>