More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AFE_2704 on replicon NC_011761
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011206  Lferr_2326  type II and III secretion system protein  100 
 
 		 478 aa  948    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.434108  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2704  type II/III secretion system protein  100 
 
 		 478 aa  948    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1403  type II and III secretion system protein  45.08 
 
 		 444 aa  333  3e-90  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4661  Flp pilus assembly protein secretin CpaC  46.29 
 
 		 443 aa  331  1e-89  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000794738  hitchhiker  0.00340482 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2798  putative outer membrane channel signal peptide protein, CpaC like  47.37 
 
 		 454 aa  332  1e-89  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.395631 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2542  type II/III secretion system protein  45.37 
 
 		 441 aa  329  6e-89  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1653  type II and III secretion system protein  46.88 
 
 		 468 aa  329  7e-89  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.745375 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0117  type II/III secretion system protein  45.6 
 
 		 441 aa  326  5e-88  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.821295  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1941  type II/III secretion system protein  45.6 
 
 		 441 aa  326  5e-88  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0187984  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1768  type II/III secretion system protein  45.6 
 
 		 441 aa  326  5e-88  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.477043  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1778  type II/III secretion system protein  45.6 
 
 		 441 aa  326  5e-88  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1290  type II/III secretion system protein  45.6 
 
 		 432 aa  326  6e-88  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1048  type II/III secretion system protein  45.6 
 
 		 432 aa  326  6e-88  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.827787  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1789  type II/III secretion system protein  45.6 
 
 		 432 aa  326  6e-88  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1443  type II and III secretion system protein  45.89 
 
 		 461 aa  324  2e-87  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.549017 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1497  type II and III secretion system protein  44.94 
 
 		 443 aa  320  3e-86  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0318341  hitchhiker  0.0000037114 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1041  type II and III secretion system protein  44.94 
 
 		 443 aa  320  3e-86  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00604679  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1521  type II and III secretion system protein  44.94 
 
 		 443 aa  320  3e-86  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00384422  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1732  type II and III secretion system protein  45.48 
 
 		 443 aa  317  4e-85  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.793195  hitchhiker  0.00000430206 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3654  pilus assembly protein  43.28 
 
 		 473 aa  311  2e-83  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4248  type II and III secretion system protein  43.18 
 
 		 454 aa  305  1.0000000000000001e-81  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.218711 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4358  type II and III secretion system protein  43.18 
 
 		 454 aa  305  1.0000000000000001e-81  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.970058 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4445  type II and III secretion system protein  44.07 
 
 		 457 aa  305  2.0000000000000002e-81  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02594  outer membrane channel signal peptide protein  44.1 
 
 		 454 aa  300  4e-80  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5409  type II and III secretion system protein  42.6 
 
 		 469 aa  294  3e-78  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.28985  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1642  type II and III secretion system protein  41.5 
 
 		 453 aa  266  8.999999999999999e-70  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00375821  normal  0.501633 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2321  type II and III secretion system protein  45.43 
 
 		 452 aa  265  1e-69  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.278369 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2072  type II and III secretion system protein  38.44 
 
 		 492 aa  265  2e-69  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00565214  normal  0.624153 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1658  type II and III secretion system protein  39.51 
 
 		 483 aa  248  1e-64  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4391  type II and III secretion system protein  37.21 
 
 		 416 aa  244  3e-63  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.260079  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2162  type II and III secretion system protein  38.52 
 
 		 428 aa  240  5e-62  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.080237 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55920  putative type II secretion system protein  37.96 
 
 		 416 aa  238  1e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0275442  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0070  type II and III secretion system protein  37.68 
 
 		 461 aa  238  2e-61  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.838423 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4871  putative type II secretion system protein  36.81 
 
 		 408 aa  232  1e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0665602  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4851  bacterial type II/III secretion system protein  35.97 
 
 		 419 aa  231  2e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2360  type II/III secretion system protein  35.89 
 
 		 482 aa  227  3e-58  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0848  type II and III secretion system protein  34.68 
 
 		 419 aa  225  1e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2741  type II and III secretion system protein  36.25 
 
 		 493 aa  224  4e-57  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1112  type II and III secretion system protein  34.76 
 
 		 484 aa  223  6e-57  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.48513  normal  0.168783 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3968  type II and III secretion system protein  36.49 
 
 		 490 aa  223  8e-57  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.198511  normal  0.42418 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3007  type II and III secretion system protein  36.77 
 
 		 477 aa  221  1.9999999999999999e-56  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0648  type II and III secretion system protein  33.11 
 
 		 422 aa  219  6e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1493  type II and III secretion system protein  34.88 
 
 		 482 aa  216  7e-55  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3514  type II and III secretion system protein  37.97 
 
 		 431 aa  212  2e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.91039  normal  0.283922 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1519  putative pilus assembly protein cpaC  34.37 
 
 		 496 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.527914  normal  0.565497 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2057  type II and III secretion system protein  34.15 
 
 		 460 aa  196  7e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.127382  normal  0.0564414 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0614  type II and III secretion system protein  33.42 
 
 		 464 aa  196  8.000000000000001e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3421  type II and III secretion system protein  33.18 
 
 		 460 aa  195  1e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.195466  normal  0.703201 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2827  type II and III secretion system protein  34.83 
 
 		 487 aa  194  2e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.863407  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1516  type II and III secretion system protein  35.28 
 
 		 517 aa  195  2e-48  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2915  type II and III secretion system protein  34.6 
 
 		 484 aa  194  3e-48  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3928  type II and III secretion system protein  32.79 
 
 		 460 aa  192  2e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.13282  normal  0.228642 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0481  type II and III secretion system protein  34.02 
 
 		 491 aa  191  2e-47  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0391  type II and III secretion system protein  31.74 
 
 		 486 aa  189  9e-47  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.796113  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2695  type II and III secretion system protein  33.41 
 
 		 530 aa  188  2e-46  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4868  type II and III secretion system protein  36.7 
 
 		 526 aa  186  6e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1167  type II and III secretion system protein  31.73 
 
 		 455 aa  186  8e-46  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0398766  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1784  type II and III secretion system protein  31.35 
 
 		 479 aa  186  1.0000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0597646  normal  0.339139 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1909  Outer membrane general secretion pathway protein, secretin  32.84 
 
 		 461 aa  182  1e-44  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5132  type II and III secretion system protein  32.24 
 
 		 466 aa  180  5.999999999999999e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.179001 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1885  type II/III secretion system protein  33.42 
 
 		 482 aa  179  7e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.181819  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1873  type II/III secretion system protein  33.42 
 
 		 482 aa  179  7e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2040  RhcC2  33.42 
 
 		 482 aa  179  7e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.199191  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0557  type II and III secretion system protein  32.59 
 
 		 461 aa  179  9e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1680  type II/III secretion system protein  33.42 
 
 		 482 aa  179  9e-44  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.427555  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0336  type II secretion system protein  33.42 
 
 		 482 aa  179  9e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.377207  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0825  RhcC2  33.42 
 
 		 482 aa  179  9e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.667822  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0305  type II and III secretion system protein  33.33 
 
 		 461 aa  179  9e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7031  putative pilus assembly protein cpaC  30.58 
 
 		 497 aa  179  1e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.157408  normal  0.721299 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2459  type II/III secretion system protein  33.33 
 
 		 492 aa  179  1e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.478191  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3520  type II and III secretion system protein  30.39 
 
 		 480 aa  179  1e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.637726  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5683  putative pilus assembly protein cpaC  30.37 
 
 		 489 aa  178  2e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.182381 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4614  type II and III secretion system protein  31.28 
 
 		 595 aa  176  6e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.228192 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1727  type II and III secretion system protein  37.37 
 
 		 520 aa  175  1.9999999999999998e-42  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4200  type II and III secretion system protein  29.22 
 
 		 480 aa  175  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.599667  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2013  type II and III secretion system protein  30.77 
 
 		 478 aa  174  3.9999999999999995e-42  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2827  type II and III secretion system protein  31.28 
 
 		 494 aa  174  3.9999999999999995e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.59291  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2703  type II and III secretion system protein  32.41 
 
 		 499 aa  174  3.9999999999999995e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.523249  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0793  type II and III secretion system protein  30.36 
 
 		 571 aa  172  1e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.00997149  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2549  type II and III secretion system protein  31.9 
 
 		 514 aa  172  1e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.124732  normal  0.115348 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3487  type II and III secretion system protein  31.92 
 
 		 473 aa  171  2e-41  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0401415 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2346  type II and III secretion system protein  31.85 
 
 		 497 aa  171  2e-41  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.397877  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2360  type II and III secretion system protein  29.06 
 
 		 574 aa  170  4e-41  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2268  type II and III secretion system protein  32.28 
 
 		 679 aa  171  4e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.144495  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2384  type II and III secretion system protein  32.04 
 
 		 501 aa  171  4e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0712341  normal  0.0685536 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1519  type II and III secretion system protein  35.44 
 
 		 504 aa  170  5e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2960  type II/III secretion system protein  32.2 
 
 		 690 aa  169  1e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6292  type II and III secretion system protein  32.08 
 
 		 657 aa  169  1e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.260655  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2644  type II and III secretion system protein:transport-associated  33.02 
 
 		 633 aa  168  2e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.2628  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1312  phospholipid-binding domain-containing protein  31.81 
 
 		 690 aa  168  2e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0233  type II and III secretion system protein  32.99 
 
 		 491 aa  168  2e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2480  type II and III secretion system protein  32.33 
 
 		 502 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.906186 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0591  type II and III secretion system protein  32.58 
 
 		 663 aa  167  2.9999999999999998e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.341845  normal  0.0532026 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1079  type II and III secretion system protein  35.31 
 
 		 539 aa  167  2.9999999999999998e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.103165  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5321  type II and III secretion system protein  30.67 
 
 		 700 aa  167  5e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.293093  hitchhiker  0.00147308 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7201  Flp pilus assembly protein secretin CpaC  31.79 
 
 		 652 aa  167  5.9999999999999996e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.360081  normal  0.571499 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3085  type II/III secretion system protein  31.52 
 
 		 690 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2371  flp pilus assembly protein, secretin CpaC  30.26 
 
 		 483 aa  165  1.0000000000000001e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.463831  normal  0.668719 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0301  type II and III secretion system protein  28.41 
 
 		 493 aa  165  1.0000000000000001e-39  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5996  type II and III secretion system protein  31.46 
 
 		 656 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.344192  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>