260 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AFE_2551 on replicon NC_011761
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011761  AFE_2551  iron-sulfur cluster-binding protein  100 
 
 
239 aa  506  9.999999999999999e-143  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.802978  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2212  heterodisulfide reductase subunit C  70.89 
 
 
238 aa  365  1e-100  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0191178  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0636  iron-sulfur cluster-binding protein  69.2 
 
 
238 aa  357  9.999999999999999e-98  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.126769 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1078  heterodisulfide reductase subunit C  36.36 
 
 
253 aa  183  2.0000000000000003e-45  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.114051  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2103  heterodisulfide reductase subunit C (HdrC-2)  34.84 
 
 
230 aa  131  7.999999999999999e-30  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.666222  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1543  heterodisulfide reductase subunit C-like protein  32.58 
 
 
230 aa  125  7e-28  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.0154389 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0968  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  29.77 
 
 
437 aa  77.4  0.0000000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.405818  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1574  putative heterodisulfide reductase, C subunit  31.61 
 
 
174 aa  75.5  0.0000000000008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0633  putative heterodisulfide reductase, C subunit  27.27 
 
 
200 aa  71.2  0.00000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1351  heterodisulfide reductase, C subunit  25.27 
 
 
193 aa  71.2  0.00000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.452628 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0358  putative heterodisulfide reductase, C subunit  25.83 
 
 
187 aa  71.2  0.00000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3675  putative heterodisulfide reductase, C subunit  28.03 
 
 
195 aa  70.5  0.00000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.141926 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2344  putative heterodisulfide reductase, C subunit  27.82 
 
 
188 aa  70.5  0.00000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.628999  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0820  putative heterodisulfide reductase, C subunit  28.78 
 
 
192 aa  70.9  0.00000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.123 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1196  heterodisulfide reductase, C subunit  30.08 
 
 
184 aa  70.1  0.00000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0809  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  28.8 
 
 
190 aa  66.6  0.0000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000061408 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1783  hypothetical protein  36.56 
 
 
386 aa  65.9  0.0000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0563  putative heterodisulfide reductase, C subunit  36.36 
 
 
211 aa  65.9  0.0000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1161  heterodisulfide reductase subunit C-like protein  25.16 
 
 
203 aa  65.5  0.0000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.860285  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0239  hypothetical protein  31.87 
 
 
194 aa  65.1  0.0000000009  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.577493 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1646  heterodisulfide reductase subunit C  26.49 
 
 
210 aa  64.7  0.000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0261138  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1207  heterodisulfide reductase, C subunit  26.02 
 
 
204 aa  64.7  0.000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1325  heterodisulfide reductase, C subunit  27.56 
 
 
188 aa  64.3  0.000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0394  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  28.31 
 
 
189 aa  63.9  0.000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00274296  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0848  heterodisulfide reductase, C subunit  27.05 
 
 
202 aa  63.2  0.000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.12259  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0625  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  31.87 
 
 
193 aa  63.5  0.000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0765561  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2098  heterodisulfide reductase, C subunit  27.01 
 
 
193 aa  62.8  0.000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1001  heterodisulfide reductase, putative  26.87 
 
 
398 aa  62.4  0.000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.284636  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1700  putative heterodisulfide reductase, C subunit  29.06 
 
 
193 aa  62.4  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000309238 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1882  heterodisulfide reductase subunit C  25.53 
 
 
195 aa  62.4  0.000000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1836  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  31.48 
 
 
191 aa  62  0.000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.139025  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0032  heterodisulfide reductase subunit  28.57 
 
 
194 aa  62  0.000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0826  heterodisulfide reductase, C subunit  25.3 
 
 
186 aa  62  0.000000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.185232  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0035  heterodisulfide reductase, putative  30.43 
 
 
393 aa  61.6  0.00000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000417872  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1834  heterodisulfide reductase, putative  30.43 
 
 
391 aa  60.8  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0759481  normal  0.0501032 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1582  heterodisulfide reductase, putative  36 
 
 
392 aa  60.8  0.00000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00374998  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3524  heterodisulfide reductase, C subunit  27.89 
 
 
185 aa  60.8  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0439  heterodisulfide reductase subunit C-like  32.93 
 
 
156 aa  60.5  0.00000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1806  heterodisulfide reductase, C subunit  30.95 
 
 
189 aa  60.5  0.00000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.577988 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2125  heterodisulfide reductase, transmembrane subunit, putative  29.03 
 
 
393 aa  60.8  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2241  CoB/CoM heterodisulfide reductase, subunit C  31.07 
 
 
194 aa  60.1  0.00000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0469153  normal  0.0166067 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2896  heterodisulfide reductase, transmembrane subunit, putative  34.21 
 
 
384 aa  60.1  0.00000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.217971 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0031  heterodisulfide reductase subunit  27.78 
 
 
194 aa  59.7  0.00000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2133  heterodisulfide reductase, transmembrane subunit, putative  28.97 
 
 
384 aa  58.9  0.00000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.411689  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1108  heterodisulfide reductase, subunit C/succinate dehydrogenase, subunit C  29.61 
 
 
502 aa  58.9  0.00000008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.785263  normal  0.633567 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0590  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  32.14 
 
 
193 aa  58.9  0.00000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.321199  normal  0.0726 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1176  hypothetical protein  31.73 
 
 
375 aa  58.5  0.00000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.390877 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17750  hypothetical protein  26.02 
 
 
204 aa  57.8  0.0000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3574  Heterodisulfide reductase subunit C-like protein  34.48 
 
 
202 aa  57.8  0.0000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0861  heterodisulfide reductase subunit  27.34 
 
 
194 aa  57.8  0.0000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1734  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  28.71 
 
 
385 aa  57  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0151  heterodisulfide reductase subunit C-like protein  27.94 
 
 
192 aa  57.4  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1348  heterodisulfide reductase, C subunit  28.57 
 
 
192 aa  57.4  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.511519 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3581  heterodisulfide reductase subunit C-like protein  28.48 
 
 
192 aa  57.4  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0322  heterodisulfide reductase, C subunit  24.83 
 
 
186 aa  57.8  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.554815 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0092  heterodisulfide reductase subunit  27.56 
 
 
182 aa  57  0.0000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3201  heterodisulfide reductase, transmembrane subunit, putative  32.89 
 
 
408 aa  56.6  0.0000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1201  CoB--CoM heterodisulfide reductase  26.61 
 
 
508 aa  55.8  0.0000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0710444  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1335  heterodisulfide reductase, C subunit  26.02 
 
 
177 aa  55.5  0.0000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1028  heterodisulfide reductase, subunit C/succinate dehydrogenase, subunit C  30.32 
 
 
502 aa  55.5  0.0000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00356665  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1113  heterodisulfide reductase, transmembrane subunit, putative  26.17 
 
 
384 aa  55.5  0.0000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0397617  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1452  hypothetical protein  26.13 
 
 
412 aa  55.5  0.0000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.275657 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1963  quinone-interacting membrane-bound oxidoreductase complex subunit C  24.53 
 
 
407 aa  55.5  0.0000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00829701 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1252  heterodisulfide reductase subunit C-like protein  32.08 
 
 
160 aa  55.5  0.0000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2317  heterodisulfide reductase subunit C  23.26 
 
 
213 aa  55.5  0.0000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3424  heterodisulfide reductase subunit  26.77 
 
 
216 aa  55.1  0.000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0198  heterodisulfide reductase subunit C  22.48 
 
 
213 aa  54.7  0.000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4092  heterodisulfide reductase subunit C-like  32.94 
 
 
148 aa  54.7  0.000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.737599  normal  0.409471 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1261  CoB--CoM heterodisulfide reductase  27.46 
 
 
502 aa  54.7  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1077  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  26.03 
 
 
382 aa  55.1  0.000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0184362  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0539  CoB--CoM heterodisulfide reductase subunit C  31.71 
 
 
184 aa  53.1  0.000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.214937  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0308  CoB--CoM heterodisulfide reductase  31.71 
 
 
184 aa  53.1  0.000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1604  CoB--CoM heterodisulfide reductase, subunit C  31.71 
 
 
184 aa  53.1  0.000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.455044  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0377  CoB--CoM heterodisulfide reductase  31.71 
 
 
184 aa  53.1  0.000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1307  CoB--CoM heterodisulfide reductase  26.98 
 
 
497 aa  51.6  0.00001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1436  Heterodisulfide reductase subunit C-like protein  33.33 
 
 
533 aa  51.2  0.00001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.695739  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0911  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  30.68 
 
 
367 aa  51.2  0.00001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0417  putative heterodisulfide reductase, C subunit  23.81 
 
 
194 aa  51.2  0.00001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.344766 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2663  Heterodisulfide reductase subunit C-like protein  30.14 
 
 
129 aa  51.6  0.00001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0414  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  29.17 
 
 
451 aa  50.4  0.00002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.137763 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0771  oxidoreductase, selenocysteine-containing  27.17 
 
 
432 aa  50.1  0.00003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.457197  normal  0.324635 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0676  succinate dehydrogenase iron-sulfur subunit  26.53 
 
 
319 aa  49.7  0.00004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0212132  hitchhiker  0.00094044 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1029  succinate dehydrogenase/fumarate reductase subunit B  23.97 
 
 
325 aa  49.3  0.00005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.77588  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3531  DNA binding domain-containing protein  30.95 
 
 
308 aa  49.3  0.00005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.635038  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0093  hypothetical protein  29.49 
 
 
423 aa  49.3  0.00006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0312  oxidoreductase  22.56 
 
 
1188 aa  48.9  0.00007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1789  FAD linked oxidase domain protein  24.36 
 
 
1183 aa  48.9  0.00007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0377487  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0975  heterodisulfide reductase subunit C-like protein  32.22 
 
 
133 aa  48.5  0.00008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.826747  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1269  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  34.92 
 
 
464 aa  48.5  0.00009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1884  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  26.88 
 
 
402 aa  48.1  0.0001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.561608  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1337  hypothetical protein  28.92 
 
 
464 aa  47.8  0.0001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3010  protein of unknown function DUF162  28.92 
 
 
464 aa  47.8  0.0001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000125194 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1131  FAD linked oxidase domain protein  22.44 
 
 
1197 aa  48.1  0.0001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0142  hypothetical protein  37.29 
 
 
418 aa  47.8  0.0001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1351  hypothetical protein  28.92 
 
 
464 aa  47.8  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1374  hypothetical protein  27.71 
 
 
465 aa  47  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.817438 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1953  heterodisulfide reductase subunit HdrC  26.67 
 
 
236 aa  47.4  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1282  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  24.72 
 
 
416 aa  47.4  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.438227 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0307  CoB--CoM heterodisulfide reductase  30.43 
 
 
196 aa  47.8  0.0002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.802269  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2341  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  29.76 
 
 
439 aa  47  0.0002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>