31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AFE_2438 on replicon NC_011761
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011761  AFE_2438  hypothetical protein  100 
 
 		 94 aa  192  2e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.386115  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2065  hypothetical protein  100 
 
 		 87 aa  176  7e-44  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.66458  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0168  hypothetical protein  83.91 
 
 		 87 aa  138  3e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1333  hypothetical protein  52.17 
 
 		 126 aa  62  0.000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.280525  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0935  hypothetical protein  42.05 
 
 		 98 aa  62  0.000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0219  hypothetical protein  50 
 
 		 148 aa  57.4  0.00000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0430  hypothetical protein  42.17 
 
 		 121 aa  56.6  0.0000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2741  hypothetical protein  42.5 
 
 		 78 aa  55.1  0.0000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.389873  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1384  hypothetical protein  37.97 
 
 		 106 aa  52.4  0.000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.958099  normal  0.904414 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0768  hypothetical protein  48.08 
 
 		 82 aa  52.8  0.000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.653371  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1280  hypothetical protein  41.33 
 
 		 121 aa  51.6  0.000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.381602  normal  0.240196 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1579  hypothetical protein  36.67 
 
 		 74 aa  50.1  0.00001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2561  hypothetical protein  42.86 
 
 		 109 aa  47  0.00008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_2969  hypothetical protein  43.94 
 
 		 89 aa  47  0.00009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0648  hypothetical protein  42.19 
 
 		 68 aa  46.2  0.0001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0211  hypothetical protein  40 
 
 		 79 aa  46.6  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.334507  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0713  hypothetical protein  32.53 
 
 		 76 aa  46.2  0.0001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000015115  normal  0.0462479 
 
 
-
 
NC_002936  DET0952  hypothetical protein  32.89 
 
 		 80 aa  46.6  0.0001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1109  hypothetical protein  36.78 
 
 		 75 aa  45.8  0.0002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0251692  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2278  hypothetical protein  31.52 
 
 		 122 aa  46.2  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.529766  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1380  hypothetical protein  41.18 
 
 		 76 aa  45.4  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.480252  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1115  hypothetical protein  45.71 
 
 		 81 aa  45.4  0.0003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1408  hypothetical protein  38.03 
 
 		 114 aa  45.1  0.0004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0906  hypothetical protein  40.32 
 
 		 120 aa  45.1  0.0004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  decreased coverage  0.000104891  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2159  hypothetical protein  33.33 
 
 		 85 aa  43.1  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.518894  normal  0.0709956 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3542  hypothetical protein  39.53 
 
 		 137 aa  43.1  0.001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3636  hypothetical protein  41.54 
 
 		 94 aa  42.4  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0192  hypothetical protein  32.91 
 
 		 81 aa  42  0.003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.345827  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0836  hypothetical protein  31.43 
 
 		 84 aa  42  0.003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00160  predicted membrane protein  34.85 
 
 		 85 aa  41.6  0.003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000356401  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_823  hypothetical protein  34.29 
 
 		 84 aa  40.4  0.007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>