More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AFE_2312 on replicon NC_011761
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011206  Lferr_1953  sugar transporter  100 
 
 
452 aa  878    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.288052  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2312  sugar transporter family protein  100 
 
 
452 aa  878    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.588743  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0468  sugar transporter  64.24 
 
 
447 aa  534  1e-150  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3661  sugar transporter  45.87 
 
 
480 aa  360  3e-98  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1731  D-xylose-proton symporter  45.41 
 
 
463 aa  348  1e-94  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0456  D-xylose-proton symporter  45.19 
 
 
463 aa  347  3e-94  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4102  sugar transporter  42.63 
 
 
477 aa  343  2.9999999999999997e-93  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3220  sugar transporter  45.06 
 
 
468 aa  330  3e-89  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.681904 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4403  sugar transporter  41.07 
 
 
492 aa  323  5e-87  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.92249  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0183  sugar transporter  41.11 
 
 
474 aa  292  7e-78  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.447711  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0757  sugar transporter  38.55 
 
 
448 aa  292  8e-78  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0214435  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36280  MFS transporter, sugar porter family  38.88 
 
 
468 aa  290  3e-77  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3108  sugar transporter  39.16 
 
 
480 aa  289  8e-77  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.934005  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0710  sugar transporter  38.03 
 
 
476 aa  288  2e-76  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.148606 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0959  sugar transporter  39.04 
 
 
472 aa  287  2.9999999999999996e-76  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1160  sugar transporter  37.25 
 
 
468 aa  285  2.0000000000000002e-75  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0565582  hitchhiker  0.000112742 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0752  sugar transporter  37.81 
 
 
464 aa  284  3.0000000000000004e-75  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.718529  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3085  galactose-proton symporter  37.81 
 
 
464 aa  282  7.000000000000001e-75  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0156709  hitchhiker  0.000187462 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3375  galactose-proton symporter  37.81 
 
 
464 aa  282  7.000000000000001e-75  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0771  sugar transporter  37.81 
 
 
464 aa  282  7.000000000000001e-75  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00259481  hitchhiker  0.000457793 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02736  hypothetical protein  37.81 
 
 
464 aa  282  7.000000000000001e-75  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.39424  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3101  galactose-proton symporter  37.81 
 
 
464 aa  282  7.000000000000001e-75  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02773  D-galactose transporter  37.81 
 
 
464 aa  282  7.000000000000001e-75  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.255079  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3286  galactose-proton symporter  37.81 
 
 
464 aa  282  7.000000000000001e-75  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.583808  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4246  galactose-proton symporter  37.72 
 
 
464 aa  281  1e-74  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.487781  normal  0.587718 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3434  galactose-proton symporter  37.81 
 
 
464 aa  281  2e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.444066  normal  0.014218 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3338  galactose-proton symporter  37.81 
 
 
464 aa  281  2e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.0071419  normal  0.395807 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3254  galactose-proton symporter  37.81 
 
 
464 aa  281  2e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000516746  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3265  galactose-proton symporter  37.81 
 
 
464 aa  281  2e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0111445  normal  0.101317 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3330  galactose-proton symporter  37.81 
 
 
464 aa  281  2e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.00323998  normal  0.618679 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2754  sugar transporter  37.04 
 
 
497 aa  278  1e-73  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8679  sugar transporter  38.36 
 
 
533 aa  276  5e-73  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.546222  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0464  hypothetical protein  40 
 
 
473 aa  276  5e-73  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1682  D-xylose proton-symporter  38.15 
 
 
458 aa  275  1.0000000000000001e-72  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000961132  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0488  hypothetical protein  40.09 
 
 
473 aa  275  1.0000000000000001e-72  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1394  sugar transporter  37.22 
 
 
452 aa  273  6e-72  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3294  sugar transporter  35.84 
 
 
471 aa  272  1e-71  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.534261 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3347  sugar transporter  35.68 
 
 
465 aa  271  2e-71  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0767559  decreased coverage  0.00268397 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4271  D-xylose transporter XylE  36.79 
 
 
491 aa  268  1e-70  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03863  hypothetical protein  37 
 
 
491 aa  268  2e-70  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02650  hypothetical protein  35.02 
 
 
472 aa  268  2e-70  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3998  D-xylose transporter XylE  37 
 
 
491 aa  268  2e-70  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.688802  normal  0.586255 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02689  arabinose transporter  35.02 
 
 
472 aa  268  2e-70  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03903  D-xylose transporter  37 
 
 
491 aa  268  2e-70  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3965  sugar transporter  37 
 
 
491 aa  268  2e-70  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5512  D-xylose transporter XylE  37 
 
 
491 aa  268  2e-70  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0105  sugar transporter  38.27 
 
 
482 aa  267  2.9999999999999995e-70  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3868  sugar transporter  36.18 
 
 
450 aa  266  4e-70  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3232  L-arabinose/proton symport protein  35.68 
 
 
472 aa  266  4e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.852071  hitchhiker  0.0000142975 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3021  arabinose-proton symporter  35.02 
 
 
472 aa  266  5e-70  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3162  arabinose-proton symporter  35.02 
 
 
472 aa  266  5.999999999999999e-70  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.839771  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2988  arabinose-proton symporter  35.02 
 
 
472 aa  266  5.999999999999999e-70  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.993393  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0849  sugar transporter  35.02 
 
 
472 aa  266  5.999999999999999e-70  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0874  sugar transporter  35.02 
 
 
472 aa  266  5.999999999999999e-70  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2989  arabinose-proton symporter  35.02 
 
 
472 aa  266  8e-70  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0609314 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3184  L-arabinose/proton symport protein  35.46 
 
 
472 aa  265  1e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3166  L-arabinose/proton symport protein  35.46 
 
 
472 aa  265  1e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4582  D-xylose transporter XylE  36.79 
 
 
491 aa  265  1e-69  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3348  L-arabinose/proton symport protein  35.46 
 
 
472 aa  265  1e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.110273 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3247  L-arabinose/proton symport protein  35.46 
 
 
472 aa  265  1e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000138124 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4110  arabinose-proton symporter  34.8 
 
 
472 aa  264  2e-69  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000412167 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4418  D-xylose transporter XylE  36.48 
 
 
491 aa  265  2e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00317086 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2334  major facilitator superfamily protein  35.22 
 
 
446 aa  264  3e-69  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0388  sugar transporter  37.72 
 
 
472 aa  263  4e-69  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.535327 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1578  sugar transporter  37.22 
 
 
466 aa  262  8.999999999999999e-69  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0295  metabolite transport protein  34.72 
 
 
482 aa  258  2e-67  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3612  sugar transporter  36.22 
 
 
475 aa  256  4e-67  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3184  sugar transporter  33.56 
 
 
441 aa  256  8e-67  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.137091  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0118  sugar transporter  36.53 
 
 
480 aa  255  1.0000000000000001e-66  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1363  sugar transporter family protein  34.13 
 
 
473 aa  255  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.498359  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0944  sugar transporter  35.31 
 
 
480 aa  254  2.0000000000000002e-66  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1174  sugar transporter  34.06 
 
 
473 aa  254  3e-66  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.63081 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0827  sugar transporter  35.2 
 
 
450 aa  252  8.000000000000001e-66  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1773  sugar transporter  37.35 
 
 
491 aa  252  9.000000000000001e-66  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0128  D-xylose proton-symporter  35.12 
 
 
484 aa  251  1e-65  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0489745  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0368  sugar transporter  34 
 
 
448 aa  250  4e-65  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.968703  hitchhiker  0.00000305958 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0853  D-xylose proton-symporter  35.63 
 
 
459 aa  249  6e-65  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1053  sugar transporter  35.32 
 
 
430 aa  249  1e-64  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.55252 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0824  sugar transporter  42 
 
 
456 aa  248  1e-64  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08400  MFS sugar transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G06730)  34.27 
 
 
561 aa  247  4e-64  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1728  sugar transporter  35.9 
 
 
468 aa  246  6.999999999999999e-64  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0944862  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4863  sugar transporter  34.31 
 
 
464 aa  246  8e-64  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.83447 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0526  sugar transporter  33.18 
 
 
457 aa  243  6e-63  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.637088  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0479  sugar transporter  34.24 
 
 
471 aa  242  7.999999999999999e-63  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000749242  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1599  sugar transporter  33.78 
 
 
444 aa  242  7.999999999999999e-63  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.846588  normal  0.510793 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1756  arabinose efflux permease  36.34 
 
 
516 aa  242  1e-62  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3727  sugar transporter  34.04 
 
 
466 aa  241  2.9999999999999997e-62  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0478  D-xylose proton-symporter  32.61 
 
 
480 aa  240  2.9999999999999997e-62  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2900  sugar transporter  36.12 
 
 
475 aa  239  5e-62  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.407104  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2102  sugar transporter  34 
 
 
457 aa  240  5e-62  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.612346 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3592  sugar transporter  33.71 
 
 
442 aa  238  1e-61  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0369851  hitchhiker  0.00000823269 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7188  sugar transporter  35.21 
 
 
438 aa  234  2.0000000000000002e-60  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07938  conserved hypothetical protein  31.81 
 
 
561 aa  233  4.0000000000000004e-60  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1514  sugar transporter  33.85 
 
 
474 aa  233  7.000000000000001e-60  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00665244  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3340  sugar transporter  34.28 
 
 
504 aa  233  8.000000000000001e-60  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.652825  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1952  sugar transporter  33.04 
 
 
482 aa  232  1e-59  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41890  MFS family sugar transporter  34.47 
 
 
449 aa  231  3e-59  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1624  hypothetical protein  34.34 
 
 
471 aa  230  4e-59  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4230  sugar transporter  33.85 
 
 
467 aa  230  5e-59  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4020  sugar transporter  32.74 
 
 
480 aa  229  9e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.997993 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>