245 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AFE_2251 on replicon NC_011761
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011206  Lferr_1899  Pyrrolo-quinoline quinone  100 
 
 		 395 aa  813    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.70821 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2251  PQQ enzyme repeat domain protein  100 
 
 		 395 aa  813    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4041  serine/threonine protein kinase  26.81 
 
 		 774 aa  112  1.0000000000000001e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.224391  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1465  protein kinase  24.78 
 
 		 653 aa  107  4e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.355835  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2164  serine/threonine protein kinase  24.1 
 
 		 652 aa  105  2e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.563698  hitchhiker  0.00000786383 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0677  Pyrrolo-quinoline quinone  27.4 
 
 		 431 aa  102  1e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.350335  normal  0.177219 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4514  Pyrrolo-quinoline quinone  25.71 
 
 		 445 aa  102  1e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3730  serine/threonine protein kinase  24.85 
 
 		 687 aa  101  2e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00433941 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3290  serine/threonine protein kinase  28.87 
 
 		 963 aa  99.4  9e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0556916 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5123  Pyrrolo-quinoline quinone  26.94 
 
 		 475 aa  98.2  2e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.513174  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1990  Pyrrolo-quinoline quinone  27.78 
 
 		 463 aa  97.1  5e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0697  Pyrrolo-quinoline quinone  30.77 
 
 		 415 aa  96.3  8e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4167  Pyrrolo-quinoline quinone  25.98 
 
 		 432 aa  95.9  1e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.275915 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1643  Pyrrolo-quinoline quinone  32.38 
 
 		 457 aa  91.7  2e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0609  Pyrrolo-quinoline quinone  25.86 
 
 		 352 aa  90.1  6e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.471438  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3300  serine/threonine protein kinase  25.8 
 
 		 795 aa  88.6  2e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3898  Pyrrolo-quinoline quinone  25.14 
 
 		 423 aa  88.6  2e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.122997  normal  0.375271 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6658  metallophosphoesterase  31.61 
 
 		 616 aa  87.8  3e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.492609 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1455  Pyrrolo-quinoline quinone  25.98 
 
 		 1454 aa  86.3  9e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1593  metallophosphoesterase  26.91 
 
 		 611 aa  84.7  0.000000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.245606 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2189  Pyrrolo-quinoline quinone  27.31 
 
 		 484 aa  77.8  0.0000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.718843 
 
 
-
 
NC_002936  DET1041  PQQ repeat-containing protein  25.99 
 
 		 371 aa  74.7  0.000000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.331576  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2056  Pyrrolo-quinoline quinone  26.37 
 
 		 705 aa  73.6  0.000000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.9756  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2694  Pyrrolo-quinoline quinone  25.75 
 
 		 450 aa  73.6  0.000000000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  hitchhiker  0.00958514  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5726  WD40-like repeat-domain-containing protein  24.47 
 
 		 901 aa  73.2  0.000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2941  Pyrrolo-quinoline quinone  24.91 
 
 		 396 aa  72.8  0.00000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.324041  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0878  cobaltochelatase  25.6 
 
 		 1812 aa  72  0.00000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3526  Pyrrolo-quinoline quinone  22.51 
 
 		 514 aa  70.9  0.00000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.103878  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_911  PQQ enzyme repeat domain protein  26.26 
 
 		 371 aa  70.9  0.00000000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00179441  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0210  Pyrrolo-quinoline quinone  25.18 
 
 		 397 aa  69.7  0.00000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0137  Pyrrolo-quinoline quinone  25.46 
 
 		 481 aa  68.9  0.0000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3730  Pyrrolo-quinoline quinone  25.71 
 
 		 383 aa  67.4  0.0000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.109503  normal  0.588424 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2698  putative quinoprotein  26.06 
 
 		 448 aa  67  0.0000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.578773  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0923  Pyrrolo-quinoline quinone  23.59 
 
 		 371 aa  66.6  0.0000000007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00190176  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0262  Pyrrolo-quinoline quinone  24.69 
 
 		 407 aa  66.2  0.0000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1355  Pyrrolo-quinoline quinone  26.06 
 
 		 454 aa  66.2  0.0000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.464809  normal  0.026391 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3588  Pyrrolo-quinoline quinone  24.75 
 
 		 389 aa  65.9  0.000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.909345  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_3012  Pyrrolo-quinoline quinone  24 
 
 		 382 aa  65.9  0.000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.345618  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1397  serine/threonine protein kinase  22.03 
 
 		 643 aa  65.1  0.000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.323701  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0271  Pyrrolo-quinoline quinone  27.24 
 
 		 445 aa  65.5  0.000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.943298 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0685  hypothetical protein  23.4 
 
 		 387 aa  64.7  0.000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000893693  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2197  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  27.14 
 
 		 385 aa  64.7  0.000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.763782  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3570  Pyrrolo-quinoline quinone  21.78 
 
 		 451 aa  64.3  0.000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3390  hypothetical protein  25.75 
 
 		 487 aa  63.9  0.000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000496951  normal  0.136227 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0655  Pyrrolo-quinoline quinone  23.4 
 
 		 402 aa  63.5  0.000000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.808652  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1121  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  26.37 
 
 		 393 aa  63.5  0.000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2664  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  24.16 
 
 		 392 aa  63.2  0.000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.280231 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1435  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  24.29 
 
 		 395 aa  62.8  0.000000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00436536  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0821  Pyrrolo-quinoline quinone  26 
 
 		 372 aa  63.2  0.000000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.403647  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4249  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  27.9 
 
 		 414 aa  62.8  0.00000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.548158  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1446  Pyrrolo-quinoline quinone  22.3 
 
 		 412 aa  62.4  0.00000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0128  serine/threonine protein kinase  25.75 
 
 		 611 aa  62.8  0.00000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.178932  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1547  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  25.23 
 
 		 395 aa  62.8  0.00000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00611389  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1308  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  22.22 
 
 		 395 aa  61.6  0.00000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000307899  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1499  hypothetical protein  23.87 
 
 		 384 aa  62  0.00000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1484  hypothetical protein  23.55 
 
 		 384 aa  62  0.00000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3006  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  24.12 
 
 		 392 aa  62  0.00000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.901484  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02404  protein assembly complex, lipoprotein component  24.6 
 
 		 392 aa  61.2  0.00000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.005806  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1156  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  24.6 
 
 		 392 aa  61.2  0.00000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00537914  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1165  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  24.6 
 
 		 392 aa  61.2  0.00000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.035422  normal  0.0264667 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2663  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  24.6 
 
 		 392 aa  61.2  0.00000003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000327746  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02366  hypothetical protein  24.6 
 
 		 392 aa  61.2  0.00000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0111233  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2887  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  24.35 
 
 		 392 aa  61.2  0.00000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00225508  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2796  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  24.6 
 
 		 392 aa  61.2  0.00000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000117492  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1261  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  26.37 
 
 		 393 aa  60.1  0.00000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.21096  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0877  Pyrrolo-quinoline quinone  23.41 
 
 		 797 aa  60.5  0.00000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1232  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  23.46 
 
 		 395 aa  60.5  0.00000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2671  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  24.35 
 
 		 392 aa  60.1  0.00000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2777  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  24.35 
 
 		 392 aa  60.1  0.00000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.985011  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2473  Pyrrolo-quinoline quinone  23.32 
 
 		 455 aa  60.1  0.00000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0010  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  24.17 
 
 		 391 aa  60.1  0.00000007  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.469712  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2758  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  24.35 
 
 		 392 aa  60.1  0.00000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.267883 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2714  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  24.35 
 
 		 392 aa  60.1  0.00000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.359129  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1293  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  22.63 
 
 		 395 aa  60.1  0.00000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.664438  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1114  Pyrrolo-quinoline quinone  24.07 
 
 		 374 aa  60.1  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0348875  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2734  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  25.11 
 
 		 393 aa  59.7  0.00000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3736  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  24.6 
 
 		 392 aa  59.7  0.00000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.550553  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2199  Pyrrolo-quinoline quinone  24.72 
 
 		 447 aa  59.3  0.0000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.839815  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3011  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  25.87 
 
 		 393 aa  58.9  0.0000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1661  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  25.75 
 
 		 402 aa  58.5  0.0000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.274941 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0030  Pyrrolo-quinoline quinone  30.43 
 
 		 499 aa  58.2  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.951716  normal  0.123126 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0029  tetrathionate hydrolase  30.43 
 
 		 499 aa  58.2  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1236  Pyrrolo-quinoline quinone  22.04 
 
 		 603 aa  58.5  0.0000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.140505  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1550  Pyrrolo-quinoline quinone  23.76 
 
 		 809 aa  58.2  0.0000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.183569  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1154  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  28.75 
 
 		 392 aa  57.4  0.0000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.536052 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1231  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  22.63 
 
 		 395 aa  57  0.0000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1899  Pyrrolo-quinoline quinone  26.21 
 
 		 398 aa  57.4  0.0000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000513554  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1531  Pyrrolo-quinoline quinone  28.78 
 
 		 546 aa  57  0.0000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.497288  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1302  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  22.63 
 
 		 395 aa  57  0.0000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1786  Pyrrolo-quinoline quinone  23.62 
 
 		 381 aa  57  0.0000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1991  cell surface protein  26.29 
 
 		 1311 aa  56.6  0.0000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.995987 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1062  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  28.12 
 
 		 392 aa  56.6  0.0000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2888  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  23.91 
 
 		 392 aa  56.6  0.0000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.597931  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3497  Pyrrolo-quinoline quinone  25.57 
 
 		 379 aa  56.6  0.0000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1437  PQQ repeat-containing protein  23.55 
 
 		 384 aa  55.8  0.000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.234341  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1259  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  23.05 
 
 		 395 aa  55.1  0.000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0514835  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3251  serine/threonine protein kinase  27.07 
 
 		 861 aa  55.5  0.000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0225262 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1189  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  23.48 
 
 		 393 aa  54.7  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0343666  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1296  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  23.48 
 
 		 393 aa  54.7  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1218  lipoprotein transmembrane  29.38 
 
 		 388 aa  54.7  0.000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.032892  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>