62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AFE_2246 on replicon NC_011761
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011206  Lferr_1896  hypothetical protein  100 
 
 		 201 aa  419  1e-116  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.649573 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2246  dsbG domain protein  100 
 
 		 201 aa  419  1e-116  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.119068  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1615  disulfide isomerase/thiol-disulfide oxidase  38.92 
 
 		 178 aa  130  2.0000000000000002e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.110652  hitchhiker  0.00109876 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1943  dsbG domain protein  38.92 
 
 		 225 aa  130  2.0000000000000002e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0209968  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3803  disulfide isomerase/thiol-disulfide oxidase  32.67 
 
 		 252 aa  87.4  1e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4237  disulfide isomerase/thiol-disulfide oxidase  32.65 
 
 		 252 aa  87  2e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.919377  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1627  disulfide isomerase/thiol-disulfide oxidase  32.65 
 
 		 252 aa  87  2e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.759797 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4610  disulfide isomerase/thiol-disulfide oxidase  32.05 
 
 		 276 aa  86.7  2e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3534  disulfide isomerase/thiol-disulfide oxidase  32.05 
 
 		 286 aa  86.7  2e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4241  disulfide isomerase/thiol-disulfide oxidase  32.89 
 
 		 268 aa  85.9  4e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.147962  normal  0.143049 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2762  disulfide isomerase/thiol-disulfide oxidase  32.3 
 
 		 256 aa  84.3  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.194838  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32610  disulfide isomerase/thiol-disulfide oxidase  31.68 
 
 		 256 aa  82.8  0.000000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.347111  normal  0.0253122 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2787  disulfide isomerase/thiol-disulfide oxidase  32.48 
 
 		 254 aa  82.8  0.000000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.856388  normal  0.976704 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0452  hypothetical protein  37.01 
 
 		 203 aa  82.4  0.000000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.912774  hitchhiker  0.000257257 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0275  thiol:disulfide interchange domain protein  37.01 
 
 		 203 aa  82.4  0.000000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2228  hypothetical protein  30.41 
 
 		 208 aa  80.5  0.00000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1057  hypothetical protein  29.73 
 
 		 222 aa  78.6  0.00000000000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000413495  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2396  disulfide isomerase/thiol-disulfide oxidase  34.93 
 
 		 257 aa  77  0.0000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000025188  hitchhiker  0.0000223583 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05940  disulfide isomerase/thiol-disulfide oxidase  34.93 
 
 		 257 aa  75.5  0.0000000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00000139676  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1547  hypothetical protein  37.69 
 
 		 283 aa  74.3  0.000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00116305 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1872  thiol:disulfide interchange protein, putative  37.69 
 
 		 255 aa  74.3  0.000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0765  disulfide isomerase/thiol-disulfide oxidase  29.3 
 
 		 248 aa  73.6  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.527932 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1355  disulfide isomerase/thiol-disulfide oxidase  32.05 
 
 		 257 aa  71.6  0.000000000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.617458  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5854  protein-disulfide isomerase-like protein  33.85 
 
 		 333 aa  70.1  0.00000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1397  Fis family transcriptional regulator  26.97 
 
 		 272 aa  70.5  0.00000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.837797  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1018  thiol:disulfide interchange domain protein  44.59 
 
 		 182 aa  68.6  0.00000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.977804  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3020  disulfide isomerase/thiol-disulfide oxidase  30.28 
 
 		 248 aa  68.6  0.00000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00562  hypothetical protein  30.28 
 
 		 247 aa  68.6  0.00000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0306036  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3938  disulfide isomerase/thiol-disulfide oxidase  29.38 
 
 		 249 aa  68.6  0.00000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.450979  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00573  periplasmic disulfide isomerase/thiol-disulfide oxidase  30.28 
 
 		 253 aa  68.6  0.00000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.023443  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0656  disulfide isomerase/thiol-disulfide oxidase  30.28 
 
 		 248 aa  68.6  0.00000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3039  disulfide isomerase/thiol-disulfide oxidase  30.28 
 
 		 248 aa  68.6  0.00000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0690  disulfide isomerase/thiol-disulfide oxidase  30.28 
 
 		 248 aa  68.2  0.00000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.678233  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0625  disulfide isomerase/thiol-disulfide oxidase  30.28 
 
 		 268 aa  68.2  0.00000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4182  disulfide isomerase/thiol-disulfide oxidase  29.77 
 
 		 251 aa  67  0.0000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0625  disulfide isomerase/thiol-disulfide oxidase  29.58 
 
 		 248 aa  65.9  0.0000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2396  thiol:disulfide interchange protein  29.93 
 
 		 280 aa  65.9  0.0000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.903284  normal  0.517846 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2031  disulfide isomerase/thiol-disulfide oxidase  27.91 
 
 		 253 aa  64.7  0.0000000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.251459 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2594  disulfide isomerase/thiol-disulfide oxidase  27.4 
 
 		 255 aa  63.9  0.000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.67724  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0704  disulfide isomerase/thiol-disulfide oxidase  29.3 
 
 		 248 aa  63.9  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.970694  normal  0.0618042 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0660  disulfide isomerase/thiol-disulfide oxidase  29.3 
 
 		 268 aa  63.9  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0719  disulfide isomerase/thiol-disulfide oxidase  29.3 
 
 		 268 aa  63.9  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.635315  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0646  disulfide isomerase/thiol-disulfide oxidase  29.3 
 
 		 248 aa  63.5  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1085  thiol:disulfide interchange domain protein  28.91 
 
 		 274 aa  58.5  0.00000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.00153173  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2291  Ankyrin  26.16 
 
 		 533 aa  55.1  0.0000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2302  Ankyrin  26.49 
 
 		 530 aa  53.1  0.000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.70161  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2560  hypothetical protein  32.48 
 
 		 302 aa  51.2  0.000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.883741 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2947  thiol:disulfide interchange protein DsbG, putative  32.48 
 
 		 302 aa  51.2  0.000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1075  hypothetical protein  27.14 
 
 		 372 aa  51.2  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.00702033  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2299  hypothetical protein  31.25 
 
 		 399 aa  49.7  0.00003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.441757  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2037  Disulphide bond isomerase, DsbC/G-like protein  23.7 
 
 		 255 aa  48.5  0.00007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.672217  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4214  hypothetical protein  26.57 
 
 		 301 aa  47.8  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000071573  normal  0.744992 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1335  hypothetical protein  23.31 
 
 		 161 aa  46.6  0.0002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.919795  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0514  thiol:disulfide interchange protein DsbG  27.27 
 
 		 122 aa  46.6  0.0003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2892  thiol:disulfide interchange protein  30.2 
 
 		 248 aa  45.8  0.0005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2768  thiol:disulfide interchange protein  30.25 
 
 		 248 aa  45.8  0.0005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.342173 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3134  putative thiol:disulfide interchange protein  30.25 
 
 		 248 aa  45.8  0.0005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.649028 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3811  hypothetical protein  23.36 
 
 		 193 aa  44.3  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.408305  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2103  Disulphide bond isomerase, DsbC/G-like protein  27.78 
 
 		 237 aa  43.5  0.002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.84966 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1066  thiol:disulfide interchange protein  23.23 
 
 		 261 aa  42.4  0.005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000006488  n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2771  Disulphide bond isomerase, DsbC/G-like protein  27.69 
 
 		 254 aa  42  0.006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.756706  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1853  Fis family transcriptional regulator  35.94 
 
 		 201 aa  42  0.007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.70818 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>