169 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AFE_2216 on replicon NC_011761
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011761  AFE_2216  hypothetical protein  100 
 
 
189 aa  379  1e-104  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.660461  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1871  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  100 
 
 
189 aa  379  1e-104  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0919541  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0763  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  37.64 
 
 
188 aa  112  4.0000000000000004e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1881  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  42.98 
 
 
219 aa  84.3  9e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03462  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase (icmt) family  50.57 
 
 
90 aa  84  0.000000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0557  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  40 
 
 
189 aa  80.1  0.00000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.704301  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3272  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  40 
 
 
189 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.116299  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5096  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  40 
 
 
189 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.887346  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5186  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  40 
 
 
189 aa  80.1  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.012103  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6308  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  36.45 
 
 
214 aa  78.2  0.00000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2780  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  37.27 
 
 
199 aa  78.2  0.00000000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0802217  hitchhiker  0.0000249152 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4508  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  35.96 
 
 
189 aa  78.2  0.00000000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.142776  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5033  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  36.84 
 
 
189 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.46797  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1797  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  36.94 
 
 
203 aa  77  0.0000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4789  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  39.47 
 
 
219 aa  76.3  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13450  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  34.21 
 
 
212 aa  75.1  0.0000000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2179  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  40.52 
 
 
219 aa  74.7  0.0000000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0864264 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0028  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  38.26 
 
 
219 aa  73.9  0.000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0012  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  36.84 
 
 
219 aa  73.9  0.000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1856  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  39.66 
 
 
219 aa  73.9  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.144827 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5331  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  37.72 
 
 
219 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2022  hypothetical protein  39.66 
 
 
219 aa  72.8  0.000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.166485  normal  0.296374 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0208  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  36.84 
 
 
219 aa  71.2  0.000000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.427112 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1004  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  32.8 
 
 
202 aa  69.3  0.00000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.00191791  normal  0.0260384 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1952  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  33.04 
 
 
191 aa  68.9  0.00000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.771752 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3520  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  35.58 
 
 
196 aa  68.9  0.00000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.492872  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1271  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  36.56 
 
 
195 aa  68.2  0.00000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.189432  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3527  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  35.09 
 
 
217 aa  67.4  0.0000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.528255  normal  0.428685 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0501  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  29.63 
 
 
209 aa  66.6  0.0000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0781  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  35.14 
 
 
189 aa  66.2  0.0000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.225749  normal  0.571315 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4825  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  37.07 
 
 
219 aa  65.5  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.776236 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5417  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  37.07 
 
 
219 aa  65.5  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.481614  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5444  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  37.07 
 
 
219 aa  65.5  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.508922 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1321  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  33.86 
 
 
239 aa  62.8  0.000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6146  hypothetical protein  31.13 
 
 
207 aa  61.6  0.000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0971  normal  0.0597032 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2564  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  31.52 
 
 
230 aa  61.6  0.000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1746  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  28.48 
 
 
194 aa  61.2  0.000000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0275  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  31.72 
 
 
213 aa  61.2  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.6638  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3215  hypothetical protein  30.58 
 
 
232 aa  60.5  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.227676  normal  0.0561388 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1821  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  30 
 
 
195 aa  58.9  0.00000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.153367  normal  0.65944 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1182  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  38.94 
 
 
210 aa  58.5  0.00000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1085  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  34.94 
 
 
172 aa  58.5  0.00000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1887  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  39.77 
 
 
201 aa  57.8  0.00000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0866287  normal  0.479748 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0186  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  32.63 
 
 
218 aa  57.4  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2737  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  32.63 
 
 
218 aa  57.8  0.0000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0193  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  31.21 
 
 
229 aa  56.6  0.0000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.00375189  decreased coverage  0.000266905 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1436  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase family protein  33.87 
 
 
222 aa  56.6  0.0000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.878923  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0088  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  31.36 
 
 
202 aa  57  0.0000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11240  integral membrane protein  34.21 
 
 
224 aa  57  0.0000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000124394  normal  0.0612998 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6241  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  30.91 
 
 
225 aa  56.6  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1612  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  41.3 
 
 
225 aa  56.2  0.0000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.346803 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3090  hypothetical protein  34.4 
 
 
232 aa  55.8  0.0000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3970  protein-S-isoprenylcysteine methyltransferase  37.89 
 
 
209 aa  55.1  0.0000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5364  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  35.4 
 
 
220 aa  55.1  0.0000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1795  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  38.27 
 
 
219 aa  54.3  0.0000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.574866 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3999  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  36.08 
 
 
224 aa  54.3  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.147768  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1486  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  38.2 
 
 
221 aa  54.3  0.000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0410752  normal  0.390877 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4073  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  36.08 
 
 
224 aa  54.3  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.222565  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1904  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  41.49 
 
 
184 aa  53.9  0.000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.654377  hitchhiker  0.000324365 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2871  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  30.51 
 
 
195 aa  53.9  0.000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0257  hypothetical protein  33.65 
 
 
194 aa  53.5  0.000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5711  hypothetical protein  43.75 
 
 
253 aa  53.1  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4737  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  32.33 
 
 
196 aa  53.5  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5298  hypothetical protein  43.75 
 
 
253 aa  53.1  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.184703 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0233  hypothetical protein  33.65 
 
 
194 aa  53.5  0.000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0412  hypothetical protein  33.91 
 
 
241 aa  52.8  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.803611  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_60928  predicted protein  34.43 
 
 
243 aa  52.8  0.000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.20813  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1515  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase family protein  33.91 
 
 
241 aa  52.8  0.000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.135527  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1429  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase family protein  33.91 
 
 
241 aa  52.8  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1169  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase family protein  33.91 
 
 
241 aa  52.8  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.130278  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06162  Prenylcystein carboxymethyl transferase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q7SI75]  29.41 
 
 
322 aa  52.4  0.000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.423115  normal  0.603581 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0024  hypothetical protein  33.91 
 
 
238 aa  52.4  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1380  hypothetical protein  33.91 
 
 
238 aa  52.4  0.000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0411508  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0131  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  33.91 
 
 
230 aa  52.4  0.000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.436359  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1564  S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  31.71 
 
 
224 aa  52.4  0.000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.737038  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3663  hypothetical protein  42.5 
 
 
253 aa  52  0.000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0571  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  35.64 
 
 
207 aa  52  0.000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.537112  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1457  hypothetical protein  41.25 
 
 
248 aa  52  0.000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1477  hypothetical protein  41.25 
 
 
248 aa  52  0.000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4501  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  33.66 
 
 
224 aa  51.2  0.000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.843705 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5414  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  30.48 
 
 
245 aa  50.8  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.596503 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5094  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  29.33 
 
 
225 aa  51.2  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00443323 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2073  hypothetical protein  33.93 
 
 
214 aa  50.4  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2629  hypothetical protein  28.77 
 
 
221 aa  50.4  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4292  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  32.41 
 
 
158 aa  50.1  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.155454  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4050  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  40 
 
 
135 aa  50.1  0.00002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.207243  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1159  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  35.29 
 
 
172 aa  50.1  0.00002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.772846  hitchhiker  0.00322732 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5389  hypothetical protein  29.66 
 
 
219 aa  49.7  0.00003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0460462 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0909  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  29.63 
 
 
157 aa  49.3  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.651251  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4624  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  31.82 
 
 
237 aa  49.7  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.213452  normal  0.986486 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1321  Putative protein-S-isoprenylcysteine methyltransferase-like  33.33 
 
 
285 aa  49.3  0.00004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.6164  normal  0.122165 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2341  hypothetical protein  29.92 
 
 
221 aa  48.5  0.00005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4951  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  33 
 
 
158 aa  48.1  0.00007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.565064  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0537  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  26.06 
 
 
233 aa  48.1  0.00008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.386143 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4519  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  36.9 
 
 
222 aa  48.1  0.00008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.105752  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3366  S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  35.71 
 
 
153 aa  47.8  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3233  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  25.69 
 
 
201 aa  47.4  0.0001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000276448  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2540  putative protein-S-isoprenylcysteine methyltransferase-like  33.04 
 
 
233 aa  46.6  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2611  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  30.3 
 
 
176 aa  46.6  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.304902 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0024  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  40 
 
 
219 aa  47  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.740206 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>