More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AFE_2083 on replicon NC_011761
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011761  AFE_2083  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 
411 aa  838    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1740  glycosyl transferase group 1  100 
 
 
411 aa  838    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00163685 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2348  glycosyl transferase, group 1  66.5 
 
 
411 aa  563  1.0000000000000001e-159  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0363579  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3111  trehalose phosphorylase/synthase  64.88 
 
 
420 aa  546  1e-154  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0297  glycosyl transferase group 1  60.81 
 
 
411 aa  503  1e-141  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0129  glycosyl transferase, group 1  49.63 
 
 
397 aa  409  1e-113  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.730138  hitchhiker  0.000955625 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1359  glycosyl transferase, group 1  51.9 
 
 
402 aa  409  1e-113  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.254886 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0594  glycosyl transferase, group 1  50.12 
 
 
401 aa  403  1e-111  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0419  glycosyl transferase group 1  46.98 
 
 
413 aa  399  9.999999999999999e-111  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.102155  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0797  glycosyl transferase, group 1  50.75 
 
 
408 aa  398  1e-109  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1812  glycosyl transferase, group 1  46.27 
 
 
407 aa  356  5e-97  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0100815  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2023  glycosyl transferase, group 1  44.99 
 
 
442 aa  355  5.999999999999999e-97  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.755986  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1718  glycosyl transferase group 1  42.75 
 
 
433 aa  332  9e-90  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5908  glycosyl transferase group 1  42.75 
 
 
410 aa  327  2.0000000000000001e-88  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0528  glycosyl transferase, group 1  42.43 
 
 
406 aa  318  1e-85  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000105595  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0542  glycosyl transferase group 1  42.18 
 
 
406 aa  318  1e-85  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000128948  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1192  glycosyl transferase, group 1  45.57 
 
 
410 aa  317  3e-85  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3082  glycosyl transferase, group 1  43.78 
 
 
474 aa  316  5e-85  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2973  glycosyl transferase, group 1  42.61 
 
 
416 aa  314  1.9999999999999998e-84  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3832  glycosyl transferase group 1  43.5 
 
 
417 aa  306  5.0000000000000004e-82  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.672883  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1763  glycosyl transferase, group 1  40.45 
 
 
419 aa  305  7e-82  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.410209  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1592  glycosyl transferase, group 1  39.75 
 
 
414 aa  302  6.000000000000001e-81  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0955331  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1821  glycosyl transferase, group 1  37.69 
 
 
403 aa  288  2e-76  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0709671  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0427  glycosyl transferase group 1  41.58 
 
 
460 aa  284  2.0000000000000002e-75  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.049978  normal  0.496775 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0451  glycosyl transferase group 1  36.02 
 
 
406 aa  278  2e-73  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.340856  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1550  glycosyl transferase group 1  34.76 
 
 
398 aa  251  2e-65  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.267317  hitchhiker  0.0000000000000568319 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4094  glycosyl transferase group 1  34.62 
 
 
509 aa  202  9e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.108712  normal  0.0454094 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3637  glycosyl transferase group 1  33.9 
 
 
497 aa  189  8e-47  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.564588 
 
 
-
 
NC_006692  CNG04480  trehalose synthase, putative  29.11 
 
 
734 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_05021  trehalose synthase (Ccg-9), putative (AFU_orthologue; AFUA_3G12100)  29.47 
 
 
705 aa  112  1.0000000000000001e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1717  glycosyl transferase, group 1  39.18 
 
 
426 aa  71.2  0.00000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.21193  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1477  glycosyl transferase group 1  31.52 
 
 
406 aa  70.9  0.00000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1365  glycosyl transferase, group 1  30.81 
 
 
396 aa  69.3  0.0000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0275215  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4999  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.61 
 
 
367 aa  67.4  0.0000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01600  glycogen synthase  30.21 
 
 
404 aa  67  0.0000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1028  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.85 
 
 
380 aa  66.6  0.0000000008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1795  phosphoheptose isomerase  29.83 
 
 
650 aa  65.1  0.000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4504  glycogen synthase  29.84 
 
 
387 aa  65.5  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.746384 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4553  group 1 glycosyl transferase  28.64 
 
 
423 aa  64.7  0.000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5001  glycosyl transferase, group 1 family protein  22.82 
 
 
365 aa  63.9  0.000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2267  sucrose-phosphate phosphatase  27.24 
 
 
721 aa  63.2  0.000000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0311712  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0792  Fis family transcriptional regulator  27.93 
 
 
342 aa  63.2  0.000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2463  glycosyl transferase, group 1 family protein  40.44 
 
 
249 aa  62.8  0.00000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3727  glycosyl transferase group 1  29.77 
 
 
672 aa  62.4  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.121085  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0498  glycosyl transferase group 1  29.73 
 
 
378 aa  61.6  0.00000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5000  glycosyl transferase group 1  23.87 
 
 
389 aa  62.4  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.704682 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1445  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.82 
 
 
381 aa  60.8  0.00000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1417  glycosyltransferase  25.82 
 
 
381 aa  60.8  0.00000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1418  glycosyltransferase  25.82 
 
 
381 aa  60.8  0.00000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0766  glycosyl transferase, group 1  35.86 
 
 
339 aa  60.8  0.00000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1558  group 1 family glycosyl transferase  25.82 
 
 
381 aa  60.8  0.00000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4231  glycogen synthase  29.1 
 
 
382 aa  60.8  0.00000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.294207 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1131  glycosyl transferase group 1  28.24 
 
 
411 aa  60.8  0.00000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1702  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.82 
 
 
381 aa  60.8  0.00000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0208519  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0151  glycosyl transferase group 1  31.52 
 
 
434 aa  60.8  0.00000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1629  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.82 
 
 
381 aa  60.8  0.00000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.170146 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1593  glycosyl transferase, group 1  35 
 
 
403 aa  60.8  0.00000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0740  putative glycosyl transferase  30.77 
 
 
442 aa  60.5  0.00000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.053122  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0428  glycogen synthase  29.47 
 
 
404 aa  60.8  0.00000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.743156  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6261  putative glycosyl transferase  28.62 
 
 
392 aa  60.5  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.204873  normal  0.0540655 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0134  glycosyl transferase, group 1  32.97 
 
 
386 aa  60.5  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1822  glycogen synthase  32.49 
 
 
398 aa  60.1  0.00000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.222954 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3754  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.44 
 
 
381 aa  60.1  0.00000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0491  glycosyl transferase group 1  24.5 
 
 
867 aa  60.1  0.00000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2372  glycosyl transferase, group 1  32.02 
 
 
383 aa  60.1  0.00000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.732911  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1664  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.82 
 
 
381 aa  59.3  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1311  glycosyl transferase group 1  35.51 
 
 
426 aa  59.3  0.0000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3106  glycosyl transferase group 1  28.3 
 
 
382 aa  59.3  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.277853  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4001  glycogen synthase  28.57 
 
 
382 aa  59.3  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0312479  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2460  glycosyl transferase group 1  29.17 
 
 
381 aa  59.7  0.0000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1751  glycosyl transferase group 1  30.95 
 
 
453 aa  59.7  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4075  glycogen synthase  28.57 
 
 
382 aa  59.3  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0832432  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0304  putative glycosyl transferase  25.12 
 
 
426 aa  59.3  0.0000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10494  mannosyltransferase  32.95 
 
 
480 aa  58.9  0.0000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00261948  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2121  glycosyl transferase group 1  28.64 
 
 
375 aa  59.3  0.0000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0744  glycosyl transferase, group 1  30.81 
 
 
383 aa  58.9  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2808  glycosyl transferase group 1  26.91 
 
 
424 aa  58.5  0.0000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.255057 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1591  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.44 
 
 
381 aa  58.9  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1412  putative glycosyl transferases group 1  26.34 
 
 
389 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0331  glycosyl transferase, group 1  29.28 
 
 
482 aa  57.8  0.0000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1473  hypothetical protein  32.73 
 
 
383 aa  57.4  0.0000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.574733  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2727  glycosyl transferase, group 1  33.52 
 
 
401 aa  57.8  0.0000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1461  glycosyl transferase group 1  24.28 
 
 
381 aa  57.8  0.0000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.244211  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0212  glycogen synthase  29.32 
 
 
388 aa  57.4  0.0000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0567  glycosyl transferase group 1  24.66 
 
 
437 aa  57.4  0.0000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.923327  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0668  glycosyl transferase, group 1  27.17 
 
 
392 aa  57.4  0.0000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10750  glycosyltransferase  27.32 
 
 
399 aa  57.4  0.0000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.944872  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0868  glycosyl transferase group 1  26.29 
 
 
419 aa  57  0.0000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2087  UDP-N-acetylglucosamine  27.42 
 
 
424 aa  57  0.0000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3047  glycosyl transferase group 1  28.57 
 
 
374 aa  57  0.0000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.284334  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3402  glycosyl transferase group 1  26.16 
 
 
385 aa  57  0.0000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.838483  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0504  glycosyl transferase group 1  26.96 
 
 
391 aa  56.6  0.0000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2312  sucrose-phosphate synthase  26.16 
 
 
723 aa  56.6  0.0000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.407263 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3331  glycosyl transferase group 1  35.51 
 
 
343 aa  57  0.0000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30000  Glycosyl transferase, group 1 family protein  28.35 
 
 
370 aa  56.6  0.0000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2457  glycosyl transferase, group 1  26.24 
 
 
386 aa  56.6  0.0000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2112  glycogen synthase  32.81 
 
 
396 aa  56.6  0.0000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1538  glycosyl transferase, group 1  27.78 
 
 
379 aa  56.2  0.0000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0398  glycosyl transferase group 1  29.73 
 
 
448 aa  56.2  0.0000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.348364  hitchhiker  0.00367672 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2129  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 
364 aa  55.8  0.000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>