37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AFE_1981 on replicon NC_011761
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011206  Lferr_1649  Pyrrolo-quinoline quinone  100 
 
 		 486 aa  1001    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.000205987  normal  0.0168641 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1981  PQQ enzyme repeat protein  100 
 
 		 509 aa  1045    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0137  Pyrrolo-quinoline quinone  26.21 
 
 		 481 aa  128  2.0000000000000002e-28  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0030  Pyrrolo-quinoline quinone  24.27 
 
 		 499 aa  82.4  0.00000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.951716  normal  0.123126 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0029  tetrathionate hydrolase  24.27 
 
 		 499 aa  82.4  0.00000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05630  FOG: WD40-like repeat  26.17 
 
 		 475 aa  65.1  0.000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.687981  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5123  Pyrrolo-quinoline quinone  26.17 
 
 		 475 aa  60.1  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.513174  normal  1 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3290  serine/threonine protein kinase  26.03 
 
 		 963 aa  55.8  0.000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0556916 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1499  hypothetical protein  26.04 
 
 		 384 aa  53.5  0.000009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1484  hypothetical protein  25.44 
 
 		 384 aa  53.1  0.00001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0804  Pyrrolo-quinoline quinone  29.85 
 
 		 536 aa  52  0.00002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004346  YfgL protein  24.31 
 
 		 386 aa  50.8  0.00006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1041  PQQ repeat-containing protein  22.9 
 
 		 371 aa  50.8  0.00006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.331576  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3730  serine/threonine protein kinase  27.21 
 
 		 687 aa  50.1  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00433941 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1741  Pyrrolo-quinoline quinone  21.8 
 
 		 570 aa  49.7  0.0001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3733  hypothetical protein  23.42 
 
 		 1067 aa  49.7  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.422005  normal  0.383912 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_911  PQQ enzyme repeat domain protein  22.61 
 
 		 371 aa  49.3  0.0002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00179441  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1643  Pyrrolo-quinoline quinone  27.04 
 
 		 457 aa  48.5  0.0003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01070  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  24.86 
 
 		 386 aa  47.8  0.0005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0923  Pyrrolo-quinoline quinone  21.46 
 
 		 371 aa  47.4  0.0007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00190176  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0821  Pyrrolo-quinoline quinone  25.83 
 
 		 372 aa  47.4  0.0007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.403647  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2326  putative quinoprotein  23.79 
 
 		 525 aa  46.2  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.55919  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0677  Pyrrolo-quinoline quinone  23.21 
 
 		 431 aa  45.4  0.002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.350335  normal  0.177219 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0697  Pyrrolo-quinoline quinone  25.41 
 
 		 415 aa  45.4  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2376  Pyrrolo-quinoline quinone  38.46 
 
 		 436 aa  45.4  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1593  metallophosphoesterase  29.55 
 
 		 611 aa  45.4  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.245606 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1550  Pyrrolo-quinoline quinone  24.71 
 
 		 809 aa  45.8  0.002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.183569  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4514  Pyrrolo-quinoline quinone  23.53 
 
 		 445 aa  45.1  0.003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0655  Pyrrolo-quinoline quinone  24.4 
 
 		 402 aa  44.7  0.004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.808652  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1796  outer membrane protein  24.11 
 
 		 497 aa  44.7  0.004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000000580169  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2415  putative quinoprotein alcohol dehydrogenase  24.22 
 
 		 577 aa  44.3  0.005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.168343  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2164  serine/threonine protein kinase  22.3 
 
 		 652 aa  43.9  0.006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.563698  hitchhiker  0.00000786383 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5726  WD40-like repeat-domain-containing protein  21.76 
 
 		 901 aa  43.9  0.007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3526  Pyrrolo-quinoline quinone  24.42 
 
 		 514 aa  43.9  0.007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.103878  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4463  serine/threonine protein kinase  22.6 
 
 		 820 aa  43.9  0.008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.846265  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02978  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  23.85 
 
 		 402 aa  43.5  0.009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.373211  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4167  Pyrrolo-quinoline quinone  31.76 
 
 		 432 aa  43.5  0.009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.275915 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>