140 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AFE_1874 on replicon NC_011761
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011206  Lferr_1549  adenylate cyclase  100 
 
 		 489 aa  985    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00196996 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1874  adenylate cyclase  100 
 
 		 489 aa  985    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2024  adenylate cyclase  29.75 
 
 		 499 aa  129  1.0000000000000001e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.374055  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0383  adenylate cyclase  26.5 
 
 		 519 aa  127  3e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0089  adenylate cyclase  28.63 
 
 		 505 aa  119  1.9999999999999998e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.445935  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2918  adenylate cyclase  31.06 
 
 		 508 aa  117  3.9999999999999997e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4991  CHAD domain-containing protein  29.09 
 
 		 508 aa  117  6e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.913323  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4466  CHAD domain-containing protein  28.71 
 
 		 508 aa  114  3e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.521313  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2354  adenylate cyclase  27.76 
 
 		 543 aa  111  3e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.87441  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2069  adenylate cyclase  32.86 
 
 		 494 aa  110  7.000000000000001e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3355  adenylate cyclase  26.67 
 
 		 487 aa  107  5e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.658253  normal  0.866981 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2018  hypothetical protein  29.45 
 
 		 505 aa  106  1e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000169644  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2680  hypothetical protein  27.67 
 
 		 505 aa  102  2e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0254729  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1706  CHAD domain-containing protein  31.41 
 
 		 510 aa  102  2e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.201862  normal  0.293429 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3231  adenylate cyclase  37.79 
 
 		 433 aa  101  3e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02924  predicted adenylate cyclase  37.79 
 
 		 433 aa  100  4e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00492896  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0646  adenylate cyclase  37.79 
 
 		 433 aa  100  4e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000201225  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02874  hypothetical protein  37.79 
 
 		 433 aa  100  4e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00301101  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5361  hypothetical protein  28.16 
 
 		 596 aa  100  4e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.319316  hitchhiker  0.00226049 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0645  adenylate cyclase  37.79 
 
 		 433 aa  100  4e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000445512  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3406  adenylate cyclase  37.5 
 
 		 445 aa  100  6e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0100742  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0350  adenylate cyclase  40.72 
 
 		 454 aa  100  6e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3346  adenylate cyclase  37.79 
 
 		 433 aa  100  8e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.748086  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0619  adenylate cyclase  30.61 
 
 		 495 aa  100  9e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2542  adenylate cyclase  34.09 
 
 		 328 aa  99.4  1e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00864  hypothetical protein  29.86 
 
 		 529 aa  99.4  1e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4365  adenylate cyclase  37.21 
 
 		 433 aa  99  2e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.456415  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3388  adenylate cyclase  35.61 
 
 		 433 aa  98.6  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004527  adenylate cyclase  28.66 
 
 		 510 aa  98.6  2e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3392  adenylate cyclase  35.12 
 
 		 433 aa  98.2  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0918  adenylate cyclase  33.6 
 
 		 508 aa  98.2  3e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.57743  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3558  adenylate cyclase  35.12 
 
 		 433 aa  97.8  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.574554  normal  0.228439 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1189  hypothetical protein  34.17 
 
 		 347 aa  97.8  4e-19  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0908  adenylate cyclase  33.6 
 
 		 498 aa  97.4  4e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00951496  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0564  adenylate cyclase  34.67 
 
 		 494 aa  97.4  5e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1449  adenylate cyclase  26.39 
 
 		 519 aa  97.4  5e-19  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00311247  normal  0.531848 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3456  adenylate cyclase  35.47 
 
 		 433 aa  97.1  6e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.333438 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3454  adenylate cyclase  32.23 
 
 		 508 aa  97.1  6e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.320835  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3485  adenylate cyclase  36.63 
 
 		 433 aa  96.3  1e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.832353  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0884  adenylate cyclase  33.6 
 
 		 508 aa  96.3  1e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0453465  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3517  adenylate cyclase  36.63 
 
 		 433 aa  95.9  1e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3462  adenylate cyclase  35.12 
 
 		 433 aa  95.5  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0774  adenylate cyclase  36.42 
 
 		 286 aa  95.1  2e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.146589  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3095  adenylate cyclase  34.95 
 
 		 508 aa  94.7  3e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.004296  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0529  putative adenylate cyclase  38.94 
 
 		 213 aa  94  5e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.293065  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0648  putative adenylate cyclase  38.94 
 
 		 213 aa  94  5e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0944  putative adenylate cyclase  38.94 
 
 		 213 aa  94  5e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1914  putative adenylate cyclase  38.94 
 
 		 213 aa  94  5e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3579  adenylate cyclase  37.5 
 
 		 215 aa  93.6  7e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.496336  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2672  hypothetical protein  38.69 
 
 		 492 aa  93.6  7e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3587  adenylate cyclase  37.5 
 
 		 215 aa  93.6  7e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2906  CHAD domain-containing protein  28.2 
 
 		 511 aa  92.8  1e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0809303  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3565  adenylate cyclase  35.84 
 
 		 443 aa  92  2e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00255763  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3851  adenylate cyclase  33.93 
 
 		 495 aa  92  2e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0188416  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3560  adenylate cyclase  38.46 
 
 		 213 aa  92.4  2e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.567904  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3769  hypothetical protein  37.2 
 
 		 503 aa  90.1  9e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4624  adenylate cyclase  30.93 
 
 		 510 aa  90.1  9e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.283729  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0823  adenylate cyclase  33.64 
 
 		 503 aa  89.4  1e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000128674  normal  0.174291 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4408  CHAD domain-containing protein  27.43 
 
 		 490 aa  89.7  1e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.38693  normal  0.881049 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4215  CHAD domain containing protein  32.27 
 
 		 511 aa  89.4  1e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.248896  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2913  adenylate cyclase  36.54 
 
 		 213 aa  88.6  2e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2575  adenylate cyclase  37.14 
 
 		 208 aa  89.4  2e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0530  adenylate cyclase  37.14 
 
 		 208 aa  89.4  2e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1159  adenylate cyclase  34.95 
 
 		 512 aa  89.4  2e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.964289  normal  0.796776 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4291  adenylate cyclase  36.99 
 
 		 435 aa  89  2e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.051247  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0502  adenylate cyclase  36.41 
 
 		 208 aa  89  2e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0379  adenylate cyclase  33.71 
 
 		 512 aa  88.2  3e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3074  CHAD domain-containing protein  30.38 
 
 		 505 aa  87.8  4e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0601253  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2332  adenylate cyclase  35.09 
 
 		 511 aa  87  7e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.440295 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0370  CHAD domain containing protein  33.33 
 
 		 512 aa  86.7  9e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0297118  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0693  adenylate cyclase  35.84 
 
 		 321 aa  85.5  0.000000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000106533  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1029  CHAD  26.04 
 
 		 504 aa  85.9  0.000000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.739933  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3118  adenylate cyclase  33.65 
 
 		 503 aa  85.1  0.000000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000370721  normal  0.76725 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3500  adenylate cyclase  34.6 
 
 		 208 aa  85.1  0.000000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.857741  hitchhiker  0.000378229 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0854  adenylate cyclase  33.65 
 
 		 503 aa  84.7  0.000000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0014497  normal  0.731285 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0562  adenylate cyclase  39.13 
 
 		 435 aa  84.7  0.000000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000134146  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0294  hypothetical protein  39.13 
 
 		 435 aa  84.7  0.000000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.513633  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0643  adenylate cyclase  39.13 
 
 		 435 aa  84.7  0.000000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000496998  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2702  adenylate cyclase  35.58 
 
 		 211 aa  84.7  0.000000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.722773  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3586  CHAD domain-containing protein  37.38 
 
 		 721 aa  84  0.000000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3486  adenylate cyclase  32.93 
 
 		 495 aa  83.6  0.000000000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00832211  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2370  adenylate cyclase  30.08 
 
 		 514 aa  82.8  0.00000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.870363  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0718  adenylate cyclase  31.07 
 
 		 500 aa  82.8  0.00000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00048972  unclonable  0.0000000193925 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4196  putative adenylate cyclase  33.92 
 
 		 535 aa  82  0.00000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0710  adenylate cyclase  36.61 
 
 		 291 aa  82  0.00000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0832  adenylate cyclase  34.72 
 
 		 443 aa  82.4  0.00000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.944566  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3182  adenylate cyclase  40.23 
 
 		 207 aa  81.6  0.00000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0891152  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3610  adenylate cyclase  29.57 
 
 		 498 aa  80.9  0.00000000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0101894 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3842  adenylate cyclase  32.37 
 
 		 500 aa  80.5  0.00000000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.023324  hitchhiker  0.0000000503049 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03713  hypothetical protein  30.69 
 
 		 501 aa  80.1  0.00000000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.153655  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1232  CHAD domain-containing protein  26.18 
 
 		 508 aa  80.1  0.00000000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0458  adenylate cyclase  35 
 
 		 211 aa  79.3  0.0000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3617  adenylate cyclase  39.31 
 
 		 208 aa  78.2  0.0000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3128  adenylate cyclase  40.88 
 
 		 219 aa  78.2  0.0000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.352745  normal  0.54028 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0947  CHAD domain-containing protein  36.45 
 
 		 719 aa  77.8  0.0000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.975855 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1086  adenylate cyclase  33.18 
 
 		 540 aa  77  0.0000000000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.394808 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0457  CyaB/UgiF-like adenylyl cyclase  32.7 
 
 		 208 aa  77  0.0000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1216  CHAD domain containing protein  30.06 
 
 		 509 aa  76.6  0.0000000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0182  adenylate cyclase  27.82 
 
 		 502 aa  75.5  0.000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3533  CHAD domain containing protein  27.56 
 
 		 520 aa  75.9  0.000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0421561 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>