More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AFE_1821 on replicon NC_011761
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011761  AFE_1821  aminotransferase, classes I and II  100 
 
 
406 aa  823  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1498  aminotransferase class I and II  100 
 
 
401 aa  811  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.632779  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1866  succinyldiaminopimelate transaminase  54.94 
 
 
396 aa  409  1e-113  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.402909  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2124  succinyldiaminopimelate transaminase  52.76 
 
 
399 aa  405  1e-112  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1340  succinyldiaminopimelate transaminase  52.38 
 
 
397 aa  402  1e-111  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.313049 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3056  succinyldiaminopimelate transaminase  53.13 
 
 
398 aa  400  1e-110  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.433541  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1098  succinyldiaminopimelate transaminase  51.75 
 
 
399 aa  397  1e-109  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1491  succinyldiaminopimelate transaminase  52.26 
 
 
398 aa  396  1e-109  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.997861  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1480  succinyldiaminopimelate transaminase  53 
 
 
402 aa  397  1e-109  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1531  aminotransferase, classes I and II  51.39 
 
 
397 aa  395  1e-109  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39020  succinyldiaminopimelate transaminase  54.41 
 
 
398 aa  394  1e-108  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0524021  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17030  succinyldiaminopimelate transaminase  52.75 
 
 
402 aa  394  1e-108  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1153  succinyldiaminopimelate transaminase  52.25 
 
 
398 aa  391  1e-107  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1143  succinyldiaminopimelate transaminase  52.12 
 
 
399 aa  390  1e-107  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.385883  normal  0.91788 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1588  succinyldiaminopimelate transaminase  52.25 
 
 
398 aa  389  1e-107  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.133702  normal  0.347765 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4189  succinyldiaminopimelate transaminase  52.25 
 
 
398 aa  389  1e-107  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.199864  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1386  succinyldiaminopimelate transaminase  52.15 
 
 
396 aa  384  1e-105  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.849578 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1267  succinyldiaminopimelate transaminase  50.62 
 
 
399 aa  378  1e-104  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.589506  normal  0.362674 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4085  succinyldiaminopimelate transaminase  51 
 
 
398 aa  380  1e-104  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.930262 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2551  aminotransferase, class I and II  49.62 
 
 
400 aa  375  1e-103  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.138065  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1269  aminotransferase class I and II  48.49 
 
 
395 aa  376  1e-103  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.58359 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1331  succinyldiaminopimelate transaminase  50.12 
 
 
399 aa  377  1e-103  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.785266  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0274  succinyldiaminopimelate transaminase  50.12 
 
 
409 aa  372  1e-102  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6048  succinyldiaminopimelate transaminase  50.37 
 
 
410 aa  372  1e-102  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5338  succinyldiaminopimelate transaminase  50.37 
 
 
410 aa  372  1e-102  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.271745 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2029  succinyldiaminopimelate transaminase  50.37 
 
 
410 aa  372  1e-102  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2485  succinyldiaminopimelate transaminase  49.75 
 
 
400 aa  372  1e-102  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.354726  normal  0.111472 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1248  succinyldiaminopimelate transaminase  50.86 
 
 
410 aa  372  1e-102  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1813  succinyldiaminopimelate transaminase  49.75 
 
 
402 aa  372  1e-102  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1394  succinyldiaminopimelate transaminase  49.01 
 
 
417 aa  374  1e-102  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2048  succinyldiaminopimelate transaminase  50.37 
 
 
410 aa  372  1e-102  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1727  succinyldiaminopimelate transaminase  50.88 
 
 
396 aa  369  1e-101  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.963211  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0560  succinyldiaminopimelate transaminase  50.75 
 
 
399 aa  369  1e-101  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.370858  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2603  succinyldiaminopimelate transaminase  49.62 
 
 
407 aa  371  1e-101  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1891  succinyldiaminopimelate transaminase  50 
 
 
399 aa  369  1e-101  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2466  succinyldiaminopimelate transaminase  49 
 
 
405 aa  370  1e-101  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000138526 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1671  succinyldiaminopimelate transaminase  48.88 
 
 
405 aa  367  1e-100  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0235103 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1424  succinyldiaminopimelate transaminase  51.49 
 
 
410 aa  366  1e-100  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000365494  normal  0.0284066 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1348  succinyldiaminopimelate transaminase  49.63 
 
 
434 aa  368  1e-100  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.248718 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1930  succinyldiaminopimelate transaminase  49.64 
 
 
420 aa  368  1e-100  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.4255 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1997  succinyldiaminopimelate transaminase  48.4 
 
 
405 aa  365  1e-99  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.356902 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2720  succinyldiaminopimelate transaminase  51 
 
 
403 aa  364  1e-99  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0250139  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1221  succinyldiaminopimelate transaminase  49.12 
 
 
398 aa  363  3e-99  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0252  succinyldiaminopimelate transaminase  48.25 
 
 
401 aa  360  3e-98  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1807  succinyldiaminopimelate transaminase  48.88 
 
 
400 aa  359  4e-98  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0439  succinyldiaminopimelate transaminase  46.25 
 
 
412 aa  358  1e-97  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2047  succinyldiaminopimelate transaminase  47.68 
 
 
409 aa  357  2e-97  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2017  succinyldiaminopimelate transaminase  50.12 
 
 
420 aa  355  6e-97  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0393  succinyldiaminopimelate transaminase  45.97 
 
 
408 aa  354  2e-96  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00205919 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3617  succinyldiaminopimelate transaminase  47.89 
 
 
401 aa  352  6e-96  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00115899  normal  0.0503817 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2193  succinyldiaminopimelate transaminase  49.62 
 
 
397 aa  350  2e-95  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2061  succinyldiaminopimelate transaminase  50.65 
 
 
387 aa  350  2e-95  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1850  succinyldiaminopimelate transaminase  47.12 
 
 
397 aa  348  1e-94  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0598613  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2515  succinyldiaminopimelate transaminase  46.67 
 
 
407 aa  344  1e-93  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0423889 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0044  succinyldiaminopimelate transaminase  47.85 
 
 
405 aa  344  2e-93  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0555  succinyldiaminopimelate transaminase  45.5 
 
 
409 aa  342  7e-93  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00147864 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1032  succinyldiaminopimelate transaminase  49.88 
 
 
397 aa  342  1e-92  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2068  succinyldiaminopimelate transaminase  50.86 
 
 
410 aa  340  3e-92  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.854431  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3244  succinyldiaminopimelate transaminase  50.86 
 
 
410 aa  340  3e-92  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.667849  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1340  succinyldiaminopimelate transaminase  50.86 
 
 
410 aa  340  3e-92  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2504  succinyldiaminopimelate transaminase  50.86 
 
 
410 aa  340  3e-92  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.181196  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1565  succinyldiaminopimelate transaminase  50.24 
 
 
415 aa  339  6e-92  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.155441  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2448  succinyldiaminopimelate transaminase  50.61 
 
 
410 aa  338  7e-92  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.805274  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1469  aminotransferase, class I and II  46.5 
 
 
399 aa  335  6e-91  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1889  succinyldiaminopimelate transaminase  47.16 
 
 
404 aa  332  8e-90  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2066  succinyldiaminopimelate transaminase  46.91 
 
 
404 aa  332  1e-89  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.595829 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4601  aminotransferase class I and II  45.78 
 
 
398 aa  315  1e-84  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0427  aminotransferase  43.08 
 
 
393 aa  282  8e-75  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1301  aminotransferase class I and II  41.36 
 
 
413 aa  274  2e-72  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.54822 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0759  hypothetical protein  41.09 
 
 
378 aa  270  5e-71  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0344164  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2899  aminotransferase, class I and II  42.64 
 
 
392 aa  266  4e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.24547  normal  0.890178 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0060  aminotransferase class I and II  42.64 
 
 
393 aa  263  4e-69  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.119317  hitchhiker  3.2787e-06 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1494  aminotransferase  41.6 
 
 
392 aa  259  4e-68  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0109617  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0144  aminotransferase, class I and II  41.34 
 
 
392 aa  259  5e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.680923  normal  0.141638 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0059  aminotransferase  41.15 
 
 
392 aa  256  6e-67  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.419945  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0491  aminotransferase class I and II  38.36 
 
 
376 aa  253  5e-66  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3706  aminotransferase  40.05 
 
 
460 aa  250  3e-65  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0132  aminotransferase  40.36 
 
 
404 aa  244  2e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.926406  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0089  aminotransferase, class I and II  42.53 
 
 
423 aa  241  2e-62  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.789487  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0275  aminotransferase, class I and II  41.07 
 
 
438 aa  233  6e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.224598 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0082  aminotransferase, class I and II  40.16 
 
 
423 aa  232  1e-59  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0909898 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0445  aminotransferase, class I and II  40.66 
 
 
412 aa  231  2e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.335861 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2672  aminotransferase, class I and II  38.99 
 
 
397 aa  229  9e-59  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0376  aminotransferase, class I and II  39.95 
 
 
420 aa  228  2e-58  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1842  aminotransferase class I and II  39.64 
 
 
416 aa  224  2e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.134959  normal  0.168146 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0281  aminotransferase class I and II  39.02 
 
 
408 aa  223  5e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0769639  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1002  aminotransferase class I and II  31.23 
 
 
386 aa  193  5e-48  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3944  aminotransferase class I and II  33.76 
 
 
388 aa  179  1e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.082916 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0074  aminotransferase  35.48 
 
 
405 aa  175  1e-42  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3971  aminotransferase class I and II  32.66 
 
 
396 aa  172  1e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.661843  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3830  succinyldiaminopimelate aminotransferase  33 
 
 
383 aa  171  2e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3893  aminotransferase class I and II  33.67 
 
 
396 aa  169  7e-41  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2532  N-succinyldiaminopimelate aminotransferase  32.04 
 
 
379 aa  154  2e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.86388e-05 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1695  LL-diaminopimelate aminotransferase  30.43 
 
 
392 aa  154  3e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.126823  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0739  LL-diaminopimelate aminotransferase  29.43 
 
 
388 aa  147  2e-34  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_646  class I/II aminotransferase  29.68 
 
 
390 aa  148  2e-34  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.552452  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0492  N-succinyldiaminopimelate aminotransferase  32.05 
 
 
370 aa  148  2e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.711349  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3027  aminotransferase class I and II  35.73 
 
 
359 aa  147  3e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.290105  normal  0.396849 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8434  aminotransferase class I and II  35.49 
 
 
359 aa  147  4e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0659  aminotransferase class I and II  35.67 
 
 
361 aa  143  5e-33  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>