More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AFE_1809 on replicon NC_011761
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011206  Lferr_1484  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 
474 aa  931    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.074526  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1809  major facilitator family protein  100 
 
 
499 aa  987    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0341  major facilitator superfamily MFS_1  44.54 
 
 
508 aa  367  1e-100  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1633  general substrate transporter  37.34 
 
 
476 aa  313  4.999999999999999e-84  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.904084  normal  0.408822 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2238  glucose transport protein  34.76 
 
 
471 aa  257  3e-67  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.154375  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4572  General substrate transporter  33.82 
 
 
477 aa  239  1e-61  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1924  major facilitator superfamily MFS_1  33.19 
 
 
465 aa  193  5e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2277  major facilitator family transporter  33.19 
 
 
465 aa  193  5e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0694  General substrate transporter  29.06 
 
 
459 aa  175  1.9999999999999998e-42  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2894  General substrate transporter  31.61 
 
 
458 aa  172  1e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.222038 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3296  major facilitator family transporter  31.61 
 
 
458 aa  172  1e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4043  general substrate transporter  25.7 
 
 
452 aa  168  2e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3234  general substrate transporter  26.57 
 
 
445 aa  168  2e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1829  General substrate transporter  26.13 
 
 
480 aa  165  2.0000000000000002e-39  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.392144  normal  0.18053 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0920  General substrate transporter  29.17 
 
 
471 aa  164  3e-39  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2863  major facilitator superfamily MFS_1  29.02 
 
 
423 aa  164  4.0000000000000004e-39  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.82901  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2681  general substrate transporter  26.18 
 
 
438 aa  162  1e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.31051 
 
 
-
 
NC_009471  Acry_3608  general substrate transporter  29.28 
 
 
469 aa  162  2e-38  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2255  general substrate transporter  27.1 
 
 
446 aa  157  3e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000684239  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0730  General substrate transporter  27.65 
 
 
464 aa  155  1e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00049  predicted transporter  25.11 
 
 
443 aa  151  2e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3554  major facilitator superfamily MFS_1  25.11 
 
 
443 aa  151  2e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0088  putative metabolite transport protein YaaU  24.27 
 
 
468 aa  151  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3610  major facilitator transporter  25.11 
 
 
443 aa  151  2e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0100231 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0051  major facilitator family transporter  25.11 
 
 
443 aa  151  2e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0047  major facilitator family transporter  25.11 
 
 
443 aa  152  2e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.454742 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00048  hypothetical protein  25.11 
 
 
443 aa  151  2e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0049  major facilitator family transporter  25.11 
 
 
443 aa  151  3e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0086  putative metabolite transport protein YaaU  24.27 
 
 
468 aa  151  3e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.509383  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0049  major facilitator family transporter  25.11 
 
 
443 aa  151  3e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0085  putative metabolite transport protein YaaU  24.48 
 
 
468 aa  151  3e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0085  putative metabolite transport protein YaaU  24.48 
 
 
468 aa  151  3e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0089  putative metabolite transport protein YaaU  24.27 
 
 
468 aa  150  4e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.343682  normal  0.458255 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2828  major facilitator transporter  27.64 
 
 
457 aa  150  4e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0712  general substrate transporter  27.17 
 
 
463 aa  150  5e-35  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0221085  hitchhiker  0.00000000000000199551 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0727  phosphate transporter  27.07 
 
 
442 aa  149  9e-35  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0831  putative iorganic phosphate transporter  27.07 
 
 
442 aa  149  2.0000000000000003e-34  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1660  MFS family transporter  28.54 
 
 
455 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1718  phosphate transporter  27 
 
 
443 aa  149  2.0000000000000003e-34  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.140032  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0278  major facilitator transporter  28.32 
 
 
441 aa  148  2.0000000000000003e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.672912  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0471  putative iorganic phosphate transporter  27 
 
 
441 aa  147  3e-34  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2879  General substrate transporter  28.11 
 
 
465 aa  147  4.0000000000000006e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19270  putative MFS transporter  29.05 
 
 
455 aa  146  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.149627  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2467  major facilitator transporter  27.56 
 
 
453 aa  144  4e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1512  general substrate transporter  27.61 
 
 
467 aa  144  4e-33  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.925564  normal  0.774713 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0325  major facilitator superfamily MFS_1  28.57 
 
 
477 aa  143  6e-33  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.184754  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6930  major facilitator superfamily MFS_1  27.45 
 
 
460 aa  143  8e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.11506  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1094  major facilitator transporter  27.25 
 
 
427 aa  142  1.9999999999999998e-32  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS02027  metabolite transporter  29.61 
 
 
476 aa  140  4.999999999999999e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.158134 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1618  major facilitator transporter  26.5 
 
 
458 aa  138  2e-31  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2911  major facilitator family transporter  29.75 
 
 
445 aa  137  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2900  major facilitator family transporter  29.32 
 
 
445 aa  137  4e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02616  predicted transporter  29.54 
 
 
445 aa  136  9.999999999999999e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0917  major facilitator superfamily MFS_1  29.54 
 
 
469 aa  136  9.999999999999999e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02579  hypothetical protein  29.54 
 
 
445 aa  136  9.999999999999999e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3102  major facilitator family transporter  29.54 
 
 
445 aa  136  9.999999999999999e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000189575  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2161  major facilitator transporter  27.61 
 
 
514 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.227484  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3221  General substrate transporter  27.43 
 
 
457 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3073  major facilitator family transporter  29.54 
 
 
445 aa  136  9.999999999999999e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.392352  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0941  major facilitator transporter  29.54 
 
 
445 aa  136  9.999999999999999e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8056  major facilitator superfamily MFS_1  30.17 
 
 
451 aa  134  3e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5178  major facilitator transporter  28.2 
 
 
457 aa  133  7.999999999999999e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1543  major facilitator transporter  26.12 
 
 
452 aa  132  1.0000000000000001e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1373  major facilitator transporter  25.22 
 
 
443 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0434545 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0025  major facilitator family transporter  25.05 
 
 
454 aa  131  2.0000000000000002e-29  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3311  major facilitator transporter  28 
 
 
474 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.799238  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5053  major facilitator superfamily MFS_1  27.1 
 
 
472 aa  131  4.0000000000000003e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.122247 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1652  general substrate transporter  25.91 
 
 
452 aa  130  4.0000000000000003e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1720  major facilitator transporter  25.91 
 
 
452 aa  130  5.0000000000000004e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0929915  hitchhiker  0.00114848 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5109  major facilitator transporter  28.91 
 
 
474 aa  130  5.0000000000000004e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1595  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  27.79 
 
 
472 aa  130  6e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5172  major facilitator transporter  29.58 
 
 
474 aa  130  6e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0809503 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0539  major facilitator transporter  29.18 
 
 
473 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3259  major facilitator transporter  28.69 
 
 
474 aa  128  3e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.331503  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0670  general substrate transporter  29.52 
 
 
459 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.753041 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0959  sugar transporter  28.85 
 
 
472 aa  127  5e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2255  major facilitator superfamily MFS_1  29.18 
 
 
473 aa  127  6e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4111  major facilitator transporter  24.09 
 
 
442 aa  127  7e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006685  CNC03960  phosphate transporter, putative  25.67 
 
 
555 aa  126  8.000000000000001e-28  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.362408  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1641  major facilitator transporter  25.11 
 
 
434 aa  124  4e-27  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0119358  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09740  putative MFS transporter  26.3 
 
 
442 aa  124  4e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00809883  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3321  major facilitator transporter  26.56 
 
 
439 aa  124  5e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2518  major facilitator transporter  25.27 
 
 
437 aa  122  9.999999999999999e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0578  general substrate transporter  24.44 
 
 
458 aa  121  3e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6518  major facilitator transporter  27.87 
 
 
475 aa  120  6e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6752  major facilitator transporter  27.87 
 
 
475 aa  120  6e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0303663 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3533  major facilitator transporter  28.89 
 
 
473 aa  119  9e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0379  major facilitator family transporter  28.94 
 
 
478 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2073  major facilitator superfamily transporter  27.33 
 
 
467 aa  117  3e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0013865 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7502  major facilitator transporter  28.18 
 
 
475 aa  118  3e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0253072  normal  0.395305 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3868  sugar transporter  27.04 
 
 
450 aa  117  5e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0177  major facilitator family transporter  28.71 
 
 
478 aa  116  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1931  major facilitator superfamily permease  28.97 
 
 
478 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0979116  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0471  major facilitator family transporter  28.71 
 
 
478 aa  116  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1431  major facilitator family transporter  28.71 
 
 
478 aa  116  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.475934  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1841  major facilitator family transporter  28.97 
 
 
478 aa  116  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1443  major facilitator transporter  28.7 
 
 
493 aa  116  1.0000000000000001e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0792  major facilitator superfamily MFS_1  28.01 
 
 
458 aa  115  2.0000000000000002e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.753449  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1884  D-xylose proton-symporter  23.32 
 
 
447 aa  115  2.0000000000000002e-24  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.326848  hitchhiker  0.0000000000014456 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6341  major facilitator transporter  27.55 
 
 
475 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>