More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AFE_1807 on replicon NC_011761
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011761  AFE_1807  carbohydrate kinase, PfkB family  100 
 
 		 319 aa  646    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.917848  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1482  1-phosphofructokinase  100 
 
 		 319 aa  646    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.132343  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2395  1-phosphofructokinase  36.17 
 
 		 303 aa  177  3e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.378006  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0445  fructose-1-phosphate kinase  36.17 
 
 		 303 aa  174  9.999999999999999e-43  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00359315  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4571  1-phosphofructokinase  35.88 
 
 		 319 aa  174  9.999999999999999e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.78186 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1252  1-phosphofructokinase  34.98 
 
 		 312 aa  173  3.9999999999999995e-42  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3541  1-phosphofructokinase  36.72 
 
 		 332 aa  170  2e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1642  tagatose-6-phosphate kinase, phosphofructokinase I  36.46 
 
 		 307 aa  170  3e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1907  tagatose-6-phosphate kinase  35.42 
 
 		 307 aa  169  7e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.961969  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1600  6-phosphofructokinase II  35.18 
 
 		 311 aa  169  7e-41  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.349634 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1347  1-phosphofructokinase  34.88 
 
 		 303 aa  166  5e-40  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.50692  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3759  1-phosphofructokinase  34.27 
 
 		 304 aa  165  8e-40  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0589  1-phosphofructokinase  32.9 
 
 		 305 aa  165  8e-40  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3564  1-phosphofructokinase  36.17 
 
 		 303 aa  163  4.0000000000000004e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0892785  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3847  1-phosphofructokinase  36.17 
 
 		 303 aa  163  4.0000000000000004e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000858241  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3727  1-phosphofructokinase  36.17 
 
 		 303 aa  163  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.5453300000000002e-26 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3463  1-phosphofructokinase  36.17 
 
 		 303 aa  162  6e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00127204  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1485  1-phosphofructokinase  34.78 
 
 		 303 aa  162  9e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.211736  normal  0.0136163 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3483  1-phosphofructokinase  36.36 
 
 		 303 aa  160  2e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.622893  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4105  ribokinase-like domain-containing protein  34.78 
 
 		 332 aa  160  3e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3817  1-phosphofructokinase  34.78 
 
 		 303 aa  160  3e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00128432  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3477  1-phosphofructokinase  35.82 
 
 		 303 aa  159  9e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000168948  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4520  1-phosphofructokinase  35.88 
 
 		 310 aa  158  1e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.491603  normal  0.561084 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4388  1-phosphofructokinase  35.88 
 
 		 310 aa  158  1e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.758839  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3768  1-phosphofructokinase  35.82 
 
 		 303 aa  157  2e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000270139  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3745  1-phosphofructokinase  35.82 
 
 		 303 aa  156  4e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0550156  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5272  1-phosphofructokinase  36.96 
 
 		 325 aa  156  5.0000000000000005e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.390992  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0358  1-phosphofructokinase  35.05 
 
 		 306 aa  156  6e-37  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0739  1-phosphofructokinase  33.33 
 
 		 306 aa  155  8e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0723  1-phosphofructokinase  33.33 
 
 		 306 aa  155  8e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1715  1-phosphofructokinase  34.45 
 
 		 324 aa  155  1e-36  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1511  1-phosphofructokinase  35.82 
 
 		 303 aa  154  2e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000166616  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0415  6-phosphofructokinase  35.62 
 
 		 350 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5875  1-phosphofructokinase  34.77 
 
 		 326 aa  153  4e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.412228  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0175  1-phosphofructokinase  32.65 
 
 		 306 aa  152  5e-36  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6213  1-phosphofructokinase  33.44 
 
 		 311 aa  151  1e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.175632  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1031  1-phosphofructokinase  34.42 
 
 		 311 aa  151  1e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3234  1-phosphofructokinase  33.44 
 
 		 311 aa  150  2e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1776  1-phosphofructokinase  29.03 
 
 		 308 aa  151  2e-35  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0686  1-phosphofructokinase  33.44 
 
 		 316 aa  150  3e-35  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.020594  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1971  PfkB  37.89 
 
 		 327 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.808112  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1351  ribokinase-like domain-containing protein  33.11 
 
 		 309 aa  147  2.0000000000000003e-34  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0382  1-phosphofructokinase  30.29 
 
 		 302 aa  147  3e-34  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000931152  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1157  1-phosphofructokinase  33.55 
 
 		 310 aa  146  4.0000000000000006e-34  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23410  6-phosphofructokinase II  34.87 
 
 		 312 aa  145  7.0000000000000006e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.479216  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01692  6-phosphofructokinase II  35 
 
 		 309 aa  145  9e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1919  1-phosphofructokinase  35 
 
 		 309 aa  145  9e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1834  ribokinase-like domain-containing protein  30.72 
 
 		 306 aa  145  9e-34  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01680  hypothetical protein  35 
 
 		 309 aa  145  9e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.943682  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1788  1-phosphofructokinase  29.7 
 
 		 311 aa  145  1e-33  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.468548  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1069  1-phosphofructokinase  32.2 
 
 		 311 aa  145  1e-33  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1909  6-phosphofructokinase 2  34.67 
 
 		 309 aa  145  1e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0142081  normal  0.242978 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1804  6-phosphofructokinase 2  34.67 
 
 		 309 aa  145  1e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0265259  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1032  tagatose-6-phosphate kinase  29.79 
 
 		 305 aa  145  1e-33  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.104168  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1968  6-phosphofructokinase 2  35 
 
 		 309 aa  144  1e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1943  6-phosphofructokinase 2  34.67 
 
 		 309 aa  144  2e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0791846  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0576  1-phosphofructokinase  30.61 
 
 		 310 aa  144  2e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000336585  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3901  1-phosphofructokinase  31.13 
 
 		 300 aa  144  2e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000128039  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2441  6-phosphofructokinase 2  34.67 
 
 		 309 aa  144  2e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.386774  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0641  1-phosphofructokinase  33.12 
 
 		 311 aa  144  2e-33  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.021814  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1468  6-phosphofructokinase 2  35 
 
 		 309 aa  144  2e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.193621  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3412  6-phosphofructokinase  32.69 
 
 		 324 aa  144  3e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0583306  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3475  6-phosphofructokinase  32.69 
 
 		 324 aa  144  3e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0202827  normal  0.0135281 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3423  6-phosphofructokinase  32.69 
 
 		 324 aa  144  3e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.151366 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1653  1-phosphofructokinase  33.45 
 
 		 312 aa  143  4e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.000747305  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0188  1-phosphofructokinase  34.78 
 
 		 317 aa  143  4e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22720  tagatose-6-phosphate kinase, phosphofructokinase I  33.09 
 
 		 315 aa  143  5e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.727681  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2650  1-phosphofructokinase  35.82 
 
 		 303 aa  142  6e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1268  1-phosphofructokinase  33.09 
 
 		 314 aa  142  8e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.955109  normal  0.500032 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0012  1-phosphofructokinase  36.05 
 
 		 308 aa  141  9.999999999999999e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00179205  unclonable  0.0000000067569 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0444  PfkB  34.33 
 
 		 312 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.649128  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0237  6-phosphofructokinase  34.32 
 
 		 320 aa  141  9.999999999999999e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0650  1-phosphofructokinase  29.47 
 
 		 307 aa  140  1.9999999999999998e-32  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2756  6-phosphofructokinase  34.28 
 
 		 312 aa  140  3e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.785383  normal  0.0918353 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1060  1-phosphofructokinase  38.85 
 
 		 308 aa  140  3.9999999999999997e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2465  1-phosphofructokinase  33.33 
 
 		 312 aa  140  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000474355  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2760  1-phosphofructokinase  35.77 
 
 		 302 aa  139  4.999999999999999e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1727  tagatose-6-phosphate kinase  29.93 
 
 		 304 aa  139  6e-32  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.209721  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0147  1-phosphofructokinase  29.57 
 
 		 315 aa  139  6e-32  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000110184  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0347  PfkB  34 
 
 		 312 aa  139  7e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0042233 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3382  1-phosphofructokinase  31.43 
 
 		 308 aa  139  7e-32  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000263995  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02097  1-phosphofructokinase  32.98 
 
 		 312 aa  139  7.999999999999999e-32  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00508947  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1490  1-phosphofructokinase  32.98 
 
 		 312 aa  139  7.999999999999999e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000119891  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1480  1-phosphofructokinase  32.98 
 
 		 312 aa  139  7.999999999999999e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00345053  unclonable  0.000000014871 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3304  1-phosphofructokinase  32.98 
 
 		 312 aa  139  7.999999999999999e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000243379  normal  0.0139965 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02056  hypothetical protein  32.98 
 
 		 312 aa  139  7.999999999999999e-32  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00616403  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2305  1-phosphofructokinase  32.98 
 
 		 312 aa  139  7.999999999999999e-32  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000269227  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2315  1-phosphofructokinase  32.98 
 
 		 312 aa  139  7.999999999999999e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000477642  hitchhiker  0.000599069 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2762  1-phosphofructokinase  32.98 
 
 		 312 aa  139  7.999999999999999e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1925  1-phosphofructokinase  33.1 
 
 		 312 aa  139  8.999999999999999e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0601047  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2353  1-phosphofructokinase  32.98 
 
 		 312 aa  138  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.0000000249505  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0795  1-phosphofructokinase  32.62 
 
 		 312 aa  138  1e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000412726  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2444  1-phosphofructokinase  32.98 
 
 		 312 aa  138  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00105747  normal  0.37193 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1188  1-phosphofructokinase  38.32 
 
 		 315 aa  138  1e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.95293  normal  0.994697 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2555  1-phosphofructokinase  32.98 
 
 		 312 aa  138  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0672567  hitchhiker  0.000484792 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0700  PfkB  32.78 
 
 		 322 aa  138  1e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2397  1-phosphofructokinase  32.98 
 
 		 312 aa  138  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.296088  hitchhiker  0.000165824 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2441  1-phosphofructokinase  32.98 
 
 		 312 aa  138  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.151265  hitchhiker  0.00000493552 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1721  6-phosphofructokinase 2  33.22 
 
 		 310 aa  138  1e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.132739  normal  0.591583 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2425  1-phosphofructokinase  32.86 
 
 		 312 aa  137  2e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>