51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AFE_1614 on replicon NC_011761
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011761  AFE_1614  excisionase domain protein  100 
 
 		 154 aa  311  1.9999999999999998e-84  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.177236  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0234  DNA binding domain protein, excisionase family  99.35 
 
 		 154 aa  308  2e-83  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.844329  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2639  hypothetical protein  76.47 
 
 		 153 aa  239  7.999999999999999e-63  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.690971  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3239  putative excisionase protein  59.48 
 
 		 153 aa  191  4e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0263514 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4162  DNA binding domain-containing protein  61.64 
 
 		 155 aa  187  4e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0766794  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4367  DNA binding domain-containing protein  52.67 
 
 		 155 aa  174  3e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.264021  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2344  excisionase/Xis, DNA-binding  54.79 
 
 		 156 aa  169  2e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000412399  unclonable  0.000000144936 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1265  DNA binding domain-containing protein  54.79 
 
 		 156 aa  169  2e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4151  excisionase domain-containing protein  53.55 
 
 		 157 aa  154  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4435  DNA binding domain-containing protein  46.21 
 
 		 149 aa  152  2e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.901637  normal  0.560095 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3385  DNA binding domain-containing protein  49.67 
 
 		 150 aa  149  1e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3752  DNA binding domain protein, excisionase family  46.85 
 
 		 153 aa  141  4e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.152724  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3978  DNA binding domain-containing protein  45.83 
 
 		 150 aa  140  7e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.382776 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0695  DNA binding domain-containing protein  46.21 
 
 		 153 aa  135  2e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0623453  normal  0.505933 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3464  DNA binding domain protein, excisionase family  43.75 
 
 		 157 aa  133  9.999999999999999e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3279  DNA binding domain-containing protein  46.1 
 
 		 149 aa  123  1e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.746198  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1776  excisionase/Xis, DNA-binding  49.48 
 
 		 97 aa  117  7e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.666085  normal  0.0963925 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4630  DNA binding domain-containing protein  49.52 
 
 		 109 aa  105  2e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3924  DNA binding domain-containing protein  39.01 
 
 		 152 aa  99.4  2e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1504  DNA binding domain protein, excisionase family  42.96 
 
 		 151 aa  97.1  9e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.018572  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0338  DNA binding domain-containing protein  42.06 
 
 		 153 aa  96.3  1e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4424  excisionase/Xis, DNA-binding  52.94 
 
 		 152 aa  95.1  3e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.412812  normal  0.513103 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7903  DNA binding domain protein, excisionase family  49.41 
 
 		 151 aa  94.7  4e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13782  excisionase  39.32 
 
 		 130 aa  83.6  9e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.696326 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0047  DNA binding domain, excisionase family  53.09 
 
 		 136 aa  82.4  0.000000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.509276  normal  0.343664 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20770  DNA-binding protein, excisionase family  40.59 
 
 		 170 aa  81.3  0.000000000000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04840  DNA-binding protein, excisionase family  39.5 
 
 		 157 aa  79.7  0.00000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.287147  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1635  DNA binding domain protein, excisionase family  40.95 
 
 		 184 aa  76.3  0.0000000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1856  excisionase/Xis, DNA-binding  43.37 
 
 		 174 aa  74.3  0.0000000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03470  DNA-binding protein, excisionase family  41.84 
 
 		 178 aa  70.5  0.000000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.417608 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4763  excisionase/Xis, DNA-binding  31.07 
 
 		 158 aa  68.9  0.00000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.180211 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12334  excisionase  48.68 
 
 		 114 aa  67.4  0.00000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3978  DNA binding domain-containing protein  33.66 
 
 		 158 aa  67.4  0.00000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.27938 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2993  DNA binding domain protein, excisionase family  38.71 
 
 		 180 aa  64.7  0.0000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3800  DNA binding domain protein, excisionase family  35.79 
 
 		 171 aa  63.5  0.0000000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4008  DNA binding domain-containing protein  36.17 
 
 		 132 aa  62  0.000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0072  DNA binding domain protein, excisionase family  34.02 
 
 		 141 aa  60.1  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2889  putative RNA polymerase, sigma 28 subunit, FliA/WhiG subfamily  39.24 
 
 		 167 aa  59.7  0.00000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8221  DNA binding domain-containing protein  31.96 
 
 		 149 aa  58.9  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3272  DNA binding domain protein, excisionase family  40.23 
 
 		 143 aa  58.9  0.00000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1445  DNA binding domain protein, excisionase family  31.73 
 
 		 203 aa  55.1  0.0000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0793  DNA binding domain protein, excisionase family  46.67 
 
 		 178 aa  52  0.000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1587  DNA binding domain-containing protein  40.58 
 
 		 166 aa  47.8  0.00005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1962  hypothetical protein  55 
 
 		 83 aa  47.8  0.00005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0383954 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0848  DNA binding domain protein, excisionase family  38.71 
 
 		 127 aa  47.8  0.00005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01190  DNA-binding protein, excisionase family  47.62 
 
 		 164 aa  43.1  0.001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1557  molybdate-binding protein  30.67 
 
 		 317 aa  43.1  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0804  regulatory protein MerR  32.1 
 
 		 132 aa  42.4  0.002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5538  DNA binding domain-containing protein  36.73 
 
 		 64 aa  40.8  0.006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1031  excisionase/Xis, DNA-binding  36.73 
 
 		 64 aa  40.8  0.007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.126715 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1158  DNA binding domain protein, excisionase family  37.5 
 
 		 320 aa  40.4  0.008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000597249  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>