More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AFE_1605 on replicon NC_011761
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011761  AFE_1605  ABC transporter, ATP-binding protein  100 
 
 		 309 aa  618  1e-176  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.692946  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1912  ABC multidrug efflux pump, ATPase subunit  74.25 
 
 		 316 aa  447  1e-125  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0244419  normal  0.149204 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1293  ABC transporter, ATP-binding protein  70.26 
 
 		 350 aa  426  1e-118  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.906267  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0859  ABC transporter related  61.54 
 
 		 319 aa  371  1e-102  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0838587  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1900  ABC transporter related  52.17 
 
 		 314 aa  333  3e-90  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1149  ABC transporter related  53.9 
 
 		 324 aa  332  4e-90  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.283923  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0657  ABC transporter-related protein  52.81 
 
 		 320 aa  330  2e-89  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00186139 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1780  ABC transporter related protein  56.61 
 
 		 312 aa  330  2e-89  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.150839  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3462  ABC transporter-related protein  53.64 
 
 		 308 aa  323  3e-87  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1761  ABC transporter related  51.67 
 
 		 322 aa  315  8e-85  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.726529  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3276  ABC transporter related protein  51.19 
 
 		 319 aa  308  8e-83  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0973  ABC transporter related  51.01 
 
 		 319 aa  307  1.0000000000000001e-82  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0918  ABC transporter related  51.01 
 
 		 333 aa  297  1e-79  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.800734 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2108  ABC transporter related  48.33 
 
 		 325 aa  297  2e-79  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.947862  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3106  ABC transporter related  61.57 
 
 		 510 aa  291  1e-77  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2905  ABC transporter related  61.26 
 
 		 512 aa  290  3e-77  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.725658  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1588  ABC transporter related  50 
 
 		 307 aa  286  2.9999999999999996e-76  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.187855  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2448  ABC transporter-related protein  48.98 
 
 		 314 aa  285  5e-76  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1355  ABC transporter related  49.49 
 
 		 315 aa  275  1.0000000000000001e-72  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000405969  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0917  ABC transporter related  45.48 
 
 		 312 aa  261  8e-69  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.807075 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0894  ABC transporter related  49.35 
 
 		 314 aa  260  2e-68  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0114  ABC transporter related  51.83 
 
 		 270 aa  259  6e-68  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4678  ABC transporter related  44.63 
 
 		 667 aa  257  2e-67  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2926  ABC transporter related  45.07 
 
 		 316 aa  256  2e-67  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2918  ABC transporter related  51.79 
 
 		 247 aa  256  4e-67  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.79893  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1083  ABC transport system ATPase component  46.58 
 
 		 304 aa  256  5e-67  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.323648 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1763  ABC transporter related  44.08 
 
 		 311 aa  254  9e-67  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.612212  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4202  ABC transporter related  42.43 
 
 		 335 aa  253  2.0000000000000002e-66  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.933672  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2809  ABC transporter related  51.83 
 
 		 255 aa  253  4.0000000000000004e-66  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.640321 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1901  ABC transporter related  45 
 
 		 323 aa  253  4.0000000000000004e-66  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.298526  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2106  ABC transporter related  44.07 
 
 		 311 aa  253  4.0000000000000004e-66  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3667  ABC transporter related  47.21 
 
 		 311 aa  252  6e-66  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.326957  normal  0.633009 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1108  ABC transporter related  54.38 
 
 		 255 aa  251  1e-65  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.298542 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5639  ABC transporter related  49.54 
 
 		 248 aa  250  2e-65  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.307001 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0403  ABC transporter, ATP-binding protein  44.55 
 
 		 305 aa  250  2e-65  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1720  ABC transporter, ATPase subunit  41.64 
 
 		 315 aa  249  4e-65  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.062047  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3538  ABC transporter related  43.29 
 
 		 323 aa  249  4e-65  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4362  ABC transporter related  43.23 
 
 		 322 aa  248  1e-64  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3222  ABC transporter-related protein  46.98 
 
 		 322 aa  248  1e-64  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.209487  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1793  ABC transporter related  46.05 
 
 		 313 aa  247  2e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  decreased coverage  0.00000132087  normal  0.412838 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3307  ABC transporter related  47.12 
 
 		 322 aa  247  2e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001403  ABC-type multidrug transport system ATPase component  42.3 
 
 		 308 aa  246  4.9999999999999997e-64  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1080  ATPase  53.85 
 
 		 275 aa  246  4.9999999999999997e-64  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1264  putative ABC transporter, ATP-binding protein  41.88 
 
 		 308 aa  243  3e-63  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000993133  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1036  ABC transporter related  45.81 
 
 		 328 aa  243  3.9999999999999997e-63  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0699  ATPase  45.97 
 
 		 354 aa  241  9e-63  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0718  ABC transporter related  43.87 
 
 		 314 aa  241  9e-63  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.226076  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3251  ABC transporter related  53.21 
 
 		 581 aa  241  1e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4697  ABC transporter related  52.68 
 
 		 582 aa  241  1e-62  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.793973  normal  0.717601 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1328  ABC transporter-related protein  50.22 
 
 		 576 aa  241  1e-62  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2901  ABC transporter related  48.88 
 
 		 580 aa  240  2e-62  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2813  ABC transporter, ATP-binding protein  48.88 
 
 		 580 aa  240  2e-62  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0658  ABC transporter-related protein  43.33 
 
 		 308 aa  240  2e-62  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00292078 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3113  ABC transporter, ATPase subunit  47.46 
 
 		 322 aa  240  2e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5304  putative ABC transporter ATP-binding protein  44.12 
 
 		 311 aa  240  2e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.664589  normal  0.137036 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3453  ABC transporter related  42.38 
 
 		 323 aa  240  2.9999999999999997e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.155551  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06358  ABC transporter component  42.62 
 
 		 308 aa  239  2.9999999999999997e-62  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3001  ABC transporter related  53.21 
 
 		 585 aa  239  4e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4664  ABC transporter related  43.18 
 
 		 318 aa  239  5.999999999999999e-62  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.019733  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3463  ABC transporter-related protein  43.62 
 
 		 305 aa  238  8e-62  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0130  ABC transporter related  51.79 
 
 		 576 aa  238  8e-62  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4311  ABC transporter related  44.77 
 
 		 317 aa  238  1e-61  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5056  ABC transporter related  45.39 
 
 		 302 aa  237  1e-61  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.844299 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0586  ABC transporter-related protein  42.43 
 
 		 327 aa  237  2e-61  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.737047  hitchhiker  0.000179773 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00761  fused predicted transporter subunits of ABC superfamily: ATP-binding components  49.32 
 
 		 578 aa  236  3e-61  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2848  ABC transporter related protein  49.32 
 
 		 578 aa  236  3e-61  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0848  ABC transporter, ATP-binding protein  49.32 
 
 		 578 aa  236  3e-61  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0859  ABC transporter, ATP-binding protein  49.32 
 
 		 578 aa  236  3e-61  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2558  ABC transporter, ATP-binding protein  49.32 
 
 		 578 aa  236  3e-61  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.943618  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0053  ABC transporter related  40.58 
 
 		 326 aa  236  3e-61  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2849  ABC transporter related  49.32 
 
 		 578 aa  236  3e-61  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.037407 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0817  ABC transporter, ATP-binding protein  49.32 
 
 		 578 aa  236  3e-61  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4163  ABC transporter related  42.02 
 
 		 323 aa  236  3e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.417858  normal  0.351966 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2369  ABC transporter related  52.07 
 
 		 575 aa  236  3e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.296305  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00778  hypothetical protein  49.32 
 
 		 578 aa  236  3e-61  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0942  ABC transporter, ATP-binding protein  49.32 
 
 		 578 aa  236  3e-61  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0147  ABC transporter, ATP-binding protein  43.67 
 
 		 309 aa  236  3e-61  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000626362  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0164  ABC transporter ATP-binding protein  40.76 
 
 		 321 aa  236  4e-61  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0222802  normal  0.939633 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2421  ABC transporter related  50.22 
 
 		 582 aa  236  4e-61  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.259147  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3706  ABC transporter related  51.87 
 
 		 594 aa  236  4e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1148  ABC transporter related  40.92 
 
 		 307 aa  236  4e-61  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00842419  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0349  ABC transporter-related protein  42.43 
 
 		 328 aa  236  5.0000000000000005e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3690  ABC transporter related  41.8 
 
 		 323 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2055  export ABC transporter ATP-binding protein  43.43 
 
 		 312 aa  235  6e-61  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.35923  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2708  ABC transporter related  49.61 
 
 		 691 aa  235  6e-61  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.163982  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1520  ABC transporter related  48.86 
 
 		 580 aa  234  9e-61  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.226797  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1285  ABC transporter related  48.23 
 
 		 579 aa  235  9e-61  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0972  ABC transporter related  43.92 
 
 		 307 aa  235  9e-61  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0880  ABC transporter ATP-binding protein  48.4 
 
 		 578 aa  234  1.0000000000000001e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0852  ABC transporter, ATP-binding protein  48.4 
 
 		 578 aa  234  1.0000000000000001e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1045  ABC transporter related  40.74 
 
 		 311 aa  234  1.0000000000000001e-60  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0056  ABC transporter related  40.26 
 
 		 326 aa  234  1.0000000000000001e-60  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.991306  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0944  ABC transporter ATP-binding protein  48.4 
 
 		 578 aa  234  1.0000000000000001e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0965  ABC transporter ATP-binding protein  48.4 
 
 		 578 aa  234  1.0000000000000001e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1134  ABC transporter related  41.25 
 
 		 651 aa  234  2.0000000000000002e-60  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1792  ABC transporter component  50.92 
 
 		 580 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.380874  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3277  ABC transporter related protein  43.14 
 
 		 307 aa  233  2.0000000000000002e-60  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0912  ABC transporter ATP-binding protein  48.4 
 
 		 578 aa  234  2.0000000000000002e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2512  ABC transporter related  49.12 
 
 		 583 aa  233  2.0000000000000002e-60  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.58848  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4062  ABC transporter related protein  50 
 
 		 583 aa  233  4.0000000000000004e-60  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>