More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AFE_1486 on replicon NC_011761
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011761  AFE_1486  biopolymer transport protein, ExbD/TolR family  100 
 
 
131 aa  264  2.9999999999999995e-70  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1201  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  100 
 
 
131 aa  264  2.9999999999999995e-70  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000102813 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1943  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  52.76 
 
 
129 aa  142  2e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1916  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  53.12 
 
 
133 aa  135  1e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2269  biopolymer transport protein, ExbD/TolR family  53.12 
 
 
133 aa  135  1e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.309606  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2300  biopolymer transport protein, ExbD/TolR family  52.89 
 
 
124 aa  134  4e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.562465  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3004  biopolymer transport protein, ExbD/TolR family  51.56 
 
 
132 aa  131  3.9999999999999996e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2614  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  51.56 
 
 
132 aa  131  3.9999999999999996e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1461  biopolymer transport protein ExbD/TolR  48.44 
 
 
154 aa  125  3e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.247373  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0769  biopolymer transport protein, ExbD/TolR family  50.82 
 
 
132 aa  123  1e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0912  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  50.82 
 
 
132 aa  123  1e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1190  biopolymer transport protein ExbD/TolR  40.94 
 
 
137 aa  105  2e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.693897  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0874  biopolymer transport protein ExbD/TolR  38.81 
 
 
135 aa  90.5  7e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.7959 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1012  TonB system transport protein  38.81 
 
 
135 aa  89.7  1e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0600  biopolymer transport protein ExbD/TolR  39.69 
 
 
135 aa  89.4  2e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0812  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  39.34 
 
 
134 aa  85.9  2e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0400  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  29.01 
 
 
131 aa  65.9  0.0000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.376121  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2345  biopolymer transport protein ExbD/TolR  32 
 
 
146 aa  65.1  0.0000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.231311  normal  0.0225242 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0736  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  36.75 
 
 
143 aa  64.7  0.0000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1213  protein TolR  36 
 
 
147 aa  64.3  0.0000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4055  biopolymer transport protein ExbD/TolR  31.5 
 
 
135 aa  64.3  0.0000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0487  biopolymer transport protein ExbD/TolR  32.79 
 
 
137 aa  63.5  0.0000000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.181601  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2346  biopolymer transport protein ExbD/TolR  29.69 
 
 
145 aa  63.2  0.000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0853163  normal  0.0509628 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2392  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  27.42 
 
 
133 aa  62  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.791616 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0646  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  32 
 
 
134 aa  62  0.000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.419547  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0486  biopolymer transport protein, ExbD/TolR family  32 
 
 
134 aa  62  0.000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.244667  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1063  biopolymer transport protein ExbD/TolR  25.6 
 
 
135 aa  60.5  0.000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2237  biopolymer ExbD/TolR family transporter  32.28 
 
 
134 aa  60.5  0.000000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.271991  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2155  biopolymer transport protein (ExbD2)  27.82 
 
 
136 aa  60.1  0.000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2301  biopolymer transport protein ExbD/TolR  33.06 
 
 
133 aa  60.1  0.000000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03432  Biopolymer transport protein  24 
 
 
135 aa  58.9  0.00000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2262  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  28.12 
 
 
141 aa  58.5  0.00000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.144392  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4538  TolR protein  32.37 
 
 
146 aa  58.2  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4210  TonB system transport protein ExbD type-1  31.5 
 
 
142 aa  58.5  0.00000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1543  biopolymer transport protein ExbD/TolR  27.13 
 
 
135 aa  58.5  0.00000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2716  biopolymer transport protein ExbD/TolR  31.01 
 
 
138 aa  58.5  0.00000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0557943  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3121  protein TolR  30.77 
 
 
142 aa  58.5  0.00000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1460  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  32.23 
 
 
158 aa  58.2  0.00000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51740  TolR protein  32.37 
 
 
146 aa  58.2  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0101841  hitchhiker  0.0000169267 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2363  protein TolR  30.4 
 
 
139 aa  57.8  0.00000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.372464 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0753  biopolymer transport protein ExbD/TolR  33.33 
 
 
144 aa  57.8  0.00000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0347505  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2772  biopolymer transport protein ExbD/TolR  28.12 
 
 
141 aa  57.8  0.00000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1851  biopolymer transport protein ExbD/TolR  34.13 
 
 
145 aa  57.8  0.00000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1563  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  29.69 
 
 
135 aa  57.4  0.00000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3630  biopolymer ExbD/TolR family transporter  32.28 
 
 
146 aa  57.4  0.00000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2923  biopolymer transport protein ExbD/TolR  29.01 
 
 
144 aa  57  0.00000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.986403 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3973  biopolymer transport exbD protein  25.2 
 
 
136 aa  57  0.00000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4449  biopolymer transport protein ExbD/TolR  29.84 
 
 
207 aa  57  0.00000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0560  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  26.77 
 
 
137 aa  57  0.00000009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.326497 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1369  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  30.16 
 
 
133 aa  57  0.00000009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1227  tolR protein  28.35 
 
 
146 aa  56.2  0.0000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.165973  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2955  putative TolR-like translocation protein  32.03 
 
 
142 aa  56.2  0.0000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.163827  normal  0.682621 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2428  biopolymer transport ExbD like protein  27.87 
 
 
148 aa  56.6  0.0000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.303812 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2221  biopolymer transport protein ExbD/TolR  33.33 
 
 
134 aa  56.2  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.109447  normal  0.312711 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2901  biopolymer transport protein ExbD/TolR  29.29 
 
 
147 aa  56.2  0.0000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00149833  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0281  biopolymer transport protein ExbD/TolR  30.4 
 
 
139 aa  56.2  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.149561  hitchhiker  0.000106063 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2891  biopolymer transport protein ExbD/TolR  28.03 
 
 
146 aa  56.2  0.0000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.123958 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1618  biopolymer transport protein ExbD/TolR  26.67 
 
 
136 aa  56.2  0.0000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.272583  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0455  biopolymer transport protein (ExbD2)  30.33 
 
 
134 aa  55.8  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0057258  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3007  biopolymer transport protein ExbD/TolR  27.27 
 
 
143 aa  55.5  0.0000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3918  biopolymer transport protein ExbD/TolR  29.23 
 
 
148 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.833668  normal  0.0813936 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1587  protein TolR  28.89 
 
 
138 aa  55.5  0.0000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.437138  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0690  biopolymer transport protein  31.67 
 
 
132 aa  56.2  0.0000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0276966  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0761  protein TolR  29.23 
 
 
148 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.156142  normal  0.243025 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3974  tolR protein  29.29 
 
 
154 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.0054859  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1413  biopolymer transport protein ExbD/TolR  29.29 
 
 
154 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.039355  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0793  biopolymer transport protein ExbD/TolR  30.08 
 
 
145 aa  55.1  0.0000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2403  biopolymer transport protein ExbD/TolR  25 
 
 
135 aa  55.5  0.0000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2608  biopolymer transport protein ExbD/TolR  27.05 
 
 
135 aa  55.1  0.0000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0506  biopolymer transport protein ExbD/TolR  31.3 
 
 
154 aa  54.7  0.0000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.529067  hitchhiker  0.000695312 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1460  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  29.82 
 
 
138 aa  54.7  0.0000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0273  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  29.41 
 
 
136 aa  54.7  0.0000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2155  biopolymer transport protein ExbD/TolR  28.1 
 
 
134 aa  54.7  0.0000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0438  biopolymer ExbD/TolR family transporter  31.45 
 
 
137 aa  54.3  0.0000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.744335  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2145  biopolymer transport protein ExbD/TolR  30.51 
 
 
167 aa  54.3  0.0000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0346  biopolymer transport protein ExbD  31.09 
 
 
141 aa  54.7  0.0000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0143  biopolymer transport protein ExbD/TolR  29.45 
 
 
148 aa  54.3  0.0000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2390  biopolymer transport protein  35.77 
 
 
133 aa  53.9  0.0000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.817875  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0898  biopolymer transport protein ExbD/TolR  37.04 
 
 
132 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.250835  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3580  protein TolR  28.23 
 
 
139 aa  53.5  0.0000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0586  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  27.27 
 
 
136 aa  53.5  0.0000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0531481  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3760  TonB system transport protein ExbD  29.41 
 
 
139 aa  53.5  0.0000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0358  biopolymer ExbD/TolR family transporter  30.33 
 
 
135 aa  53.5  0.0000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0309097 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0173  biopolymer ExbD/TolR family transporter  27.69 
 
 
136 aa  53.1  0.000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.311198  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0573  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  27.87 
 
 
139 aa  53.1  0.000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.234389  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1460  biopolymer transport protein ExbD/TolR  27.87 
 
 
135 aa  53.1  0.000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1805  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  27.27 
 
 
137 aa  53.1  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.654076  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3511  protein TolR  28.23 
 
 
139 aa  53.1  0.000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0114553  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2919  biopolymer transport protein ExbD/TolR  30.83 
 
 
134 aa  53.1  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0661927  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3062  biopolymer transport protein ExbD/TolR  27.12 
 
 
127 aa  53.1  0.000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.196503  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1656  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  27.27 
 
 
142 aa  53.5  0.000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.310193  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2277  biopolymer transport protein ExbD/TolR  32.2 
 
 
139 aa  52.8  0.000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0227736  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4593  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  35.8 
 
 
132 aa  53.1  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0470  biopolymer transport protein ExbD/TolR  30 
 
 
141 aa  52.8  0.000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.923665 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0244  biopolymer transport protein ExbD/TolR  29.92 
 
 
149 aa  52.8  0.000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0844  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  27.69 
 
 
183 aa  53.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0364273 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0861  protein TolR  29.41 
 
 
152 aa  52.8  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.0000417761  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2012  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  27.64 
 
 
219 aa  52  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0915  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  24.62 
 
 
140 aa  52.8  0.000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.574244  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0011  biopolymer transport protein ExbD/TolR  27.56 
 
 
136 aa  52.4  0.000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>