More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AFE_1445 on replicon NC_011761
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011761  AFE_1445  elongation factor Ts  100 
 
 
292 aa  579  1e-164  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0721565  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1161  elongation factor Ts  100 
 
 
292 aa  579  1e-164  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.899352 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1160  elongation factor Ts  55.22 
 
 
293 aa  309  4e-83  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0809  elongation factor Ts  55.56 
 
 
294 aa  307  2e-82  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.333937  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1453  translation elongation factor Ts  55.1 
 
 
292 aa  301  7e-81  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.358895  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0568  elongation factor Ts  55.89 
 
 
293 aa  299  3e-80  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.011982  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1862  elongation factor Ts  53.38 
 
 
292 aa  295  9e-79  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.981206  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1465  elongation factor Ts  52.7 
 
 
291 aa  290  2e-77  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.456181  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1672  elongation factor Ts  53.24 
 
 
292 aa  288  7e-77  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1678  elongation factor Ts  53.24 
 
 
292 aa  287  1e-76  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1544  elongation factor Ts  51.85 
 
 
296 aa  286  2e-76  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0609  elongation factor Ts  51.85 
 
 
296 aa  286  2e-76  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.00638051  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1496  translation elongation factor Ts  52.7 
 
 
289 aa  284  1e-75  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0658  elongation factor Ts  52.2 
 
 
302 aa  276  4e-73  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2980  elongation factor Ts  52.76 
 
 
285 aa  275  5e-73  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.340847  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0564  translation elongation factor Ts (EF-Ts)  53.42 
 
 
289 aa  273  2e-72  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3434  elongation factor Ts  50.85 
 
 
285 aa  272  6e-72  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  4.83484e-05  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1014  elongation factor Ts  50.85 
 
 
285 aa  272  6e-72  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  1.40304e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1067  elongation factor Ts  50.85 
 
 
285 aa  272  6e-72  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0055688  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01373  elongation factor Ts  52.22 
 
 
290 aa  269  4e-71  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000291458  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3164  elongation factor Ts  51.38 
 
 
285 aa  269  5e-71  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.347737  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1284  elongation factor Ts  51.72 
 
 
294 aa  265  7e-70  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  1.49192e-10  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3433  translation elongation factor Ts  51.72 
 
 
283 aa  265  9e-70  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0243528  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3490  elongation factor Ts  51.72 
 
 
283 aa  265  9e-70  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.126778  normal  0.506395 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0180  elongation factor Ts  51.72 
 
 
283 aa  265  9e-70  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00454958  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00168  elongation factor Ts  51.72 
 
 
283 aa  265  9e-70  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0115413  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0174  elongation factor Ts  51.72 
 
 
283 aa  265  9e-70  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0152981  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0163  elongation factor Ts  51.72 
 
 
283 aa  265  9e-70  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00406817  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0181  elongation factor Ts  51.72 
 
 
283 aa  265  9e-70  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0337912  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00167  hypothetical protein  51.72 
 
 
283 aa  265  9e-70  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00987131  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0172  elongation factor Ts  51.72 
 
 
283 aa  265  9e-70  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.403994  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38980  elongation factor Ts  50.89 
 
 
289 aa  259  3e-68  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0708  elongation factor Ts  50 
 
 
283 aa  259  4e-68  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0168239  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0942  elongation factor Ts  51.03 
 
 
283 aa  258  9e-68  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00345216  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0255  elongation factor Ts  50.69 
 
 
283 aa  257  1e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0242  elongation factor Ts  50.69 
 
 
283 aa  257  1e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0239  elongation factor Ts  50.69 
 
 
283 aa  257  1e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.62558 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0239  elongation factor Ts  50.69 
 
 
283 aa  257  1e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.637528  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0257  elongation factor Ts  50.34 
 
 
283 aa  256  4e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0428296  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01131  elongation factor Ts  50.51 
 
 
292 aa  255  5e-67  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.179274  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3359  elongation factor Ts  50.69 
 
 
283 aa  255  6e-67  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.461306  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1089  elongation factor Ts  51.03 
 
 
283 aa  254  2e-66  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0664105  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1250  elongation factor Ts  50.18 
 
 
290 aa  253  4e-66  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2596  elongation factor Ts  50 
 
 
290 aa  252  5e-66  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.526378  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3789  elongation factor Ts  48.62 
 
 
283 aa  252  5e-66  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00180508 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2150  elongation factor Ts  49.49 
 
 
292 aa  246  3e-64  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0274457  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1554  elongation factor Ts  48.1 
 
 
282 aa  246  4e-64  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1841  translation elongation factor Ts (EF-Ts)  46.41 
 
 
303 aa  243  4e-63  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.844303 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2065  elongation factor Ts  49.15 
 
 
292 aa  241  9e-63  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1535  translation elongation factor Ts  47.75 
 
 
287 aa  241  1e-62  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1344  elongation factor Ts  47.75 
 
 
287 aa  241  1e-62  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.483596 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2975  translation elongation factor Ts  49.1 
 
 
292 aa  241  1e-62  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3052  elongation factor Ts  49.47 
 
 
287 aa  238  8e-62  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.204992  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1102  elongation factor Ts  47.24 
 
 
287 aa  235  5e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.433956  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1142  elongation factor Ts  50.17 
 
 
294 aa  235  8e-61  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  6.57358e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1273  elongation factor Ts  48.11 
 
 
286 aa  234  1e-60  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00309579  normal  0.676189 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3725  elongation factor Ts  48.31 
 
 
296 aa  234  1e-60  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.689523  normal  0.208993 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0079  translation elongation factor Ts  43.48 
 
 
294 aa  234  1e-60  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  5.72472e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1484  elongation factor Ts  48.75 
 
 
289 aa  232  7e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.113842  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17070  elongation factor Ts  48.75 
 
 
289 aa  232  7e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2034  elongation factor Ts  49.16 
 
 
294 aa  231  1e-59  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4081  elongation factor Ts  47.52 
 
 
287 aa  230  2e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.356848 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2679  translation elongation factor Ts  43.37 
 
 
310 aa  229  3e-59  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  3.00093e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0461  elongation factor Ts  44.66 
 
 
307 aa  229  4e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.679488  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1147  elongation factor Ts  47.52 
 
 
287 aa  229  5e-59  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1592  elongation factor Ts  47.16 
 
 
287 aa  228  1e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.767126  normal  0.635775 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4185  elongation factor Ts  47.16 
 
 
287 aa  228  1e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3873  elongation factor Ts  48.67 
 
 
295 aa  226  2e-58  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  8.77189e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2478  elongation factor Ts  49.16 
 
 
295 aa  227  2e-58  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  7.42116e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2547  elongation factor Ts  49.82 
 
 
306 aa  227  2e-58  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3867  elongation factor Ts  48.67 
 
 
295 aa  226  2e-58  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  4.42897e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2426  elongation factor Ts  47.93 
 
 
282 aa  227  2e-58  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00181853  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3649  elongation factor Ts  48.67 
 
 
295 aa  226  4e-58  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00136281  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0351  elongation factor Ts  47.42 
 
 
294 aa  226  5e-58  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.556574  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3838  elongation factor Ts  48.67 
 
 
295 aa  225  6e-58  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  5.61449e-62 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3964  elongation factor Ts  48.67 
 
 
295 aa  225  6e-58  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  4.29522e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3677  elongation factor Ts  48.67 
 
 
295 aa  225  6e-58  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0354011  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3567  elongation factor Ts  48.67 
 
 
295 aa  225  6e-58  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  9.87514e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3585  elongation factor Ts  48.67 
 
 
295 aa  225  6e-58  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.425648  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1953  elongation factor Ts  45.45 
 
 
303 aa  225  7e-58  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.055152  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1671  elongation factor Ts  45.45 
 
 
303 aa  225  7e-58  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  5.32175e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1132  elongation factor Ts  43.55 
 
 
307 aa  225  8e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1777  elongation factor Ts  45.13 
 
 
308 aa  224  1e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03236  elongation factor Ts  48.79 
 
 
281 aa  224  1e-57  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0559  elongation factor Ts  48.2 
 
 
292 aa  224  1e-57  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0031589 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0390  elongation factor Ts  47.08 
 
 
294 aa  224  2e-57  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.432291  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2030  elongation factor Ts  46.95 
 
 
310 aa  223  2e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1584  elongation factor Ts  45.13 
 
 
308 aa  224  2e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1319  elongation factor Ts  48.33 
 
 
295 aa  223  3e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  6.05396e-05  hitchhiker  4.6093e-17 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2525  elongation factor Ts  43.51 
 
 
308 aa  223  3e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1809  elongation factor Ts  42.25 
 
 
288 aa  223  3e-57  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.864602  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2827  elongation factor Ts  44.22 
 
 
308 aa  223  4e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.161224  normal  0.539807 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1858  elongation factor Ts  45.64 
 
 
307 aa  222  6e-57  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0307388 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1695  elongation factor Ts  47.44 
 
 
301 aa  222  7e-57  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4516  elongation factor Ts  46.13 
 
 
300 aa  222  7e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2305  elongation factor Ts  45.51 
 
 
291 aa  222  7e-57  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.427266  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1382  elongation factor Ts  43.85 
 
 
307 aa  221  8e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3924  elongation factor Ts  48 
 
 
295 aa  221  8e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000450684  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1695  elongation factor Ts  45.45 
 
 
307 aa  220  2e-56  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1118  elongation factor Ts  45.98 
 
 
305 aa  219  4e-56  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.681588  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>