More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AFE_1443 on replicon NC_011761
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011206  Lferr_1159  hypothetical protein  100 
 
 		 196 aa  384  1e-106  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1443  membrane protein, DedA family  100 
 
 		 196 aa  384  1e-106  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.611046  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5989  hypothetical protein  39.66 
 
 		 196 aa  128  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5252  DedA family protein  40.78 
 
 		 220 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0291  hypothetical protein  41.61 
 
 		 220 aa  123  2e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3150  hypothetical protein  40.78 
 
 		 185 aa  121  5e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.942177  normal  0.360239 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69250  hypothetical protein  40.12 
 
 		 196 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5218  DedA family protein  40.99 
 
 		 214 aa  119  3e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.488895  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5041  hypothetical protein  40.62 
 
 		 214 aa  119  3e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.273824  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5127  hypothetical protein  40.37 
 
 		 214 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2029  hypothetical protein  37.16 
 
 		 202 aa  115  3e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.21733  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2688  uncharacterized membrane-associated protein-like protein  34.04 
 
 		 206 aa  114  6e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.69909  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1350  SNARE associated Golgi protein  36.81 
 
 		 187 aa  114  1.0000000000000001e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00752365  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1551  uncharacterized membrane-associated protein-like protein  32.98 
 
 		 212 aa  110  1.0000000000000001e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000813787 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1368  hypothetical protein  37.85 
 
 		 212 aa  109  2.0000000000000002e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000019954  hitchhiker  0.00000047765 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0298  hypothetical protein  36.56 
 
 		 184 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1474  DedA family protein  37.29 
 
 		 204 aa  106  3e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.313098  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1541  hypothetical protein  38.37 
 
 		 193 aa  105  5e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0551154 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2359  inner membrane protein YohD  34.78 
 
 		 189 aa  102  4e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.84239  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2516  inner membrane protein YohD  34.78 
 
 		 189 aa  102  4e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2404  hypothetical protein  34.78 
 
 		 189 aa  102  4e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2315  inner membrane protein YohD  34.78 
 
 		 189 aa  102  4e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5466  hypothetical protein  39.75 
 
 		 218 aa  101  8e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.939965  normal  0.0246648 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2408  inner membrane protein YohD  34.24 
 
 		 189 aa  100  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.425446  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02066  conserved inner membrane protein  39.16 
 
 		 192 aa  97.1  1e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1521  SNARE associated Golgi protein-like protein  39.16 
 
 		 192 aa  97.1  1e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0907  hypothetical protein  39.16 
 
 		 192 aa  97.1  1e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.339562  normal  0.188855 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2426  hypothetical protein  39.16 
 
 		 192 aa  97.4  1e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1511  SNARE associated Golgi protein  39.16 
 
 		 192 aa  97.1  1e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02024  hypothetical protein  39.16 
 
 		 192 aa  97.1  1e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2271  hypothetical protein  39.16 
 
 		 192 aa  97.1  1e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0835  hypothetical protein  39.16 
 
 		 192 aa  97.1  1e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3263  hypothetical protein  39.16 
 
 		 192 aa  96.7  2e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0121567 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2736  hypothetical protein  33.52 
 
 		 188 aa  97.1  2e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.629413  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2742  DedA family protein  32.95 
 
 		 193 aa  95.5  4e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4992  SNARE associated Golgi protein  33.5 
 
 		 200 aa  94.7  8e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1607  phage integrase family site specific recombinase  32.7 
 
 		 201 aa  92.4  4e-18  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.000335594  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0679  conserved hypothetical integral membrane protein, DedA family  36.92 
 
 		 197 aa  90.1  2e-17  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0935  DedA family protein  38.17 
 
 		 198 aa  88.6  6e-17  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.754047  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1400  integral membrane protein  33.79 
 
 		 189 aa  87.8  9e-17  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.965854  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0887  integral membrane protein  33.58 
 
 		 187 aa  87.4  1e-16  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1215  hypothetical protein  28.73 
 
 		 187 aa  86.7  2e-16  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.758432  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1168  DedA family protein  33.09 
 
 		 203 aa  85.9  3e-16  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.247815  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1006  DedA family protein  37.4 
 
 		 198 aa  85.9  4e-16  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.738671  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0886  DedA family protein  37.4 
 
 		 198 aa  85.9  4e-16  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2869  SNARE associated Golgi protein  29.49 
 
 		 203 aa  85.1  6e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0399631 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0504  integral membrane protein  32.17 
 
 		 189 aa  84.7  8e-16  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0036  hypothetical protein  31.85 
 
 		 204 aa  83.2  0.000000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1045  DedA family protein  35.88 
 
 		 204 aa  83.2  0.000000000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.429498  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1695  integral membrane protein  30.06 
 
 		 190 aa  80.1  0.00000000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1394  SNARE associated Golgi protein  32.75 
 
 		 256 aa  79.7  0.00000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.527728  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0628  hypothetical protein  30.05 
 
 		 199 aa  79  0.00000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.341746 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0915  hypothetical protein  32.45 
 
 		 206 aa  79.3  0.00000000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.00745427  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0542  SNARE associated Golgi protein  32.26 
 
 		 188 aa  78.2  0.00000000000007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00029156  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1307  GTP-binding protein  27.27 
 
 		 189 aa  75.5  0.0000000000005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0416159  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1316  preprotein translocase, YajC subunit  30.92 
 
 		 179 aa  75.5  0.0000000000005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000599  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1164  SNARE associated Golgi protein  28.64 
 
 		 203 aa  75.1  0.0000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4224  DedA protein (DSG-1 protein)  30.86 
 
 		 220 aa  70.9  0.00000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0539738  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0838  hypothetical protein  34.31 
 
 		 229 aa  70.1  0.00000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0807  phosphoesterase, PA-phosphatase related  35.33 
 
 		 664 aa  69.7  0.00000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.568795  normal  0.843348 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1764  SNARE associated Golgi protein  29.1 
 
 		 223 aa  69.7  0.00000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000231934 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1224  DedA family protein  26.88 
 
 		 185 aa  67.4  0.0000000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1332  integral membrane protein  28.89 
 
 		 185 aa  67.4  0.0000000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1344  DedA family protein  26.88 
 
 		 185 aa  67  0.0000000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0240972  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1467  SNARE associated Golgi protein  29.11 
 
 		 213 aa  66.2  0.0000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2256  SNARE associated Golgi protein  29.95 
 
 		 224 aa  67  0.0000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0232  phosphoesterase, PA-phosphatase related  36.03 
 
 		 457 aa  66.6  0.0000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0186  SNARE associated Golgi protein  27.23 
 
 		 209 aa  66.6  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4897  dedA protein  25.7 
 
 		 204 aa  66.2  0.0000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4760  DedA family protein  25.7 
 
 		 204 aa  66.2  0.0000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5272  dedA protein  25.7 
 
 		 204 aa  66.2  0.0000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0519  DedA family protein  25.27 
 
 		 185 aa  66.2  0.0000000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.72895  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5141  dedA protein  25.7 
 
 		 204 aa  66.2  0.0000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2487  hypothetical protein  24.32 
 
 		 194 aa  66.2  0.0000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.35222  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0704  SNARE associated Golgi protein  28.57 
 
 		 202 aa  66.2  0.0000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.693025  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4069  SNARE associated Golgi protein  23.84 
 
 		 219 aa  65.9  0.0000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00208186  hitchhiker  0.00137396 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6745  SNARE associated Golgi protein  29.53 
 
 		 189 aa  65.9  0.0000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1452  hypothetical protein  27.78 
 
 		 237 aa  65.9  0.0000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  decreased coverage  0.00552947  normal  0.0731246 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_27115  predicted protein  26.92 
 
 		 252 aa  65.1  0.0000000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000197052  normal  0.0145567 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4741  dedA protein  25.7 
 
 		 204 aa  65.5  0.0000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.98218  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5176  dedA protein  25.7 
 
 		 204 aa  65.1  0.0000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0575  DedA family protein  27.96 
 
 		 213 aa  65.1  0.0000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.684924  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1810  SNARE associated Golgi protein  29.25 
 
 		 206 aa  64.7  0.0000000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5185  dedA protein  25.7 
 
 		 204 aa  64.7  0.0000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0859  SNARE associated Golgi protein  29.09 
 
 		 206 aa  64.7  0.0000000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1172  phosphoesterase PA-phosphatase related  27.22 
 
 		 676 aa  64.7  0.0000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.98006  normal  0.0665428 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0566  DedA family protein  28.65 
 
 		 206 aa  64.7  0.0000000009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.180728 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5832  SNARE associated Golgi protein  28.19 
 
 		 189 aa  64.3  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0701046  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5170  dedA protein  25.7 
 
 		 204 aa  63.5  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1709  SNARE associated Golgi protein-related protein  32.64 
 
 		 217 aa  63.5  0.000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01105  hypothetical protein  26.95 
 
 		 191 aa  63.5  0.000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2482  dedA protein  31.62 
 
 		 198 aa  63.5  0.000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.323289  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1818  SNARE associated Golgi protein  30.36 
 
 		 209 aa  63.5  0.000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.685944  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7566  hypothetical protein  31.37 
 
 		 218 aa  63.2  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2527  membrane protein, DedA family  28.93 
 
 		 215 aa  62.8  0.000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1291  SNARE associated Golgi protein  29.7 
 
 		 212 aa  62.8  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.677756  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2156  SNARE associated Golgi protein  28.93 
 
 		 215 aa  62.8  0.000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000142104 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1301  DedA protein (DSG-1 protein)  28.12 
 
 		 230 aa  63.2  0.000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0955835  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1167  DedA protein (DSG-1 protein)  26.75 
 
 		 219 aa  62.8  0.000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.482076  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1183  DedA family protein  32.08 
 
 		 677 aa  62.4  0.000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.157357  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>