138 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AFE_1304 on replicon NC_011761
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011761  AFE_1304  transposon resolvase  100 
 
 		 209 aa  433  1e-121  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0311544  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0754  Resolvase domain protein  45.45 
 
 		 207 aa  195  4.0000000000000005e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0941  resolvase domain-containing protein  42.64 
 
 		 208 aa  186  2e-46  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0143335  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1710  resolvase domain-containing protein  45.79 
 
 		 222 aa  179  2e-44  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1118  Resolvase domain protein  41.36 
 
 		 229 aa  155  4e-37  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000220769  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0272  Resolvase domain protein  40.84 
 
 		 229 aa  152  4e-36  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000593088  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0744  Resolvase domain protein  39.27 
 
 		 229 aa  146  2.0000000000000003e-34  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.000000124642  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0658  hypothetical protein  39.69 
 
 		 215 aa  145  3e-34  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1564  hypothetical protein  39.69 
 
 		 215 aa  145  3e-34  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.20655  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1270  Resolvase domain protein  36.02 
 
 		 195 aa  145  5e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2574  DNA binding domain protein, excisionase family  39.23 
 
 		 194 aa  139  3.9999999999999997e-32  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.235149  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3324  resolvase domain-containing protein  41.44 
 
 		 197 aa  139  3.9999999999999997e-32  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.296266  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2194  Resolvase domain protein  37.63 
 
 		 208 aa  137  1e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.72008  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2645  DNA binding domain protein, excisionase family  40.88 
 
 		 192 aa  135  4e-31  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1913  Resolvase domain protein  36.6 
 
 		 208 aa  135  6.0000000000000005e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2443  DNA binding domain protein, excisionase family  39.23 
 
 		 193 aa  134  8e-31  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.453884  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0948  site-specific integrase/resolvase  40.46 
 
 		 209 aa  134  9e-31  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.531266  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0895  DNA binding domain protein, excisionase family  40.88 
 
 		 192 aa  133  1.9999999999999998e-30  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2048  Resolvase domain protein  39.78 
 
 		 193 aa  133  1.9999999999999998e-30  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0322526  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0911  DNA binding domain protein, excisionase family  39.23 
 
 		 192 aa  128  8.000000000000001e-29  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  unclonable  0.00000302589  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3670  DNA binding domain-containing protein  37.06 
 
 		 201 aa  126  2.0000000000000002e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.635315  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2150  DNA binding domain protein, excisionase family  36.55 
 
 		 195 aa  124  1e-27  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3461  regulatory protein, MerR  67.9 
 
 		 128 aa  121  9.999999999999999e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1111  DNA binding domain-containing protein  35.23 
 
 		 215 aa  118  6e-26  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.385151  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1219  DNA binding domain protein, excisionase family  35 
 
 		 201 aa  117  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1808  DNA binding domain protein, excisionase family  36.18 
 
 		 219 aa  116  1.9999999999999998e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1513  DNA binding domain protein, excisionase family  35 
 
 		 213 aa  115  3e-25  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2716  DNA binding domain protein, excisionase family  35 
 
 		 213 aa  115  3e-25  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  decreased coverage  0.00788025  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0465  resolvase-like protein  33.68 
 
 		 219 aa  115  6.9999999999999995e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.123984  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3893  DNA binding domain protein, excisionase family  32.65 
 
 		 203 aa  114  6.9999999999999995e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3943  DNA binding domain protein, excisionase family  32.65 
 
 		 203 aa  114  6.9999999999999995e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000130893  normal  0.0337021 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1911  DNA binding domain-containing protein  36.36 
 
 		 216 aa  114  7.999999999999999e-25  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1241  Resolvase domain protein  33.16 
 
 		 222 aa  113  2.0000000000000002e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0456632  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1070  resolvase domain-containing protein  34.83 
 
 		 197 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.709621  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2393  DNA binding domain protein, excisionase family  36.11 
 
 		 191 aa  112  3e-24  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1174  DNA binding domain protein, excisionase family  35.18 
 
 		 219 aa  113  3e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.122691  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0785  Resolvase domain protein  33.33 
 
 		 202 aa  112  6e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00525149  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0131  DNA binding domain protein, excisionase family  36.18 
 
 		 216 aa  110  1.0000000000000001e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000948008  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0122  DNA binding domain protein, excisionase family  36.18 
 
 		 216 aa  110  1.0000000000000001e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1717  regulatory protein MerR  32.28 
 
 		 201 aa  110  2.0000000000000002e-23  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.212526  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0522  DNA binding domain protein, excisionase family  35.5 
 
 		 244 aa  108  5e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0170413  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0851  regulatory protein MerR  32.45 
 
 		 222 aa  108  6e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2781  Resolvase domain protein  32.45 
 
 		 222 aa  108  6e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.912906 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0751  Resolvase domain protein  32.11 
 
 		 209 aa  107  1e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1190  DNA binding domain protein, excisionase family  34.67 
 
 		 216 aa  104  9e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0818  DNA binding domain protein, excisionase family  35.68 
 
 		 216 aa  103  2e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1220  DNA binding domain protein, excisionase family  30.21 
 
 		 201 aa  103  2e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0390  DNA binding domain protein, excisionase family  34.17 
 
 		 216 aa  103  3e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0112175  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0484  DNA binding domain protein, excisionase family  34.17 
 
 		 216 aa  103  3e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.114276  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0947  Resolvase domain protein  32.12 
 
 		 195 aa  100  1e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000000151254  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0236  Resolvase domain protein  33.7 
 
 		 195 aa  100  1e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000223632  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1449  Resolvase domain protein  31.16 
 
 		 207 aa  96.7  2e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0392946  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2000  DNA binding domain protein, excisionase family  32.47 
 
 		 212 aa  94.4  1e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.27976  normal  0.357405 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1000  Resolvase domain protein  31.61 
 
 		 206 aa  93.6  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0589477 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2935  Resolvase domain protein  31.61 
 
 		 206 aa  93.6  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1105  transposon resolvase  32.98 
 
 		 196 aa  93.2  3e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.600674  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1033  transposon resolvase  37.12 
 
 		 204 aa  91.7  7e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.412274  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2002  regulatory protein, MerR  34.64 
 
 		 148 aa  91.7  8e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3431  resolvase-like protein  33.7 
 
 		 197 aa  89.4  4e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1224  putative site-specific integrase-resolvase  31.69 
 
 		 197 aa  89  4e-17  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.997311  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0684  resolvase domain-containing protein  32.61 
 
 		 190 aa  86.3  3e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.245344 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5676  resolvase domain-containing protein  32.61 
 
 		 190 aa  86.3  3e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2513  Resolvase domain protein  30.11 
 
 		 195 aa  85.1  6e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12805  resolvase  31.35 
 
 		 193 aa  84.3  0.000000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00189559  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2683  resolvase-like protein  31.32 
 
 		 190 aa  82.4  0.000000000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.300522  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10616  resolvase  30.81 
 
 		 202 aa  81.3  0.000000000000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000496522  normal  0.221326 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12994  resolvase  31.22 
 
 		 194 aa  79.7  0.00000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000478883  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0842  resolvase domain-containing protein  26.88 
 
 		 196 aa  79.7  0.00000000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.419  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1191  Resolvase domain protein  25 
 
 		 205 aa  69.3  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1614  resolvase domain-containing protein  29.82 
 
 		 182 aa  68.9  0.00000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00182311  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1218  resolvase domain protein  25 
 
 		 205 aa  68.6  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10939  resolvase  26.15 
 
 		 193 aa  67  0.0000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13862  resolvase  30.83 
 
 		 203 aa  65.1  0.0000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5986  resolvase domain-containing protein  31.45 
 
 		 162 aa  64.7  0.0000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00224994  normal  0.0280728 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0727  transposon resolvase  65.62 
 
 		 87 aa  55.1  0.0000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2084  regulatory protein MerR  43.94 
 
 		 94 aa  55.1  0.0000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0196  putative site-specific integrase-resolvase, degenerate  34.92 
 
 		 63 aa  54.3  0.000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000193839  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2776  putative resolvase  29 
 
 		 116 aa  51.6  0.000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.481265  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3717  regulatory protein MerR  35.37 
 
 		 315 aa  50.8  0.00001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12900  resolvase  30.06 
 
 		 295 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0601752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2343  resolvase domain-containing protein  28.03 
 
 		 218 aa  48.5  0.00008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0795867  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2120  Resolvase domain protein  27.07 
 
 		 217 aa  47.8  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1891  transposase OrfA  37.29 
 
 		 74 aa  47.8  0.0001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2159  DNA binding domain protein, excisionase family  44.44 
 
 		 72 aa  47.8  0.0001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010579  XfasM23_2258  resolvase domain-containing protein  37.29 
 
 		 74 aa  46.6  0.0003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.216039  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0923  MerR family transcriptional regulator  44.19 
 
 		 119 aa  44.7  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.190958  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3726  resolvase family site-specific recombinase  25 
 
 		 218 aa  44.3  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1301  transcriptional regulator mlrA-like protein  31.25 
 
 		 243 aa  44.3  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1503  MerR family transcriptional regulator  42 
 
 		 242 aa  44.7  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000104173 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1525  MerR family transcriptional regulator  42 
 
 		 242 aa  44.3  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00175945 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0010  transcriptional regulator, MerR family protein  44.9 
 
 		 241 aa  44.3  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.904582  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1488  transcriptional regulator, MerR family protein  42 
 
 		 242 aa  44.3  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.372841  normal  0.479872 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1781  transcriptional regulator, MerR family protein  42 
 
 		 242 aa  44.7  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.329966  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3749  site-specific recombinase, resolvase family  25 
 
 		 218 aa  44.3  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.016515  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3798  site-specific recombinase, resolvase family  25 
 
 		 218 aa  44.3  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1517  site-specific recombinase, resolvase family  25 
 
 		 218 aa  44.3  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.114467 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3753  resolvase family site-specific recombinase  25 
 
 		 218 aa  43.9  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1258  transcriptional regulator mlrA  31.25 
 
 		 243 aa  43.9  0.002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00289591  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2464  MerR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 243 aa  43.9  0.002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1987  transcriptional regulator mlrA  31.25 
 
 		 243 aa  43.9  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>