More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AFE_1211 on replicon NC_011761
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003295  RSc3163  TPR domain protein  53.71 
 
 
700 aa  673    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1211  TPR domain/sulfotransferase domain protein  100 
 
 
695 aa  1413    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4265  TPR repeat-containing protein  49.93 
 
 
697 aa  642    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1855  sulfotransferase  50.65 
 
 
725 aa  668    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1096  sulfotransferase  35.67 
 
 
1764 aa  425  1e-117  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4342  TPR repeat-containing protein  38.38 
 
 
1406 aa  360  5e-98  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.603254  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3942  sulfotransferase  31.82 
 
 
673 aa  285  2.0000000000000002e-75  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.749375 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2196  sulfotransferase  33.07 
 
 
648 aa  283  8.000000000000001e-75  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02385  TPR domain protein  31.08 
 
 
652 aa  278  4e-73  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.761952  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1675  tetratricopeptide TPR_4  32.91 
 
 
542 aa  264  4.999999999999999e-69  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.184674  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2213  sulfotransferase  32.01 
 
 
656 aa  260  5.0000000000000005e-68  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2482  sulfotransferase TPR domain-containing protein  34.64 
 
 
530 aa  256  8e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.99645 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2649  sulfotransferase  31.13 
 
 
669 aa  255  2.0000000000000002e-66  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1757  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  35.93 
 
 
530 aa  254  5.000000000000001e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2716  TPR domain/sulfotransferase domain protein  30.65 
 
 
762 aa  251  5e-65  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2338  sulfotransferase  30.65 
 
 
762 aa  251  5e-65  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.355943  normal  0.127881 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0768  sulfotransferase  32.68 
 
 
663 aa  249  1e-64  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3684  sulfotransferase  35.03 
 
 
542 aa  248  4e-64  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.843363  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3035  sulfotransferase  33.55 
 
 
677 aa  234  3e-60  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.530133  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2992  sulfotransferase  30.53 
 
 
634 aa  234  4.0000000000000004e-60  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.49268  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3132  sulfotransferase  31.34 
 
 
720 aa  229  1e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.915715  hitchhiker  0.000116891 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2501  sulfotransferase  33.58 
 
 
717 aa  226  7e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.957515 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3169  tetratricopeptide TPR_2  32.56 
 
 
604 aa  223  9.999999999999999e-57  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.120053  normal  0.668049 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1094  TPR repeat-containing protein  25.49 
 
 
685 aa  215  2.9999999999999995e-54  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14411  Flp pilus assembly protein TadD  28.37 
 
 
594 aa  214  2.9999999999999995e-54  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00033533 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0534  TPR repeat-containing protein  32.62 
 
 
573 aa  215  2.9999999999999995e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3721  sulfotransferase  28.05 
 
 
637 aa  211  5e-53  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3470  sulfotransferase  30.45 
 
 
532 aa  203  7e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0843  hypothetical protein  39.35 
 
 
322 aa  202  1.9999999999999998e-50  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.552979  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3323  TPR repeat protein  32.73 
 
 
578 aa  201  3e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.96902  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4327  TPR domain-containing protein  35.78 
 
 
899 aa  195  2e-48  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2846  sulfotransferase  33.77 
 
 
889 aa  195  2e-48  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0601  sulfotransferase  32.68 
 
 
525 aa  191  2.9999999999999997e-47  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1262  sulfotransferase  27.56 
 
 
546 aa  190  8e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0215668 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4275  TPR domain/sulfotransferase domain-containing protein  28.78 
 
 
527 aa  187  4e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1051  sulfotransferase  33.73 
 
 
536 aa  185  2.0000000000000003e-45  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1057  TPR domain/sulfotransferase domain protein  28.85 
 
 
549 aa  184  4.0000000000000006e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0505037  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0890  sulfotransferase  31.07 
 
 
524 aa  170  1e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00371  hypothetical protein  24.91 
 
 
529 aa  167  8e-40  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03828  tetratricopeptide repeat family  32.52 
 
 
533 aa  163  1e-38  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1174  sulfotransferase  30.63 
 
 
531 aa  162  3e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1288  sulfotransferase  26.54 
 
 
636 aa  160  7e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.494721  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2992  tetratricopeptide TPR_2  24.65 
 
 
548 aa  157  4e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0107405  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1727  sulfotransferase  31.39 
 
 
519 aa  154  4e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00214225  normal  0.298549 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2112  sulfotransferase  36.07 
 
 
624 aa  148  4.0000000000000006e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.214082 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15741  hypothetical protein  25.61 
 
 
514 aa  144  7e-33  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.354121 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1812  TPR repeat-containing protein  28.38 
 
 
713 aa  142  1.9999999999999998e-32  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.154682 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0167  sulfotransferase  28.42 
 
 
488 aa  141  3.9999999999999997e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12261  TPR repeat-containing sulfotransferase  22.92 
 
 
614 aa  140  8.999999999999999e-32  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  29.21 
 
 
810 aa  138  3.0000000000000003e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  29.49 
 
 
878 aa  138  3.0000000000000003e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15821  hypothetical protein  27.3 
 
 
482 aa  137  6.0000000000000005e-31  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.978409  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24101  hypothetical protein  28.46 
 
 
725 aa  137  8e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42741  predicted protein  32 
 
 
742 aa  135  1.9999999999999998e-30  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  25.3 
 
 
3145 aa  133  1.0000000000000001e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2993  TPR repeat-containing protein  31.85 
 
 
789 aa  130  8.000000000000001e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00312978 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3339  TPR repeat-containing protein  32.47 
 
 
732 aa  127  9e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.469864 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00391  TPR repeat-containing protein  22.94 
 
 
502 aa  126  1e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.264497  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1092  TPR repeat-containing protein  29.67 
 
 
612 aa  125  3e-27  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2900  TPR repeat-containing protein  26.4 
 
 
538 aa  125  3e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3340  TPR repeat-containing protein  31.45 
 
 
828 aa  124  4e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.710571 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00421  hypothetical protein  24.39 
 
 
484 aa  124  4e-27  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.391795  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0911  tetratricopeptide TPR_4  31.1 
 
 
875 aa  124  5e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.379762  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0637  TPR repeat-containing protein  29.74 
 
 
4489 aa  121  3.9999999999999996e-26  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0165  TPR repeat-containing protein  30.88 
 
 
828 aa  121  3.9999999999999996e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0585605  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.67 
 
 
632 aa  120  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3141  sulfotransferase  25.25 
 
 
625 aa  119  1.9999999999999998e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.423755  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  26.29 
 
 
927 aa  118  3.9999999999999997e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2417  TPR repeat-containing protein  29.63 
 
 
762 aa  115  2.0000000000000002e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0038  TPR repeat-containing protein  24.17 
 
 
494 aa  114  5e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24081  hypothetical protein  29.61 
 
 
764 aa  114  6e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1093  TPR repeat-containing protein  26.33 
 
 
681 aa  113  9e-24  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.353622  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0152  TPR repeat-containing protein  30.29 
 
 
828 aa  113  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0641  TPR repeat-containing protein  28.22 
 
 
1094 aa  111  4.0000000000000004e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.230386  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4728  TPR repeat-containing protein  31.92 
 
 
718 aa  110  6e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.346608 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0453  TPR domain-containing protein  32.33 
 
 
626 aa  110  7.000000000000001e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.311085  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1232  TPR repeat-containing protein  26.1 
 
 
750 aa  110  7.000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.967237  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24071  hypothetical protein  27.74 
 
 
622 aa  110  7.000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2599  TPR domain-containing protein  32.44 
 
 
614 aa  110  8.000000000000001e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0734298  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1233  TPR repeat-containing protein  26.45 
 
 
909 aa  110  8.000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.161918  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3015  TPR domain-containing protein  32.33 
 
 
626 aa  110  8.000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0970  TPR domain-containing protein  32.44 
 
 
614 aa  110  8.000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0177  TPR repeat-containing protein  32.44 
 
 
614 aa  110  8.000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2906  TPR repeat-containing protein  32.44 
 
 
614 aa  110  9.000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0475913  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2992  TPR repeat-containing protein  30.42 
 
 
824 aa  110  1e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000746825 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1087  TPR repeat-containing protein  28.19 
 
 
808 aa  109  2e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00731  hypothetical protein  27.18 
 
 
816 aa  109  2e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.456129 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  28.14 
 
 
3035 aa  108  3e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4768  sulfotransferase  22.95 
 
 
676 aa  108  4e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.260339  normal  0.153237 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1787  TPR repeat-containing protein  24.2 
 
 
543 aa  107  5e-22  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.662156  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2349  TPR repeat-containing protein  24.72 
 
 
649 aa  106  2e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0186841  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0153  TPR repeat-containing protein  29.79 
 
 
754 aa  105  4e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.372833  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2853  TPR repeat-containing protein  25.34 
 
 
3172 aa  104  5e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0166  TPR repeat-containing protein  29.48 
 
 
754 aa  103  1e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.268335  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23981  hypothetical protein  30.29 
 
 
587 aa  103  1e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.167552 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0200  TPR repeat-containing protein  27.53 
 
 
505 aa  102  2e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2861  sulfotransferase  22.21 
 
 
681 aa  102  2e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.392476 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4628  TPR repeat-containing protein  30.63 
 
 
714 aa  102  2e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.342126 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2480  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  25.7 
 
 
1022 aa  102  3e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0157  TPR repeat-containing protein  28.44 
 
 
465 aa  102  3e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>