32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AFE_1209 on replicon NC_011761
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011761  AFE_1209  outer membrane autotransporter, putative  100 
 
 		 3484 aa  6486    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1208  outer membrane autotransporter TapA  37.36 
 
 		 991 aa  189  1.0000000000000001e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1031  outer membrane autotransporter  32.58 
 
 		 1172 aa  159  7e-37  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0914454  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2115  outer membrane autotransporter barrel domain protein  34.38 
 
 		 1694 aa  157  4e-36  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0846995  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3162  putative hemagglutinin-related protein  38.18 
 
 		 1012 aa  120  6.9999999999999995e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1095  outer membrane autotransporter  28.06 
 
 		 10429 aa  102  1e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4218  hypothetical protein  32.69 
 
 		 407 aa  89.7  8e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0836  hypothetical protein  35.29 
 
 		 268 aa  89  0.000000000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000351202 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1857  outer membrane autotransporter  34.85 
 
 		 2848 aa  88.6  0.000000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.150379  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1781  SH3 type 3 domain protein  32.43 
 
 		 489 aa  81.6  0.0000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4840  hypothetical protein  47.25 
 
 		 908 aa  80.1  0.0000000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.191443  hitchhiker  0.00180703 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3385  outer membrane autotransporter  28.73 
 
 		 972 aa  77.8  0.000000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.308218 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1203  outer membrane autotransporter  23.68 
 
 		 1769 aa  76.3  0.000000000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4267  outer membrane autotransporter  33.87 
 
 		 939 aa  75.1  0.00000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0488  outer membrane autotransporter barrel domain protein  31.68 
 
 		 774 aa  70.1  0.0000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.510592  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44994  predicted protein  42.66 
 
 		 840 aa  68.2  0.000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0685164  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_38966  predicted protein  43.12 
 
 		 555 aa  61.2  0.0000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00578111  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1306  outer membrane autotransporter barrel domain protein  29.01 
 
 		 1489 aa  58.5  0.000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2179  putative outer membrane adhesin like proteiin  45.16 
 
 		 14916 aa  57  0.000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6171  outer membrane autotransporter  33.87 
 
 		 1458 aa  56.6  0.000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6464  outer membrane autotransporter  33.87 
 
 		 1459 aa  56.6  0.000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0096  autotransporter beta-domain-containing protein  26.58 
 
 		 1035 aa  56.6  0.000009  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1857  outer membrane autotransporter barrel domain protein  35.09 
 
 		 1322 aa  55.1  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000638249 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25041  hypothetical protein  29.66 
 
 		 574 aa  54.7  0.00003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0069  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  46.88 
 
 		 348 aa  53.9  0.00005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00693904 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2876  outer membrane autotransporter  36.92 
 
 		 1550 aa  53.5  0.00008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0130  putative lipoprotein  27.19 
 
 		 857 aa  51.2  0.0003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1098  chromosome partitioning ATPase  40 
 
 		 1132 aa  50.8  0.0005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1370  autotransporter beta-domain-containing protein  28.49 
 
 		 955 aa  50.4  0.0006  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.498654  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01745  serine protease  31.25 
 
 		 942 aa  50.1  0.0008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2338  hypothetical protein  33 
 
 		 1977 aa  49.7  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0603  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  31.31 
 
 		 735 aa  47  0.007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.705665 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>