33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AFE_1208 on replicon NC_011761
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011761  AFE_1208  outer membrane autotransporter TapA  100 
 
 		 991 aa  1903    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1209  outer membrane autotransporter, putative  42.87 
 
 		 3484 aa  397  1e-109  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1031  outer membrane autotransporter  32.91 
 
 		 1172 aa  144  9.999999999999999e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0914454  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2115  outer membrane autotransporter barrel domain protein  33.33 
 
 		 1694 aa  135  5e-30  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0846995  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0836  hypothetical protein  35.87 
 
 		 268 aa  88.6  6e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000351202 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3162  putative hemagglutinin-related protein  35.62 
 
 		 1012 aa  85.5  0.000000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44994  predicted protein  40.51 
 
 		 840 aa  75.9  0.000000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0685164  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2876  outer membrane autotransporter  25.41 
 
 		 1550 aa  75.5  0.000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0046  putative serine protease  28.5 
 
 		 1066 aa  72.4  0.00000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000707412  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1857  outer membrane autotransporter  37.58 
 
 		 2848 aa  70.5  0.0000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.150379  normal  1 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_38966  predicted protein  44.76 
 
 		 555 aa  68.9  0.0000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00578111  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1095  outer membrane autotransporter  26.03 
 
 		 10429 aa  67  0.000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3385  outer membrane autotransporter  23.57 
 
 		 972 aa  65.9  0.000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.308218 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2179  putative outer membrane adhesin like proteiin  45.16 
 
 		 14916 aa  57.8  0.000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1203  outer membrane autotransporter  24.21 
 
 		 1769 aa  56.2  0.000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44995  predicted protein  49.23 
 
 		 1217 aa  56.2  0.000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00833272  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_48493  predicted protein  35.29 
 
 		 551 aa  54.7  0.000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.0000192267  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4840  hypothetical protein  55.88 
 
 		 908 aa  51.6  0.00007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.191443  hitchhiker  0.00180703 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4232  beta strand repeat-containing protein  29.62 
 
 		 1446 aa  51.2  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.819177  normal  0.109622 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4267  outer membrane autotransporter  32.12 
 
 		 939 aa  50.1  0.0002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6171  outer membrane autotransporter  28.84 
 
 		 1458 aa  48.9  0.0004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6464  outer membrane autotransporter  28.81 
 
 		 1459 aa  49.3  0.0004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49571  predicted protein  31.58 
 
 		 1000 aa  48.5  0.0006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.822968  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3078  cellulosome anchoring protein, cohesin region  32.99 
 
 		 2313 aa  48.1  0.0008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3351  peptidase M23B  32.34 
 
 		 687 aa  47.8  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0955739  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0854  outer membrane autotransporter barrel domain protein  66.67 
 
 		 3629 aa  46.6  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3050  fibronectin, type III  32.2 
 
 		 667 aa  46.6  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000157497  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0488  outer membrane autotransporter barrel domain protein  35.37 
 
 		 774 aa  47  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.510592  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0032  rhodanese-like protein  49.32 
 
 		 248 aa  46.6  0.003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1194  autotransporter domain-containing protein  58.06 
 
 		 1068 aa  45.4  0.005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.170523 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3532  outer membrane autotransporter  25.39 
 
 		 1152 aa  45.1  0.006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_48494  predicted protein  32.11 
 
 		 582 aa  45.1  0.007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.078765  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1283  outer membrane autotransporter barrel domain protein  26.76 
 
 		 3015 aa  44.7  0.008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>