More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AFE_1145 on replicon NC_011761
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011761  AFE_1145  tyrosine recombinase, phage integrase family  100 
 
 
301 aa  622  1e-177  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.00135559  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1668  tyrosine recombinase XerD subunit  30.33 
 
 
295 aa  119  8e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.179488  normal  0.0195248 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0435  integrase family protein  29.82 
 
 
299 aa  115  8e-25  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1300  tyrosine recombinase XerD subunit  32.06 
 
 
297 aa  108  9e-23  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4177  site-specific tyrosine recombinase XerC  29.93 
 
 
298 aa  107  2e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0208532 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1038  site-specific tyrosine recombinase XerD  38.42 
 
 
296 aa  107  2e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00331502  normal  0.0102802 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4199  site-specific tyrosine recombinase XerD  38.42 
 
 
296 aa  107  2e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00345142  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4158  site-specific tyrosine recombinase XerD  37.85 
 
 
296 aa  107  2e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.44443  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4271  site-specific tyrosine recombinase XerC  29.93 
 
 
298 aa  107  2e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4196  site-specific tyrosine recombinase XerC  29.93 
 
 
298 aa  107  2e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0689633  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3846  site-specific tyrosine recombinase XerD  37.85 
 
 
296 aa  107  2e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0256715  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4168  tyrosine recombinase XerC  29.93 
 
 
298 aa  107  2e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4036  site-specific tyrosine recombinase XerC  29.93 
 
 
298 aa  107  2e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4330  site-specific tyrosine recombinase XerC  29.93 
 
 
298 aa  107  2e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4222  site-specific tyrosine recombinase XerD  37.85 
 
 
296 aa  107  2e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00160259  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0063  tyrosine recombinase XerC  30.8 
 
 
304 aa  107  3e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3920  site-specific tyrosine recombinase XerD  38.42 
 
 
296 aa  106  4e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  3.17777e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4311  site-specific tyrosine recombinase XerD  37.29 
 
 
296 aa  106  4e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.789664  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3999  site-specific tyrosine recombinase XerD  37.29 
 
 
296 aa  106  4e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.189801  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3830  site-specific tyrosine recombinase XerD  37.29 
 
 
296 aa  106  4e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4113  site-specific tyrosine recombinase XerD  37.29 
 
 
296 aa  106  4e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.00015e-24 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03687  site-specific tyrosine recombinase XerC  29.93 
 
 
298 aa  106  6e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.446663  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03636  hypothetical protein  29.93 
 
 
298 aa  106  6e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.487194  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3738  tyrosine recombinase XerD subunit  31.72 
 
 
328 aa  105  1e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3929  site-specific tyrosine recombinase XerC  25.99 
 
 
299 aa  104  2e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000313294  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0386  phage integrase family site specific recombinase  28.78 
 
 
400 aa  104  2e-21  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2788  site-specific tyrosine recombinase XerD  37.29 
 
 
296 aa  104  2e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000777667  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1622  tyrosine recombinase XerD  29.86 
 
 
310 aa  103  3e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5250  site-specific tyrosine recombinase XerC  29.28 
 
 
298 aa  103  4e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1501  tyrosine recombinase XerD subunit  30.25 
 
 
295 aa  103  4e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2257  site-specific tyrosine recombinase XerD  36.52 
 
 
299 aa  102  5e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.977256  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1185  tyrosine recombinase XerD  29.15 
 
 
315 aa  102  6e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0531401  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2378  tyrosine recombinase XerD  39.29 
 
 
296 aa  102  7e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.336575 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1225  integrase family protein  32.23 
 
 
301 aa  102  8e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.103765  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2022  tyrosine recombinase XerD subunit  40.37 
 
 
309 aa  102  9e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2567  site-specific tyrosine recombinase XerD  33.33 
 
 
313 aa  101  1e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.615759 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1827  tyrosine recombinase XerD  32.79 
 
 
306 aa  102  1e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2052  tyrosine recombinase XerD  30.47 
 
 
296 aa  102  1e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2497  integrase family protein  31.58 
 
 
308 aa  100  2e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1142  tyrosine recombinase XerD  30.18 
 
 
295 aa  100  2e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1554  tyrosine recombinase XerD  28.66 
 
 
295 aa  101  2e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1821  integrase family protein  28.01 
 
 
307 aa  101  2e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0364742  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1314  site-specific tyrosine recombinase XerC  25.66 
 
 
299 aa  101  2e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  1.9497e-06  unclonable  8.39468e-26 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1585  tyrosine recombinase XerD  28.66 
 
 
295 aa  101  2e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0106  phage integrase family protein  30.32 
 
 
295 aa  100  3e-20  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0497  tyrosine recombinase XerC  32.01 
 
 
324 aa  100  3e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.237269  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1282  tyrosine recombinase XerD  30.11 
 
 
295 aa  100  4e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.63418  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1556  integrase family protein  27.03 
 
 
307 aa  100  4e-20  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.36987  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0396  tyrosine recombinase XerD  39.13 
 
 
309 aa  99.8  4e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2471  tyrosine recombinase XerC subunit  31.29 
 
 
308 aa  100  4e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0340389  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4336  site-specific tyrosine recombinase XerC  28.48 
 
 
300 aa  99.8  5e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1996  site-specific tyrosine recombinase XerC  28.83 
 
 
300 aa  99.4  6e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3969  site-specific tyrosine recombinase XerC  25.33 
 
 
299 aa  99.4  6e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  3.91393e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3572  site-specific tyrosine recombinase XerC  25.33 
 
 
299 aa  99.8  6e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  6.85052e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3682  site-specific tyrosine recombinase XerC  25.33 
 
 
299 aa  99.4  6e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.245295  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3843  site-specific tyrosine recombinase XerC  25.33 
 
 
299 aa  99.8  6e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.27577e-62 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4229  site-specific tyrosine recombinase XerC  28.48 
 
 
300 aa  99.4  7e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09590  tyrosine recombinase XerD  31.07 
 
 
302 aa  99.4  7e-20  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.0503565 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11988  putative tyrosine recombinase  30.07 
 
 
298 aa  98.2  1e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0840  integrase family protein  27.08 
 
 
294 aa  98.6  1e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.774041 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5470  tyrosine recombinase XerD  28.06 
 
 
316 aa  98.2  1e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.602612  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3878  site-specific tyrosine recombinase XerC  25 
 
 
299 aa  98.2  1e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  1.07327e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1674  tyrosine recombinase XerD  30.47 
 
 
297 aa  98.6  1e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0517708  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1023  integrase family protein  25.68 
 
 
297 aa  98.6  1e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0854512  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5117  tyrosine recombinase XerD  40 
 
 
327 aa  98.6  1e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.843466 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2544  site-specific tyrosine recombinase XerD  30.07 
 
 
308 aa  98.2  1e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1060  tyrosine recombinase XerD  27.78 
 
 
295 aa  98.6  1e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.17947  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3062  site-specific tyrosine recombinase XerD  32.17 
 
 
308 aa  97.8  2e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4177  site-specific tyrosine recombinase XerC  28.48 
 
 
300 aa  97.8  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.225708  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4159  site-specific tyrosine recombinase XerC  29.5 
 
 
300 aa  97.8  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.937296  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4277  site-specific tyrosine recombinase XerC  29.5 
 
 
300 aa  97.8  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1099  tyrosine recombinase XerD  29.39 
 
 
296 aa  97.8  2e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3654  site-specific tyrosine recombinase XerC  25 
 
 
301 aa  97.8  2e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  4.89449e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2483  site-specific tyrosine recombinase XerC  26.95 
 
 
299 aa  97.8  2e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  8.55714e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3590  site-specific tyrosine recombinase XerC  25 
 
 
299 aa  97.1  3e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0796955  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1769  tyrosine recombinase XerD  28.87 
 
 
304 aa  97.1  3e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.151783  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0660  integrase family protein  35.09 
 
 
284 aa  97.4  3e-19  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1299  site-specific tyrosine recombinase XerC  27.76 
 
 
291 aa  96.3  5e-19  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1082  integrase family protein  25.42 
 
 
290 aa  96.3  6e-19  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1521  tyrosine recombinase XerD  31.07 
 
 
346 aa  95.1  1e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.531713  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2391  site-specific tyrosine recombinase XerC  28.62 
 
 
311 aa  95.1  1e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0478  integrase family protein  41.06 
 
 
312 aa  95.5  1e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3873  site-specific tyrosine recombinase XerC  24.67 
 
 
299 aa  95.1  1e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00557083  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0198  tyrosine recombinase XerC subunit  28.77 
 
 
291 aa  95.5  1e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0021573 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3090  tyrosine recombinase XerD  31.32 
 
 
320 aa  95.1  1e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0704  integrase family protein  28 
 
 
305 aa  95.5  1e-18  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  1.43659e-07  unclonable  2.74126e-08 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1687  tyrosine recombinase XerD subunit  31.91 
 
 
314 aa  94.4  2e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0485  site-specific tyrosine recombinase XerC  27.8 
 
 
322 aa  94.4  2e-18  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.853028 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1320  tyrosine recombinase XerD  34.22 
 
 
302 aa  94.7  2e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1982  tyrosine recombinase XerC  28.62 
 
 
298 aa  94.4  2e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0026523  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2271  phage integrase family protein  30.2 
 
 
321 aa  94.4  2e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1520  tyrosine recombinase XerD  30.85 
 
 
362 aa  94.7  2e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.83292e-06 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3928  integrase family protein  27.3 
 
 
290 aa  94  2e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2210  integrase family protein  29.28 
 
 
295 aa  94.7  2e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.41024e-08 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0124  phage integrase family protein  28.87 
 
 
298 aa  94  3e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.776243  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1934  phage integrase family protein  25.26 
 
 
297 aa  93.6  3e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1104  site-specific tyrosine recombinase XerC  26.15 
 
 
300 aa  94  3e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  3.17379e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0367  site-specific tyrosine recombinase XerD  36.52 
 
 
298 aa  94  3e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2509  integrase family protein  36.94 
 
 
380 aa  94  3e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.593152  normal  0.73908 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1906  integrase family protein  28.72 
 
 
295 aa  94  3e-18  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.713326  normal  0.217947 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>