81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AFE_1073 on replicon NC_011761
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011761  AFE_1073  BRO family protein  100 
 
 
313 aa  640  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.00174599  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2642  hypothetical protein  33.33 
 
 
252 aa  129  6e-29  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.226633  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1874  prophage antirepressor  46.83 
 
 
299 aa  114  3e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  2.68327e-09  normal  0.0527213 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2462  BRO-like protein  49.15 
 
 
248 aa  109  6e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  4.68179e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_013208  Aaci_3150  prophage antirepressor  46.15 
 
 
206 aa  105  7e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0524  prophage antirepressor  49.09 
 
 
259 aa  105  1e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.844398  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3227  prophage antirepressor  31.56 
 
 
252 aa  105  1e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.323772  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1644  BRO domain-containing protein  46.55 
 
 
239 aa  104  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0834656  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3400  prophage antirepressor  47.06 
 
 
284 aa  104  2e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  1.83753e-06  unclonable  1.97476e-16 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3791  prophage antirepressor  47.2 
 
 
283 aa  102  7e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3740  prophage antirepressor  47.2 
 
 
283 aa  102  7e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1235  prophage antirepressor  45.31 
 
 
263 aa  102  8e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  2.98657e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2342  Prophage antirepressor protein  37.58 
 
 
263 aa  99.8  5e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.21228  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4013  BRO domain-containing protein  41.46 
 
 
284 aa  98.2  1e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3254  prophage antirepressor  41.73 
 
 
270 aa  99  1e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  7.11854e-10  decreased coverage  7.07487e-15 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0898  prophage antirepressor  47.11 
 
 
217 aa  97.8  2e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.798648  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1161  hypothetical protein  42.86 
 
 
193 aa  96.7  5e-19  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  3.30342e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1177  hypothetical protein  29.77 
 
 
420 aa  96.7  5e-19  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.163274  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1825  prophage antirepressor  30.43 
 
 
535 aa  96.3  6e-19  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1205  prophage antirepressor  30.43 
 
 
535 aa  96.3  6e-19  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.312147  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1367  prophage antirepressor  47.01 
 
 
264 aa  96.3  6e-19  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  unclonable  2.14644e-08  unclonable  1.53039e-25 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1741  prophage antirepressor-like  51.92 
 
 
184 aa  95.1  1e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.729676  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1181  prophage antirepressor  44.92 
 
 
188 aa  94.4  2e-18  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  decreased coverage  3.54678e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2133  phage antirepressor protein  43.8 
 
 
244 aa  93.6  4e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.335904 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1060  prophage antirepressor  29.1 
 
 
262 aa  92.8  6e-18  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  2.14143e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2795  prophage antirepressor-like  50.96 
 
 
197 aa  92  1e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.441436  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0554  prophage antirepressor  47.12 
 
 
269 aa  90.9  2e-17  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.239939  hitchhiker  0.000124341 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0575  prophage antirepressor  35.53 
 
 
295 aa  90.5  3e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1867  prophage antirepressor  33.52 
 
 
272 aa  88.2  2e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  1.86522e-09  normal  0.142835 
 
 
-
 
NC_010183  BcerKBAB4_5813  prophage antirepressor  45.83 
 
 
256 aa  87.4  2e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1322  prophage antirepressor  42.72 
 
 
236 aa  87  4e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  3.5001e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2402  prophage antirepressor  40.65 
 
 
230 aa  86.3  6e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.339438 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3073  prophage antirepressor  38.71 
 
 
270 aa  84.3  3e-15  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.229766  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1864  prophage antirepressor  39.84 
 
 
293 aa  82.8  7e-15  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.886046 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3440  prophage antirepressor  42.37 
 
 
285 aa  82  1e-14  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  1.05678e-11  unclonable  9.66468e-17 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2380  BRO domain-containing protein  41.03 
 
 
335 aa  81.3  2e-14  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.016925  normal  0.26363 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2185  putative antirepressor protein encoded by prophage CP-933N  36.89 
 
 
192 aa  81.3  2e-14  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0690247  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1398  prophage antirepressor  38.02 
 
 
204 aa  81.3  2e-14  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.178309  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0789  BRO, N-terminal  42.86 
 
 
172 aa  81.6  2e-14  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000825833 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0803  prophage antirepressor  41.23 
 
 
257 aa  80.5  3e-14  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  1.45423e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1555  antirepressor protein  42.24 
 
 
292 aa  80.5  3e-14  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0345805  hitchhiker  0.000277946 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1000  BRO family protein  40.52 
 
 
211 aa  79.3  7e-14  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.173667  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1877  prophage LambdaSa2, antirepressor protein, putative  40.18 
 
 
236 aa  79.3  8e-14  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0256664  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0278  BRO family protein  45.37 
 
 
140 aa  77.4  3e-13  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.000343854  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0258  BRO family protein  45.37 
 
 
140 aa  77.4  3e-13  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2513  BRO, N-terminal  45.36 
 
 
172 aa  77  4e-13  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0512852  normal  0.446294 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1165  prophage antirepressor  40.91 
 
 
149 aa  75.5  1e-12  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1083  BRO family protein  39.82 
 
 
134 aa  74.3  2e-12  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.100944  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1714  BRO family protein, truncation  46.07 
 
 
101 aa  73.6  4e-12  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.109606  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2135  phage-encoded protein  35.16 
 
 
260 aa  70.5  3e-11  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.000332219  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0797  BRO, N-terminal  39.62 
 
 
111 aa  70.9  3e-11  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.651064  hitchhiker  1.14436e-06 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1804  prophage antirepressor  36.44 
 
 
244 aa  69.7  5e-11  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3521  BRO, N-terminal  40.4 
 
 
199 aa  70.1  5e-11  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000239324  decreased coverage  0.000343043 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1142  phage antirepressor protein  33.11 
 
 
267 aa  70.1  5e-11  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  4.18777e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1118  BRO domain-containing protein  32.67 
 
 
247 aa  70.1  5e-11  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.296909  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0568  prophage antirepressor  37.5 
 
 
153 aa  68.6  1e-10  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.762577  n/a   
 
 
-
 
NC_013207  Aaci_3107  prophage antirepressor  37.5 
 
 
153 aa  68.6  1e-10  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2805  prophage antirepressor-like  43.82 
 
 
105 aa  66.2  7e-10  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0292574  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1315  prophage antirepressor  32 
 
 
256 aa  65.5  1e-09  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.930298  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4120  prophage antirepressor  35.09 
 
 
192 aa  65.1  1e-09  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0152271  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1616  hypothetical protein  37.86 
 
 
151 aa  63.9  3e-09  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0345712  n/a   
 
 
-
 
NC_012040  Cla_a013  putative antirepressor, BRO family  30.32 
 
 
183 aa  61.2  2e-08  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0225  prophage antirepressor  28.82 
 
 
180 aa  59.7  6e-08  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.285205  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1740  BRO-like protein  35.71 
 
 
254 aa  57.8  3e-07  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  8.80579e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3087  prophage antirepressor  37.86 
 
 
317 aa  57.4  3e-07  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3917  prophage antirepressor  24.86 
 
 
245 aa  55.5  1e-06  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0381452  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2504  BRO family protein  47.06 
 
 
58 aa  55.5  1e-06  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.880081 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2475  prophage antirepressor  58.14 
 
 
261 aa  53.5  4e-06  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  5.54878e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1061  prophage antirepressor-like protein  28.81 
 
 
210 aa  52.4  1e-05  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  1.79859e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2622  BRO domain-containing protein  31 
 
 
205 aa  51.6  2e-05  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  9.19421e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3698  prophage antirepressor  37.04 
 
 
120 aa  50.4  4e-05  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.206352 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1649  BRO-like protein  34.34 
 
 
265 aa  47.8  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  5.43299e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1080  prophage antirepressor-like protein  31.15 
 
 
206 aa  48.5  0.0002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  1.74443e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1652  hypothetical protein  25 
 
 
191 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.215639  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3726  hypothetical protein  25.33 
 
 
191 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0902  prophage antirepressor  30.69 
 
 
226 aa  46.2  0.0007  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2303  Prophage antirepressor  40 
 
 
136 aa  46.2  0.0008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.634607  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1196  prophage antirepressor  30.69 
 
 
228 aa  44.7  0.002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0930  BRO domain-containing protein  24.81 
 
 
243 aa  44.3  0.003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0480253  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3820  hypothetical protein  24 
 
 
181 aa  43.1  0.005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00391965 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1040  hypothetical protein  24.82 
 
 
170 aa  42.7  0.008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.57663 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>