189 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AFE_1057 on replicon NC_011761
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011761  AFE_1057  TPR domain/sulfotransferase domain protein  100 
 
 
549 aa  1121    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0505037  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4342  TPR repeat-containing protein  30.81 
 
 
1406 aa  194  3e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.603254  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1211  TPR domain/sulfotransferase domain protein  28.85 
 
 
695 aa  184  3e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4265  TPR repeat-containing protein  29.02 
 
 
697 aa  178  3e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2338  sulfotransferase  30.57 
 
 
762 aa  172  1e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.355943  normal  0.127881 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2716  TPR domain/sulfotransferase domain protein  30.57 
 
 
762 aa  172  1e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3163  TPR domain protein  30.26 
 
 
700 aa  167  4e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1096  sulfotransferase  24.58 
 
 
1764 aa  167  5.9999999999999996e-40  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1855  sulfotransferase  29.33 
 
 
725 aa  166  9e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0768  sulfotransferase  31.31 
 
 
663 aa  159  1e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3684  sulfotransferase  32.97 
 
 
542 aa  156  1e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.843363  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2213  sulfotransferase  29.3 
 
 
656 aa  151  3e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3035  sulfotransferase  33.23 
 
 
677 aa  149  1.0000000000000001e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.530133  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02385  TPR domain protein  29.53 
 
 
652 aa  148  2.0000000000000003e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.761952  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4327  TPR domain-containing protein  31.09 
 
 
899 aa  147  5e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2846  sulfotransferase  30.29 
 
 
889 aa  145  3e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2196  sulfotransferase  27.24 
 
 
648 aa  144  5e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1262  sulfotransferase  28.62 
 
 
546 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0215668 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3132  sulfotransferase  32.23 
 
 
720 aa  141  3.9999999999999997e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.915715  hitchhiker  0.000116891 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2482  sulfotransferase TPR domain-containing protein  32.58 
 
 
530 aa  141  3.9999999999999997e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.99645 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1675  tetratricopeptide TPR_4  27.71 
 
 
542 aa  137  7.000000000000001e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.184674  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3942  sulfotransferase  28.54 
 
 
673 aa  135  1.9999999999999998e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.749375 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3721  sulfotransferase  32.34 
 
 
637 aa  135  3e-30  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1757  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.55 
 
 
530 aa  134  3e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0890  sulfotransferase  27.49 
 
 
524 aa  133  9e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2501  sulfotransferase  32.03 
 
 
717 aa  133  9e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.957515 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1727  sulfotransferase  28.9 
 
 
519 aa  132  1.0000000000000001e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00214225  normal  0.298549 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3169  tetratricopeptide TPR_2  32.31 
 
 
604 aa  131  3e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.120053  normal  0.668049 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0534  TPR repeat-containing protein  29.19 
 
 
573 aa  130  4.0000000000000003e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0601  sulfotransferase  32.01 
 
 
525 aa  130  6e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0843  hypothetical protein  31.58 
 
 
322 aa  129  1.0000000000000001e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.552979  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1812  TPR repeat-containing protein  27.43 
 
 
713 aa  128  2.0000000000000002e-28  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.154682 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1174  sulfotransferase  26.78 
 
 
531 aa  129  2.0000000000000002e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42741  predicted protein  28.35 
 
 
742 aa  126  8.000000000000001e-28  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14411  Flp pilus assembly protein TadD  22.38 
 
 
594 aa  125  2e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00033533 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1094  TPR repeat-containing protein  23.33 
 
 
685 aa  124  5e-27  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2649  sulfotransferase  30.1 
 
 
669 aa  124  5e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2992  sulfotransferase  29.62 
 
 
634 aa  123  7e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.49268  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1288  sulfotransferase  24.45 
 
 
636 aa  122  1.9999999999999998e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.494721  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3323  TPR repeat protein  26.45 
 
 
578 aa  121  3e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.96902  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3336  sulfotransferase  31.05 
 
 
670 aa  120  6e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.850036 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4275  TPR domain/sulfotransferase domain-containing protein  26.64 
 
 
527 aa  120  9e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3470  sulfotransferase  29.07 
 
 
532 aa  117  5e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15741  hypothetical protein  25.43 
 
 
514 aa  115  2.0000000000000002e-24  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.354121 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12261  TPR repeat-containing sulfotransferase  27.4 
 
 
614 aa  112  1.0000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0167  sulfotransferase  24.54 
 
 
488 aa  110  9.000000000000001e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15821  hypothetical protein  24.91 
 
 
482 aa  108  3e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.978409  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00371  hypothetical protein  22.49 
 
 
529 aa  107  4e-22  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2992  tetratricopeptide TPR_2  25.25 
 
 
548 aa  104  4e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0107405  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2112  sulfotransferase  29.46 
 
 
624 aa  103  1e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.214082 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3141  sulfotransferase  31.09 
 
 
625 aa  103  1e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.423755  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2900  TPR repeat-containing protein  31.77 
 
 
538 aa  101  5e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03828  tetratricopeptide repeat family  25.28 
 
 
533 aa  98.6  2e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00421  hypothetical protein  25.11 
 
 
484 aa  95.1  3e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.391795  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0038  TPR repeat-containing protein  25.23 
 
 
494 aa  93.6  8e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3552  TPR repeat-containing protein  27.44 
 
 
510 aa  88.2  3e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00157607  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00391  TPR repeat-containing protein  23.22 
 
 
502 aa  84.3  0.000000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.264497  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2318  TPR repeat-containing protein  30.97 
 
 
245 aa  67.4  0.0000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0258  sulfotransferase  29.41 
 
 
626 aa  65.1  0.000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0087  TPR repeat-containing protein  26.74 
 
 
366 aa  65.1  0.000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1699  hypothetical protein  25.38 
 
 
307 aa  63.9  0.000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.860301  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0784  TPR repeat-containing protein  23.56 
 
 
709 aa  63.9  0.000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  23.81 
 
 
3035 aa  63.2  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1787  TPR repeat-containing protein  25.56 
 
 
543 aa  62.4  0.00000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.662156  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0629  TPR repeat-containing protein  27.34 
 
 
1049 aa  62.8  0.00000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  25.7 
 
 
1276 aa  62  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1181  sulfotransferase  27.59 
 
 
266 aa  61.2  0.00000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.902134  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1421  tetratricopeptide TPR_2  22.56 
 
 
471 aa  60.8  0.00000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0844206  normal  0.0579144 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0060  TPR repeat-containing protein  28.8 
 
 
562 aa  60.8  0.00000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3949  TPR repeat-containing protein  27.27 
 
 
361 aa  59.3  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2065  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  21.93 
 
 
465 aa  58.9  0.0000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.145613  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3643  TPR domain-containing protein  26.11 
 
 
1979 aa  58.2  0.0000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3808  TPR repeat-containing protein  29.19 
 
 
578 aa  58.2  0.0000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.556982 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0484  TPR repeat-containing protein  22.97 
 
 
435 aa  57.4  0.0000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0637  TPR repeat-containing protein  24.74 
 
 
4489 aa  57  0.0000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013163  Cyan8802_4605  TPR repeat-containing protein  23.85 
 
 
279 aa  55.5  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4728  TPR repeat-containing protein  29.84 
 
 
718 aa  55.8  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.346608 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2893  O-linked N-acetylglucosamine transferase  26.85 
 
 
397 aa  55.5  0.000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.272299 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1796  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  20.8 
 
 
465 aa  55.1  0.000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.769841  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1342  TPR repeat-containing protein  23.58 
 
 
391 aa  54.7  0.000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2034  TPR repeat-containing protein  27.63 
 
 
416 aa  53.9  0.000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0709  TPR repeat-containing protein  21.13 
 
 
465 aa  53.9  0.000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19131  hypothetical protein  26.67 
 
 
936 aa  53.9  0.000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.105709 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4626  TPR repeat-containing protein  25.35 
 
 
452 aa  53.5  0.000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1773  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  18.94 
 
 
466 aa  53.1  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  24.59 
 
 
927 aa  52.8  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1603  TPR repeat-containing protein  23.77 
 
 
804 aa  53.1  0.00001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4159  TPR repeat-containing protein  22.84 
 
 
467 aa  52.8  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00004642 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3201  TPR repeat-containing protein  28.48 
 
 
955 aa  52  0.00003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0757905 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5619  SPINDLY family O-linked N-acetylglucosamine transferase  28.49 
 
 
739 aa  52  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.474452 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1019  TPR repeat-containing protein  22.44 
 
 
273 aa  51.6  0.00003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0464  TPR repeat-containing protein  21.98 
 
 
205 aa  52  0.00003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2383  TPR repeat-containing protein  24.82 
 
 
1421 aa  52  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.823331 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4781  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  22.27 
 
 
738 aa  52  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.409511  normal  0.0812036 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0799  KR domain protein  23.81 
 
 
3045 aa  51.6  0.00004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.482882 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1344  TPR repeat-containing protein  22.08 
 
 
471 aa  51.6  0.00004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.641665  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1774  sulfotransferase domain-containing protein  25.76 
 
 
358 aa  51.2  0.00004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.588183 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1770  TPR repeat-containing protein  24.67 
 
 
393 aa  51.2  0.00005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.452955  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  31.58 
 
 
4079 aa  51.2  0.00005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2321  TPR repeat-containing protein  21.93 
 
 
750 aa  50.8  0.00006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>