201 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AFE_0998 on replicon NC_011761
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011761  AFE_0998  transcriptional regulator, putative  100 
 
 
243 aa  495  1e-139  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.000689636  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3268  transciptional regulator  35.34 
 
 
229 aa  129  4e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  9.53974e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3495  putative phage repressor  33.76 
 
 
229 aa  127  1e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  5.8003e-08  unclonable  8.89639e-06 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3371  putative phage repressor  33.76 
 
 
229 aa  127  2e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  1.19805e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2020  putative phage repressor  34.62 
 
 
233 aa  127  2e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0868068  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3616  putative phage repressor  34.19 
 
 
233 aa  124  9e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0874136  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0767  putative phage repressor  34.19 
 
 
233 aa  124  1e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.420477  normal  0.277646 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0768  putative phage repressor  34.05 
 
 
240 aa  122  4e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.194498  hitchhiker  0.000185751 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0740  putative phage repressor  33.76 
 
 
240 aa  122  4e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1965  putative phage repressor  33.33 
 
 
263 aa  109  3e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.526038  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2622  putative phage repressor  32.2 
 
 
243 aa  103  2e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  1.46435e-05 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2563  putative phage repressor  31.72 
 
 
225 aa  103  2e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1648  putative phage repressor  32.05 
 
 
230 aa  103  3e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00656681  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4606  transcriptional regulator  33.2 
 
 
237 aa  103  3e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52530  transcriptional regulator  33.2 
 
 
237 aa  103  4e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  1.32202e-05  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0755  transcriptional regulator PrtR  33.19 
 
 
256 aa  101  1e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.011984  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3964  putative phage repressor  32.05 
 
 
259 aa  99  6e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.072898  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07960  transcriptional regulator PrtR  32.35 
 
 
256 aa  97.1  2e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0101148  hitchhiker  0.000834984 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0789  prophage MuSo2, Cro/CI family transcriptional regulator  29.44 
 
 
245 aa  96.3  4e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  2.34402e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0648  prophage MuSo2, Cro/CI family transcriptional regulator  29.44 
 
 
245 aa  96.3  4e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.19  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2067  putative phage repressor  30.22 
 
 
247 aa  94.7  1e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  5.02138e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2114  putative phage repressor  29.78 
 
 
247 aa  93.6  3e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00404649  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2652  prophage MuSo2, Cro/CI family transcriptional regulator  27.27 
 
 
248 aa  91.3  1e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0641  prophage MuSo1, Cro/CI family transcriptional regulator  28.97 
 
 
240 aa  87  2e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1840  putative phage repressor  27.85 
 
 
270 aa  87.4  2e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.100687  hitchhiker  6.04594e-05 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3365  putative phage repressor  29.82 
 
 
215 aa  86.7  3e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.193057 
 
 
-
 
NC_011314  VSAL_p320_13  putative peptidase, S24-like  28.7 
 
 
205 aa  85.1  9e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.568691  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2775  putative phage repressor  30.29 
 
 
264 aa  83.2  3e-15  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0272  putative phage repressor  29.19 
 
 
235 aa  83.2  3e-15  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2924  putative phage repressor  30.29 
 
 
264 aa  83.2  3e-15  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3262  putative phage repressor  28.16 
 
 
241 aa  81.3  1e-14  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1510  putative phage repressor  28.64 
 
 
212 aa  80.1  3e-14  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.432994  normal  0.193235 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2366  peptidase  27.75 
 
 
222 aa  78.2  1e-13  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  7.99679e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4446  putative phage repressor  28.51 
 
 
209 aa  77.8  1e-13  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0623  peptidase S24, S26A and S26B  27.64 
 
 
243 aa  77.4  2e-13  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.471102 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4824  putative phage repressor  27.98 
 
 
216 aa  77  3e-13  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.852274  normal  0.393285 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1980  transcriptional regulator, putative  28.04 
 
 
219 aa  75.5  7e-13  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00751555  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0721  transcriptional regulator, putative  27.8 
 
 
243 aa  74.7  1e-12  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3211  putative phage repressor  28.63 
 
 
248 aa  74.7  1e-12  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.02032 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0335  putative phage repressor  26.49 
 
 
230 aa  73.6  3e-12  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4635  putative phage repressor  28.88 
 
 
214 aa  72.8  4e-12  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.671239 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0352  putative phage repressor  26.23 
 
 
261 aa  72.4  6e-12  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00411274 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4049  putative phage repressor  27.83 
 
 
248 aa  72.4  6e-12  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00309972  hitchhiker  1.929e-10 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2167  putative phage repressor  26.29 
 
 
244 aa  71.2  1e-11  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.117586  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0817  putative phage repressor  26.41 
 
 
205 aa  70.5  2e-11  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1365  putative phage repressor  27.73 
 
 
227 aa  69.7  4e-11  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2990  prophage LambdaSo, Cro/CI family transcriptional regulator  34.51 
 
 
272 aa  69.7  4e-11  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2481  putative phage repressor  29.44 
 
 
230 aa  69.7  4e-11  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1135  phage repressor  28.21 
 
 
270 aa  69.3  6e-11  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2283  putative phage repressor  31.39 
 
 
292 aa  68.6  8e-11  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00298807  unclonable  4.71179e-11 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1875  putative phage repressor  27.2 
 
 
244 aa  68.9  8e-11  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011665  Sbal223_4494  putative phage repressor  26.64 
 
 
231 aa  67.8  1e-10  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1999  putative phage repressor  27.43 
 
 
247 aa  68.2  1e-10  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.148968  normal  0.25035 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1192  putative phage repressor  26.98 
 
 
252 aa  65.9  5e-10  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1413  putative phage repressor  25.98 
 
 
216 aa  66.2  5e-10  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0602324  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3076  transcriptional regulator  25.84 
 
 
219 aa  66.2  5e-10  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  hitchhiker  0.0011023  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1011  putative phage repressor  26.05 
 
 
218 aa  65.9  6e-10  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.763396  unclonable  3.01408e-06 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1024  phage repressor  27.12 
 
 
265 aa  65.5  7e-10  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.277837  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2371  putative phage repressor  32.03 
 
 
233 aa  65.5  8e-10  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1065  putative phage repressor  28.26 
 
 
209 aa  64.3  2e-09  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.518416  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0370  putative transcriptional regulator  28.92 
 
 
210 aa  63.2  4e-09  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.128546  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3589  putative phage repressor  27.27 
 
 
225 aa  62.4  7e-09  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00136688  hitchhiker  0.00299337 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0808  putative repressor protein  26.41 
 
 
251 aa  62  8e-09  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.768996  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0819  putative phage repressor  30.86 
 
 
229 aa  62  8e-09  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1261  putative phage repressor  27.39 
 
 
236 aa  60.8  2e-08  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.05761e-12 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4115  putative phage repressor  23.48 
 
 
248 aa  60.1  3e-08  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.396113  hitchhiker  2.11881e-06 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1158  transcriptional regulator, putative  26.15 
 
 
270 aa  60.5  3e-08  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2959  prophage MuMc02, S24 family peptidase  30.18 
 
 
193 aa  60.5  3e-08  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.77058  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0710  putative phage repressor  25.65 
 
 
238 aa  59.3  5e-08  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2091  peptidase S24 S26A and S26B  25.69 
 
 
238 aa  58.9  6e-08  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  3.99055e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2054  putative phage repressor  25.69 
 
 
238 aa  58.9  6e-08  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  3.4182e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0189  putative phage repressor  24.88 
 
 
211 aa  58.9  7e-08  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2178  putative phage repressor  29.5 
 
 
213 aa  58.9  8e-08  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0386181  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1183  putative prophage repressor  28.37 
 
 
210 aa  58.5  9e-08  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00355534  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0641  putative phage repressor  25.44 
 
 
263 aa  58.2  1e-07  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4418  putative phage repressor  26.75 
 
 
213 aa  58.2  1e-07  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000888993  normal  0.473724 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0569  phage repressor protein, putative  33.33 
 
 
244 aa  58.2  1e-07  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.251206  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0248  hypothetical protein  26.89 
 
 
233 aa  58.2  1e-07  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4997  transcriptional regulator  24.36 
 
 
246 aa  57.8  2e-07  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.357527 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1326  putative phage repressor  28.26 
 
 
204 aa  57.4  2e-07  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1689  putative phage repressor  25.52 
 
 
239 aa  56.2  4e-07  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0556751 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2335  putative phage repressor  25.58 
 
 
245 aa  56.2  5e-07  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00049871  unclonable  1.60936e-08 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0726  putative phage repressor  23.04 
 
 
225 aa  55.8  6e-07  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.255707  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0316  putative phage repressor protein  33.33 
 
 
244 aa  55.8  6e-07  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00907838  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2949  DNA-binding protein, putative  27.9 
 
 
231 aa  55.5  7e-07  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1124  putative phage repressor protein  32.18 
 
 
239 aa  55.5  8e-07  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000298454  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02998  transcriptional regulator PbsX family  40 
 
 
125 aa  55.5  8e-07  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1440  signal peptidase I, putative  29.55 
 
 
220 aa  55.1  1e-06  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.144172  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3896  Cro/CI family transcriptional regulator  27.43 
 
 
215 aa  54.7  1e-06  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00353592 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2676  putative phage repressor  30.38 
 
 
231 aa  55.1  1e-06  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0135442 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0617  putative phage repressor  27 
 
 
244 aa  53.9  2e-06  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3869  peptidase  25.93 
 
 
218 aa  53.1  3e-06  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1094  putative phage repressor  28.05 
 
 
249 aa  53.5  3e-06  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.189719 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2330  putative phage repressor  25.85 
 
 
302 aa  52.8  4e-06  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.965048  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0398  XRE family transcriptional regulator  25.1 
 
 
244 aa  52.8  5e-06  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2281  putative phage repressor  27.62 
 
 
232 aa  52.4  6e-06  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1479  putative prophage repressor  26.85 
 
 
206 aa  52.4  6e-06  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.734418  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4132  repressor protein c2, putative  27.71 
 
 
217 aa  52.4  6e-06  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0232  putative phage repressor  31.65 
 
 
222 aa  52  8e-06  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.407354  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0215  phage repressor protein, putative  33.73 
 
 
209 aa  52  8e-06  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0406422  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>