More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AFE_0995 on replicon NC_011761
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011761  AFE_0995  site-specific recombinase, phage integrase family  100 
 
 		 349 aa  716    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.00503137  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3005  phage integrase family site specific recombinase  49.85 
 
 		 369 aa  331  1e-89  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3070  prophage DLP12 integrase  49.85 
 
 		 369 aa  331  1e-89  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1532  phage integrase family site specific recombinase  49.85 
 
 		 369 aa  331  1e-89  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3300  phage integrase family site specific recombinase  49.85 
 
 		 369 aa  331  1e-89  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.248425  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3128  integrase family protein  42.58 
 
 		 384 aa  307  2.0000000000000002e-82  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.169868  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0366  site-specific recombinase, phage integrase family  41.71 
 
 		 387 aa  305  1.0000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.529105  hitchhiker  0.00000000819042 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0165  integrase family protein  46.92 
 
 		 369 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0770  phage integrase family protein  43.04 
 
 		 387 aa  299  5e-80  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.17567  normal  0.038003 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1037  Phage integrase  47.59 
 
 		 338 aa  299  6e-80  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1092  phage integrase  54.04 
 
 		 276 aa  296  4e-79  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.00970061  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0600  prophage DLP12 integrase  40.83 
 
 		 387 aa  291  1e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000371504 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0603  prophage DLP12 integrase  40.56 
 
 		 387 aa  288  7e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.591827  normal  0.109932 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00486  predicted integrase  40.44 
 
 		 387 aa  286  5e-76  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00491  hypothetical protein  40.44 
 
 		 387 aa  286  5e-76  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0272  phage integrase family site specific recombinase  41.97 
 
 		 386 aa  283  4.0000000000000003e-75  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0996  phage integrase family protein  39.66 
 
 		 387 aa  277  2e-73  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000294682 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0832  Phage integrase  40.72 
 
 		 341 aa  271  1e-71  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0290  integrase  40.07 
 
 		 324 aa  219  7.999999999999999e-56  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0955438  normal  0.658855 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5334  integrase family protein  31.08 
 
 		 354 aa  143  4e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5317  integrase family protein  31.08 
 
 		 354 aa  143  4e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0710  Integrase protein  30.21 
 
 		 343 aa  130  3e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5143  phage integrase family site specific recombinase  30.61 
 
 		 404 aa  125  1e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0463539  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1428  integrase family protein  30.77 
 
 		 421 aa  115  8.999999999999998e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3904  phage integrase family site specific recombinase  58.43 
 
 		 122 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.908319  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2312  hypothetical protein  27.51 
 
 		 364 aa  114  2.0000000000000002e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2069  phage integrase  28.48 
 
 		 359 aa  115  2.0000000000000002e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.244007  hitchhiker  0.000737798 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6626  putative prophage integrase  27.34 
 
 		 386 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.351385 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2123  hypothetical protein  30.13 
 
 		 353 aa  109  9.000000000000001e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1126  phage integrase family protein  27.67 
 
 		 367 aa  109  9.000000000000001e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.665365  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0287  site-specific recombinase, phage integrase family  31.06 
 
 		 412 aa  108  2e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3473  integrase family protein  28.3 
 
 		 392 aa  107  3e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00115261 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3986  phage integrase family site specific recombinase  38.79 
 
 		 172 aa  105  9e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1281  integrase family protein  29.6 
 
 		 429 aa  104  3e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0441454  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003284  integrase  28.93 
 
 		 401 aa  100  4e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0046  Phage integrase  31.19 
 
 		 251 aa  97.4  3e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.380307  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2002  phage integrase  36.72 
 
 		 188 aa  96.7  5e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0764365 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3274  phage integrase family site specific recombinase  38.04 
 
 		 159 aa  94.4  2e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4065  integrase family protein  26.85 
 
 		 394 aa  92.8  7e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.438471  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1723  prophage DLP12 integrase  46.24 
 
 		 128 aa  90.5  4e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.241784  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1525  phage integrase family site specific recombinase  52.7 
 
 		 132 aa  90.5  4e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1546  prophage DLP12 integrase  46.24 
 
 		 128 aa  90.5  4e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2998  hypothetical protein  32.83 
 
 		 212 aa  90.5  4e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1037  phage integrase family protein  25.67 
 
 		 372 aa  90.1  5e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.197081  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0335  phage integrase family protein  27.66 
 
 		 356 aa  89.4  9e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.224886 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0194  phage integrase  27.69 
 
 		 333 aa  89  1e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.334318  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3565  phage integrase family protein  30.61 
 
 		 402 aa  88.6  1e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000473566  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3561  Phage integrase  31.31 
 
 		 275 aa  86.3  7e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1016  integrase family protein  36.9 
 
 		 412 aa  84  0.000000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6962  integrase family protein  29.04 
 
 		 327 aa  82.8  0.000000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2244  phage integrase family protein  25.15 
 
 		 348 aa  82.8  0.000000000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.16735  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0535  site-specific recombinase, phage integrase family  30.3 
 
 		 413 aa  82.8  0.000000000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1456  integrase family protein  28.91 
 
 		 337 aa  82  0.00000000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.699839  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1722  hypothetical protein  30.09 
 
 		 339 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.178853  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0401  phage integrase family protein  28.46 
 
 		 332 aa  80.9  0.00000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2612  phage integrase family protein  27.51 
 
 		 443 aa  81.3  0.00000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1465  integrase family protein  25.86 
 
 		 334 aa  80.5  0.00000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.890522 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0092  Fels-2 prophage protein  36.09 
 
 		 191 aa  80.5  0.00000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000678287  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4388  integrase family protein  26.53 
 
 		 399 aa  79.7  0.00000000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.754595  normal  0.599822 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0636  integrase family protein  30.66 
 
 		 397 aa  79  0.0000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00117125  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0399  phage integrase family protein  24.24 
 
 		 337 aa  78.2  0.0000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3047  phage integrase  24.07 
 
 		 381 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.182322  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1554  putative integrase/recombinase protein  29.41 
 
 		 354 aa  77.8  0.0000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0447  phage integrase  23.98 
 
 		 381 aa  77.8  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3213  integrase family protein  29.22 
 
 		 388 aa  77.8  0.0000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0926  phage integrase family protein  23.98 
 
 		 381 aa  77.8  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2809  integrase family protein  30.11 
 
 		 338 aa  77  0.0000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1522  phage integrase family site specific recombinase  28.44 
 
 		 339 aa  77.4  0.0000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0089  phage integrase family protein  28.82 
 
 		 400 aa  77.4  0.0000000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20500  Phage integrase  25.27 
 
 		 399 aa  77.4  0.0000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0548  hypothetical protein  25.66 
 
 		 334 aa  76.3  0.0000000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.271041 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1111  phage integrase family protein  24.82 
 
 		 329 aa  76.3  0.0000000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.30334  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2661  phage integrase  29.86 
 
 		 347 aa  76.3  0.0000000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0679447  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0446  phage integrase family protein  29.86 
 
 		 347 aa  76.3  0.0000000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.286621  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3132  phage integrase family site specific recombinase  28.17 
 
 		 222 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0776  phage integrase  27.49 
 
 		 334 aa  75.1  0.000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.228831  normal  0.0322595 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2297  integrative genetic element Ppu40, integrase  29.11 
 
 		 274 aa  74.3  0.000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.880812  normal  0.023746 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3903  phage integrase family site specific recombinase  45.24 
 
 		 99 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.823274  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4219  phage integrase family protein  25.46 
 
 		 463 aa  73.6  0.000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1337  integrase family protein  28.37 
 
 		 392 aa  73.2  0.000000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0155558  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7637  integrase family protein  28 
 
 		 425 aa  73.2  0.000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3980  phage integrase family protein  27.41 
 
 		 365 aa  72.8  0.000000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.356268  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0269  integrase family protein  31.37 
 
 		 405 aa  72.8  0.000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0847  integrase family protein  29.17 
 
 		 374 aa  72.4  0.00000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.136673  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4162  integrase family protein  24.93 
 
 		 396 aa  72.4  0.00000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0322  phage integrase family protein  25.93 
 
 		 379 aa  72.4  0.00000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  decreased coverage  0.00211784  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0438  hypothetical protein  28.72 
 
 		 337 aa  71.6  0.00000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2854  integrase family protein  28.25 
 
 		 351 aa  72  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.820272 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2359  integrase family protein  26.82 
 
 		 398 aa  71.6  0.00000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.522134  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3048  integrase family protein  29.17 
 
 		 374 aa  71.6  0.00000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3514  phage integrase family protein  31.31 
 
 		 336 aa  71.6  0.00000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.123025  normal  0.0375273 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3201  integrase family protein  27.93 
 
 		 351 aa  70.5  0.00000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.689071 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1646  integrase family protein  28.88 
 
 		 330 aa  70.5  0.00000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1727  phage integrase  27.32 
 
 		 267 aa  70.5  0.00000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.539916  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2633  phage integrase family protein  26.82 
 
 		 419 aa  70.5  0.00000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0639  integrase family protein  28.16 
 
 		 374 aa  70.1  0.00000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.988788  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2964  phage integrase  28.64 
 
 		 387 aa  69.7  0.00000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.187641  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3658  putative bacteriophage integrase  28.57 
 
 		 444 aa  69.3  0.00000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.626735 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0805  site-specific recombinase/integrase  29.48 
 
 		 396 aa  68.9  0.0000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0116297  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3783  integrase family protein  29.87 
 
 		 334 aa  68.9  0.0000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>