More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AFE_0995 on replicon NC_011761
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011761  AFE_0995  site-specific recombinase, phage integrase family  100 
 
 
349 aa  716  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.00503137  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3070  prophage DLP12 integrase  49.85 
 
 
369 aa  331  1e-89  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3005  phage integrase family site specific recombinase  49.85 
 
 
369 aa  331  1e-89  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3300  phage integrase family site specific recombinase  49.85 
 
 
369 aa  331  1e-89  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.248425  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1532  phage integrase family site specific recombinase  49.85 
 
 
369 aa  331  1e-89  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3128  integrase family protein  42.58 
 
 
384 aa  307  2e-82  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.169868  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0366  site-specific recombinase, phage integrase family  41.71 
 
 
387 aa  305  1e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.529105  hitchhiker  8.19042e-09 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0165  integrase family protein  46.92 
 
 
369 aa  303  3e-81  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0770  phage integrase family protein  43.04 
 
 
387 aa  299  5e-80  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.17567  normal  0.038003 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1037  Phage integrase  47.59 
 
 
338 aa  299  6e-80  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1092  phage integrase  54.04 
 
 
276 aa  296  4e-79  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.00970061  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0600  prophage DLP12 integrase  40.83 
 
 
387 aa  291  1e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000371504 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0603  prophage DLP12 integrase  40.56 
 
 
387 aa  288  7e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.591827  normal  0.109932 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00491  hypothetical protein  40.44 
 
 
387 aa  286  5e-76  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00486  predicted integrase  40.44 
 
 
387 aa  286  5e-76  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0272  phage integrase family site specific recombinase  41.97 
 
 
386 aa  283  4e-75  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0996  phage integrase family protein  39.66 
 
 
387 aa  277  2e-73  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000294682 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0832  Phage integrase  40.72 
 
 
341 aa  271  1e-71  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0290  integrase  40.07 
 
 
324 aa  219  8e-56  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0955438  normal  0.658855 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5317  integrase family protein  31.08 
 
 
354 aa  143  4e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5334  integrase family protein  31.08 
 
 
354 aa  143  4e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0710  Integrase protein  30.21 
 
 
343 aa  130  3e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5143  phage integrase family site specific recombinase  30.61 
 
 
404 aa  125  1e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0463539  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1428  integrase family protein  30.77 
 
 
421 aa  115  9e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2069  phage integrase  28.48 
 
 
359 aa  115  2e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.244007  hitchhiker  0.000737798 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2312  hypothetical protein  27.51 
 
 
364 aa  114  2e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3904  phage integrase family site specific recombinase  58.43 
 
 
122 aa  114  2e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.908319  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6626  putative prophage integrase  27.34 
 
 
386 aa  112  1e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.351385 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2123  hypothetical protein  30.13 
 
 
353 aa  109  9e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1126  phage integrase family protein  27.67 
 
 
367 aa  109  9e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.665365  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0287  site-specific recombinase, phage integrase family  31.06 
 
 
412 aa  108  2e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3473  integrase family protein  28.3 
 
 
392 aa  107  3e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00115261 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3986  phage integrase family site specific recombinase  38.79 
 
 
172 aa  105  9e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1281  integrase family protein  29.6 
 
 
429 aa  104  3e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0441454  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003284  integrase  28.93 
 
 
401 aa  100  4e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0046  Phage integrase  31.19 
 
 
251 aa  97.4  3e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.380307  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2002  phage integrase  36.72 
 
 
188 aa  96.7  5e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0764365 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3274  phage integrase family site specific recombinase  38.04 
 
 
159 aa  94.4  2e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4065  integrase family protein  26.85 
 
 
394 aa  92.8  7e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.438471  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1525  phage integrase family site specific recombinase  52.7 
 
 
132 aa  90.5  4e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1546  prophage DLP12 integrase  46.24 
 
 
128 aa  90.5  4e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1723  prophage DLP12 integrase  46.24 
 
 
128 aa  90.5  4e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.241784  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2998  hypothetical protein  32.83 
 
 
212 aa  90.5  4e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1037  phage integrase family protein  25.67 
 
 
372 aa  90.1  5e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.197081  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0335  phage integrase family protein  27.66 
 
 
356 aa  89.4  9e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.224886 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0194  phage integrase  27.69 
 
 
333 aa  89  1e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.334318  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3565  phage integrase family protein  30.61 
 
 
402 aa  88.6  1e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  4.73566e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3561  Phage integrase  31.31 
 
 
275 aa  86.3  7e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1016  integrase family protein  36.9 
 
 
412 aa  84  4e-15  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6962  integrase family protein  29.04 
 
 
327 aa  82.8  7e-15  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2244  phage integrase family protein  25.15 
 
 
348 aa  82.8  8e-15  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.16735  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0535  site-specific recombinase, phage integrase family  30.3 
 
 
413 aa  82.8  9e-15  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1456  integrase family protein  28.91 
 
 
337 aa  82  1e-14  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.699839  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1722  hypothetical protein  30.09 
 
 
339 aa  81.6  2e-14  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.178853  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0401  phage integrase family protein  28.46 
 
 
332 aa  80.9  3e-14  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2612  phage integrase family protein  27.51 
 
 
443 aa  81.3  3e-14  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1465  integrase family protein  25.86 
 
 
334 aa  80.5  4e-14  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.890522 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0092  Fels-2 prophage protein  36.09 
 
 
191 aa  80.5  4e-14  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  6.78287e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4388  integrase family protein  26.53 
 
 
399 aa  79.7  7e-14  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.754595  normal  0.599822 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0636  integrase family protein  30.66 
 
 
397 aa  79  1e-13  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00117125  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0399  phage integrase family protein  24.24 
 
 
337 aa  78.2  2e-13  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3047  phage integrase  24.07 
 
 
381 aa  78.6  2e-13  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.182322  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1554  putative integrase/recombinase protein  29.41 
 
 
354 aa  77.8  3e-13  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3213  integrase family protein  29.22 
 
 
388 aa  77.8  3e-13  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0447  phage integrase  23.98 
 
 
381 aa  77.8  3e-13  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0926  phage integrase family protein  23.98 
 
 
381 aa  77.8  3e-13  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0089  phage integrase family protein  28.82 
 
 
400 aa  77.4  4e-13  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2809  integrase family protein  30.11 
 
 
338 aa  77  4e-13  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20500  Phage integrase  25.27 
 
 
399 aa  77.4  4e-13  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1522  phage integrase family site specific recombinase  28.44 
 
 
339 aa  77.4  4e-13  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0548  hypothetical protein  25.66 
 
 
334 aa  76.3  7e-13  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.271041 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1111  phage integrase family protein  24.82 
 
 
329 aa  76.3  8e-13  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.30334  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0446  phage integrase family protein  29.86 
 
 
347 aa  76.3  9e-13  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.286621  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2661  phage integrase  29.86 
 
 
347 aa  76.3  9e-13  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0679447  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0776  phage integrase  27.49 
 
 
334 aa  75.1  2e-12  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.228831  normal  0.0322595 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3132  phage integrase family site specific recombinase  28.17 
 
 
222 aa  74.7  2e-12  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3903  phage integrase family site specific recombinase  45.24 
 
 
99 aa  74.3  3e-12  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.823274  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2297  integrative genetic element Ppu40, integrase  29.11 
 
 
274 aa  74.3  3e-12  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.880812  normal  0.023746 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4219  phage integrase family protein  25.46 
 
 
463 aa  73.6  5e-12  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7637  integrase family protein  28 
 
 
425 aa  73.2  6e-12  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1337  integrase family protein  28.37 
 
 
392 aa  73.2  6e-12  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0155558  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0269  integrase family protein  31.37 
 
 
405 aa  72.8  8e-12  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3980  phage integrase family protein  27.41 
 
 
365 aa  72.8  8e-12  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.356268  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0847  integrase family protein  29.17 
 
 
374 aa  72.4  1e-11  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.136673  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4162  integrase family protein  24.93 
 
 
396 aa  72.4  1e-11  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0322  phage integrase family protein  25.93 
 
 
379 aa  72.4  1e-11  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  decreased coverage  0.00211784  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2854  integrase family protein  28.25 
 
 
351 aa  72  2e-11  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.820272 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0438  hypothetical protein  28.72 
 
 
337 aa  71.6  2e-11  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3048  integrase family protein  29.17 
 
 
374 aa  71.6  2e-11  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2359  integrase family protein  26.82 
 
 
398 aa  71.6  2e-11  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.522134  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3514  phage integrase family protein  31.31 
 
 
336 aa  71.6  2e-11  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.123025  normal  0.0375273 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1727  phage integrase  27.32 
 
 
267 aa  70.5  4e-11  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.539916  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3201  integrase family protein  27.93 
 
 
351 aa  70.5  4e-11  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.689071 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1646  integrase family protein  28.88 
 
 
330 aa  70.5  4e-11  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2633  phage integrase family protein  26.82 
 
 
419 aa  70.5  4e-11  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0639  integrase family protein  28.16 
 
 
374 aa  70.1  5e-11  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.988788  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2964  phage integrase  28.64 
 
 
387 aa  69.7  6e-11  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.187641  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3658  putative bacteriophage integrase  28.57 
 
 
444 aa  69.3  9e-11  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.626735 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0805  site-specific recombinase/integrase  29.48 
 
 
396 aa  68.9  1e-10  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0116297  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3783  integrase family protein  29.87 
 
 
334 aa  68.9  1e-10  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>