More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AFE_0973 on replicon NC_011761
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011206  Lferr_1088  putative periplasmic protease  100 
 
 
334 aa  679    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0973  putative periplasmic protease  100 
 
 
334 aa  679    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2629  putative periplasmic protease  60.96 
 
 
333 aa  407  1e-113  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.751964  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2013  putative periplasmic protease  50.15 
 
 
348 aa  318  6e-86  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0439516  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2903  putative periplasmic protease  45.95 
 
 
343 aa  317  3e-85  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000180746  normal  0.0386673 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3114  putative periplasmic protease  50.46 
 
 
340 aa  316  4e-85  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0953569  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2314  putative periplasmic protease  49.56 
 
 
348 aa  314  1.9999999999999998e-84  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.454993  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003018  SohB protein peptidase U7 family  46.76 
 
 
353 aa  314  1.9999999999999998e-84  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000939  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3556  putative periplasmic protease  49.26 
 
 
339 aa  312  3.9999999999999997e-84  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.132568  normal  0.518214 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2570  putative periplasmic protease  49.04 
 
 
336 aa  312  3.9999999999999997e-84  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1694  putative periplasmic protease  45.99 
 
 
343 aa  312  4.999999999999999e-84  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0077753  normal  0.738833 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3211  putative periplasmic protease  49.4 
 
 
339 aa  312  4.999999999999999e-84  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.888582  normal  0.61318 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2119  putative periplasmic protease  50.63 
 
 
337 aa  312  4.999999999999999e-84  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000182338  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1926  putative periplasmic protease  49.85 
 
 
348 aa  310  2e-83  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2471  putative periplasmic protease  48.42 
 
 
337 aa  310  2e-83  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000173214  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0102  putative periplasmic protease  51.43 
 
 
335 aa  310  2.9999999999999997e-83  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1913  putative periplasmic protease  48.96 
 
 
339 aa  308  8e-83  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.786378  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3922  putative periplasmic protease  48.96 
 
 
339 aa  307  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.113918  normal  0.0490355 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1161  putative periplasmic protease  45.85 
 
 
353 aa  304  1.0000000000000001e-81  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.189873  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2394  putative periplasmic protease  50.67 
 
 
338 aa  303  2.0000000000000002e-81  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.00000000216852  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1651  putative periplasmic protease  48.19 
 
 
342 aa  303  4.0000000000000003e-81  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000359076  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2659  putative periplasmic protease  49.56 
 
 
348 aa  301  1e-80  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0477819  unclonable  0.0000000288065 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2166  putative periplasmic protease  47.8 
 
 
348 aa  300  2e-80  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0622193  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2306  putative periplasmic protease  48.68 
 
 
348 aa  300  3e-80  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2036  putative periplasmic protease  48.68 
 
 
348 aa  300  3e-80  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.210716  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1925  putative periplasmic protease  48.68 
 
 
348 aa  300  3e-80  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0571162  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2692  putative periplasmic protease  50.33 
 
 
338 aa  299  5e-80  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000260799  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1674  putative periplasmic protease  50.33 
 
 
330 aa  299  5e-80  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000678362  hitchhiker  0.00314277 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0578  putative periplasmic protease  47.32 
 
 
353 aa  298  1e-79  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.000000000000048636  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1530  putative periplasmic protease  48.33 
 
 
338 aa  297  2e-79  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000000234628  unclonable  0.0000000000765641 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0841  putative periplasmic protease  49.21 
 
 
347 aa  296  5e-79  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0227554  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1193  putative periplasmic protease  46.88 
 
 
349 aa  295  9e-79  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1202  putative periplasmic protease  51.54 
 
 
324 aa  293  2e-78  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.184937  normal  0.0260504 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2460  putative periplasmic protease  49.85 
 
 
340 aa  293  3e-78  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0165849  hitchhiker  0.0077968 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1530  putative periplasmic protease  44.15 
 
 
353 aa  291  9e-78  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  0.00000285162  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02863  putative periplasmic protease  45.93 
 
 
353 aa  291  1e-77  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01896  putative periplasmic protease  44.61 
 
 
340 aa  291  1e-77  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000105224  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0461  putative periplasmic protease  47.56 
 
 
338 aa  291  1e-77  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1726  putative periplasmic protease  47.56 
 
 
338 aa  291  1e-77  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1184  putative periplasmic protease  51.19 
 
 
326 aa  289  4e-77  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.084263  normal  0.0267663 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27550  putative periplasmic protease  48.64 
 
 
342 aa  289  6e-77  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2790  putative periplasmic protease  49.67 
 
 
338 aa  287  2e-76  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000021118  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2713  putative periplasmic protease  49.67 
 
 
338 aa  287  2e-76  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000822492  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2728  peptidase, U7 family  50.46 
 
 
340 aa  286  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1470  putative periplasmic protease  48.63 
 
 
338 aa  286  2.9999999999999996e-76  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000101356  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2933  putative periplasmic protease  49.49 
 
 
338 aa  286  4e-76  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1536  putative periplasmic protease  48.63 
 
 
338 aa  286  4e-76  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000229962  unclonable  0.0000262337 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2407  putative periplasmic protease  48.3 
 
 
343 aa  283  2.0000000000000002e-75  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000170796  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40840  putative periplasmic protease  51.24 
 
 
341 aa  282  6.000000000000001e-75  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0992  putative periplasmic protease  55.7 
 
 
332 aa  281  1e-74  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0462132  unclonable  0.000000000696502 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1759  peptidase S49  46.61 
 
 
356 aa  280  2e-74  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.257491  normal  0.0518499 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2530  putative periplasmic protease  49.85 
 
 
339 aa  279  5e-74  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.581434  normal  0.322286 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3463  putative periplasmic protease  50.53 
 
 
341 aa  278  7e-74  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.145757  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2356  putative periplasmic protease  57.5 
 
 
349 aa  276  3e-73  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.203735  hitchhiker  0.000000387336 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1381  putative periplasmic protease  57.5 
 
 
349 aa  276  3e-73  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2016  putative periplasmic protease  42.42 
 
 
365 aa  276  4e-73  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000438973  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2181  putative periplasmic protease  45.05 
 
 
344 aa  275  7e-73  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0119902  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01248  predicted inner membrane peptidase  57.08 
 
 
349 aa  275  9e-73  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.57179  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2377  Peptidase S49 domain protein  57.08 
 
 
349 aa  275  9e-73  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00026529  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1859  putative periplasmic protease  57.08 
 
 
349 aa  275  9e-73  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000000140347 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1904  putative periplasmic protease  57.08 
 
 
349 aa  275  9e-73  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000180069 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1605  putative periplasmic protease  45.29 
 
 
334 aa  275  1.0000000000000001e-72  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.741471  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1496  putative periplasmic protease  57.08 
 
 
349 aa  273  2.0000000000000002e-72  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1707  putative periplasmic protease  45.59 
 
 
347 aa  273  2.0000000000000002e-72  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.122025 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1471  putative periplasmic protease  56.67 
 
 
349 aa  273  2.0000000000000002e-72  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.251936  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1897  Peptidase S49 domain protein  49.26 
 
 
347 aa  273  4.0000000000000004e-72  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1430  putative periplasmic protease  55.83 
 
 
348 aa  271  1e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.28088  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1906  putative periplasmic protease  55.83 
 
 
348 aa  271  1e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000000137079 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1612  putative periplasmic protease  55.83 
 
 
348 aa  271  1e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000117623 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1848  putative periplasmic protease  55.83 
 
 
348 aa  271  1e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.805473  normal  0.10396 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1843  putative periplasmic protease  55.42 
 
 
348 aa  269  4e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000005383 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1972  putative periplasmic protease  45.3 
 
 
349 aa  268  7e-71  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.114164  normal  0.766223 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0843  putative periplasmic protease  42.34 
 
 
325 aa  268  8.999999999999999e-71  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2198  putative periplasmic protease  55.56 
 
 
347 aa  265  8e-70  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000353353 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0917  putative periplasmic protease  46.23 
 
 
312 aa  256  3e-67  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0886  putative periplasmic protease  57.14 
 
 
312 aa  256  4e-67  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0332  putative periplasmic protease  54.01 
 
 
332 aa  248  9e-65  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1938  putative periplasmic protease  49.24 
 
 
349 aa  246  4e-64  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_5654  predicted protein  47.22 
 
 
234 aa  189  8e-47  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.221345  normal  0.32323 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_4014  predicted protein  48.78 
 
 
216 aa  188  1e-46  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.545391  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_5396  predicted protein  44.24 
 
 
165 aa  122  9.999999999999999e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.751288  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1066  peptidase S49  30.13 
 
 
316 aa  95.9  8e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.609608  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2771  signal peptide peptidase SppA, 36K type  32.54 
 
 
584 aa  94  4e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3060  signal peptide peptidase SppA, 67K type  31.91 
 
 
625 aa  93.2  5e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0909  peptidase S49  32.87 
 
 
364 aa  93.2  5e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0531296 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0974  peptidase S49  32.41 
 
 
364 aa  92  1e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0652949 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0396  signal peptide peptidase SppA, 36K type  33.33 
 
 
325 aa  90.5  3e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.302309  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0560  signal peptide peptidase SppA, 67K type  35.18 
 
 
596 aa  88.2  2e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.789825 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0067  signal peptide peptidase SppA, 36K type  32.81 
 
 
325 aa  88.2  2e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1737  signal peptide peptidase SppA, 67K type  31.03 
 
 
605 aa  87.4  3e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.000998332  decreased coverage  0.00000852075 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1560  protease  28.51 
 
 
313 aa  87.8  3e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.22727  normal  0.14187 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2080  signal peptide peptidase SppA, 67K type  31.03 
 
 
605 aa  87.4  3e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0583  signal peptide peptidase A  33.85 
 
 
273 aa  87  4e-16  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2221  signal peptide peptidase SppA, 67K type  36.42 
 
 
661 aa  86.3  7e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.431319 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0102  S49 family peptidase  34.57 
 
 
326 aa  85.9  9e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1234  signal peptide peptidase SppA, 36K type  36.42 
 
 
260 aa  85.1  0.000000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0032  signal peptide peptidase SppA, 36K type  32.93 
 
 
371 aa  85.5  0.000000000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.557774  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0522  signal peptide peptidase SppA, 67K type  28.98 
 
 
626 aa  85.5  0.000000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.200693  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1376  peptidase S49  33.74 
 
 
295 aa  84.7  0.000000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.972193  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0963  signal peptide peptidase SppA, 36K type  27.61 
 
 
547 aa  84.3  0.000000000000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>