More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AFE_0862 on replicon NC_011761
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011761  AFE_0862  drug resistance transporter, putative  100 
 
 
387 aa  787    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.184539  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0986  secretion protein HlyD family protein  100 
 
 
389 aa  787    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.3536  hitchhiker  0.00174986 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3583  major facilitator superfamily efflux pump membrane fusion protein  39.41 
 
 
420 aa  256  7e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0766049  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2468  secretion protein HlyD family protein  36.69 
 
 
393 aa  255  8e-67  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1024  secretion protein HlyD  38.86 
 
 
404 aa  252  9.000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1480  secretion protein HlyD family protein  38.86 
 
 
404 aa  252  9.000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1504  secretion protein HlyD family protein  38.86 
 
 
404 aa  252  9.000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.226713  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1751  efflux pump membrane protein  39.35 
 
 
407 aa  251  1e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0610226 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1426  secretion protein HlyD family protein  38.81 
 
 
405 aa  252  1e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0183071 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1386  secretion protein HlyD family protein  38.81 
 
 
407 aa  251  1e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1214  secretion protein HlyD family protein  39.14 
 
 
429 aa  247  2e-64  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.314397  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1123  secretion protein HlyD family protein  39.14 
 
 
429 aa  248  2e-64  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.911317  normal  0.519674 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1725  efflux pump membrane protein  37.82 
 
 
406 aa  246  4e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1636  efflux pump membrane protein  38.87 
 
 
424 aa  245  9e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00067211 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2560  multidrug resistance protein  39.71 
 
 
410 aa  245  9e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.634691  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2816  major facilitator superfamily efflux pump membrane fusion protein  37.95 
 
 
413 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.106074  normal  0.653781 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1293  multidrug resistance A (translocase) transmembrane protein  39.41 
 
 
428 aa  244  1.9999999999999999e-63  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.538155  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4645  HlyD family secretion protein  38.18 
 
 
404 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.109619  normal  0.493066 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1288  secretion protein HlyD family protein  39.95 
 
 
392 aa  243  3e-63  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.230633 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1767  multidrug resistance protein  39.41 
 
 
411 aa  243  3e-63  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1919  multidrug resistance protein  39.41 
 
 
411 aa  243  3e-63  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.666477  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1744  multidrug resistance protein  39.41 
 
 
411 aa  243  3e-63  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1503  putative multidrug resistance protein  39.41 
 
 
411 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1057  multidrug resistance protein, putative  39.41 
 
 
411 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0394345  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0171  putative multidrug resistance protein  39.41 
 
 
411 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.152509  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2027  secretion protein HlyD  36.62 
 
 
413 aa  243  3.9999999999999997e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.294658  normal  0.169998 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0995  putative multidrug resistance protein  39.41 
 
 
411 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3549  secretion protein HlyD family protein  38.24 
 
 
397 aa  241  2e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68130  multidrug resistance protein  40.66 
 
 
394 aa  241  2e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00130699  normal  0.0310617 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5897  multidrug resistance protein  40.06 
 
 
400 aa  240  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3330  efflux pump membrane protein  35.88 
 
 
391 aa  239  5e-62  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2225  secretion protein HlyD family protein  38.24 
 
 
397 aa  239  5.999999999999999e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.818643  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3163  efflux pump membrane protein  36.1 
 
 
390 aa  238  1e-61  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2373  secretion protein HlyD family protein  38.59 
 
 
395 aa  238  1e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0858  efflux pump membrane protein  36.15 
 
 
391 aa  237  2e-61  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1445  secretion protein HlyD family protein  39.03 
 
 
444 aa  238  2e-61  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1515  secretion protein HlyD  38.25 
 
 
405 aa  238  2e-61  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.498978  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3930  multidrug resistance protein A  37.06 
 
 
394 aa  238  2e-61  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.725166 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3643  secretion protein HlyD  38.38 
 
 
400 aa  237  3e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.870857  normal  0.0330116 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02540  multidrug efflux system  37.06 
 
 
390 aa  236  4e-61  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02505  hypothetical protein  37.06 
 
 
390 aa  236  4e-61  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2821  multidrug resistance protein A  37.06 
 
 
390 aa  236  4e-61  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2807  multidrug resistance protein A  37.06 
 
 
390 aa  236  4e-61  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000414824  hitchhiker  0.00826621 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1022  efflux pump membrane protein  37.06 
 
 
390 aa  236  4e-61  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.727271  normal  0.0227655 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2968  multidrug resistance protein A  37.06 
 
 
390 aa  236  4e-61  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.157313  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0999  efflux pump membrane protein  37.06 
 
 
390 aa  236  5.0000000000000005e-61  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.486081  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3486  efflux pump membrane protein  35.09 
 
 
391 aa  236  7e-61  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0859  secretion protein HlyD  42.15 
 
 
402 aa  233  3e-60  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.556695  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2004  secretion protein HlyD family protein  36.93 
 
 
380 aa  233  5e-60  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3201  multidrug resistance protein A  34.45 
 
 
390 aa  231  1e-59  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3460  multidrug resistance protein A  34.45 
 
 
390 aa  231  1e-59  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3338  efflux pump membrane protein  34.45 
 
 
390 aa  232  1e-59  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.615616  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2024  secretion protein HlyD  35.11 
 
 
429 aa  231  2e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0436308  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3191  multidrug resistance protein A  36.51 
 
 
390 aa  230  3e-59  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.168067  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1730  secretion protein HlyD  35.01 
 
 
402 aa  230  4e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3120  multidrug resistance protein A  36.49 
 
 
390 aa  226  6e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0308659 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2997  multidrug resistance protein A  36.49 
 
 
390 aa  225  8e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00138717 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2931  multidrug resistance protein A  36.49 
 
 
390 aa  225  8e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2962  multidrug resistance protein A  36.49 
 
 
390 aa  225  8e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.832708  hitchhiker  0.00715907 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3014  multidrug resistance protein A  36.49 
 
 
390 aa  225  8e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00193784 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3743  efflux pump membrane protein  34.77 
 
 
390 aa  225  8e-58  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.881561  normal  0.148039 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3748  multidrug resistance protein  34.04 
 
 
402 aa  224  1e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.155411  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01156  multidrug resistance efflux pump  39.29 
 
 
372 aa  225  1e-57  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.461805  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2416  secretion protein HlyD family protein  38.38 
 
 
437 aa  224  2e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.975538 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3235  secretion protein HlyD  38.97 
 
 
465 aa  224  3e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.265062  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0890  efflux pump membrane protein  36.13 
 
 
391 aa  224  3e-57  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0249504  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2078  secretion protein HlyD family protein  38.31 
 
 
397 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2518  drug resistance MFS transporter, membrane fusion protein (MFP) subunit EmrK  34.75 
 
 
387 aa  219  6e-56  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4314  MFS efflux pump, membrane fusion protein, EmrA subfamily  39.21 
 
 
423 aa  218  1e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02278  EmrKY-TolC multidrug resistance efflux pump, membrane fusion protein component  34.46 
 
 
387 aa  217  2e-55  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.29421  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1289  efflux pump membrane protein  34.46 
 
 
387 aa  217  2e-55  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02239  hypothetical protein  34.46 
 
 
387 aa  217  2e-55  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.371729  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1301  efflux pump membrane protein  34.46 
 
 
387 aa  217  2e-55  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.632829  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3599  drug resistance MFS transporter, membrane fusion protein (MFP) subunit EmrK  34.46 
 
 
387 aa  218  2e-55  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0273562 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2505  drug resistance MFS transporter, membrane fusion protein (MFP) subunit EmrK  34.46 
 
 
387 aa  217  2e-55  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.012377  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2737  drug resistance MFS transporter, membrane fusion protein (MFP) subunit EmrK  35.17 
 
 
387 aa  218  2e-55  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.778541  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2654  drug resistance MFS transporter, membrane fusion protein (MFP) subunit EmrK  34.46 
 
 
387 aa  216  5e-55  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2021  secretion protein HlyD family protein  38.67 
 
 
413 aa  216  5e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0240231 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0262  secretion protein HlyD family protein  40.29 
 
 
405 aa  216  7e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00123427 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0257  secretion protein HlyD family protein  40.29 
 
 
402 aa  215  9.999999999999999e-55  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3743  secretion protein HlyD family protein  36.13 
 
 
453 aa  214  1.9999999999999998e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00143217  normal  0.519955 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3490  secretion protein HlyD family protein  37.94 
 
 
448 aa  209  5e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.592297  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1021  multidrug resistance protein VceA  39.53 
 
 
395 aa  207  2e-52  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1144  secretion protein HlyD family protein  36.2 
 
 
374 aa  207  3e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.143245  normal  0.639337 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4889  HlyD family secretion protein  36.95 
 
 
459 aa  206  7e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.392756  normal  0.502569 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5574  secretion protein HlyD family protein  38.96 
 
 
480 aa  203  5e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4021  secretion protein HlyD family protein  37.01 
 
 
451 aa  203  5e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.228244  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0039  secretion protein HlyD family protein  42.31 
 
 
370 aa  202  6e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0038  drug resistance secretion protein, putative  42.31 
 
 
370 aa  202  6e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3904  efflux pump membrane protein  35.18 
 
 
381 aa  201  1.9999999999999998e-50  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6205  secretion protein HlyD  39.35 
 
 
450 aa  199  6e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.127149  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4503  secretion protein HlyD family protein  38.54 
 
 
396 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0562  HlyD family secretion protein  39.26 
 
 
396 aa  197  3e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5028  secretion protein HlyD family protein  39.34 
 
 
396 aa  197  3e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.826607  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1634  secretion protein HlyD family protein  35.99 
 
 
453 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.975133  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4219  secretion protein HlyD family protein  38.92 
 
 
386 aa  195  1e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.439503  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1081  multidrug resistance protein  39.71 
 
 
488 aa  193  5e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.00767071  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0732  multidrug resistance secretion protein  39.24 
 
 
489 aa  192  6e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1825  multidrug resistance protein  39.24 
 
 
489 aa  192  6e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.996701  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1875  multidrug resistance protein  39.71 
 
 
488 aa  192  9e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.371693  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>