201 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AFE_0723 on replicon NC_011761
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011761  AFE_0723  helix-turn-helix domain protein  100 
 
 		 123 aa  251  2.0000000000000002e-66  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.523038  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0871  putative transcriptional regulator, ModE family  100 
 
 		 123 aa  251  2.0000000000000002e-66  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.741628  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2293  ModE family transcriptional regulator  56.07 
 
 		 115 aa  123  8.000000000000001e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.11585  normal  0.260705 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1869  putative transcriptional regulator, ModE family  58.41 
 
 		 125 aa  115  9.999999999999999e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.214893  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4071  putative transcriptional regulator, ModE family  49.56 
 
 		 115 aa  115  3e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4205  putative transcriptional regulator, ModE family  48.8 
 
 		 125 aa  111  4.0000000000000004e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.590179  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2514  ModE family transcriptional regulator  50 
 
 		 125 aa  108  2.0000000000000002e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.217491  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2824  ModE family transcriptional regulator  53.33 
 
 		 152 aa  108  2.0000000000000002e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.812847 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3881  putative transcriptional regulator, ModE family  53.15 
 
 		 119 aa  105  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.180792  normal  0.0155271 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2794  ModE family transcriptional regulator  48.11 
 
 		 107 aa  104  4e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4419  ModE family transcriptional regulator  46.9 
 
 		 125 aa  102  2e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.675399  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1642  LysR family transcriptional regulator  49.02 
 
 		 128 aa  99.8  1e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.986241 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6170  ModE family transcriptional regulator  47.22 
 
 		 141 aa  98.6  3e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.350331  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0974  molybdenum-binding transcriptional repressor  47.79 
 
 		 132 aa  97.4  5e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3515  ModE family transcriptional regulator  45.05 
 
 		 112 aa  97.1  8e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000445767  normal  0.258614 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2664  ModE family transcriptional regulator  54.35 
 
 		 118 aa  96.7  9e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.554277  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5511  putative transcriptional regulator, ModE family  47.27 
 
 		 114 aa  96.3  1e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3706  putative transcriptional regulator, ModE family  47.27 
 
 		 114 aa  96.3  1e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1193  ModE family transcriptional regulator  49.06 
 
 		 107 aa  94.7  3e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.239879  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1343  molybdenum transport protein, putative  52.73 
 
 		 177 aa  94.4  5e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4259  ModE family transcriptional regulator  56.84 
 
 		 138 aa  92  2e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.459196  normal  0.100548 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2496  ModE family transcriptional regulator  52.04 
 
 		 115 aa  92  2e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.159703 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3480  transcriptional regulator ModE  55.24 
 
 		 117 aa  89.4  1e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4319  ModE family transcriptional regulator  45.76 
 
 		 129 aa  88.6  3e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0494502  normal  0.0757875 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0934  LysR family transcriptional regulator  51.11 
 
 		 134 aa  87.4  6e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.102124  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1927  ModE family transcriptional regulator  47.46 
 
 		 129 aa  87.4  6e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3409  ModE family transcriptional regulator  47.06 
 
 		 116 aa  86.7  9e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0426925  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0011  ModE family transcriptional regulator  51.61 
 
 		 125 aa  82.8  0.000000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1950  ModE family transcriptional regulator  48.11 
 
 		 137 aa  80.9  0.000000000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0318025  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6143  putative transcriptional regulator, ModE family  43.96 
 
 		 114 aa  79  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.144159  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5342  putative transcriptional regulator, ModE family  39.09 
 
 		 114 aa  78.6  0.00000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3199  ModE family transcriptional regulator  40.87 
 
 		 162 aa  77.8  0.00000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.213891  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2952  ModE family transcriptional regulator  45.26 
 
 		 118 aa  76.3  0.0000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3767  putative transcriptional regulator, ModE family  53.01 
 
 		 112 aa  75.9  0.0000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1477  molybdenum-binding protein, N-terminal:molybdenum-pterin binding protein  35.54 
 
 		 272 aa  73.6  0.0000000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0460  ModE family transcriptional regulator  43.59 
 
 		 127 aa  73.6  0.0000000000009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000661787  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3855  ModE family transcriptional regulator  55.56 
 
 		 117 aa  73.2  0.000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.81779  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0281  ModE family transcriptional regulator  37.17 
 
 		 134 aa  70.9  0.000000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2036  ModE family transcriptional regulator  35.51 
 
 		 276 aa  70.9  0.000000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.646179  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2068  TOBE domain protein  45.16 
 
 		 257 aa  69.3  0.00000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2075  molybdenum transport regulator  40.22 
 
 		 140 aa  68.9  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4134  putative transcriptional regulator, ModE family  45.31 
 
 		 121 aa  68.6  0.00000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0113407 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0938  putative transcriptional regulator, ModE family  41.56 
 
 		 132 aa  67.8  0.00000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0137945 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50680  Mo regulation, Mo processing homeostasis  35.51 
 
 		 270 aa  67.8  0.00000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.438349  n/a   
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3874  transcriptional repressor, ModE  44.16 
 
 		 262 aa  67.4  0.00000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0735734  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4166  ModE family transcriptional regulator  44.16 
 
 		 262 aa  67.4  0.00000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00104797  normal  0.104434 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0962  molybdate transport repressor  40.22 
 
 		 263 aa  67  0.00000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0976  ModE family transcriptional regulator  40.85 
 
 		 270 aa  66.2  0.0000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1034  molybdenum-pterin-binding protein, molybdate transport system regulatory protein  41.77 
 
 		 111 aa  65.9  0.0000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.296727  normal  0.0986762 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0856  ModE family transcriptional regulator  40.22 
 
 		 263 aa  65.9  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5199  transcriptional regulator, ModE family  39.13 
 
 		 263 aa  65.9  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1405  putative transcriptional regulator, ModE family  39.33 
 
 		 126 aa  65.5  0.0000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.518534  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1131  putative transcriptional regulator, ModE family  68.75 
 
 		 125 aa  65.5  0.0000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0940  transcriptional regulator, ModE family  42.11 
 
 		 263 aa  64.7  0.0000000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000762676  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2144  molybdenum-pterin binding domain-containing protein  34.29 
 
 		 195 aa  64.7  0.0000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.947345  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1731  ModE family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 268 aa  64.7  0.0000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000816631  normal  0.0463603 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1100  ModE family transcriptional regulator  38.16 
 
 		 145 aa  64.7  0.0000000005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.87335  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1578  putative transcriptional regulator, ModE family  42.03 
 
 		 134 aa  63.9  0.0000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.82567 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1265  putative molybdenum transport protein ModA  32.38 
 
 		 195 aa  63.5  0.0000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0023  ModE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 135 aa  63.2  0.000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0330  putative transcriptional regulator, ModE family  35.48 
 
 		 116 aa  62  0.000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000263512  normal  0.179413 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1573  putative molybdenum-binding protein  41.05 
 
 		 265 aa  62.8  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.163171  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33430  Molybdenum-binding ModE protein  33.64 
 
 		 270 aa  62  0.000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0386  ModE family transcriptional regulator  44.32 
 
 		 254 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.129709  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0207  ModE family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 120 aa  61.6  0.000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1701  ModE family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 125 aa  62  0.000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.540153  normal  0.344174 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0360  ModE family transcriptional regulator  43.53 
 
 		 254 aa  61.2  0.000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.970254  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0705  ModE family transcriptional regulator  38.04 
 
 		 263 aa  60.8  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.190808 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0057  ModE family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 137 aa  59.7  0.00000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0390  ModE family transcriptional regulator  43.18 
 
 		 254 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.920005  normal  0.212591 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0066  ModE family transcriptional regulator  37.89 
 
 		 108 aa  59.3  0.00000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0000184024  normal  0.128771 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5178  ModE family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 254 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0047301  normal  0.255411 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2476  molybdate transport repressor  35.44 
 
 		 263 aa  58.5  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.240008  normal  0.243533 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4842  ModE family transcriptional regulator  43.18 
 
 		 254 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00572189  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0054  ModE family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 138 aa  58.2  0.00000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0286693 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2202  putative transcriptional regulator, ModE family  38.75 
 
 		 111 aa  58.2  0.00000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1086  NUDIX hydrolase  31.76 
 
 		 236 aa  58.2  0.00000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.702437  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2877  ModE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 125 aa  58.2  0.00000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.795322  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0567  ModE family transcriptional regulator  48.72 
 
 		 268 aa  57.8  0.00000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1989  ModE family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 263 aa  57  0.00000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.455542  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0482  putative transcriptional regulator, ModE family  36.25 
 
 		 128 aa  56.6  0.0000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000243706  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2059  regulatory protein LysR  30.39 
 
 		 245 aa  56.2  0.0000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000246336  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2041  putative transcriptional regulator, ModE family  37.84 
 
 		 118 aa  56.2  0.0000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0585  ModE family transcriptional regulator  29.89 
 
 		 261 aa  55.8  0.0000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3358  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  45.45 
 
 		 265 aa  55.1  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.142068 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4312  hypothetical protein  45.45 
 
 		 265 aa  55.1  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0533  putative transcriptional regulator, ModE family  30.38 
 
 		 118 aa  54.3  0.0000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4689  helix-turn-helix, Fis-type:molybdenum-binding protein, N-terminal:molybdenum-pterin binding protein  38.82 
 
 		 254 aa  53.9  0.0000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0492  molybdate transport regulator ModE, putative  40.79 
 
 		 254 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05434  putative molybdenum-pterin-binding protein  43.42 
 
 		 269 aa  52.4  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0447  transcriptional regulator, ModE family  41.56 
 
 		 268 aa  52.8  0.000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1572  ModE family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 123 aa  52.8  0.000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.113677  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2203  molybdenum-pterin binding domain-containing protein  28.74 
 
 		 260 aa  51.6  0.000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0630  ModE family transcriptional regulator  44.74 
 
 		 290 aa  51.6  0.000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4329  transcriptional regulator, ModE family  41.03 
 
 		 270 aa  51.2  0.000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00653536 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3194  ModE family transcriptional regulator  45.07 
 
 		 259 aa  51.2  0.000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.112161  hitchhiker  0.0000253797 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0770  ModE family transcriptional regulator  45.07 
 
 		 259 aa  51.2  0.000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0260908 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4219  transcriptional regulator, ModE family  41.03 
 
 		 270 aa  51.2  0.000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1638  transcriptional regulator, ModE family  44.16 
 
 		 269 aa  51.2  0.000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0731324  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0744  ModE family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 259 aa  51.2  0.000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0139669 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>