27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AFE_0711 on replicon NC_011761
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011761  AFE_0711  NHL repeat protein  100 
 
 		 398 aa  804    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0859  NHL repeat containing protein  100 
 
 		 398 aa  804    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0790  NHL repeat-containing protein  56.57 
 
 		 395 aa  411  1e-114  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.395295  normal  1 
 
 
-
 
NC_008036  Sala_3206  NHL repeat-containing protein  57.03 
 
 		 419 aa  408  1e-113  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0109  NHL repeat containing protein  55.47 
 
 		 397 aa  409  1e-113  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.894409 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1812  NHL repeat containing protein  54.91 
 
 		 397 aa  411  1e-113  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0113  NHL repeat containing protein  54.93 
 
 		 397 aa  405  1.0000000000000001e-112  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3874  NHL repeat containing protein  53.91 
 
 		 388 aa  395  1e-109  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4601  NHL repeat-containing protein  52.81 
 
 		 390 aa  397  1e-109  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3754  NHL repeat containing protein  51.6 
 
 		 398 aa  372  1e-102  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0470  hypothetical protein  50 
 
 		 371 aa  358  9.999999999999999e-98  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.043698 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3798  NHL repeat-containing protein  45.01 
 
 		 367 aa  268  1e-70  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.88272 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3229  NHL repeat containing protein  46.61 
 
 		 380 aa  265  8.999999999999999e-70  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.657691  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1073  NHL repeat-containing protein  45.43 
 
 		 362 aa  262  1e-68  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0871328  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0477  NHL repeat containing protein  43.7 
 
 		 368 aa  259  8e-68  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.517472  normal  0.232991 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2370  NHL repeat-containing protein  44.32 
 
 		 397 aa  258  2e-67  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0112642 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3876  NHL repeat containing protein  37.89 
 
 		 379 aa  202  9.999999999999999e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2063  NHL repeat containing protein  27.2 
 
 		 652 aa  64.7  0.000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2917  NHL repeat containing protein  27.3 
 
 		 623 aa  58.5  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.304592  normal  0.453442 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0027  Fibronectin type III domain protein  27.95 
 
 		 460 aa  55.1  0.000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00583  hypothetical protein  25.17 
 
 		 472 aa  50.8  0.00004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.718247  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2272  glycoside hydrolase family 26  28.52 
 
 		 711 aa  50.8  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.738347  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2158  NHL repeat-containing protein  27.4 
 
 		 1750 aa  46.6  0.0009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1378  hypothetical protein  29.07 
 
 		 1030 aa  46.2  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.872311  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4723  NHL repeat containing protein  25.14 
 
 		 1079 aa  45.4  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.645184  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2074  NHL repeat containing protein  23.51 
 
 		 522 aa  44.7  0.003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.614793 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0242  NHL repeat-containing protein  37.36 
 
 		 1146 aa  43.9  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00900908 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>