More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AFE_0621 on replicon NC_011761
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011761  AFE_0621  phosphoglycerate mutase family protein  100 
 
 
222 aa  449  1e-125  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0771  Phosphoglycerate mutase  100 
 
 
222 aa  449  1e-125  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1503  Phosphoglycerate mutase  37.5 
 
 
211 aa  132  6e-30  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0209  phosphoglycerate mutase  44.44 
 
 
218 aa  126  3e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0707  phosphoglycerate mutase  36.65 
 
 
209 aa  125  7e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0074  Phosphoglycerate mutase  40.22 
 
 
210 aa  122  4e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.107325  normal  0.82394 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1322  Phosphoglycerate mutase  32.28 
 
 
209 aa  122  4e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1067  phosphoglycerate mutase  39.89 
 
 
202 aa  121  7e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  5.9372e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0911  Phosphoglycerate mutase  36.67 
 
 
214 aa  120  2e-26  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05711  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  35.36 
 
 
442 aa  117  1e-25  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1465  alpha-ribazole phosphatase  38.8 
 
 
205 aa  117  1e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05411  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  35.36 
 
 
442 aa  115  4e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05791  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  33.15 
 
 
442 aa  115  4e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.840151  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0515  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  34.25 
 
 
442 aa  115  7e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.85164  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3274  Phosphoglycerate mutase  37.82 
 
 
370 aa  114  8e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  2.75954e-05  hitchhiker  0.000874495 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0327  phosphoglycerate mutase  34.9 
 
 
389 aa  114  2e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1847  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  34.03 
 
 
442 aa  113  2e-24  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0233931  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1105  phosphoglycerate mutase  41.61 
 
 
214 aa  114  2e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05721  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  34.95 
 
 
442 aa  113  2e-24  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.169271  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5474  Phosphoglycerate mutase  39.04 
 
 
198 aa  113  3e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0398  Phosphoglycerate mutase  41.11 
 
 
209 aa  112  4e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.95004  normal  0.481126 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2790  Phosphoglycerate mutase  37.93 
 
 
215 aa  111  1e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3311  Phosphoglycerate mutase  37.93 
 
 
215 aa  110  1e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.16526  normal  0.76051 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2249  Phosphoglycerate mutase  41.3 
 
 
234 aa  110  1e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2311  phosphoglycerate mutase  49.59 
 
 
440 aa  110  2e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.3615 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0229  fructose-2,6-bisphosphatase  38.33 
 
 
223 aa  110  2e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12560  fructose-2,6-bisphosphatase  38.14 
 
 
203 aa  110  2e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.834883  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2324  phosphoglycerate mutase  35.33 
 
 
213 aa  109  3e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0703569 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1381  Phosphoglycerate mutase  31.73 
 
 
240 aa  109  3e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6815  Fructose-2 6-bisphosphatase-like protein  50 
 
 
452 aa  109  4e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.142428 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0946  phosphoglycerate mutase  31.28 
 
 
233 aa  108  4e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.97615  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3375  Phosphoglycerate mutase  34.24 
 
 
213 aa  108  5e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.10408 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3088  alpha-ribazole phosphatase  34.01 
 
 
213 aa  108  5e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  2.63977e-06  hitchhiker  0.00177034 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02509  phosphoglycerate mutase  38.46 
 
 
214 aa  108  5e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1597  Phosphoglycerate mutase  28.43 
 
 
206 aa  108  6e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0485  phosphoglycerate mutase  36.07 
 
 
445 aa  108  8e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.081071 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1600  phosphoglycerate mutase  33.51 
 
 
209 aa  108  8e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2787  Phosphoglycerate mutase  36.36 
 
 
220 aa  108  9e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0389  Phosphoglycerate mutase  36.41 
 
 
226 aa  106  2e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0252032  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0374  Phosphoglycerate mutase  36.41 
 
 
226 aa  106  2e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1699  phosphoglycerate mutase  34.78 
 
 
213 aa  106  3e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.812426  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3133  Phosphoglycerate mutase  38.55 
 
 
200 aa  105  4e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3153  alpha-ribazole phosphatase  35.29 
 
 
196 aa  105  5e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  1.5335e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0968  Phosphoglycerate mutase  33.7 
 
 
212 aa  105  7e-22  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.667484  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14960  fructose-2,6-bisphosphatase  34.87 
 
 
243 aa  105  7e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.588171  normal  0.430385 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0613  phosphoglycerate mutase  37.06 
 
 
223 aa  104  9e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.496101 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1908  phosphoglycerate mutase  34.41 
 
 
208 aa  104  1e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.393562  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3955  phosphoglycerate mutase  38.38 
 
 
240 aa  104  1e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0124021 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0881  Phosphoglycerate mutase  44.93 
 
 
391 aa  103  2e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1121  alpha-ribazole-5`-phosphate phosphatase CobC, putative  38.02 
 
 
198 aa  103  2e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.568184  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0808  Phosphoglycerate mutase  36.97 
 
 
214 aa  103  2e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0275634 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1226  Phosphoglycerate mutase  39.33 
 
 
195 aa  103  2e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.129631  normal  0.708444 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2647  Phosphoglycerate mutase  36.26 
 
 
212 aa  103  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.372085 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3812  phosphoglycerate mutase  35.26 
 
 
224 aa  103  2e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.234713 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0420  phosphoglycerate mutase  38.42 
 
 
224 aa  103  3e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.104537 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0701  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  36.81 
 
 
442 aa  102  4e-21  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1615  phosphoglycerate mutase  40.22 
 
 
237 aa  102  5e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.979507  normal  0.794966 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0816  phosphoglycerate mutase  36.32 
 
 
212 aa  102  5e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3348  Phosphoglycerate mutase  36.55 
 
 
223 aa  102  7e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.27148  hitchhiker  0.000518506 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4091  phosphoglycerate mutase  43.14 
 
 
227 aa  101  8e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.810291 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1894  phosphatase PhoE  36.88 
 
 
203 aa  101  9e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00837019  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3404  bifunctional RNase H/acid phosphatase  43.87 
 
 
365 aa  101  1e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.262281 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3590  Phosphoglycerate mutase  31.41 
 
 
448 aa  100  1e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0571749  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3502  Phosphoglycerate mutase  35.11 
 
 
200 aa  101  1e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3353  bifunctional RNase H/acid phosphatase  43.87 
 
 
365 aa  101  1e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.359668 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0685  phosphoglycerate mutase  37.5 
 
 
221 aa  100  1e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05171  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  31.49 
 
 
443 aa  101  1e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2470  phosphoglycerate mutase  34.62 
 
 
213 aa  100  1e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3342  bifunctional RNase H/acid phosphatase  43.87 
 
 
365 aa  101  1e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.135995  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0202  phosphoglycerate mutase  37.5 
 
 
221 aa  100  1e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.326215  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1204  phosphoglycerate mutase  37.11 
 
 
207 aa  101  1e-20  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0960  phosphoglycerate mutase  36.06 
 
 
214 aa  100  2e-20  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  4.42989e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2646  Phosphoglycerate mutase  35.84 
 
 
214 aa  100  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.451935 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3404  phosphoglycerate mutase family protein  35.94 
 
 
220 aa  100  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1657  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  33.7 
 
 
444 aa  100  2e-20  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1817  Phosphoglycerate mutase  35.39 
 
 
208 aa  100  2e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3369  phosphoglycerate mutase family protein  35.94 
 
 
220 aa  100  2e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2892  bifunctional RNase H/acid phosphatase  42.68 
 
 
356 aa  100  2e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.816574  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2516  Phosphoglycerate mutase  30.89 
 
 
448 aa  100  2e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2494  Phosphoglycerate mutase  38.1 
 
 
210 aa  100  2e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.439678  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1513  phosphoribosyltransferase, putative/phosphoglycerate mutase family protein  31.22 
 
 
438 aa  99.8  3e-20  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000537342 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3410  phosphoglycerate mutase 2  35.94 
 
 
229 aa  99.8  3e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3618  bifunctional RNase H/acid phosphatase  41.94 
 
 
369 aa  99.8  3e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.324125  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2893  phosphoglycerate mutase  41.24 
 
 
205 aa  99.8  3e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.209877  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0114  Phosphoglycerate mutase  34.12 
 
 
210 aa  99.8  3e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  1.10333e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3771  phosphoglycerate mutase  36.98 
 
 
220 aa  99.4  4e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2273  Phosphoglycerate mutase  37.23 
 
 
208 aa  99.4  4e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0652  phosphoglycerate mutase  35.94 
 
 
221 aa  99.4  4e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.288396  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1079  phosphoglycerate mutase  35.58 
 
 
214 aa  99  5e-20  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  1.19918e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3598  phosphoglycerate mutase  34.64 
 
 
207 aa  99  5e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.593139  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1243  phosphoglycerate mutase, putative  36.98 
 
 
229 aa  99  5e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.348551  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0605  phosphoglycerate mutase  36.98 
 
 
220 aa  98.6  6e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.338062  normal  0.808152 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0972  Phosphoglycerate mutase  36.61 
 
 
215 aa  99  6e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1422  phosphoglycerate mutase family protein  37.63 
 
 
207 aa  98.6  7e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.314707  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3460  Phosphoglycerate mutase  39.09 
 
 
363 aa  98.2  8e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1975  Phosphoglycerate mutase  35.79 
 
 
207 aa  98.2  9e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00690294  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1897  phosphatase PhoE  30.65 
 
 
203 aa  98.2  9e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1859  phosphatase PhoE  30.65 
 
 
203 aa  98.2  9e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.324195  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0579  phosphoglycerate mutase  37.5 
 
 
220 aa  97.8  1e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.763016  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1599  phosphoglycerate mutase  36.41 
 
 
223 aa  97.8  1e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>