More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AFE_0530 on replicon NC_011761
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011761  AFE_0530  carbohydrate kinase, PfkB family  100 
 
 
313 aa  648  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.00148509  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0688  PfkB domain protein  100 
 
 
313 aa  648  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  unclonable  4.05539e-09  hitchhiker  0.000110738 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0173  PfkB domain protein  58.58 
 
 
310 aa  390  1e-107  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.00145747  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0047  carbohydrate kinase  58.77 
 
 
310 aa  377  1e-103  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2548  carbohydrate kinase, PfkB  58.44 
 
 
310 aa  372  1e-102  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.636589  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0209  PfkB  56.41 
 
 
311 aa  372  1e-102  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0171  carbohydrate kinase  57.37 
 
 
310 aa  368  1e-101  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.150341 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2067  Adenosine kinase  55.02 
 
 
310 aa  367  1e-100  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2634  ribokinase-like domain-containing protein  56.77 
 
 
314 aa  358  6e-98  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.831919  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3508  PfkB family kinase  56.45 
 
 
312 aa  357  1e-97  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3506  sugar kinase  56.45 
 
 
312 aa  357  1e-97  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1158  ribokinase, putative  56.77 
 
 
312 aa  358  1e-97  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3470  PfkB family kinase  56.45 
 
 
312 aa  357  1e-97  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.375649  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0427  putative ribokinase  56.13 
 
 
312 aa  355  4e-97  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3683  adenosine kinase  55.59 
 
 
312 aa  355  4e-97  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.235022  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0569  ribokinase-like domain-containing protein  55.27 
 
 
312 aa  355  4e-97  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.561391  decreased coverage  6.90864e-05 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1286  putative ribokinase  56.13 
 
 
312 aa  355  4e-97  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3278  putative ribokinase  56.13 
 
 
312 aa  355  4e-97  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0117  adenosine kinase  55.27 
 
 
312 aa  355  4e-97  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0600  adenosine kinase  55.27 
 
 
312 aa  355  4e-97  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.333204  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2784  ribokinase-like domain-containing protein  55.91 
 
 
312 aa  355  7e-97  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.417689  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3455  PfkB domain protein  54.37 
 
 
312 aa  353  3e-96  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.327587  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3431  PfkB domain protein  55.16 
 
 
312 aa  352  4e-96  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0295739  normal  0.0158701 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3935  PfkB  55.81 
 
 
310 aa  351  9e-96  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0713343  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3036  PfkB domain protein  53.07 
 
 
311 aa  349  4e-95  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2791  putative sugar kinase transferase protein  52.43 
 
 
311 aa  349  4e-95  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00725009  normal  0.760664 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0526  ribokinase-like domain-containing protein  54.11 
 
 
312 aa  348  7e-95  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.846303  normal  0.476119 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1195  ribokinase-like domain-containing protein  52.23 
 
 
316 aa  347  1e-94  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0527  putative sugar kinase transferase, PfkB  54.19 
 
 
312 aa  347  1e-94  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.827149 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0502  ribokinase-like domain-containing protein  53.8 
 
 
320 aa  347  2e-94  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2626  PfkB domain protein  52.75 
 
 
311 aa  347  2e-94  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3069  hypothetical protein  53.05 
 
 
315 aa  347  2e-94  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.795207  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2870  PfkB  52.4 
 
 
315 aa  344  9e-94  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0148576  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04263  sugar kinase  52.75 
 
 
362 aa  342  5e-93  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.383154  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0471  PfkB  54.25 
 
 
320 aa  341  1e-92  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  1.38593e-08  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0207  ribokinase-like domain-containing protein  50.78 
 
 
319 aa  339  4e-92  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  7.60585e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0225  PfkB domain protein  50.95 
 
 
319 aa  338  8e-92  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  1.45112e-08  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3450  PfkB domain protein  52.24 
 
 
311 aa  332  5e-90  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3388  ribokinase-like domain-containing protein  52.46 
 
 
307 aa  319  3e-86  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.684995 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2506  ribokinase, putative  55.16 
 
 
283 aa  311  1e-83  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.617052  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1103  PfkB  50.5 
 
 
300 aa  308  6e-83  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00948504  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0953  PfkB domain protein  50.17 
 
 
300 aa  308  1e-82  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.940655  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3635  ribokinase-like domain-containing protein  53.69 
 
 
298 aa  305  9e-82  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.151802  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2945  PfkB domain protein  53.69 
 
 
298 aa  304  1e-81  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1493  ribokinase-like domain-containing protein  51.01 
 
 
298 aa  301  1e-80  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0861  ribokinase-like domain-containing protein  51.34 
 
 
298 aa  300  3e-80  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.035179  normal  0.0608327 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1498  ribokinase-like domain-containing protein  49.66 
 
 
300 aa  295  8e-79  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0386  ribokinase-like domain-containing protein  52.63 
 
 
302 aa  294  1e-78  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00477103 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3210  putative sugar kinase transferase protein  49.66 
 
 
301 aa  291  1e-77  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.258809  decreased coverage  0.003878 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2351  ribokinase-like domain-containing protein  46.62 
 
 
318 aa  269  5e-71  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  1.53207e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3562  PfkB domain protein  45.37 
 
 
324 aa  258  1e-67  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0800  ribokinase-like domain-containing protein  40.89 
 
 
312 aa  237  2e-61  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.151496 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1489  carbohydrate kinase  42.07 
 
 
308 aa  234  1e-60  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  2.0351e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0487  ribokinase-like domain-containing protein  41.94 
 
 
327 aa  231  1e-59  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.518253  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0158  ribokinase-like domain-containing protein  41.88 
 
 
327 aa  229  6e-59  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0849672  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0200  PfkB domain protein  42.26 
 
 
318 aa  220  3e-56  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2935  PfkB domain protein  40.45 
 
 
308 aa  214  1e-54  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.158693 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2001  ribokinase-like domain-containing protein  39.48 
 
 
308 aa  207  3e-52  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0769014  normal  0.324635 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3144  ribokinase-like domain-containing protein  37.7 
 
 
327 aa  199  3e-50  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3081  PfkB domain protein  34.29 
 
 
324 aa  193  3e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00739756  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0955  ribokinase-like domain-containing protein  34.97 
 
 
339 aa  183  4e-45  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.989352  normal  0.38603 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1665  Adenosine kinase  35.02 
 
 
329 aa  181  1e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.237492 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3257  Adenosine kinase  35.03 
 
 
325 aa  181  1e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00285447  hitchhiker  0.000112709 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3120  adenosine kinase  35.14 
 
 
326 aa  180  3e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3063  PfkB domain protein  35.33 
 
 
324 aa  180  3e-44  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.142988  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12230  carbohydrate kinase cbhK  34.18 
 
 
324 aa  176  4e-43  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  5.30804e-07  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2666  PfkB domain protein  34.42 
 
 
328 aa  176  5e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.56784  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27030  sugar kinase, ribokinase  35.18 
 
 
321 aa  175  7e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.805869  normal  0.364358 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1286  PfkB domain-containing protein  33.44 
 
 
328 aa  174  1e-42  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.324688  normal  0.237222 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3153  Adenosine kinase  33.12 
 
 
323 aa  174  2e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1798  adenosine kinase  34.62 
 
 
326 aa  171  2e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.527553  normal  0.339618 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1012  putative carbohydrate kinase  33.12 
 
 
324 aa  169  5e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0637666  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2947  adenosine kinase  32.92 
 
 
323 aa  166  4e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3535  ribokinase-like domain-containing protein  32.59 
 
 
325 aa  163  3e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.32323  decreased coverage  0.000219352 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3311  adenosine kinase  32.28 
 
 
324 aa  161  1e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.353965  normal  0.464112 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3362  adenosine kinase  32.28 
 
 
324 aa  161  1e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0175719 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3566  adenosine kinase  32.79 
 
 
323 aa  162  1e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0415989  normal  0.0392481 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3300  adenosine kinase  32.28 
 
 
324 aa  161  1e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3294  PfkB domain protein  33.23 
 
 
325 aa  160  2e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.284548  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3303  ribokinase-like domain-containing protein  32.81 
 
 
325 aa  160  2e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.121546 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1531  PfkB domain protein  31.15 
 
 
329 aa  156  4e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0901719  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4145  PfkB domain-containing protein  31.65 
 
 
327 aa  152  5e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.786211  decreased coverage  0.0063394 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0492  ribokinase-like domain-containing protein  32.98 
 
 
302 aa  146  4e-34  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1416  ribokinase-like domain-containing protein  31.8 
 
 
302 aa  144  2e-33  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1220  cytidine kinase / inosine-guanosine kinase  32.27 
 
 
302 aa  144  2e-33  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.515057  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1406  ribokinase-like domain-containing protein  34.05 
 
 
302 aa  142  8e-33  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1201  ribokinase-like domain-containing protein  31.82 
 
 
298 aa  138  1e-31  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2903  cytidine kinase / inosine-guanosine kinase  32.96 
 
 
299 aa  132  5e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.859362  hitchhiker  0.00094244 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0077  PfkB  32.01 
 
 
299 aa  122  1e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.273667  normal  0.451983 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0967  cytidine kinase / inosine-guanosine kinase  30.04 
 
 
300 aa  115  1e-24  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0230959  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1085  PfkB domain protein  30.47 
 
 
294 aa  99.8  5e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.000428719  normal  0.482766 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0932  inosine-guanosine kinase / cytidine kinase  26.88 
 
 
298 aa  97.1  3e-19  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.934328  normal  0.0821037 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1080  PfkB domain protein  26.67 
 
 
317 aa  96.3  7e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1658  ribokinase-like domain-containing protein  29.76 
 
 
298 aa  93.2  5e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.468132  normal  0.0440332 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0859  ribokinase-like domain-containing protein  29.92 
 
 
296 aa  90.9  2e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.826184  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0185  ribokinase  27.17 
 
 
291 aa  77.8  2e-13  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  6.9064e-07  normal  0.0609987 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1649  ribokinase-like domain-containing protein  27.11 
 
 
308 aa  74.7  2e-12  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0416676  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2526  ribokinase  28.04 
 
 
301 aa  72  1e-11  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1357  PfkB domain protein  25.84 
 
 
303 aa  70.1  5e-11  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  3.68195e-09  normal  0.047324 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0118  ribokinase  28.05 
 
 
303 aa  69.7  7e-11  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>