79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AFE_0498 on replicon NC_011761
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011761  AFE_0498  hypothetical protein  100 
 
 		 145 aa  303  4.0000000000000004e-82  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  decreased coverage  0.0035037  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0659  protein of unknown function DUF1486  100 
 
 		 145 aa  303  4.0000000000000004e-82  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.984641  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2666  protein of unknown function DUF1486  29.71 
 
 		 142 aa  78.6  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5286  hypothetical protein  34.43 
 
 		 137 aa  75.5  0.0000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0931  hypothetical protein  28.03 
 
 		 140 aa  68.2  0.00000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5626  protein of unknown function DUF1486  32.29 
 
 		 147 aa  67  0.00000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1719  protein of unknown function DUF1486  30.53 
 
 		 152 aa  66.6  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1646  protein of unknown function DUF1486  30.53 
 
 		 152 aa  66.6  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.081161  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2975  hypothetical protein  31.72 
 
 		 152 aa  64.3  0.0000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.903707  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0339  protein of unknown function DUF1486  23.53 
 
 		 137 aa  62.8  0.000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.175362  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2545  protein of unknown function DUF1486  29.08 
 
 		 139 aa  60.1  0.00000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0441  hypothetical protein  28.93 
 
 		 144 aa  59.7  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.664223  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4210  hypothetical protein  26.87 
 
 		 144 aa  58.2  0.00000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0316  protein of unknown function DUF1486  30.91 
 
 		 138 aa  57.4  0.00000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1710  hypothetical protein  28.79 
 
 		 142 aa  53.5  0.000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.518536  normal  0.0462427 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5540  protein of unknown function DUF1486  23.91 
 
 		 138 aa  52  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0249  hypothetical protein  29.35 
 
 		 150 aa  51.6  0.000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000330917  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3939  hypothetical protein  26.6 
 
 		 135 aa  51.6  0.000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3371  hypothetical protein  24.26 
 
 		 133 aa  50.8  0.000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.032421  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3219  protein of unknown function DUF1486  28.12 
 
 		 148 aa  50.8  0.000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000000247367  hitchhiker  0.000405951 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0080  flavin reductase domain protein FMN-binding  28.81 
 
 		 316 aa  50.4  0.000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5224  hypothetical protein  29.55 
 
 		 148 aa  49.7  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1624  hypothetical protein  36.36 
 
 		 151 aa  49.7  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000580657 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1283  protein of unknown function DUF1486  25.42 
 
 		 132 aa  48.9  0.00002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4924  hypothetical protein  28.57 
 
 		 155 aa  49.3  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_26927  predicted protein  25.19 
 
 		 242 aa  48.9  0.00002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00169388  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0619  hypothetical protein  25.53 
 
 		 128 aa  48.1  0.00004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.619761  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26760  predicted ester cyclase  25.69 
 
 		 140 aa  48.1  0.00004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.683774  normal  0.316469 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1107  protein of unknown function DUF1486  24.43 
 
 		 163 aa  48.1  0.00004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0915  protein of unknown function DUF1486  25.69 
 
 		 138 aa  47.8  0.00005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.282506  normal  0.0578966 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4099  protein of unknown function DUF1486  26.6 
 
 		 132 aa  47.8  0.00005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.000310906  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1135  hypothetical protein  23.16 
 
 		 136 aa  47.8  0.00005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.168418  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2990  hypothetical protein  25.42 
 
 		 132 aa  47.8  0.00006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1354  hypothetical protein  29.35 
 
 		 185 aa  47  0.00008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0972  hypothetical protein  27.41 
 
 		 162 aa  47  0.00008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.284776  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1469  hypothetical protein  30.43 
 
 		 185 aa  47  0.00009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0561  hypothetical protein  25.53 
 
 		 134 aa  47  0.00009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0987  hypothetical protein  30.43 
 
 		 185 aa  47  0.00009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.983826  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1394  hypothetical protein  29.35 
 
 		 185 aa  47  0.00009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.984832  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4917  hypothetical protein  26.53 
 
 		 149 aa  46.2  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3974  hypothetical protein  22.14 
 
 		 131 aa  46.6  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2641  hypothetical protein  26.8 
 
 		 176 aa  46.2  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0292741  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5476  hypothetical protein  22.34 
 
 		 128 aa  45.4  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.880512  normal  0.34526 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4678  protein of unknown function DUF1486  22.46 
 
 		 141 aa  45.8  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000675641 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2668  protein of unknown function DUF1486  32.08 
 
 		 155 aa  46.2  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000361014  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1447  hypothetical protein  27.5 
 
 		 185 aa  45.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0560331  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1364  hypothetical protein  25 
 
 		 127 aa  45.1  0.0003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0351  protein of unknown function DUF1486  21.9 
 
 		 145 aa  44.7  0.0004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_36501  predicted protein  20.61 
 
 		 284 aa  44.7  0.0004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.260623  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2161  protein of unknown function DUF1486  22.06 
 
 		 123 aa  44.7  0.0005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.395088  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3928  protein of unknown function DUF1486  26.36 
 
 		 157 aa  44.3  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.106321 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4651  hypothetical protein  22.31 
 
 		 186 aa  44.3  0.0005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.712908 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6920  hypothetical protein  24.73 
 
 		 128 aa  44.7  0.0005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.365039 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1364  hypothetical protein  23.81 
 
 		 138 aa  43.5  0.0009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.646938  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6384  hypothetical protein  24.44 
 
 		 147 aa  43.5  0.0009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.792832  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4630  protein of unknown function DUF1486  26.09 
 
 		 126 aa  43.5  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.601638  normal  0.196817 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1703  hypothetical protein  26.26 
 
 		 185 aa  42.4  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4326  hypothetical protein  24.47 
 
 		 286 aa  42.4  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0121723  normal  0.11718 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0209  hypothetical protein  26.26 
 
 		 185 aa  42.4  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0131745  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1546  hypothetical protein  26.26 
 
 		 185 aa  42.4  0.002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4171  hypothetical protein  24.47 
 
 		 286 aa  42.4  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4925  hypothetical protein  21.32 
 
 		 137 aa  42.4  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.773252  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1104  hypothetical protein  26.26 
 
 		 185 aa  42.4  0.002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0489751  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4095  hypothetical protein  24.47 
 
 		 286 aa  42.4  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1729  hypothetical protein  26.26 
 
 		 185 aa  42.4  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0373687  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1882  hypothetical protein  26.26 
 
 		 185 aa  42.4  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0563369  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0955  hypothetical protein  26.26 
 
 		 185 aa  42.4  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.949837  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4135  protein of unknown function DUF1486  22 
 
 		 134 aa  42.4  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5397  hypothetical protein  25 
 
 		 187 aa  41.6  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.255025  normal  0.733155 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4442  putative lipoprotein  26.88 
 
 		 179 aa  41.6  0.003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.987994  normal  0.460875 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4914  hypothetical protein  25 
 
 		 137 aa  42  0.003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.208327  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4086  hypothetical protein  25.93 
 
 		 380 aa  41.6  0.003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.358053 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0952  protein of unknown function DUF1486  30.67 
 
 		 149 aa  41.6  0.004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0666254  decreased coverage  0.00444563 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2604  hypothetical protein  27.27 
 
 		 186 aa  41.6  0.004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1595  hypothetical protein  22.7 
 
 		 138 aa  41.2  0.005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000510897  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0892  putative lipoprotein  25.81 
 
 		 179 aa  41.2  0.005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2254  protein of unknown function DUF1486  22.34 
 
 		 134 aa  40.8  0.007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.416383  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46310  hypothetical protein  24.1 
 
 		 135 aa  40.4  0.008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0677929  normal  0.0352526 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1022  putative lipoprotein  26.88 
 
 		 179 aa  40.4  0.008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>