More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AFE_0394 on replicon NC_011761
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011761  AFE_0394  30S ribosomal protein S15  100 
 
 		 89 aa  180  7e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.259337  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0558  30S ribosomal protein S15  100 
 
 		 89 aa  180  7e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.576278 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0212  ribosomal protein S15  68.54 
 
 		 89 aa  125  1.0000000000000001e-28  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1663  30S ribosomal protein S15  66.29 
 
 		 89 aa  124  4.0000000000000003e-28  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.1386  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2437  30S ribosomal protein S15  68.54 
 
 		 89 aa  124  5e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.39623  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2554  30S ribosomal protein S15  69.66 
 
 		 89 aa  122  1e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.382305  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2479  ribosomal protein S15  65.17 
 
 		 89 aa  122  1e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.053537  normal  0.211646 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3071  30S ribosomal protein S15  65.17 
 
 		 89 aa  122  2e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.33844  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2117  ribosomal protein S15  66.29 
 
 		 89 aa  121  3e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0620683  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0956  30S ribosomal protein S15  66.29 
 
 		 89 aa  120  5e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1951  ribosomal protein S15  64.04 
 
 		 89 aa  120  6e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.245042  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0905  30S ribosomal protein S15  61.8 
 
 		 89 aa  120  9e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.713518  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2509  30S ribosomal protein S15  67.42 
 
 		 89 aa  119  9.999999999999999e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1216  ribosomal protein S15  65.17 
 
 		 89 aa  119  9.999999999999999e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.296388  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3345  ribosomal protein S15  64.04 
 
 		 89 aa  119  9.999999999999999e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.157077  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4487  ribosomal protein S15  67.42 
 
 		 89 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4177  30S ribosomal protein S15  67.42 
 
 		 89 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.418521  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2449  SSU ribosomal protein S15P  68.54 
 
 		 89 aa  119  1.9999999999999998e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0751959  normal  0.780373 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0490  ribosomal protein S15  64.04 
 
 		 89 aa  118  1.9999999999999998e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.515865 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0921  30S ribosomal protein S15  65.17 
 
 		 89 aa  119  1.9999999999999998e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1030  ribosomal protein S15  65.17 
 
 		 89 aa  119  1.9999999999999998e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.168108  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3166  30S ribosomal protein S15  61.8 
 
 		 89 aa  118  3e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.177567  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5458  30S ribosomal protein S15  66.29 
 
 		 89 aa  118  3e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.259891  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62720  30S ribosomal protein S15  66.29 
 
 		 89 aa  118  3e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.460956  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1233  30S ribosomal protein S15  58.43 
 
 		 89 aa  118  3e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42790  30S ribosomal protein S15  66.29 
 
 		 89 aa  117  3.9999999999999996e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.441707  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0694  SSU ribosomal protein S15P  65.17 
 
 		 89 aa  117  4.9999999999999996e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.108476  normal  0.216291 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1905  30S ribosomal protein S15  63.22 
 
 		 88 aa  117  4.9999999999999996e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000149248  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0782  30S ribosomal protein S15  66.29 
 
 		 89 aa  117  6e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00988358  normal  0.116943 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1338  30S ribosomal protein S15  67.05 
 
 		 90 aa  117  6e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0211534  normal  0.0449315 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3219  30S ribosomal protein S15  67.05 
 
 		 90 aa  117  6e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.962482 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1590  30S ribosomal protein S15  63.22 
 
 		 88 aa  117  7e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  1.18687e-19  normal  0.0361736 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1673  30S ribosomal protein S15  59.77 
 
 		 88 aa  117  7.999999999999999e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000247174  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1746  30S ribosomal protein S15  60.67 
 
 		 89 aa  116  7.999999999999999e-26  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0497945  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1592  30S ribosomal protein S15  65.48 
 
 		 88 aa  116  9e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00000646106  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1111  30S ribosomal protein S15  62.92 
 
 		 89 aa  115  9.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.185363  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2773  30S ribosomal protein S15  62.92 
 
 		 89 aa  115  9.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5113  30S ribosomal protein S15  62.92 
 
 		 89 aa  116  9.999999999999999e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0443958  normal  0.15757 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2014  ribosomal protein S15  65.17 
 
 		 89 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0275051  normal  0.303203 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4709  30S ribosomal protein S15  65.17 
 
 		 89 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00644247 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2069  30S ribosomal protein S15  64.04 
 
 		 89 aa  115  1.9999999999999998e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.614484  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0407  30S ribosomal protein S15  65.17 
 
 		 89 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1465  ribosomal protein S15  59.55 
 
 		 100 aa  115  1.9999999999999998e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0290661 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1056  30S ribosomal protein S15  62.92 
 
 		 89 aa  115  1.9999999999999998e-25  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1835  30S ribosomal protein S15  65.17 
 
 		 89 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1124  30S ribosomal protein S15  65.17 
 
 		 89 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1429  30S ribosomal protein S15  65.17 
 
 		 89 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1055  30S ribosomal protein S15  65.17 
 
 		 89 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00453834  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4574  30S ribosomal protein S15  65.17 
 
 		 89 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0323645  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0743  30S ribosomal protein S15  65.17 
 
 		 89 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.660742  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1284  30S ribosomal protein S15  65.17 
 
 		 89 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.942726  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1292  30S ribosomal protein S15  65.17 
 
 		 89 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.608351  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07090  30S ribosomal protein S15  59.55 
 
 		 89 aa  115  3e-25  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.619693  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1695  30S ribosomal protein S15  64.04 
 
 		 89 aa  114  3e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.0000686217  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3784  30S ribosomal protein S15  61.8 
 
 		 89 aa  114  3e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.116654  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1106  30S ribosomal protein S15  64.04 
 
 		 89 aa  114  3e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3261  30S ribosomal protein S15  64.37 
 
 		 88 aa  115  3e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1234  30S ribosomal protein S15  64.04 
 
 		 89 aa  114  3e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0854619  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1166  30S ribosomal protein S15  64.04 
 
 		 89 aa  114  3e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.466617  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4709  30S ribosomal protein S15  64.04 
 
 		 89 aa  114  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.217974  normal  0.177644 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2483  30S ribosomal protein S15  61.8 
 
 		 89 aa  114  3.9999999999999997e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.629413  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2919  30S ribosomal protein S15  61.8 
 
 		 89 aa  114  3.9999999999999997e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.653515  normal  0.312513 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0724  30S ribosomal protein S15  64.04 
 
 		 89 aa  114  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0155068 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3605  30S ribosomal protein S15  65.17 
 
 		 89 aa  114  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.228641  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0055  30S ribosomal protein S15  65.17 
 
 		 89 aa  114  3.9999999999999997e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2278  30S ribosomal protein S15  65.17 
 
 		 89 aa  114  5e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0135045  normal  0.085969 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5582  30S ribosomal protein S15  65.17 
 
 		 89 aa  114  5e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.171961  normal  0.430005 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2052  30S ribosomal protein S15  58.43 
 
 		 89 aa  114  5e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1464  ribosomal protein S15  64.04 
 
 		 89 aa  114  5e-25  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2171  30S ribosomal protein S15  65.17 
 
 		 89 aa  114  5e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.191878  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1438  30S ribosomal protein S15  60.67 
 
 		 89 aa  114  5e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000724827 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1642  30S ribosomal protein S15  65.17 
 
 		 89 aa  114  5e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.655154  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2818  30S ribosomal protein S15  64.37 
 
 		 88 aa  114  5e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.219702 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2292  30S ribosomal protein S15  65.17 
 
 		 89 aa  114  5e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0792803  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2254  30S ribosomal protein S15  65.17 
 
 		 89 aa  114  5e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1023  30S ribosomal protein S15  65.17 
 
 		 89 aa  114  5e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.672022 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0967  30S ribosomal protein S15  59.77 
 
 		 88 aa  114  5e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000000355811  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1417  SSU ribosomal protein S15P  65.85 
 
 		 88 aa  114  6e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0360533  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3584  ribosomal protein S15  62.92 
 
 		 89 aa  114  6e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.890304  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2419  ribosomal protein S15  65.17 
 
 		 89 aa  114  6e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.746866  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2206  30S ribosomal protein S15  65.17 
 
 		 89 aa  113  6.9999999999999995e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.442595  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1945  30S ribosomal protein S15  64.04 
 
 		 89 aa  113  6.9999999999999995e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0262342 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1433  30S ribosomal protein S15  59.55 
 
 		 89 aa  113  6.9999999999999995e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0572737  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1145  30S ribosomal protein S15  64.04 
 
 		 89 aa  113  7.999999999999999e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.150061  normal  0.144917 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0070  SSU ribosomal protein S15P  61.8 
 
 		 89 aa  113  7.999999999999999e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000286421  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1056  30S ribosomal protein S15  62.07 
 
 		 88 aa  113  7.999999999999999e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000322002  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1310  ribosomal protein S15  66.29 
 
 		 89 aa  113  1.0000000000000001e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0952  30S ribosomal protein S15  63.22 
 
 		 88 aa  112  1.0000000000000001e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000371083 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07890  ribosomal protein S15  61.63 
 
 		 88 aa  113  1.0000000000000001e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2767  30S ribosomal protein S15  60.92 
 
 		 88 aa  112  1.0000000000000001e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0332694  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3515  30S ribosomal protein S15  64.37 
 
 		 88 aa  112  1.0000000000000001e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1257  ribosomal protein S15  59.55 
 
 		 89 aa  112  1.0000000000000001e-24  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0867  30S ribosomal protein S15  63.22 
 
 		 88 aa  112  1.0000000000000001e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.350166  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5185  30S ribosomal protein S15  63.22 
 
 		 88 aa  112  2.0000000000000002e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1994  30S ribosomal protein S15  58.62 
 
 		 88 aa  112  2.0000000000000002e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0200554  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1441  ribosomal protein S15  60.47 
 
 		 88 aa  111  3e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0269  30S ribosomal protein S15  59.55 
 
 		 89 aa  111  3e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0214678 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1024  ribosomal protein S15  60.67 
 
 		 89 aa  111  3e-24  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3671  30S ribosomal protein S15  60.92 
 
 		 88 aa  111  3e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000549892  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3030  30S ribosomal protein S15  59.55 
 
 		 89 aa  110  4.0000000000000004e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000113979  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>