More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AFE_0382 on replicon NC_011761
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011206  Lferr_0552  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  100 
 
 
347 aa  706  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  unclonable  5.99381e-09  hitchhiker  0.00134587 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0382  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  100 
 
 
347 aa  706  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.00597114  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2202  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  53.53 
 
 
361 aa  347  2e-94  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.000136827  normal  0.042221 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2572  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  53.85 
 
 
348 aa  346  3e-94  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27180  hypothetical protein  43.59 
 
 
323 aa  278  8e-74  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  2.08157e-05  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2270  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  43.45 
 
 
321 aa  277  2e-73  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.0010326  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2070  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  45.95 
 
 
321 aa  276  4e-73  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00392784  normal  0.0533041 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1922  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  46.13 
 
 
325 aa  275  1e-72  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  3.95353e-10  unclonable  2.80385e-16 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1762  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  43.4 
 
 
325 aa  274  2e-72  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  2.30902e-06  hitchhiker  7.07546e-13 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2320  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  44.78 
 
 
325 aa  271  9e-72  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.00187329  hitchhiker  4.16474e-05 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4012  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  44.09 
 
 
323 aa  271  1e-71  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  1.67491e-10  normal  0.572357 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23090  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  46.62 
 
 
317 aa  270  3e-71  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00352469  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2300  hypothetical protein  43.77 
 
 
323 aa  269  5e-71  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00744329  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3449  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  44.44 
 
 
325 aa  268  7e-71  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  1.48197e-08  hitchhiker  2.81321e-05 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0717  hypothetical protein  51.55 
 
 
332 aa  266  3e-70  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  2.98888e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2556  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  43.51 
 
 
318 aa  266  5e-70  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  4.97106e-11  hitchhiker  9.91148e-17 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0855  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  43.69 
 
 
361 aa  251  2e-65  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.840952  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1763  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  41.4 
 
 
314 aa  235  7e-61  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0411  hypothetical protein  41.08 
 
 
314 aa  234  1e-60  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1566  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  40.59 
 
 
387 aa  232  7e-60  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00819943  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1758  hypothetical protein  39.35 
 
 
424 aa  228  1e-58  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0412  LysM domain-containing protein  38.01 
 
 
434 aa  226  5e-58  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0114  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  44.89 
 
 
355 aa  223  5e-57  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0183  putative lipoprotein  42.18 
 
 
435 aa  221  1e-56  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2161  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  40.71 
 
 
439 aa  219  5e-56  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1584  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  39.38 
 
 
329 aa  217  2e-55  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.310939  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0573  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  41.01 
 
 
441 aa  214  2e-54  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4081  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  40.57 
 
 
409 aa  213  3e-54  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3988  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  41.09 
 
 
409 aa  212  7e-54  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0969  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  37.54 
 
 
303 aa  201  2e-50  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  1.1509e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001253  hypothetical protein  42.74 
 
 
308 aa  199  6e-50  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1553  hypothetical protein  43.89 
 
 
244 aa  198  1e-49  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1430  hypothetical protein  43.89 
 
 
244 aa  197  2e-49  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4076  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  36.3 
 
 
292 aa  196  6e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000400018  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1163  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  40.68 
 
 
301 aa  191  1e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  1.06835e-07  normal  0.0179239 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1006  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  41.28 
 
 
313 aa  191  2e-47  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  1.14472e-06  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05123  hypothetical protein  41.88 
 
 
308 aa  189  8e-47  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0079  hypothetical protein  40.57 
 
 
306 aa  187  3e-46  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  1.35684e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3485  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  39.41 
 
 
482 aa  186  4e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1082  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  39.83 
 
 
333 aa  186  5e-46  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  4.31634e-06  normal  0.0168034 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3748  LysM domain-containing protein  42.86 
 
 
304 aa  184  3e-45  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1662  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  38.91 
 
 
327 aa  183  4e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  1.34968e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3091  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  43.28 
 
 
304 aa  183  5e-45  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  2.80887e-07  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0844  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  43.28 
 
 
304 aa  182  6e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  4.08528e-07  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0881  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  43.28 
 
 
304 aa  182  6e-45  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  3.8242e-05  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3255  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  41.18 
 
 
305 aa  181  1e-44  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3074  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  43.28 
 
 
304 aa  181  2e-44  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  3.73361e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0598  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  41.77 
 
 
306 aa  181  2e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0116  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  37.9 
 
 
349 aa  180  4e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.259654  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0707  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  37.79 
 
 
304 aa  179  6e-44  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  4.09779e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0476  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  35.86 
 
 
321 aa  178  1e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  4.32617e-06  unclonable  8.02452e-06 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2980  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  34.9 
 
 
300 aa  178  1e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2444  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  38.17 
 
 
340 aa  178  1e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.0013268  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4195  LysM domain-containing protein  35.12 
 
 
303 aa  177  2e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.543729  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1310  hypothetical protein  42.92 
 
 
306 aa  177  2e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2622  peptidoglycan-binding LysM:ErfK/YbiS/YcfS/YnhG protein  37.65 
 
 
322 aa  177  3e-43  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0580662  normal  0.781551 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2185  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  36.86 
 
 
337 aa  176  4e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  5.08337e-10  unclonable  2.28332e-08 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3357  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  34.6 
 
 
358 aa  176  5e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2529  hypothetical protein  42.5 
 
 
306 aa  176  5e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.990181  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2824  hypothetical protein  42.5 
 
 
306 aa  176  5e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00803  hypothetical protein  42.5 
 
 
306 aa  176  5e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1853  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  34.65 
 
 
354 aa  176  5e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  1.97997e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0889  hypothetical protein  42.5 
 
 
306 aa  176  5e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.479275  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1747  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  34.65 
 
 
354 aa  176  5e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  9.20948e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0843  hypothetical protein  42.5 
 
 
306 aa  176  5e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0876  hypothetical protein  42.5 
 
 
306 aa  176  5e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00786  hypothetical protein  42.5 
 
 
306 aa  176  5e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2823  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  42.5 
 
 
306 aa  176  5e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2588  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  34.65 
 
 
339 aa  176  6e-43  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.424492  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0968  hypothetical protein  42.5 
 
 
304 aa  176  6e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.495532  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2835  hypothetical protein  41.6 
 
 
311 aa  176  7e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  1.68176e-06  normal  0.833391 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1700  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  33.66 
 
 
333 aa  175  8e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  2.19984e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1638  hypothetical protein  41.2 
 
 
307 aa  175  1e-42  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.383508  hitchhiker  0.0042534 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2746  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  37.4 
 
 
340 aa  174  1e-42  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000362064  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0726  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  41.08 
 
 
304 aa  174  2e-42  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0968  hypothetical protein  40.15 
 
 
306 aa  174  2e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0905  hypothetical protein  40.15 
 
 
306 aa  174  2e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0877  hypothetical protein  40.15 
 
 
306 aa  174  2e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01888  hypothetical protein  41.2 
 
 
310 aa  174  2e-42  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.014746  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01899  conserved protein with NAD(P)-binding Rossmann-fold domain  41.2 
 
 
310 aa  174  2e-42  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0183339  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1666  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  41.2 
 
 
311 aa  174  2e-42  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00191568  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0989  hypothetical protein  41.27 
 
 
306 aa  174  3e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.800938  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1134  hypothetical protein  40.8 
 
 
310 aa  173  5e-42  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  2.58795e-08  hitchhiker  9.68229e-05 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0968  hypothetical protein  40.8 
 
 
310 aa  173  5e-42  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  1.62984e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2272  hypothetical protein  40.8 
 
 
310 aa  173  5e-42  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  4.09269e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0935  hypothetical protein  41.43 
 
 
306 aa  172  6e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2113  hypothetical protein  41.2 
 
 
310 aa  172  6e-42  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  3.00781e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2289  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG like protein  40.19 
 
 
285 aa  172  1e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.156844  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3251  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  35.1 
 
 
366 aa  170  3e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1662  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  39.25 
 
 
285 aa  170  3e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0971  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  36.55 
 
 
307 aa  169  5e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1953  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  37.89 
 
 
334 aa  168  1e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  8.19451e-06  unclonable  1.26491e-08 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01647  hypothetical protein  37.89 
 
 
334 aa  168  1e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  1.43336e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1894  LysM/ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  37.89 
 
 
334 aa  168  1e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  4.68575e-11  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1964  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  37.89 
 
 
334 aa  168  1e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  2.02065e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2392  LysM domain/ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  37.89 
 
 
334 aa  168  1e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  1.65096e-06  hitchhiker  1.99913e-05 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01637  hypothetical protein  37.89 
 
 
334 aa  168  1e-40  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  1.18084e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1518  LysM/ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  37.89 
 
 
334 aa  168  1e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  4.62996e-07  hitchhiker  6.71919e-09 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1759  LysM/ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  37.89 
 
 
334 aa  168  1e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  4.83856e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1766  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  32.81 
 
 
337 aa  168  2e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  2.76408e-06  unclonable  1.69171e-06 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>