More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AFE_0368 on replicon NC_011761
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011206  Lferr_0538  phosphoserine phosphatase SerB  100 
 
 
372 aa  653  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  1.17789e-07  unclonable  3.04475e-11 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0368  phosphoserine phosphatase  100 
 
 
327 aa  653  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.00427946  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1620  phosphoserine phosphatase SerB  45.49 
 
 
275 aa  203  3e-51  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1640  putative phosphoserine phosphatase protein  51.6 
 
 
285 aa  202  6e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.791178  normal  0.179226 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2240  phosphoserine phosphatase SerB  52.74 
 
 
281 aa  202  7e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00113806  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1492  phosphoserine phosphatase SerB  53.96 
 
 
281 aa  201  1e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.806128  normal  0.053472 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5077  phosphoserine phosphatase  52.94 
 
 
281 aa  200  2e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1962  phosphoserine phosphatase  49.78 
 
 
279 aa  200  2e-50  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.436827  normal  0.668349 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1906  phosphoserine phosphatase SerB  52.17 
 
 
310 aa  199  4e-50  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0401863  normal  0.165029 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0928  phosphoserine phosphatase SerB  46.97 
 
 
296 aa  199  4e-50  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.215666  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1778  phosphoserine phosphatase SerB  52.94 
 
 
316 aa  199  5e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.685999  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6301  phosphoserine phosphatase SerB  52.94 
 
 
316 aa  199  5e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.463475  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1803  phosphoserine phosphatase SerB  52.94 
 
 
281 aa  199  6e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0615896  normal  0.554721 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1890  phosphoserine phosphatase  53.27 
 
 
302 aa  198  1e-49  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1577  phosphoserine phosphatase SerB  51.69 
 
 
285 aa  198  1e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0191931 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2283  3-phosphoserine phosphatase  50.47 
 
 
398 aa  197  2e-49  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  7.52134e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0978  phosphoserine phosphatase SerB  52.48 
 
 
279 aa  197  2e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.485159  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5336  phosphoserine phosphatase SerB  50.21 
 
 
419 aa  196  5e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.414905  normal  0.119609 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1690  phosphoserine phosphatase SerB  50.49 
 
 
281 aa  196  6e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.656788  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1718  phosphoserine phosphatase SerB  50.49 
 
 
316 aa  195  1e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1855  phosphoserine phosphatase SerB  51.49 
 
 
279 aa  194  2e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.247202 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1924  phosphoserine phosphatase  47.84 
 
 
328 aa  192  5e-48  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0636  phosphoserine phosphatase SerB  48.37 
 
 
276 aa  192  6e-48  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.458304  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1329  phosphoserine phosphatase SerB  49.03 
 
 
237 aa  192  6e-48  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2554  phosphoserine phosphatase SerB  47.58 
 
 
236 aa  192  7e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.497931  normal  0.0396142 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1368  phosphoserine phosphatase  48.61 
 
 
284 aa  191  1e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0127039  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2007  phosphoserine phosphatase SerB  47.2 
 
 
235 aa  190  3e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00211698 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0136  phosphoserine phosphatase  47.84 
 
 
432 aa  190  3e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.357065  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2331  phosphoserine phosphatase  50.5 
 
 
279 aa  190  3e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.124383  normal  0.106642 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2322  phosphoserine phosphatase  49.01 
 
 
454 aa  187  1e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2504  phosphoserine phosphatase SerB  44.59 
 
 
278 aa  187  2e-46  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  7.07909e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1357  phosphoserine phosphatase  47.22 
 
 
307 aa  187  2e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4883  phosphoserine phosphatase SerB  44.49 
 
 
264 aa  187  2e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.35019 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0624  phosphoserine phosphatase  46.38 
 
 
322 aa  187  2e-46  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.184048  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1073  phosphoserine phosphatase  49.01 
 
 
281 aa  187  3e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1802  phosphoserine phosphatase  49.01 
 
 
281 aa  187  3e-46  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0094  phosphoserine phosphatase  49.01 
 
 
281 aa  187  3e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.188283  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2264  phosphoserine phosphatase  49.01 
 
 
281 aa  187  3e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.738321  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2157  phosphoserine phosphatase  49.01 
 
 
281 aa  187  3e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.752004  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1107  phosphoserine phosphatase  48.54 
 
 
306 aa  186  3e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2194  phosphoserine phosphatase  49.01 
 
 
281 aa  187  3e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1568  phosphoserine phosphatase  46.51 
 
 
241 aa  186  4e-46  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0185537  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2720  phosphoserine phosphatase  47.3 
 
 
236 aa  186  4e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.377645  normal  0.210354 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1313  phosphoserine phosphatase  49.01 
 
 
568 aa  186  4e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2577  phosphoserine phosphatase SerB  49.27 
 
 
237 aa  186  5e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.7758  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0314  phosphoserine phosphatase SerB  44.02 
 
 
410 aa  186  5e-46  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.0906615 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002634  phosphoserine phosphatase  46.58 
 
 
326 aa  185  9e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1145  phosphoserine phosphatase SerB  47.54 
 
 
326 aa  184  1e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  5.32777e-07 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1756  phosphoserine phosphatase SerB  45 
 
 
309 aa  185  1e-45  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4935  phosphoserine phosphatase  49.53 
 
 
322 aa  183  4e-45  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.801469  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5902  phosphoserine phosphatase  49.53 
 
 
322 aa  183  4e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4623  phosphoserine phosphatase  49.53 
 
 
322 aa  183  4e-45  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4987  phosphoserine phosphatase  49.53 
 
 
322 aa  183  4e-45  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04264  3-phosphoserine phosphatase  49.53 
 
 
322 aa  183  4e-45  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3668  phosphoserine phosphatase  49.53 
 
 
322 aa  183  4e-45  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.610208 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04229  hypothetical protein  49.53 
 
 
322 aa  183  4e-45  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3610  phosphoserine phosphatase SerB  49.53 
 
 
322 aa  183  4e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2846  phosphoserine phosphatase SerB  46.51 
 
 
237 aa  182  8e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.793398  normal  0.583528 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1576  phosphoserine phosphatase  46.05 
 
 
237 aa  182  9e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.665461  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2041  phosphoserine phosphatase  50.24 
 
 
404 aa  181  1e-44  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.143406  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1688  phosphoserine phosphatase SerB  49.76 
 
 
380 aa  181  1e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.0594827 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4937  phosphoserine phosphatase  49.06 
 
 
322 aa  181  1e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.859759 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2786  phosphoserine phosphatase SerB  47.6 
 
 
410 aa  180  2e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2655  phosphoserine phosphatase SerB  45.02 
 
 
298 aa  181  2e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.607459 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3222  phosphoserine phosphatase SerB  46.72 
 
 
326 aa  180  2e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1223  phosphoserine phosphatase  52.26 
 
 
330 aa  181  2e-44  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3316  phosphoserine phosphatase  44.9 
 
 
292 aa  181  2e-44  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.979977  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2817  phosphoserine phosphatase SerB  50.77 
 
 
331 aa  180  3e-44  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0018  phosphoserine phosphatase SerB  43.4 
 
 
291 aa  180  3e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.395606  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3223  phosphoserine phosphatase SerB  46.31 
 
 
326 aa  180  3e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0978  phosphoserine phosphatase  42.23 
 
 
316 aa  180  3e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0353451 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0913  phosphoserine phosphatase SerB  51.23 
 
 
296 aa  179  4e-44  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.697374  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1598  phosphoserine phosphatase SerB  44.64 
 
 
408 aa  179  4e-44  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3361  phosphoserine phosphatase SerB  46.31 
 
 
326 aa  179  4e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0476733 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1107  phosphoserine phosphatase  43.97 
 
 
330 aa  179  5e-44  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00829453 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1042  phosphoserine phosphatase  43.97 
 
 
330 aa  179  5e-44  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00193123 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4701  phosphoserine phosphatase SerB  38.71 
 
 
404 aa  179  5e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.995062 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2882  phosphoserine phosphatase SerB  45.02 
 
 
298 aa  179  6e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0008  phosphoserine phosphatase SerB  44.64 
 
 
291 aa  179  7e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00197314 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4785  phosphoserine phosphatase SerB  46.7 
 
 
404 aa  179  8e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.174471  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1682  phosphoserine phosphatase SerB  45.33 
 
 
400 aa  179  8e-44  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4909  phosphoserine phosphatase SerB  46.7 
 
 
415 aa  178  9e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.45946  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2777  phosphoserine phosphatase SerB  42.81 
 
 
298 aa  178  1e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.64316  normal  0.211606 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4820  phosphoserine phosphatase SerB  47.32 
 
 
403 aa  178  1e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29300  phosphoserine phosphatase  46.45 
 
 
409 aa  177  2e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.78907  normal  0.19351 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4962  phosphoserine phosphatase SerB  46.26 
 
 
404 aa  177  2e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.414119 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0506  phosphoserine phosphatase  48.56 
 
 
404 aa  177  2e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.138167  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2012  phosphoserine phosphatase SerB  46.72 
 
 
295 aa  177  2e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0547  phosphoserine phosphatase  48.11 
 
 
322 aa  177  2e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0971338 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1419  phosphoserine phosphatase SerB  50.52 
 
 
223 aa  177  3e-43  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3292  phosphoserine phosphatase SerB  47.09 
 
 
297 aa  176  4e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.117576  normal  0.403499 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1046  phosphoserine phosphatase  44.75 
 
 
330 aa  176  5e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00163618 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03372  phosphoserine phosphatase  46.46 
 
 
326 aa  176  5e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3043  phosphoserine phosphatase SerB  48.03 
 
 
335 aa  176  6e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1712  phosphoserine phosphatase SerB  45.13 
 
 
410 aa  176  7e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0666  phosphoserine phosphatase  48.58 
 
 
325 aa  176  7e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1350  phosphoserine phosphatase  44.55 
 
 
291 aa  175  9e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4988  phosphoserine phosphatase  48.11 
 
 
322 aa  174  1e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4936  phosphoserine phosphatase  48.11 
 
 
322 aa  174  1e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4902  phosphoserine phosphatase  48.11 
 
 
322 aa  174  1e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>