More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AFE_0326 on replicon NC_011761
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011761  AFE_0326  30S ribosomal protein S10  100 
 
 		 102 aa  206  1e-52  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0169409  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0496  30S ribosomal protein S10  100 
 
 		 102 aa  206  1e-52  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.250229  hitchhiker  0.00000000405496 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0755  30S ribosomal protein S10  77.45 
 
 		 103 aa  164  4e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000508535  normal  0.0162488 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2325  30S ribosomal protein S10  76.47 
 
 		 103 aa  163  6.9999999999999995e-40  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.0000023421  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2951  30S ribosomal protein S10  75.49 
 
 		 103 aa  161  2.0000000000000002e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00000133875  hitchhiker  0.000000722255 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1933  30S ribosomal protein S10  75.25 
 
 		 101 aa  162  2.0000000000000002e-39  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1946  30S ribosomal protein S10  75.25 
 
 		 101 aa  162  2.0000000000000002e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1911  30S ribosomal protein S10  75.25 
 
 		 101 aa  162  2.0000000000000002e-39  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.253834 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2018  30S ribosomal protein S10  75.25 
 
 		 101 aa  162  2.0000000000000002e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3298  30S ribosomal protein S10  75.49 
 
 		 103 aa  161  2.0000000000000002e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.0000231204  hitchhiker  0.000170279 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1345  30S ribosomal protein S10  74.51 
 
 		 102 aa  161  3e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.312234  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0766  30S ribosomal protein S10  76.47 
 
 		 102 aa  160  5.0000000000000005e-39  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.300244  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0245  30S ribosomal protein S10  76.47 
 
 		 104 aa  160  5.0000000000000005e-39  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.814405  normal  0.941593 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0679  30S ribosomal protein S10  74.51 
 
 		 102 aa  160  7e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.330255  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3020  30S ribosomal protein S10  76 
 
 		 104 aa  160  8.000000000000001e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000044729  hitchhiker  0.00550197 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0404  30S ribosomal protein S10  74.51 
 
 		 102 aa  159  9e-39  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00000000016581  normal  0.139805 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04522  30S ribosomal protein S10  74.26 
 
 		 104 aa  159  1e-38  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000034971  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0859  30S ribosomal protein S10  75 
 
 		 109 aa  159  1e-38  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.591238  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0278  30S ribosomal protein S10  74.51 
 
 		 102 aa  159  1e-38  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000078248  unclonable  0.0000000940306 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0425  30S ribosomal protein S10  72.55 
 
 		 103 aa  159  1e-38  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.00000000000101436  hitchhiker  0.0000276478 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2373  30S ribosomal protein S10  73.53 
 
 		 103 aa  158  2e-38  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.837203  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0488  30S ribosomal protein S10  71.57 
 
 		 103 aa  158  3e-38  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000350893  hitchhiker  0.00967015 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3181  30S ribosomal protein S10  72.55 
 
 		 102 aa  158  3e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00000486821  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0483  30S ribosomal protein S10  71.57 
 
 		 103 aa  158  3e-38  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.0000105944  normal  0.026966 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3323  30S ribosomal protein S10  72.55 
 
 		 102 aa  158  3e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.434875  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3865  30S ribosomal protein S10  71.57 
 
 		 103 aa  158  3e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2170  ribosomal protein S10  74.51 
 
 		 103 aa  157  5e-38  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00128539  normal  0.372781 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0758  30S ribosomal protein S10  73.53 
 
 		 102 aa  157  5e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.389687  normal  0.459809 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5071  30S ribosomal protein S10  73.53 
 
 		 102 aa  156  8e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.755306 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1363  30S ribosomal protein S10  73.53 
 
 		 102 aa  156  8e-38  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.562313 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3668  30S ribosomal protein S10  73.53 
 
 		 102 aa  156  8e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2294  30S ribosomal protein S10  73.53 
 
 		 102 aa  156  8e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.335659 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3185  30S ribosomal protein S10  73.53 
 
 		 102 aa  156  8e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.887844  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1544  30S ribosomal protein S10  73.53 
 
 		 102 aa  156  8e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2841  30S ribosomal protein S10  72.55 
 
 		 103 aa  156  9e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00000513436  normal  0.19032 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3645  30S ribosomal protein S10  72.55 
 
 		 103 aa  156  9e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  unclonable  0.000000000475308  hitchhiker  0.0000000000162231 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0313  30S ribosomal protein S10  72.55 
 
 		 103 aa  156  9e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000233009  normal  0.0207604 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0846  SSU ribosomal protein S10P  72.55 
 
 		 103 aa  156  9e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000264723  decreased coverage  0.00000947215 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3805  30S ribosomal protein S10  72.55 
 
 		 103 aa  156  1e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  hitchhiker  0.00677019  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0326  30S ribosomal protein S10  72.55 
 
 		 103 aa  156  1e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00113902  normal  0.0302801 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3477  30S ribosomal protein S10  72.55 
 
 		 103 aa  156  1e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.000000483294  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3747  30S ribosomal protein S10  72.55 
 
 		 103 aa  156  1e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000000016598  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2633  30S ribosomal protein S10  72.55 
 
 		 103 aa  156  1e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.000272648  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1353  30S ribosomal protein S10  73.53 
 
 		 102 aa  155  1e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.777643  normal  0.0177608 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0337  30S ribosomal protein S10  71.57 
 
 		 103 aa  156  1e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.0012954  decreased coverage  0.000295628 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0277  30S ribosomal protein S10  71.57 
 
 		 103 aa  156  1e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.0000127009  decreased coverage  0.000000000926134 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3777  30S ribosomal protein S10  72.55 
 
 		 103 aa  156  1e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0000424797  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0272  30S ribosomal protein S10  71.57 
 
 		 103 aa  156  1e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  unclonable  0.0000000000156586  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0700  30S ribosomal protein S10  71.57 
 
 		 102 aa  155  1e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000505972  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3446  30S ribosomal protein S10  72.55 
 
 		 103 aa  156  1e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000000122515  normal  0.0314834 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1923  30S ribosomal protein S10  72.55 
 
 		 103 aa  156  1e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000013045  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3069  30S ribosomal protein S10  72.55 
 
 		 103 aa  156  1e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000000998747  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3449  30S ribosomal protein S10  73.53 
 
 		 102 aa  155  1e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.852431 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2965  30S ribosomal protein S10  74.51 
 
 		 102 aa  156  1e-37  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.118126  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0248  30S ribosomal protein S10  72.55 
 
 		 103 aa  156  1e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.0000000127153  normal  0.202124 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2735  ribosomal protein S10  71.57 
 
 		 102 aa  156  1e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.796099  normal  0.119445 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2760  30S ribosomal protein S10  72.55 
 
 		 103 aa  156  1e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000915461  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3170  30S ribosomal protein S10  72.55 
 
 		 103 aa  156  1e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000357931  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0266  30S ribosomal protein S10  72.55 
 
 		 103 aa  156  1e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00303963  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0347  30S ribosomal protein S10  72.55 
 
 		 103 aa  156  1e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0012099  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0275  30S ribosomal protein S10  72.55 
 
 		 103 aa  156  1e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000312385  normal  0.114579 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0390  30S ribosomal protein S10  71.57 
 
 		 103 aa  156  1e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000705562  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0581  30S ribosomal protein S10  73.53 
 
 		 102 aa  155  2e-37  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1947  30S ribosomal protein S10  74.51 
 
 		 102 aa  155  2e-37  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00729  30S ribosomal protein S10  71.57 
 
 		 103 aa  155  2e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1907  30S ribosomal protein S10  72.55 
 
 		 102 aa  155  2e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.000187857  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2689  30S ribosomal protein S10  73.53 
 
 		 102 aa  155  2e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.283235  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1678  30S ribosomal protein S10  72.55 
 
 		 102 aa  155  2e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.196634  hitchhiker  0.0000449756 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0052  30S ribosomal protein S10  72.55 
 
 		 103 aa  155  2e-37  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000149229  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0582  30S ribosomal protein S10  75 
 
 		 103 aa  155  2e-37  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001743  SSU ribosomal protein S10p (S20e)  71.57 
 
 		 103 aa  155  2e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000127695  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0354  30S ribosomal protein S10  72.55 
 
 		 102 aa  155  2e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.953045  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2175  30S ribosomal protein S10  71.57 
 
 		 103 aa  155  2e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000032436  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1554  30S ribosomal protein S10  70.59 
 
 		 103 aa  155  2e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.0000633059  normal  0.961708 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0319  30S ribosomal protein S10  71.57 
 
 		 103 aa  155  2e-37  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0188597  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0275  30S ribosomal protein S10  72.55 
 
 		 106 aa  154  3e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2122  30S ribosomal protein S10  71.57 
 
 		 102 aa  154  3e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.854148  normal  0.454228 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2161  30S ribosomal protein S10  71.57 
 
 		 102 aa  154  3e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.589096 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0932  30S ribosomal protein S10  71.57 
 
 		 102 aa  154  3e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0025936  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2439  30S ribosomal protein S10  71.57 
 
 		 102 aa  154  3e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.605965  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3444  30S ribosomal protein S10  70.59 
 
 		 103 aa  154  3e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.000018475  normal  0.343621 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1839  30S ribosomal protein S10  72.55 
 
 		 102 aa  154  3e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.051766  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0985  30S ribosomal protein S10  72.55 
 
 		 102 aa  155  3e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.547253  normal  0.0405609 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3329  30S ribosomal protein S10  71.57 
 
 		 102 aa  154  3e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000189761 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3339  30S ribosomal protein S10  72.55 
 
 		 103 aa  154  4e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00000104246  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1429  30S ribosomal protein S10  71.57 
 
 		 102 aa  154  4e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0117668  normal  0.0108914 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0457  30S ribosomal protein S10  72.55 
 
 		 103 aa  154  4e-37  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.403688  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1331  30S ribosomal protein S10  71.57 
 
 		 102 aa  154  4e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.104333  normal  0.0980723 
 
 
-
 
NC_004310  BR1234  30S ribosomal protein S10  71.57 
 
 		 102 aa  154  5.0000000000000005e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.159706  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1955  30S ribosomal protein S10  71.57 
 
 		 102 aa  154  5.0000000000000005e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0158653  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1197  30S ribosomal protein S10  71.57 
 
 		 102 aa  154  5.0000000000000005e-37  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.56445  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1796  SSU ribosomal protein S10P  72.55 
 
 		 104 aa  154  5.0000000000000005e-37  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.13057  normal  0.040484 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2535  30S ribosomal protein S10  70.59 
 
 		 102 aa  153  6e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.112296  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0360  30S ribosomal protein S10  70.59 
 
 		 102 aa  153  6e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1715  30S ribosomal protein S10  70.59 
 
 		 102 aa  153  6e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.380329  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3796  30S ribosomal protein S10  72.73 
 
 		 104 aa  153  6e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00000453996  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2858  30S ribosomal protein S10  71.57 
 
 		 102 aa  153  7e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.800784  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0294  ribosomal protein S10  71.57 
 
 		 103 aa  153  7e-37  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000065146  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1263  30S ribosomal protein S10  70.59 
 
 		 103 aa  153  7e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0110329  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0718  30S ribosomal protein S10  71.57 
 
 		 103 aa  153  7e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00000141431  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>