More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AFE_0295 on replicon NC_011761
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011761  AFE_0295  serine hydroxymethyltransferase  100 
 
 
414 aa  852  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0471  serine hydroxymethyltransferase  100 
 
 
414 aa  852  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.937307  hitchhiker  0.000595927 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0902  serine hydroxymethyltransferase  65.95 
 
 
416 aa  572  1e-162  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1871  Glycine hydroxymethyltransferase  67.87 
 
 
417 aa  572  1e-162  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0163056  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2762  serine hydroxymethyltransferase  66.43 
 
 
417 aa  568  1e-161  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3914  serine hydroxymethyltransferase  66.11 
 
 
415 aa  566  1e-160  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.355744  normal  0.102127 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1093  serine hydroxymethyltransferase  66.19 
 
 
417 aa  567  1e-160  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60890  serine hydroxymethyltransferase  66.43 
 
 
417 aa  562  1e-159  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5243  serine hydroxymethyltransferase  65.95 
 
 
417 aa  558  1e-158  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.383038  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1231  serine hydroxymethyltransferase  65.95 
 
 
417 aa  558  1e-158  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1557  serine hydroxymethyltransferase  66.19 
 
 
417 aa  558  1e-158  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3044  serine hydroxymethyltransferase  66.19 
 
 
417 aa  560  1e-158  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.196975  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40970  serine hydroxymethyltransferase  64.99 
 
 
417 aa  557  1e-157  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3363  serine hydroxymethyltransferase  65.62 
 
 
415 aa  555  1e-157  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0703  serine hydroxymethyltransferase  65.71 
 
 
417 aa  557  1e-157  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.602975  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4513  serine hydroxymethyltransferase  65.47 
 
 
417 aa  555  1e-157  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0695784  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0702  serine hydroxymethyltransferase  65.47 
 
 
417 aa  556  1e-157  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0603318  normal  0.0336909 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0573  serine hydroxymethyltransferase  65.79 
 
 
417 aa  557  1e-157  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0671  serine hydroxymethyltransferase  65.47 
 
 
417 aa  556  1e-157  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.557812  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1185  serine hydroxymethyltransferase  63.88 
 
 
417 aa  551  1e-156  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.961366 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3250  serine hydroxymethyltransferase  64.9 
 
 
415 aa  553  1e-156  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04405  serine hydroxymethyltransferase  65.31 
 
 
417 aa  551  1e-156  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1942  serine hydroxymethyltransferase  64.9 
 
 
415 aa  553  1e-156  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4877  serine hydroxymethyltransferase  64.99 
 
 
417 aa  553  1e-156  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.402887  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3234  serine hydroxymethyltransferase  64.9 
 
 
415 aa  553  1e-156  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3196  serine hydroxymethyltransferase  64.9 
 
 
415 aa  553  1e-156  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3262  serine hydroxymethyltransferase  65.54 
 
 
454 aa  553  1e-156  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2668  serine hydroxymethyltransferase  64.9 
 
 
415 aa  553  1e-156  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0834  serine hydroxymethyltransferase  64.9 
 
 
415 aa  553  1e-156  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4270  serine hydroxymethyltransferase  65.47 
 
 
417 aa  551  1e-156  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3638  serine hydroxymethyltransferase  64.51 
 
 
417 aa  553  1e-156  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1209  serine hydroxymethyltransferase  63.88 
 
 
417 aa  551  1e-156  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.985536 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1160  serine hydroxymethyltransferase  63.64 
 
 
417 aa  551  1e-156  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.145933 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1379  serine hydroxymethyltransferase  64.58 
 
 
415 aa  552  1e-156  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2075  serine hydroxymethyltransferase  64.9 
 
 
415 aa  553  1e-156  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5200  serine hydroxymethyltransferase  65.54 
 
 
415 aa  551  1e-156  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1094  serine hydroxymethyltransferase  63.64 
 
 
417 aa  551  1e-156  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.412028  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1014  serine hydroxymethyltransferase  64.83 
 
 
417 aa  553  1e-156  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0759  serine hydroxymethyltransferase  65.71 
 
 
417 aa  551  1e-156  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1142  serine hydroxymethyltransferase  63.31 
 
 
417 aa  548  1e-155  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.510367  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1094  serine hydroxymethyltransferase  63.64 
 
 
417 aa  550  1e-155  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.383314 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0841  glycine hydroxymethyltransferase  64.51 
 
 
417 aa  550  1e-155  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.33053  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3162  serine hydroxymethyltransferase  63.64 
 
 
417 aa  549  1e-155  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.911286  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3094  glycine hydroxymethyltransferase  64.9 
 
 
417 aa  548  1e-155  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0791  serine hydroxymethyltransferase  65.38 
 
 
417 aa  549  1e-155  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3305  serine hydroxymethyltransferase  63.88 
 
 
417 aa  551  1e-155  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.297219  hitchhiker  0.000907019 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0762  serine hydroxymethyltransferase  65.87 
 
 
417 aa  551  1e-155  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0765  serine hydroxymethyltransferase  65.38 
 
 
415 aa  551  1e-155  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.186767  normal  0.156833 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0790  serine hydroxymethyltransferase  64.18 
 
 
415 aa  549  1e-155  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2780  serine hydroxymethyltransferase  63.4 
 
 
417 aa  549  1e-155  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0678  serine hydroxymethyltransferase  63.7 
 
 
415 aa  548  1e-155  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.478588 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4632  serine hydroxymethyltransferase  64.75 
 
 
417 aa  548  1e-155  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.10278  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3471  serine hydroxymethyltransferase  63.4 
 
 
417 aa  551  1e-155  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2581  serine hydroxymethyltransferase  65.06 
 
 
415 aa  546  1e-154  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.848716  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0445  serine hydroxymethyltransferase  63.55 
 
 
417 aa  546  1e-154  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  4.71586e-07  hitchhiker  1.2571e-06 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0775  serine hydroxymethyltransferase  64.82 
 
 
415 aa  544  1e-154  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0739852  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1158  serine hydroxymethyltransferase  63.79 
 
 
417 aa  546  1e-154  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  4.44868e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3161  serine hydroxymethyltransferase  63.4 
 
 
417 aa  547  1e-154  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.261571  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1265  serine hydroxymethyltransferase  63.55 
 
 
417 aa  546  1e-154  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  7.7829e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0683  serine hydroxymethyltransferase  65.06 
 
 
431 aa  545  1e-154  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0700  serine hydroxymethyltransferase  65.3 
 
 
431 aa  546  1e-154  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0504784  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0323  serine hydroxymethyltransferase  65.06 
 
 
415 aa  546  1e-154  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0806  serine hydroxymethyltransferase  65.06 
 
 
415 aa  546  1e-154  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2449  serine hydroxymethyltransferase  64.9 
 
 
415 aa  545  1e-154  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0373  serine hydroxymethyltransferase  65.87 
 
 
419 aa  547  1e-154  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.238829  normal  0.155765 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3895  serine hydroxymethyltransferase  65.06 
 
 
415 aa  546  1e-154  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2165  serine hydroxymethyltransferase  64.34 
 
 
414 aa  544  1e-154  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.675395  normal  0.0470902 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2754  serine hydroxymethyltransferase  64.66 
 
 
415 aa  546  1e-154  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0722  serine hydroxymethyltransferase  63.46 
 
 
436 aa  544  1e-154  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.59476  normal  0.142236 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1660  serine hydroxymethyltransferase  64.66 
 
 
418 aa  544  1e-153  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0479076  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1033  serine hydroxymethyltransferase  62.92 
 
 
417 aa  544  1e-153  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.414818  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3102  serine hydroxymethyltransferase  63.64 
 
 
415 aa  541  1e-153  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00573934  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1912  serine hydroxymethyltransferase  64.75 
 
 
430 aa  543  1e-153  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.637321  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1160  serine hydroxymethyltransferase  64.11 
 
 
415 aa  543  1e-153  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.215239 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1851  serine hydroxymethyltransferase  64.99 
 
 
417 aa  543  1e-153  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3036  serine hydroxymethyltransferase  65.23 
 
 
417 aa  542  1e-153  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.603855  normal  0.847682 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2680  serine hydroxymethyltransferase  62.74 
 
 
508 aa  543  1e-153  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1887  Glycine hydroxymethyltransferase  64.75 
 
 
419 aa  544  1e-153  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.409267  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2796  serine hydroxymethyltransferase  64.99 
 
 
417 aa  540  1e-152  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3162  serine hydroxymethyltransferase  64.49 
 
 
413 aa  538  1e-152  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.243328  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0004  serine hydroxymethyltransferase  63.77 
 
 
416 aa  538  1e-152  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0307  serine hydroxymethyltransferase  62.32 
 
 
414 aa  538  1e-152  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.209874  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2930  serine hydroxymethyltransferase  64.75 
 
 
417 aa  540  1e-152  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2710  serine hydroxymethyltransferase  64.75 
 
 
417 aa  540  1e-152  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2817  serine hydroxymethyltransferase  64.75 
 
 
417 aa  540  1e-152  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5930  glycine hydroxymethyltransferase  66.43 
 
 
438 aa  541  1e-152  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.224958  normal  0.0770182 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6283  glycine hydroxymethyltransferase  65.38 
 
 
419 aa  539  1e-152  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.461604 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2755  serine hydroxymethyltransferase  64.75 
 
 
417 aa  540  1e-152  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.418331  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4031  serine hydroxymethyltransferase  63.7 
 
 
417 aa  540  1e-152  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2836  serine hydroxymethyltransferase  64.51 
 
 
417 aa  536  1e-151  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2477  serine hydroxymethyltransferase  63.22 
 
 
417 aa  537  1e-151  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1881  serine hydroxymethyltransferase  63.14 
 
 
415 aa  537  1e-151  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.662029  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2704  serine hydroxymethyltransferase  64.51 
 
 
417 aa  536  1e-151  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1126  serine hydroxymethyltransferase  64.51 
 
 
417 aa  536  1e-151  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2916  serine hydroxymethyltransferase  64.51 
 
 
417 aa  536  1e-151  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02407  hypothetical protein  64.51 
 
 
417 aa  536  1e-151  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1117  Glycine hydroxymethyltransferase  64.51 
 
 
417 aa  536  1e-151  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.796866  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1605  serine hydroxymethyltransferase  63.88 
 
 
415 aa  535  1e-151  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0938811  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1917  serine hydroxymethyltransferase  61.93 
 
 
430 aa  536  1e-151  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.584505  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0318  serine hydroxymethyltransferase  63.13 
 
 
418 aa  535  1e-151  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>