210 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AFE_0261 on replicon NC_011761
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011761  AFE_0261  YGGT family protein  100 
 
 		 92 aa  176  9e-44  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.634053  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0438  protein of unknown function YGGT  100 
 
 		 92 aa  176  9e-44  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000112129 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1165  protein of unknown function YGGT  48.19 
 
 		 105 aa  82.4  0.000000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000835508  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1166  protein of unknown function YGGT  42.17 
 
 		 105 aa  76.3  0.0000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000866748  hitchhiker  0.00575832 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3054  protein of unknown function YGGT  40.48 
 
 		 99 aa  75.9  0.0000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.649035  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3655  protein of unknown function YGGT  47.13 
 
 		 199 aa  75.1  0.0000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0866  YGGT family protein  39.76 
 
 		 104 aa  74.3  0.0000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0149  protein of unknown function YGGT  37.63 
 
 		 100 aa  73.9  0.0000000000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.041214 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1696  protein of unknown function YGGT  42.35 
 
 		 100 aa  73.2  0.000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.471282  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0933  protein of unknown function YGGT  44.16 
 
 		 85 aa  71.2  0.000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0945487  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1838  protein of unknown function YGGT  53.73 
 
 		 183 aa  70.9  0.000000000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1018  protein of unknown function YGGT  43.04 
 
 		 85 aa  70.9  0.000000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2172  hypothetical protein  40.7 
 
 		 100 aa  69.3  0.00000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0505653  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4761  protein of unknown function YGGT  47.83 
 
 		 106 aa  68.9  0.00000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.211635 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1838  hypothetical protein  40.96 
 
 		 189 aa  67.8  0.00000000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000231673  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5321  hypothetical protein  40.54 
 
 		 196 aa  67.4  0.00000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.223141 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03060  hypothetical protein  34.15 
 
 		 197 aa  65.5  0.0000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0479202  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0339  protein of unknown function YGGT  47.3 
 
 		 192 aa  65.1  0.0000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0475  hypothetical protein  37.84 
 
 		 196 aa  64.3  0.0000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1093  protein of unknown function YGGT  40 
 
 		 98 aa  64.3  0.0000000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.869762  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05130  hypothetical protein  36.59 
 
 		 197 aa  64.7  0.0000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.409368  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1027  protein of unknown function YGGT  40 
 
 		 98 aa  64.3  0.0000000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5048  YGGT family protein  37.84 
 
 		 196 aa  64.3  0.0000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.710638  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0492  hypothetical protein  35.37 
 
 		 197 aa  63.5  0.0000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0369  protein of unknown function YGGT  36.99 
 
 		 196 aa  62.8  0.000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.758714  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1665  protein of unknown function YGGT  36.71 
 
 		 99 aa  63.2  0.000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.905288  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2689  protein of unknown function YGGT  46.48 
 
 		 182 aa  62.4  0.000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.885228  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5096  hypothetical protein  35.62 
 
 		 196 aa  61.6  0.000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.109817  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3185  protein of unknown function YGGT  47.89 
 
 		 182 aa  62  0.000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000491839  normal  0.0847291 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5146  protein of unknown function YGGT  35.62 
 
 		 196 aa  61.6  0.000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.605809  normal  0.987937 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4969  protein of unknown function YGGT  35.62 
 
 		 196 aa  61.6  0.000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1336  protein of unknown function YGGT  47.89 
 
 		 182 aa  62  0.000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000680586  hitchhiker  0.0000219253 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0534  protein of unknown function YGGT  34.25 
 
 		 194 aa  61.6  0.000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3027  protein of unknown function YGGT  47.89 
 
 		 182 aa  61.6  0.000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000050243  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3042  protein of unknown function YGGT  47.89 
 
 		 182 aa  62  0.000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000000245532  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1230  protein of unknown function YGGT  45.07 
 
 		 182 aa  61.2  0.000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000000825612  normal  0.409234 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03300  hypothetical protein  49.23 
 
 		 178 aa  61.6  0.000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4152  protein of unknown function YGGT  35.06 
 
 		 197 aa  61.2  0.000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.762639 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1901  protein of unknown function YGGT  38.67 
 
 		 100 aa  61.2  0.000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.879042  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0011  hypothetical protein  51.67 
 
 		 185 aa  60.8  0.000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5573  hypothetical protein  43.42 
 
 		 187 aa  60.8  0.000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.364539  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1085  protein of unknown function YGGT  36.47 
 
 		 87 aa  60.8  0.000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000000150484  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2449  protein of unknown function YGGT  42.67 
 
 		 187 aa  60.5  0.000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.550896  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2684  protein of unknown function YGGT  45.71 
 
 		 184 aa  60.5  0.000000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000426882  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1262  protein of unknown function YGGT  46.48 
 
 		 182 aa  60.5  0.000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0091593  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0956  protein of unknown function YGGT  34.21 
 
 		 89 aa  60.8  0.000000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00321355  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0547  protein of unknown function YGGT  43.48 
 
 		 180 aa  60.5  0.000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2158  hypothetical protein  42.67 
 
 		 187 aa  60.5  0.000000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.101701  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3111  hypothetical protein  42.67 
 
 		 213 aa  60.5  0.000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4049  protein of unknown function YGGT  44 
 
 		 187 aa  60.1  0.000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3452  hypothetical protein  47.69 
 
 		 184 aa  60.5  0.000000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0294828  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0751  YGGT family membrane protein  42.67 
 
 		 187 aa  60.5  0.000000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2585  hypothetical protein  42.67 
 
 		 213 aa  60.5  0.000000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3028  YGGT family membrane protein  42.67 
 
 		 213 aa  60.5  0.000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.952589  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3083  YGGT family membrane protein  42.67 
 
 		 213 aa  60.5  0.000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2028  YGGT family membrane protein  42.67 
 
 		 187 aa  60.5  0.000000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.835593  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1522  hypothetical protein  42.67 
 
 		 187 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0153866  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0818  protein of unknown function YGGT  42.67 
 
 		 187 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0880  hypothetical protein  41.33 
 
 		 187 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.123554  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0469  protein of unknown function YGGT  42.67 
 
 		 187 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1191  protein of unknown function YGGT  45.07 
 
 		 182 aa  59.7  0.00000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0253033  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0807  protein of unknown function YGGT  42.67 
 
 		 187 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.968375  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0948  protein of unknown function YGGT  42.67 
 
 		 187 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.199708  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1192  protein of unknown function YGGT  45.71 
 
 		 182 aa  59.7  0.00000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0499744  normal  0.653735 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03580  hypothetical protein  58.49 
 
 		 182 aa  60.1  0.00000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0910  protein of unknown function YGGT  42.67 
 
 		 187 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0607  protein of unknown function YGGT  42.67 
 
 		 187 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3355  hypothetical protein  44.29 
 
 		 182 aa  58.9  0.00000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3609  protein of unknown function YGGT  37.84 
 
 		 189 aa  59.3  0.00000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3113  protein of unknown function YGGT  41.33 
 
 		 187 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.143528  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0861  hypothetical protein  35.71 
 
 		 88 aa  58.9  0.00000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00343102  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2479  protein of unknown function YGGT  43.66 
 
 		 182 aa  59.3  0.00000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.619107  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3001  hypothetical protein  47.06 
 
 		 187 aa  58.2  0.00000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3056  protein of unknown function YGGT  36.9 
 
 		 196 aa  58.5  0.00000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.502077  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3842  protein of unknown function YGGT  48.39 
 
 		 84 aa  58.2  0.00000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0714  protein of unknown function YGGT  36.36 
 
 		 84 aa  58.2  0.00000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.674624  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1547  riboflavin synthase alpha subunit  37.18 
 
 		 97 aa  57.8  0.00000005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.836777  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0415  protein of unknown function YGGT  40.91 
 
 		 107 aa  57.8  0.00000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000337721  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0947  protein of unknown function YGGT  47.62 
 
 		 192 aa  57.8  0.00000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.618723  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1125  protein of unknown function YGGT  43.66 
 
 		 182 aa  57.8  0.00000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00000165213  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0439  yggt family protein  46.27 
 
 		 103 aa  57.8  0.00000005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.000131375  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2862  protein of unknown function YGGT  40.85 
 
 		 182 aa  57.4  0.00000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0177844  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002454  membrane protein  56.6 
 
 		 185 aa  57  0.00000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0679  protein of unknown function YGGT  41.38 
 
 		 98 aa  57  0.00000008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.345775  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0541  membrane protein, related to K+ transport  45 
 
 		 184 aa  57  0.00000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.182958  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0020  protein of unknown function YGGT  39.19 
 
 		 94 aa  57  0.00000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.310945  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2188  integral membrane protein  39.06 
 
 		 193 aa  56.6  0.0000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.199645  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0405  protein of unknown function YGGT  35.21 
 
 		 97 aa  56.2  0.0000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.97811  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1212  protein of unknown function YGGT  47.62 
 
 		 182 aa  56.2  0.0000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0177861 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2214  hypothetical protein  39.06 
 
 		 192 aa  56.2  0.0000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000107485  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1411  protein of unknown function YGGT  40.32 
 
 		 84 aa  56.2  0.0000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000759704  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0615  hypothetical protein  40.32 
 
 		 93 aa  55.5  0.0000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  1.8017800000000001e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3096  protein of unknown function YGGT  31.25 
 
 		 102 aa  55.8  0.0000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.669144  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3637  protein of unknown function YGGT  39.68 
 
 		 94 aa  55.8  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.160206  normal  0.479955 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0106  yggt family protein  40.51 
 
 		 99 aa  56.2  0.0000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4032  protein of unknown function YGGT  38.46 
 
 		 184 aa  55.1  0.0000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00886825 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1330  protein of unknown function YGGT  52 
 
 		 182 aa  55.1  0.0000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.008416 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3642  hypothetical protein  40.62 
 
 		 202 aa  55.5  0.0000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1135  protein of unknown function YGGT  50 
 
 		 182 aa  55.5  0.0000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000824226  normal  0.525534 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3720  protein of unknown function YGGT  44.12 
 
 		 180 aa  54.7  0.0000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>