More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AFE_0246 on replicon NC_011761
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011761  AFE_0246  dethiobiotin synthetase  100 
 
 		 234 aa  463  9.999999999999999e-131  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.187676  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0422  dethiobiotin synthase  100 
 
 		 234 aa  463  9.999999999999999e-131  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000789598 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2900  dithiobiotin synthetase  43.84 
 
 		 221 aa  175  5e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.380379  normal  0.231577 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2160  dethiobiotin synthase  47.12 
 
 		 228 aa  169  3e-41  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1133  dithiobiotin synthetase  46.08 
 
 		 226 aa  165  5e-40  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2812  dethiobiotin synthase  48.04 
 
 		 266 aa  164  6.9999999999999995e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00660538  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0153  dethiobiotin synthase  41.75 
 
 		 238 aa  154  1e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3643  dethiobiotin synthase  45.58 
 
 		 236 aa  154  2e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4031  dethiobiotin synthase  45.19 
 
 		 240 aa  150  2e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.677394 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1833  dethiobiotin synthase  43.46 
 
 		 233 aa  147  2.0000000000000003e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0465  dithiobiotin synthetase  43.41 
 
 		 230 aa  145  6e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.000000224118  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0899  dethiobiotin synthase  44.59 
 
 		 232 aa  144  1e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.579086 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0149  dethiobiotin synthase  45.37 
 
 		 248 aa  142  4e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3135  histidinol dehydrogenase  42.92 
 
 		 230 aa  142  5e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4084  dithiobiotin synthetase  45.05 
 
 		 228 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.610971  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2753  dithiobiotin synthetase  43.95 
 
 		 234 aa  140  1.9999999999999998e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.11733  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0323  dethiobiotin synthase  44.28 
 
 		 227 aa  138  7.999999999999999e-32  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0117307 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0372  dithiobiotin synthetase  44.7 
 
 		 239 aa  138  7.999999999999999e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.356167  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0116  dethiobiotin synthase  41.87 
 
 		 254 aa  138  7.999999999999999e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.173766  normal  0.959156 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1373  dithiobiotin synthetase  46.83 
 
 		 235 aa  137  2e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.409918  normal  0.0708007 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1804  dethiobiotin synthase  40.39 
 
 		 221 aa  137  2e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.511205  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1437  dithiobiotin synthetase  46.83 
 
 		 235 aa  134  9e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.895386  normal  0.581627 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5172  dithiobiotin synthetase  43.28 
 
 		 226 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0206613  normal  0.27561 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1163  dethiobiotin synthase  42.65 
 
 		 237 aa  134  9.999999999999999e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0360919  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1459  dethiobiotin synthase  43.75 
 
 		 244 aa  132  3.9999999999999996e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000175087  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4265  dithiobiotin synthetase  40.17 
 
 		 245 aa  132  6.999999999999999e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0554323 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45930  dithiobiotin synthetase  42.2 
 
 		 231 aa  131  7.999999999999999e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.460318  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0396  dithiobiotin synthetase  40.27 
 
 		 226 aa  131  7.999999999999999e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0704487  normal  0.887363 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4836  dithiobiotin synthetase  42.16 
 
 		 226 aa  130  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.519377 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4683  dithiobiotin synthetase  42.4 
 
 		 226 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.462604  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0392  dithiobiotin synthetase  39.82 
 
 		 226 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1045  dethiobiotin synthetase  34.48 
 
 		 242 aa  129  3e-29  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6277  dithiobiotin synthetase  47.62 
 
 		 239 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0529  dethiobiotin synthase  43.24 
 
 		 237 aa  129  5.0000000000000004e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.256581  normal  0.69291 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2097  dethiobiotin synthase  36.99 
 
 		 243 aa  128  7.000000000000001e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2773  dethiobiotin synthase  37.91 
 
 		 226 aa  128  8.000000000000001e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0046697  hitchhiker  0.00857242 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0498  dethiobiotin synthetase  42.29 
 
 		 226 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.545472  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2356  dithiobiotin synthetase  39.71 
 
 		 231 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000168324 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0292  dethiobiotin synthase  39.92 
 
 		 237 aa  127  2.0000000000000002e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0765643  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0366  dithiobiotin synthetase  39.37 
 
 		 226 aa  126  3e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.55843  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0633  dithiobiotin synthetase  33.48 
 
 		 238 aa  125  4.0000000000000003e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000700922  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2428  dithiobiotin synthetase  39.71 
 
 		 231 aa  125  4.0000000000000003e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0142166 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0445  dithiobiotin synthetase  40.37 
 
 		 247 aa  125  7e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1722  dethiobiotin synthase  38.71 
 
 		 237 aa  124  9e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000192281  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2516  dithiobiotin synthetase  39.23 
 
 		 231 aa  124  1e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000238987 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003868  dethiobiotin synthetase  34.3 
 
 		 228 aa  124  1e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0874118  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0926  dithiobiotin synthetase  38.24 
 
 		 225 aa  124  2e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000415248  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1314  dithiobiotin synthetase  38.46 
 
 		 226 aa  124  2e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0198365  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2737  dithiobiotin synthetase  38.76 
 
 		 231 aa  122  3e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2961  dithiobiotin synthetase  39.51 
 
 		 227 aa  123  3e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0450029  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1580  dithiobiotin synthetase  44.44 
 
 		 270 aa  122  4e-27  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0294479  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1157  dethiobiotin synthase  38.38 
 
 		 217 aa  122  5e-27  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.125346  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0857  dithiobiotin synthetase  33.04 
 
 		 227 aa  122  5e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2554  dethiobiotin synthase  37.34 
 
 		 287 aa  122  5e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0309873  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00745  dethiobiotin synthetase  38.73 
 
 		 225 aa  121  9e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000476961  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00762  hypothetical protein  38.73 
 
 		 225 aa  121  9e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000475745  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0832  dithiobiotin synthetase  38.73 
 
 		 225 aa  121  9e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  4.0116e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0801  dithiobiotin synthetase  38.73 
 
 		 225 aa  121  9.999999999999999e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000000100914  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0841  dithiobiotin synthetase  38.73 
 
 		 225 aa  120  9.999999999999999e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000101687  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2439  dethiobiotin synthase  37.81 
 
 		 227 aa  120  9.999999999999999e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.00602737  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2864  dethiobiotin synthase  38.24 
 
 		 225 aa  120  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000724623  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1869  dethiobiotin synthase  37.32 
 
 		 222 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000332608  decreased coverage  0.000000281099 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01810  dithiobiotin synthetase  34.13 
 
 		 227 aa  120  1.9999999999999998e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2865  dithiobiotin synthetase  38.24 
 
 		 225 aa  120  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000243352  normal  0.051363 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2574  dithiobiotin synthetase  38.73 
 
 		 225 aa  120  3e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000268609  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1479  dithiobiotin synthetase  43.63 
 
 		 229 aa  119  3e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0324532  normal  0.310327 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1428  dithiobiotin synthetase  36.82 
 
 		 240 aa  119  3e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1508  dithiobiotin synthetase  39.3 
 
 		 226 aa  119  3e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000663248  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2928  dithiobiotin synthetase  36.82 
 
 		 245 aa  119  4.9999999999999996e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1637  dithiobiotin synthetase  43.96 
 
 		 226 aa  118  6e-26  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1441  dithiobiotin synthetase  41.51 
 
 		 230 aa  118  7e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00254947  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0249  dithiobiotin synthetase  33.78 
 
 		 225 aa  118  7.999999999999999e-26  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2841  dithiobiotin synthetase  36.32 
 
 		 240 aa  117  9.999999999999999e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2045  putative dithiobiotin synthetase  38.12 
 
 		 221 aa  117  9.999999999999999e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.154785  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1798  dithiobiotin synthetase  36.16 
 
 		 246 aa  118  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.121118  normal  0.709521 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0892  dithiobiotin synthetase  37.25 
 
 		 228 aa  117  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.000165002  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1129  dethiobiotin synthetase  40.48 
 
 		 228 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.543969  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0861  dithiobiotin synthetase  37.25 
 
 		 230 aa  117  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00211774  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1868  putative dithiobiotin synthetase  38.6 
 
 		 222 aa  116  3e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.218738  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3453  dethiobiotin synthase  36.76 
 
 		 225 aa  116  3e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1980  putative dithiobiotin synthetase  38.6 
 
 		 222 aa  116  3e-25  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02208  cobyrinic acid a,c-diamide synthase:dethiobiotin synthase  37.5 
 
 		 233 aa  116  3.9999999999999997e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.020926  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1269  dithiobiotin synthetase  38.24 
 
 		 238 aa  116  3.9999999999999997e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000478349  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0947  dithiobiotin synthetase  36.76 
 
 		 228 aa  115  5e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00000283218  normal  0.605393 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0924  dithiobiotin synthetase  36.76 
 
 		 228 aa  115  5e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.000798071  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0572  dithiobiotin synthetase  43.69 
 
 		 240 aa  115  6e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0410  dithiobiotin synthetase  43.69 
 
 		 240 aa  115  6e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06570  dithiobiotin synthetase  44.04 
 
 		 228 aa  115  6e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.803425  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0389  dithiobiotin synthetase  43.69 
 
 		 240 aa  115  6e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1836  dethiobiotin synthase  41.86 
 
 		 242 aa  115  7.999999999999999e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.354399  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0833  dithiobiotin synthetase  36.27 
 
 		 230 aa  114  8.999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000108766  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1431  dethiobiotin synthetase  32.24 
 
 		 212 aa  114  1.0000000000000001e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2536  dethiobiotin synthase  37.31 
 
 		 226 aa  114  1.0000000000000001e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000213384  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1921  dethiobiotin synthase  32.55 
 
 		 235 aa  114  2.0000000000000002e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0147663  decreased coverage  0.00139462 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1895  putative dithiobiotin synthetase  38.94 
 
 		 221 aa  113  3e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0604  dithiobiotin synthetase  45.05 
 
 		 228 aa  112  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2284  dethiobiotin synthase  36.84 
 
 		 223 aa  112  6e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.165561 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2346  putative dithiobiotin synthetase  36.77 
 
 		 221 aa  112  6e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.237745  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0171  dithiobiotin synthetase  44.2 
 
 		 239 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2982  dithiobiotin synthetase  45.18 
 
 		 239 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>