210 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AFE_0166 on replicon NC_011761
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011761  AFE_0166  HNH endonuclease domain protein  100 
 
 
184 aa  383  1e-106  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0345  HNH endonuclease  100 
 
 
184 aa  383  1e-106  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.585904 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01172  HNH endonuclease family protein  57.06 
 
 
220 aa  211  2.9999999999999995e-54  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.572297  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1053  hypothetical protein  57.39 
 
 
204 aa  209  2e-53  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.368832  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1152  HNH endonuclease domain protein  59.2 
 
 
181 aa  209  2e-53  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2778  HNH endonuclease  57.63 
 
 
221 aa  208  5e-53  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.572366  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0934  HNH endonuclease  56.82 
 
 
186 aa  206  2e-52  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.39126  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1257  HNH endonuclease  55.23 
 
 
189 aa  195  4.0000000000000005e-49  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0252  HNH endonuclease  50.56 
 
 
193 aa  190  1e-47  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0319112  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0423  hypothetical protein  53.98 
 
 
185 aa  189  2e-47  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4034  HNH endonuclease  54.55 
 
 
185 aa  189  2.9999999999999997e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000888657 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2277  HNH endonuclease  49.17 
 
 
194 aa  187  5e-47  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2772  HNH endonuclease  51.93 
 
 
199 aa  186  1e-46  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.583807  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0267  HNH endonuclease domain-containing protein  49.44 
 
 
194 aa  179  2e-44  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2596  HNH endonuclease domain-containing protein  49.16 
 
 
196 aa  177  5.999999999999999e-44  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.821966  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3847  HNH endonuclease  47.49 
 
 
185 aa  173  9.999999999999999e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2733  HNH endonuclease  48.33 
 
 
185 aa  172  1.9999999999999998e-42  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.560093  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3448  HNH endonuclease  48.31 
 
 
185 aa  172  1.9999999999999998e-42  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.19182  normal  0.328861 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3397  HNH endonuclease  48.33 
 
 
185 aa  172  1.9999999999999998e-42  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01815  restriction endonuclease  52.35 
 
 
184 aa  171  6.999999999999999e-42  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00000133785  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1270  HNH endonuclease  47.19 
 
 
186 aa  170  1e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.210243  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3227  HNH endonuclease  47.78 
 
 
185 aa  169  2e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1434  HNH endonuclease  47.19 
 
 
185 aa  167  8e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.212887  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0960  HNH endonuclease  44.44 
 
 
189 aa  167  1e-40  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.639629  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4054  HNH endonuclease  48.9 
 
 
191 aa  166  2e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000779297  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2107  HNH endonuclease  46.93 
 
 
185 aa  162  3e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0295  hypothetical protein  46.41 
 
 
187 aa  162  3e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0984641 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0889  HNH endonuclease  42.78 
 
 
189 aa  157  5e-38  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.184851  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5382  HNH endonuclease  47.75 
 
 
202 aa  156  1e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.631878 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3215  hypothetical protein  43.1 
 
 
193 aa  152  2.9999999999999998e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6164  HNH endonuclease  44.69 
 
 
187 aa  151  4e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16481  HNH endonuclease family protein  36.6 
 
 
168 aa  93.2  2e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.587799  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0405  HNH endonuclease  38.1 
 
 
169 aa  92  4e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.359772 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0346  HNH nuclease  38.65 
 
 
174 aa  91.7  6e-18  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.118836 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3060  HNH endonuclease  44.9 
 
 
183 aa  88.6  4e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.137861  normal  0.0666766 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0978  HNH endonuclease  46 
 
 
170 aa  89  4e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2202  HNH nuclease  43.12 
 
 
165 aa  88.6  5e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.815076 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4555  HNH endonuclease  44.9 
 
 
183 aa  88.2  5e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00702162  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1834  HNH endonuclease  33.75 
 
 
165 aa  87.8  9e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0645517  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0931  HNH endonuclease  47.25 
 
 
174 aa  87.4  9e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.432363  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5379  HNH endonuclease  44.9 
 
 
182 aa  87.4  1e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.785631  normal  0.574785 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0389  HNH endonuclease  34.16 
 
 
165 aa  87  1e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.235309  normal  0.408465 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2144  HNH endonuclease  47.67 
 
 
189 aa  87  1e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17361  HNH endonuclease family protein  31.87 
 
 
185 aa  87.4  1e-16  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.334321  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1715  HNH endonuclease  47.62 
 
 
197 aa  87  1e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.513097 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1995  HNH endonuclease  47.62 
 
 
168 aa  87.4  1e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0301593 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1211  HNH endonuclease  41.75 
 
 
198 aa  86.7  2e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.594325  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5301  HNH endonuclease  44.9 
 
 
182 aa  85.9  3e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.480344  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4834  HNH endonuclease  44.9 
 
 
182 aa  85.9  3e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.492463  normal  0.684674 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5662  HNH endonuclease  48.15 
 
 
171 aa  85.9  3e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0860  HNH endonuclease  34.57 
 
 
168 aa  85.5  4e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4342  HNH endonuclease  44.09 
 
 
182 aa  85.5  4e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.64843 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1954  HNH endonuclease  44.33 
 
 
197 aa  85.5  4e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.843087  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1583  HNH endonuclease  53.95 
 
 
166 aa  85.1  5e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19741  HNH endonuclease family protein  35.1 
 
 
168 aa  85.1  5e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3479  HNH endonuclease  45.88 
 
 
169 aa  85.1  6e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0281943  normal  0.571859 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1099  HNH endonuclease family protein  35.1 
 
 
168 aa  84.3  8e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1621  HNH endonuclease family protein  30.22 
 
 
185 aa  83.6  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5432  HNH endonuclease  49.41 
 
 
174 aa  84  0.000000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0404895 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17201  HNH endonuclease family protein  30.22 
 
 
185 aa  84  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.659718  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2818  HNH endonuclease  52.44 
 
 
173 aa  84  0.000000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.0346696 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0170  HNH endonuclease  42.42 
 
 
171 aa  83.2  0.000000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1582  HNH endonuclease  34.16 
 
 
167 aa  83.2  0.000000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.485926 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23331  HNH endonuclease family protein  34.64 
 
 
189 aa  83.2  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1985  HNH nuclease  37.09 
 
 
174 aa  82.8  0.000000000000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.110291  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3733  HNH endonuclease  50.65 
 
 
187 aa  82.4  0.000000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1417  HNH endonuclease  50 
 
 
174 aa  82.4  0.000000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.421094  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1905  HNH endonuclease  44.94 
 
 
204 aa  82  0.000000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4220  HNH endonuclease  46.51 
 
 
177 aa  82.4  0.000000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17101  HNH endonuclease family protein  30.22 
 
 
187 aa  81.6  0.000000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0411  HNH endonuclease  31.68 
 
 
165 aa  81.3  0.000000000000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1974  HNH endonuclease  44.94 
 
 
198 aa  80.5  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.54643  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3705  HNH endonuclease  42.86 
 
 
205 aa  80.5  0.00000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.189968  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1202  HNH endonuclease  44.74 
 
 
205 aa  80.5  0.00000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2059  HNH endonuclease  44.94 
 
 
198 aa  80.5  0.00000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.26208  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1327  HNH endonuclease  42.16 
 
 
186 aa  79.7  0.00000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.102116  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3285  HNH endonuclease  33.77 
 
 
165 aa  79.3  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2838  HNH endonuclease  33.77 
 
 
165 aa  79.3  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.576583 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17680  restriction endonuclease  47.06 
 
 
175 aa  79  0.00000000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.560252  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0891  HNH endonuclease  45.24 
 
 
174 aa  79  0.00000000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.374169  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0537  HNH endonuclease domain-containing protein  48.1 
 
 
177 aa  77.8  0.00000000000008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.525131  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2501  HNH endonuclease  47.92 
 
 
146 aa  77.8  0.00000000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000947022  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4460  HNH endonuclease  49.35 
 
 
181 aa  77.4  0.0000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.282325  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_478  restriction endonuclease  46.84 
 
 
176 aa  77.4  0.0000000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3111  HNH endonuclease  44.33 
 
 
188 aa  77.4  0.0000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.599577 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3083  HNH endonuclease  43.3 
 
 
188 aa  77  0.0000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.342454  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4081  HNH endonuclease  48.75 
 
 
169 aa  76.6  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0126  HNH nuclease  43.37 
 
 
168 aa  75.9  0.0000000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1633  HNH endonuclease  33.55 
 
 
186 aa  76.3  0.0000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0513  HNH endonuclease  45.57 
 
 
176 aa  74.7  0.0000000000006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2776  HNH endonuclease  46.91 
 
 
179 aa  74.7  0.0000000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.228269  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3201  HNH endonuclease  45.78 
 
 
186 aa  74.3  0.000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.177111  normal  0.769466 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2350  HNH endonuclease  39.8 
 
 
188 aa  72.8  0.000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.459711  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3103  HNH endonuclease  38.71 
 
 
189 aa  72.4  0.000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.220092 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0868  HNH endonuclease  41.84 
 
 
165 aa  72  0.000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0479287  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0613  HNH endonuclease  46.15 
 
 
185 aa  71.6  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0558  HNH endonuclease  47.44 
 
 
185 aa  71.6  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0342  HNH endonuclease  47.44 
 
 
185 aa  71.2  0.000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.440485  normal  0.426528 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3490  HNH endonuclease  46.15 
 
 
185 aa  71.2  0.000000000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0745  HNH endonuclease  44.87 
 
 
191 aa  70.9  0.000000000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>