More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AFE_0141 on replicon NC_011761
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011761  AFE_0141  phosphoheptose isomerase/cytidylyltransferase  100 
 
 
358 aa  726    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0314  rfaE bifunctional protein  100 
 
 
358 aa  726    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000289381 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13120  phosphoheptose isomerase  53.19 
 
 
197 aa  203  4e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4115  phosphoheptose isomerase  56.82 
 
 
197 aa  203  4e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.726909  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4686  phosphoheptose isomerase  55.25 
 
 
197 aa  203  4e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.493935  normal  0.0490355 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4421  phosphoheptose isomerase  56.25 
 
 
195 aa  202  5e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.440249  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3356  phosphoheptose isomerase  52.66 
 
 
197 aa  203  5e-51  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0931  phosphoheptose isomerase  58.24 
 
 
197 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3429  phosphoheptose isomerase  56.82 
 
 
195 aa  201  1.9999999999999998e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.102889  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0909  phosphoheptose isomerase  54.7 
 
 
197 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.247472  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57500  phosphoheptose isomerase  54.7 
 
 
197 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0298  phosphoheptose isomerase  52.66 
 
 
197 aa  200  3e-50  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4997  phosphoheptose isomerase  54.7 
 
 
197 aa  200  3e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.478077  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4401  phosphoheptose isomerase  55.25 
 
 
197 aa  200  3e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.152156 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3686  phosphoheptose isomerase  52.66 
 
 
197 aa  200  3e-50  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0259  phosphoheptose isomerase  52.66 
 
 
197 aa  200  3e-50  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3882  phosphoheptose isomerase  52.66 
 
 
197 aa  200  3e-50  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.118064 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3991  phosphoheptose isomerase  52.66 
 
 
197 aa  200  3.9999999999999996e-50  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1323  phosphoheptose isomerase  55.25 
 
 
195 aa  199  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.419202  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4071  phosphoheptose isomerase  52.66 
 
 
197 aa  200  3.9999999999999996e-50  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4525  phosphoheptose isomerase  57.65 
 
 
197 aa  200  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4189  phosphoheptose isomerase  52.66 
 
 
197 aa  200  3.9999999999999996e-50  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4101  phosphoheptose isomerase  52.66 
 
 
197 aa  200  3.9999999999999996e-50  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3694  phosphoheptose isomerase  52.66 
 
 
197 aa  200  3.9999999999999996e-50  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.456591  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3264  phosphoheptose isomerase  55.68 
 
 
195 aa  199  5e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.409403  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03359  phosphoheptose isomerase  58.02 
 
 
198 aa  199  7e-50  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0350  phosphoheptose isomerase  51.6 
 
 
195 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0433035  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0271  phosphoheptose isomerase  51.06 
 
 
196 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000156445  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4253  phosphoheptose isomerase  51.6 
 
 
197 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00003184 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0387  phosphoheptose isomerase  51.06 
 
 
197 aa  196  6e-49  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.889842  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0250  phosphoheptose isomerase  51.06 
 
 
197 aa  196  7e-49  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.851625  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0225  phosphoheptose isomerase  50.53 
 
 
197 aa  195  9e-49  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0706313  normal  0.114772 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0354  phosphoheptose isomerase  58.79 
 
 
210 aa  194  2e-48  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4312  phosphoheptose isomerase  56.14 
 
 
195 aa  194  2e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0105  cytidyltransferase  69.4 
 
 
159 aa  191  1e-47  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.160832  normal  0.0164853 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2206  phosphoheptose isomerase  52.55 
 
 
196 aa  191  1e-47  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.175972  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2104  phosphoheptose isomerase  48.97 
 
 
198 aa  191  2e-47  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.375307  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3874  phosphoheptose isomerase  53.14 
 
 
197 aa  189  5e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0392  phosphoheptose isomerase  52 
 
 
199 aa  189  5.999999999999999e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.880276  normal  0.0515398 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0406  phosphoheptose isomerase  55.56 
 
 
195 aa  188  1e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0501  phosphoheptose isomerase  57.24 
 
 
196 aa  187  2e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.457964 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6250  ADP-heptose synthase bifunctional sugarkinase/adenylyltransferase  61.31 
 
 
161 aa  187  2e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.264846 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0272  phosphoheptose isomerase  51.4 
 
 
199 aa  188  2e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2819  rfaE bifunctional protein  62.5 
 
 
161 aa  187  3e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.675163  normal  0.258332 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4229  cytidyltransferase-related protein  64.66 
 
 
160 aa  187  3e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.204202 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2293  bifunctional ADP-heptose synthase  62.04 
 
 
161 aa  187  3e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.401253  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2907  rfaE bifunctional protein  62.04 
 
 
161 aa  187  3e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0202219  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0397  rfaE bifunctional protein  61.76 
 
 
160 aa  186  6e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.32955  normal  0.0151006 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0238  cytidyltransferase-like protein  58.23 
 
 
161 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0072  cytidyltransferase-like protein  58.23 
 
 
161 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.41814  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0607  bifunctional ADP-heptose synthase  58.23 
 
 
161 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1355  cytidyltransferase-like protein  58.23 
 
 
161 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.29998  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3207  cytidyltransferase-like protein  58.23 
 
 
161 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2922  rfaE bifunctional protein  61.76 
 
 
161 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.69152 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0425  aut protein  58.23 
 
 
161 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.121089  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0444  aut protein  58.23 
 
 
161 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.47822  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2956  rfaE bifunctional protein  61.03 
 
 
161 aa  184  3e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0487  rfaE bifunctional protein  62.41 
 
 
160 aa  183  4.0000000000000006e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0349421 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0258  phosphoheptose isomerase  51.12 
 
 
199 aa  182  5.0000000000000004e-45  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1935  phosphoheptose isomerase  51.12 
 
 
199 aa  182  6e-45  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.201386  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004503  phosphoheptose isomerase  47.03 
 
 
196 aa  182  7e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000149814  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0367  ADP-D-glycero-D-manno-heptose synthase  62.41 
 
 
161 aa  182  8.000000000000001e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0870794  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2656  DnaA initiator-associating protein DiaA  49.19 
 
 
196 aa  181  1e-44  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.967641  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0111  phosphoheptose isomerase  47.57 
 
 
196 aa  180  2.9999999999999997e-44  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0486  cytidyltransferase-related  61.87 
 
 
162 aa  180  2.9999999999999997e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0124  phosphoheptose isomerase  53.49 
 
 
195 aa  180  4e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0201  rfaE bifunctional protein  62.41 
 
 
160 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00889  hypothetical protein  46.49 
 
 
196 aa  179  4.999999999999999e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2202  phosphoheptose isomerase  53.45 
 
 
197 aa  179  4.999999999999999e-44  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.874166  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3695  phosphoheptose isomerase  50 
 
 
197 aa  179  4.999999999999999e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.862655  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0031  phosphoheptose isomerase  54.67 
 
 
200 aa  179  5.999999999999999e-44  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.0000157257  hitchhiker  0.0000000939635 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0035  phosphoheptose isomerase  48.02 
 
 
210 aa  179  5.999999999999999e-44  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0672429  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0107  phosphoheptose isomerase  54.02 
 
 
197 aa  177  3e-43  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0339734 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0171  rfaE bifunctional protein  59.42 
 
 
178 aa  177  3e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0164  rfaE bifunctional protein  60.29 
 
 
178 aa  177  3e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.701084 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1676  rfaE bifunctional protein  56.25 
 
 
162 aa  176  5e-43  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1969  rfaE bifunctional protein  59.7 
 
 
162 aa  176  7e-43  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4052  bifunctional ADP-heptose synthase  61.94 
 
 
170 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0105  cytidyltransferase-like protein  59.42 
 
 
171 aa  174  1.9999999999999998e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3765  phosphoheptose isomerase  50.29 
 
 
200 aa  174  2.9999999999999996e-42  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.765674  normal  0.047114 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0309  putative transferase protein  59.56 
 
 
166 aa  172  5e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3586  DnaA initiator-associating protein DiaA  47.09 
 
 
196 aa  173  5e-42  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.765842  normal  0.187267 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3631  DnaA initiator-associating protein DiaA  44.15 
 
 
196 aa  172  5.999999999999999e-42  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03016  DnaA initiator-associating factor for replication initiation  44.15 
 
 
196 aa  172  5.999999999999999e-42  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0556  DnaA initiator-associating protein DiaA  44.15 
 
 
196 aa  172  5.999999999999999e-42  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3341  DnaA initiator-associating protein DiaA  44.15 
 
 
196 aa  172  5.999999999999999e-42  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4434  phosphoheptose isomerase  47.4 
 
 
196 aa  172  5.999999999999999e-42  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3455  DnaA initiator-associating protein DiaA  46.51 
 
 
196 aa  172  5.999999999999999e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3621  DnaA initiator-associating protein DiaA  46.51 
 
 
196 aa  172  5.999999999999999e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3524  DnaA initiator-associating protein DiaA  46.51 
 
 
196 aa  172  5.999999999999999e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.437897  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0549  DnaA initiator-associating protein DiaA  44.15 
 
 
196 aa  172  5.999999999999999e-42  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.91217  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3623  DnaA initiator-associating protein DiaA  44.15 
 
 
196 aa  172  5.999999999999999e-42  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4468  DnaA initiator-associating protein DiaA  44.15 
 
 
196 aa  172  5.999999999999999e-42  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3561  DnaA initiator-associating protein DiaA  46.51 
 
 
196 aa  172  5.999999999999999e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02967  hypothetical protein  44.15 
 
 
196 aa  172  5.999999999999999e-42  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3444  DnaA initiator-associating protein DiaA  44.15 
 
 
196 aa  172  5.999999999999999e-42  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3453  DnaA initiator-associating protein DiaA  46.51 
 
 
196 aa  172  5.999999999999999e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2381  phosphoheptose isomerase  47.06 
 
 
197 aa  172  6.999999999999999e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1410  phosphoheptose isomerase  50.62 
 
 
186 aa  172  9e-42  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3096  phosphoheptose isomerase  53.5 
 
 
214 aa  171  1e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.286369  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>