147 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AFE_0102 on replicon NC_011761
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011761  AFE_0102  ABC transporter, permease protein, putative  100 
 
 
378 aa  759    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0104  protein of unknown function DUF214  100 
 
 
378 aa  759    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.33773  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1293  hypothetical protein  60.32 
 
 
384 aa  492  9.999999999999999e-139  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4425  protein of unknown function DUF214  60.58 
 
 
378 aa  491  9.999999999999999e-139  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.144574  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4558  protein of unknown function DUF214  60.58 
 
 
378 aa  491  9.999999999999999e-139  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.987497  normal  0.0915843 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0146  ABC transporter, permease protein  59.26 
 
 
378 aa  482  1e-135  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1034  ABC transporter, permease protein  58.99 
 
 
378 aa  481  1e-135  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.778603  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1505  hypothetical protein  60.32 
 
 
378 aa  484  1e-135  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.481293  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0444  ABC transporter, permease protein  59.26 
 
 
378 aa  483  1e-135  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.147924  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1317  efflux ABC transporter, permease protein  59.26 
 
 
378 aa  482  1e-135  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2769  ABC transporter, permease protein, putative  58.73 
 
 
378 aa  481  1e-135  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.715584  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2626  efflux ABC transporter, permease protein  59.26 
 
 
378 aa  482  1e-135  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0172  efflux ABC transporter, permease protein  59.26 
 
 
378 aa  482  1e-135  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.776599  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7011  hypothetical protein  58.99 
 
 
378 aa  476  1e-133  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0792174  normal  0.559457 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5592  protein of unknown function DUF214  57.94 
 
 
378 aa  475  1e-133  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00756234  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1222  hypothetical protein  58.67 
 
 
398 aa  468  1.0000000000000001e-131  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5886  hypothetical protein  57.94 
 
 
378 aa  470  1.0000000000000001e-131  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0313  protein of unknown function DUF214  55.82 
 
 
380 aa  438  9.999999999999999e-123  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0010  protein of unknown function DUF214  56.61 
 
 
380 aa  426  1e-118  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000261565  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1808  ABC-transporter permease protein, putative  34.69 
 
 
366 aa  217  2.9999999999999998e-55  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.218527  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2114  hypothetical protein  33.77 
 
 
380 aa  211  2e-53  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.0000213217  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1117  protein of unknown function DUF214  30.79 
 
 
381 aa  199  7e-50  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0167  hypothetical protein  32.38 
 
 
380 aa  193  4e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0469  protein of unknown function DUF214  31.69 
 
 
386 aa  192  9e-48  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1630  protein of unknown function DUF214  33.85 
 
 
382 aa  189  5.999999999999999e-47  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1398  protein of unknown function DUF214  29.59 
 
 
397 aa  134  3e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00210458  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3083  hypothetical protein  26.58 
 
 
376 aa  126  7e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.262583  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0827  ABC transporter, permease protein, putative  26.96 
 
 
410 aa  124  4e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0698  protein of unknown function DUF214  27.37 
 
 
376 aa  119  9.999999999999999e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.112552 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2646  ABC transporter, permease component  26.3 
 
 
374 aa  110  6e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4544  protein of unknown function DUF214  24.93 
 
 
372 aa  99.4  9e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0301435  normal  0.636617 
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3894  hypothetical protein  25.33 
 
 
402 aa  99.4  1e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4023  ABC efflux pump, inner membrane subunit  25.2 
 
 
375 aa  98.6  2e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7062  putative ABC transporter, permease protein  24.8 
 
 
377 aa  98.2  2e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.549141  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1553  hypothetical protein  24.47 
 
 
376 aa  96.7  6e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2146  protein of unknown function DUF214  25.62 
 
 
392 aa  84.3  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2797  hypothetical protein  22.97 
 
 
415 aa  82.8  0.00000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0642464 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5155  protein of unknown function DUF214  24.51 
 
 
407 aa  82.8  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0126  hypothetical protein  24.01 
 
 
384 aa  82.8  0.00000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.447116  normal  0.743413 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3709  protein of unknown function DUF214  26.77 
 
 
406 aa  78.6  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1408  protein of unknown function DUF214  22.9 
 
 
379 aa  73.9  0.000000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.485745  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0999  protein of unknown function DUF214  25.32 
 
 
414 aa  68.6  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.59064  normal  0.175396 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1223  DevC protein  24.16 
 
 
392 aa  68.6  0.0000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.933137  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3639  DevC protein  23.39 
 
 
388 aa  67  0.0000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.543907  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0381  hypothetical protein  23.56 
 
 
381 aa  65.9  0.000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.199092  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0829  protein of unknown function DUF214  22.3 
 
 
400 aa  64.3  0.000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1047  protein of unknown function DUF214  22.27 
 
 
401 aa  63.5  0.000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.60518  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0049  hypothetical protein  22.41 
 
 
397 aa  63.9  0.000000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3712  hypothetical protein  22.54 
 
 
400 aa  63.5  0.000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1835  hypothetical protein  21.1 
 
 
399 aa  63.2  0.000000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.515684  normal  0.328379 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1686  protein of unknown function DUF214  21 
 
 
399 aa  62  0.00000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3304  hypothetical protein  23.84 
 
 
380 aa  61.2  0.00000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.578664  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0230  protein of unknown function DUF214  19.71 
 
 
400 aa  60.5  0.00000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3587  DevC protein  26.39 
 
 
385 aa  60.1  0.00000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.694594  normal  0.0264093 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0009  DevC protein  22.59 
 
 
384 aa  59.7  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.611516 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2250  DevC protein  25.69 
 
 
385 aa  59.3  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0130513  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3920  DevC protein  24.17 
 
 
392 aa  59.3  0.0000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0091  DevC protein  25.69 
 
 
384 aa  59.3  0.0000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0331  DevC protein  24.09 
 
 
385 aa  59.3  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.233298  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3624  hypothetical protein  21.71 
 
 
397 aa  58.2  0.0000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.212055  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1432  hypothetical protein  28.26 
 
 
402 aa  57  0.0000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.696316  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4323  hypothetical protein  22.94 
 
 
378 aa  56.6  0.0000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.113559 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2836  hypothetical protein  21.14 
 
 
397 aa  56.6  0.0000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00251794 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0255  hypothetical protein  22.44 
 
 
397 aa  56.6  0.0000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0121  permease, putative  25 
 
 
362 aa  56.6  0.0000008  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1218  DevC protein  21.23 
 
 
389 aa  56.6  0.0000008  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.188524  normal  0.730906 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10072  glutamine ABC transporter membrane protein  22.97 
 
 
349 aa  55.5  0.000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.929786  normal  0.0856316 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3254  putative ABC transporter, permease protein  21.83 
 
 
354 aa  54.3  0.000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0758  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  24.22 
 
 
420 aa  53.5  0.000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00020569  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1048  peptide ABC transporter permease  23.02 
 
 
348 aa  53.5  0.000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3300  hypothetical protein  22.5 
 
 
377 aa  53.5  0.000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.21339  normal  0.477373 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2092  DevC protein  22.51 
 
 
388 aa  53.1  0.000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000758237 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0600  DevC protein  24.09 
 
 
388 aa  52.4  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3023  ABC transporter permease  21.32 
 
 
354 aa  51.6  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.7303  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3008  ABC transporter, permease  21.94 
 
 
354 aa  52  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1251  DevC protein  21.23 
 
 
389 aa  51.6  0.00002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0933437  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3256  ABC transporter permease  21.32 
 
 
354 aa  51.6  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3244  putative ABC transporter, permease protein  21.94 
 
 
354 aa  52  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3407  hypothetical protein  21.23 
 
 
400 aa  51.6  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.246613  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2586  DevC protein  23.67 
 
 
392 aa  51.2  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.131635  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0971  hypothetical protein  21.94 
 
 
397 aa  50.8  0.00003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0827102  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3274  putative ABC transporter, permease protein  21.15 
 
 
354 aa  50.8  0.00003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.922817  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1062  ABC transporter  29.52 
 
 
409 aa  50.4  0.00004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.978594  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3413  hypothetical protein  22.44 
 
 
373 aa  50.8  0.00004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.779659  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1564  hypothetical protein  26.74 
 
 
397 aa  50.8  0.00004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2972  hypothetical protein  21.68 
 
 
354 aa  50.8  0.00004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0587122  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0948  ABC transporter, permease protein, putative  20.14 
 
 
399 aa  50.4  0.00005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2945  ABC transporter, permease  21.43 
 
 
354 aa  50.1  0.00006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0790  putative ABC transporter permease protein  23.29 
 
 
371 aa  50.1  0.00006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.119405 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1915  hypothetical protein  28.23 
 
 
414 aa  50.1  0.00006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4445  DevC protein  20.83 
 
 
390 aa  50.1  0.00006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1233  DevC protein  25.45 
 
 
392 aa  49.7  0.00008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000657909  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4954  ABC transporter related  22.44 
 
 
681 aa  49.7  0.00008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0415826  normal  0.0801144 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5332  ABC transporter related  22.44 
 
 
681 aa  49.7  0.00008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0305255 
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3833  hypothetical protein  21.35 
 
 
401 aa  49.7  0.00009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3850  hypothetical protein  21.35 
 
 
401 aa  49.7  0.00009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.17644  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1918  hypothetical protein  21.35 
 
 
401 aa  49.7  0.00009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1363  hypothetical protein  20.29 
 
 
381 aa  49.7  0.0001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.222862  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1347  peptide ABC transporter permease  22.89 
 
 
348 aa  48.9  0.0001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3800  DevC protein  21.27 
 
 
383 aa  48.9  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>