More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AFE_0101 on replicon NC_011761
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011761  AFE_0101  ABC transporter, ATP-binding protein  100 
 
 		 230 aa  466  9.999999999999999e-131  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0103  ABC transporter related  100 
 
 		 230 aa  466  9.999999999999999e-131  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1294  ABC transporter related  69.87 
 
 		 234 aa  323  2e-87  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5591  ABC transporter related  69.27 
 
 		 232 aa  311  5.999999999999999e-84  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0559495  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1504  ABC transporter related  66.96 
 
 		 231 aa  310  1e-83  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.211906  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5887  ABC transporter related  67.89 
 
 		 232 aa  306  2.0000000000000002e-82  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0445  ABC transporter, ATP-binding protein  66.97 
 
 		 232 aa  303  1.0000000000000001e-81  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.168038  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2768  ABC transporter, ATP-binding protein  67.27 
 
 		 234 aa  303  2.0000000000000002e-81  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1223  ABC transporter related  66.06 
 
 		 232 aa  303  2.0000000000000002e-81  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.438365  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1033  ABC transporter, ATP-binding protein  67.27 
 
 		 232 aa  303  2.0000000000000002e-81  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2625  efflux ABC transporter, ATP-binding protein  67.27 
 
 		 234 aa  303  2.0000000000000002e-81  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0147  ABC transporter, ATP-binding protein  66.82 
 
 		 232 aa  300  1e-80  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0173  efflux ABC transporter, ATP-binding protein  66.82 
 
 		 234 aa  300  1e-80  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1318  efflux ABC transporter, ATP-binding protein  66.82 
 
 		 234 aa  300  1e-80  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4557  ABC transporter related  67.43 
 
 		 232 aa  296  1e-79  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0557853 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4424  ABC transporter related  67.43 
 
 		 232 aa  296  1e-79  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.056527  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7010  ABC transporter related  65.14 
 
 		 232 aa  296  2e-79  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0349987  normal  0.4125 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0009  ABC transporter related  60.71 
 
 		 235 aa  290  1e-77  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000406325  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0312  ABC transporter related  56.44 
 
 		 242 aa  258  7e-68  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.403569  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0826  ATPase  45.58 
 
 		 233 aa  204  1e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0697  ABC transporter related  46.9 
 
 		 232 aa  204  1e-51  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.10839 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0470  ABC transporter related protein  45.54 
 
 		 264 aa  201  5e-51  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0166  ABC transporter related  47.49 
 
 		 240 aa  201  6e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1395  ABC transporter related protein  44.09 
 
 		 238 aa  197  1.0000000000000001e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0267947  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0964  ABC transporter related  43.56 
 
 		 241 aa  196  2.0000000000000003e-49  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1809  ABC transporter, ATP-binding protein  45.16 
 
 		 235 aa  195  5.000000000000001e-49  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.596439  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7063  putative ABC transporter, ATP-binding protein  45.29 
 
 		 239 aa  193  1e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.107717  normal  1 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3084  ABC transporter related  44.29 
 
 		 230 aa  193  2e-48  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.319445  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3074  ABC transporter related  44.84 
 
 		 239 aa  191  6e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1554  ABC transporter related  44.25 
 
 		 246 aa  191  1e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2113  ABC transporter related  46.76 
 
 		 240 aa  190  2e-47  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.000000136112  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1199  ABC transporter, ATP-binding protein  41.28 
 
 		 221 aa  189  2.9999999999999997e-47  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0191254  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1629  ABC transporter related  44.86 
 
 		 315 aa  189  2.9999999999999997e-47  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1116  ABC transporter related protein  41.36 
 
 		 240 aa  187  1e-46  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.53256  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1015  ABC transporter related  45.79 
 
 		 228 aa  186  2e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.5301  normal  0.120325 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4022  ABC transporter, ATPase subunit  42.79 
 
 		 259 aa  185  5e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.91478  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3422  ABC transporter related  44.2 
 
 		 224 aa  182  4.0000000000000006e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0111  ABC transporter related  41.82 
 
 		 237 aa  180  1e-44  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3893  ABC transporter related  42.41 
 
 		 242 aa  181  1e-44  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0531  ABC transporter related  44.86 
 
 		 246 aa  181  1e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.328993  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0191  ABC transporter related  43.93 
 
 		 247 aa  180  1e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00111007  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0388  putative ABC transporter, ATP-binding protein  43.17 
 
 		 235 aa  179  2e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.771085  normal  0.640067 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0492  ABC transporter related  41.82 
 
 		 238 aa  179  2.9999999999999997e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.925941  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0198  ABC transporter related  43.06 
 
 		 251 aa  179  2.9999999999999997e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.884369 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0838  ABC transporter related protein  43.75 
 
 		 224 aa  179  4e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4474  ABC transporter related  45.54 
 
 		 227 aa  178  4.999999999999999e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1243  ABC transporter related  38.84 
 
 		 229 aa  178  4.999999999999999e-44  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0223  ABC transporter related  44.93 
 
 		 225 aa  178  5.999999999999999e-44  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0225  ABC transporter related  44.93 
 
 		 225 aa  178  5.999999999999999e-44  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0694  ABC transporter related  42.53 
 
 		 230 aa  178  7e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00813244  hitchhiker  0.000136942 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5470  ABC transporter related  45.83 
 
 		 231 aa  178  8e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0589089  normal  0.059102 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1061  ABC transporter related  45.74 
 
 		 239 aa  178  8e-44  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.691054  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2944  ABC transporter, ATP-binding protein  40.45 
 
 		 223 aa  177  1e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.81423  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3273  ABC transporter, ATP-binding protein  40.45 
 
 		 223 aa  177  1e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.942342  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0285  ABC transporter related  43.46 
 
 		 246 aa  177  1e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.664514  normal  0.0597012 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3243  ABC transporter, ATP-binding protein  40.45 
 
 		 223 aa  176  2e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3705  ABC transporter related  39.73 
 
 		 293 aa  177  2e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4362  ABC transporter related  45.07 
 
 		 230 aa  176  2e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1966  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  41.7 
 
 		 233 aa  176  3e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00198197  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3267  ABC transporter, ATP-binding protein  40 
 
 		 223 aa  176  3e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.194795  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1758  ABC transporter related  42.29 
 
 		 241 aa  176  3e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.101671 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2150  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  41.7 
 
 		 233 aa  176  3e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.166466  hitchhiker  0.000506788 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0127  ABC transporter related  41.74 
 
 		 252 aa  176  3e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.713745  normal  0.982283 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3993  ABC transporter related  45.07 
 
 		 260 aa  176  3e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.222107  normal  0.622959 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1318  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  41.7 
 
 		 233 aa  176  3e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.113611  hitchhiker  0.00161216 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1333  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  41.7 
 
 		 233 aa  176  3e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00479967 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2297  ABC transporter related  42.13 
 
 		 225 aa  176  3e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1295  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  41.7 
 
 		 233 aa  176  3e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0289168  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1341  ABC transporter, ATP-binding protein  42.34 
 
 		 234 aa  176  4e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2004  ABC transporter, ATP-binding protein  40 
 
 		 223 aa  176  4e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.476728  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1552  ABC transporter-related protein  43.06 
 
 		 221 aa  176  4e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3022  ABC transporter ATP-binding protein  40 
 
 		 223 aa  175  5e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.191779  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3007  ABC transporter, ATP-binding protein  40 
 
 		 223 aa  175  5e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1905  ABC transporter  39.55 
 
 		 232 aa  175  5e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.030671  hitchhiker  0.00477686 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3255  ABC transporter ATP-binding protein  40 
 
 		 223 aa  175  5e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.676269  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1775  ABC transporter related  44.75 
 
 		 298 aa  175  5e-43  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2358  ABC transporter-related protein  41.44 
 
 		 225 aa  175  6e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.816057 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2740  putative macrolide efflux ABC transporter, ATP-binding protein  42.06 
 
 		 228 aa  174  7e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3253  ABC transporter, ATP-binding protein  40 
 
 		 223 aa  175  7e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0955  ABC transporter related protein  42.99 
 
 		 240 aa  174  8e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0487401  normal  0.0166931 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19670  ABC transporter related  42.01 
 
 		 232 aa  173  1.9999999999999998e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4480  ABC transporter related  42.31 
 
 		 217 aa  173  1.9999999999999998e-42  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.859777  normal  0.280923 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25440  putative lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  39.55 
 
 		 227 aa  173  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2971  ABC transporter related  39.55 
 
 		 223 aa  173  1.9999999999999998e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0119229  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3710  ABC transporter related  42.58 
 
 		 255 aa  173  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2521  ABC transporter related  42.4 
 
 		 235 aa  173  1.9999999999999998e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1678  ABC transporter related  40.27 
 
 		 235 aa  173  1.9999999999999998e-42  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.184707  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1899  ABC transporter related  40.45 
 
 		 228 aa  172  2.9999999999999996e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.676555  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1516  ABC transporter related  38.74 
 
 		 230 aa  173  2.9999999999999996e-42  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0083  ABC transporter related  39.91 
 
 		 228 aa  172  2.9999999999999996e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1659  ABC transporter related  38.64 
 
 		 241 aa  172  2.9999999999999996e-42  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3339  ABC transporter related  40.45 
 
 		 249 aa  172  2.9999999999999996e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2009  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  40.81 
 
 		 233 aa  172  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.56693  normal  0.0495903 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2174  lipoprotein releasing system ATP-binding protein  39.55 
 
 		 227 aa  172  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.638459  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0238  ABC transporter related  44.39 
 
 		 223 aa  172  2.9999999999999996e-42  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.145385 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0829  ABC transporter related  41.44 
 
 		 245 aa  172  3.9999999999999995e-42  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.848546 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1641  ABC transporter related  40 
 
 		 254 aa  172  3.9999999999999995e-42  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3651  ABC transporter component  46.08 
 
 		 237 aa  172  3.9999999999999995e-42  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0633  ABC transporter, ATPase subunit  39.01 
 
 		 252 aa  172  3.9999999999999995e-42  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0652413  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2206  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  40.81 
 
 		 233 aa  172  5e-42  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.165489  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>