28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AFE_0094 on replicon NC_011761
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011761  AFE_0094  prevent-host-death family protein  100 
 
 		 102 aa  211  3.9999999999999995e-54  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0096  prevent-host-death family protein  100 
 
 		 80 aa  163  6.9999999999999995e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3164  prevent-host-death family protein  73.49 
 
 		 84 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.332735  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4834  prevent-host-death protein  66.22 
 
 		 83 aa  106  1e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4183  prevent-host-death family protein  66.22 
 
 		 83 aa  106  1e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3332  prevent-host-death family protein  66.22 
 
 		 83 aa  106  1e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0856  prevent-host-death protein  63.29 
 
 		 84 aa  104  5e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.162182 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6403  prevent-host-death family protein  57.5 
 
 		 84 aa  95.9  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0680  prevent-host-death protein  58.02 
 
 		 84 aa  95.9  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.219164  normal  0.89049 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2838  Antitoxin of toxin-antitoxin stability system  61.64 
 
 		 88 aa  95.1  3e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.54708  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2040  prevent-host-death family protein  59.04 
 
 		 84 aa  94  6e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.699065  normal  0.67049 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4564  prevent-host-death family protein  60.87 
 
 		 84 aa  92  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4748  prevent-host-death family protein  60 
 
 		 84 aa  89.7  1e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1398  prevent-host-death protein  58.67 
 
 		 93 aa  88.2  3e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000552263  normal  0.0192165 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1389  prevent-host-death family protein  50 
 
 		 85 aa  87.4  5e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2000  prevent-host-death family protein  58.44 
 
 		 83 aa  83.6  9e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0919472  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3417  prevent-host-death protein  56.58 
 
 		 83 aa  80.9  0.000000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.531157  normal  0.0244722 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3557  prevent-host-death family protein  47.89 
 
 		 83 aa  71.6  0.000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5182  prevent-host-death family protein  44.19 
 
 		 93 aa  70.1  0.000000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.104067  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4337  prevent-host-death protein  46.38 
 
 		 77 aa  58.5  0.00000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.574582 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0506  hypothetical protein  38.16 
 
 		 93 aa  49.7  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.275503 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0714  prevent-host-death family protein  42.86 
 
 		 93 aa  50.1  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000667491  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4537  prevent-host-death family protein  31.71 
 
 		 88 aa  47  0.00009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0623765 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4285  hypothetical protein  32.22 
 
 		 92 aa  44.7  0.0004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.192464  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5092  prevent-host-death family protein  34.25 
 
 		 112 aa  43.1  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4580  prevent-host-death family protein  31.71 
 
 		 88 aa  43.5  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.564565  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5263  prevent-host-death family protein  29.27 
 
 		 88 aa  42.7  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.416232  normal  1 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4514  prevent-host-death protein  36 
 
 		 91 aa  40.8  0.006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.680635  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>