19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AFE_0091 on replicon NC_011761
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011761  AFE_0091  hypothetical protein  100 
 
 
86 aa  177  3e-44  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.855268  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1277  ParB domain protein nuclease  56.82 
 
 
689 aa  53.1  1e-06  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0467  nuclease  56.82 
 
 
687 aa  52  3e-06  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3740  nuclease  69.44 
 
 
692 aa  51.6  4e-06  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2322  nuclease  56.82 
 
 
682 aa  50.8  6e-06  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2617  hypothetical protein  66.67 
 
 
597 aa  50.8  7e-06  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31190  hypothetical protein  52.27 
 
 
684 aa  50.4  7e-06  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  1.26349e-09  unclonable  1.05034e-21 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3033  ParB family protein  50 
 
 
688 aa  48.9  2e-05  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.391676 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1870  ParB domain protein nuclease  52.27 
 
 
684 aa  49.3  2e-05  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2733  nuclease  50 
 
 
688 aa  48.9  2e-05  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.905416  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2943  nuclease  45.1 
 
 
683 aa  47.4  7e-05  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.24471  normal  0.819404 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0680  nuclease  70.97 
 
 
681 aa  46.6  0.0001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3534  ParB domain protein nuclease  50 
 
 
687 aa  44.3  0.0006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2612  ParB domain protein nuclease  45.45 
 
 
679 aa  43.9  0.0007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1478  ParB family protein  67.74 
 
 
680 aa  43.5  0.0009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2640  ParB family protein  47.73 
 
 
690 aa  41.2  0.005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.587748  normal  0.035821 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1245  ParB family protein  47.73 
 
 
683 aa  41.2  0.005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.034848 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4159  nuclease  64.52 
 
 
679 aa  40.8  0.006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.841229  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2078  ParB domain protein nuclease  64.52 
 
 
677 aa  40  0.01  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>