29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AFE_0090 on replicon NC_011761
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011761  AFE_0090  hypothetical protein  100 
 
 
59 aa  124  4e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0825  hypothetical protein  80.95 
 
 
272 aa  79.3  2e-14  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.98901 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3243  hypothetical protein  59.52 
 
 
180 aa  60.8  6e-09  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2664  hypothetical protein  59.52 
 
 
252 aa  58.9  2e-08  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.945475  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4613  hypothetical protein  48.94 
 
 
277 aa  57.4  6e-08  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  4.41366e-05 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6046  hypothetical protein  52.38 
 
 
313 aa  56.2  1e-07  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.296494  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1523  putative restriction endonuclease  52.38 
 
 
258 aa  53.1  1e-06  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.74121  normal  0.0967794 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0358  putative restriction endonuclease  50 
 
 
265 aa  52.4  2e-06  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0409  hypothetical protein  53.66 
 
 
263 aa  49.3  2e-05  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5044  hypothetical protein  43.9 
 
 
257 aa  48.5  3e-05  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.899608 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1104  hypothetical protein  50 
 
 
345 aa  48.9  3e-05  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3520  hypothetical protein  48.78 
 
 
256 aa  47.4  7e-05  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0271  putative restriction endonuclease  51.28 
 
 
268 aa  46.2  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.788002  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0490  hypothetical protein  51.22 
 
 
260 aa  47  0.0001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03602  hypothetical protein  45.24 
 
 
256 aa  45.4  0.0002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0146  hypothetical protein  52.63 
 
 
279 aa  44.7  0.0004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3648  hypothetical protein  47.37 
 
 
265 aa  44.3  0.0006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4171  putative restriction endonuclease  38.1 
 
 
257 aa  43.9  0.0007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.118239  normal  0.3128 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0501  restriction endonuclease  41.46 
 
 
295 aa  43.1  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1054  hypothetical protein  42.86 
 
 
375 aa  43.5  0.001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.09564  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0191  hypothetical protein  36.92 
 
 
308 aa  41.6  0.003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.314917 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1194  hypothetical protein  36.92 
 
 
308 aa  41.6  0.003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0062  putative restriction endonuclease  38.1 
 
 
257 aa  41.2  0.005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4781  putative restriction endonuclease  42.5 
 
 
255 aa  41.2  0.005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3975  restriction endonuclease-like protein  46.67 
 
 
309 aa  40.8  0.006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2006  hypothetical protein  46.34 
 
 
253 aa  40.8  0.006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.398772  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1468  hypothetical protein  42.55 
 
 
304 aa  40.8  0.007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.978213  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3867  restriction endonuclease-like  47.62 
 
 
309 aa  40.8  0.007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0757  hypothetical protein  44.19 
 
 
358 aa  40.4  0.009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>